1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : NdisCP
Entry ID 10111
Creation 2012-01-06 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-01-06 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-04-26 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: NdisCP
Name NdisCP
Class Catalase peroxidase    [Orthogroup: CP001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Sordariomycetes Sordariaceae Neurospora
Organism Neurospora discreta    [TaxId: 29879 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NdisCP
start..stop		 S start..stop
NcCP01 1520 0 1..753 1..753
NtetCP01_2509 1514 0 1..753 1..753
SmaCP01 1439 0 1..753 1..753
PanCP01 1185 0 1..753 1..755
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '10111' 'join(458341..460602)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 458341..460602 2260  
join(458341..460602)


exon

Literature and cross-references NdisCP
DNA ref. JGI genome:   scaffold_9 (458341..460602)
Protein sequence: NdisCP
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   753 (101)
PWM (Da):   %s   83142.73 (11126.8)  
PI (pH):   %s   6.17 (5.84) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-130
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSECPVRKSN VGGGGTKNHE WWPAQLRLNI LRQHTPVSNP LDKDFDYAAA FKSLDYEGLK KDLTKLMTDS QDWWPADFGH YGGLFIRMAW HSAGTYRVTD GRGGGGEGQQ RFAPLNSWPD  NVSLDKARRL LWPIKQKYGN KISWADLILL TGNVALESMG FKTFGFAGGR PDTWEADESV YWGAETTWLG NEDRYAEGQE GHEGHGIVQG DESKKQHKDI HNRDLQNPLA SSHMGLIYVN  PEGPDGIPDP VASAKDIRVT FGRMAMDDEE TVALIAGGHT FGKTHGAGPT HHVGKEPEAA PIEHQGLGWA NSFGQGKGPD TITSGLEVTW TPTPTKWGMG YLEYLYKFDW EPTKSPAGAN  QWVAKNAEPS IPDAYDPNKK KLPTMLTTDI ALRMDPAYDK ICRDYLANPD KFADAFARAW FKLLHRDIGP RTRWIGPEVP SEILPWEDYI PPVDYQIIDD NDIAALKKEI LATGVAPRKL  IFVAWSSASS FRGSDKRGGA NGARIRLAPQ NEWKVNDPST LREVLAALES VQQKFNNSSS GKKVSLADLI VLGGVAALEQ ASGLVVPFTP GRNDATQEHT DVHSFNHLEP YADGFRSYGK  GTKRVRTEQF LIDRAALLTL SAPELTALIG GLRVLEANYD GSSYGVLTKT PGKLTNDYFV NLLDTNTAWK AADNEGEVFI GYDRKTHDKK WTATRADLIF GAHAELRALA EVYAAADGEE 
KFKRDFVAAW HKVMNLDRFD LGQEGQGQNA PKL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCCGAGT GCCCCGTCCG CAAGTCCAAC GTCGGCGGTG GTGGCACCAA GAACCACGAG TGGTGGCCCG CCCAGCTTAG GCTCAACATC CTCCGCCAAC ATACCCCCGT CTCCAACCCC  CTCGACAAAG ACTTCGACTA TGCCGCTGCT TTCAAGAGCC TCGACTACGA AGGCCTCAAG AAGGACCTCA CTAAACTCAT GACCGACTCG CAAGACTGGT GGCCTGCTGA TTTCGGCCAC  TATGGCGGTC TCTTCATCCG CATGGCATGG CACAGCGCTG GTACCTACCG TGTCACGGAT GGCCGTGGAG GCGGTGGTGA GGGTCAGCAG CGCTTTGCTC CTCTCAACAG CTGGCCCGAC  AACGTCTCCC TCGACAAGGC CCGTCGTCTC CTGTGGCCCA TCAAGCAAAA GTACGGCAAT AAGATCTCGT GGGCCGACTT GATCCTGCTG ACTGGTAACG TGGCTCTCGA GTCCATGGGC  TTCAAGACCT TTGGCTTTGC TGGTGGCCGT CCCGACACGT GGGAGGCTGA CGAGTCTGTG TACTGGGGTG CCGAGACTAC ATGGCTGGGT AACGAGGACC GCTACGCCGA GGGTCAGGAA  GGCCACGAGG GACACGGTAT CGTCCAAGGT GACGAGTCCA AGAAACAGCA CAAGGACATC CACAACCGTG ACCTGCAGAA CCCCCTTGCC TCCTCCCATA TGGGCCTCAT CTACGTCAAC  CCTGAAGGTC CCGACGGCAT TCCCGACCCC GTTGCCTCCG CCAAGGATAT CCGTGTTACC TTTGGCCGCA TGGCTATGGA CGACGAGGAG ACTGTCGCTC TGATCGCTGG TGGTCACACC  TTTGGCAAGA CCCATGGTGC CGGTCCTACT CACCATGTCG GCAAGGAGCC AGAGGCTGCT CCCATCGAGC ACCAAGGGCT CGGCTGGGCA AATAGCTTTG GCCAGGGCAA GGGTCCCGAT  ACTATCACCA GTGGTCTTGA AGTCACTTGG ACACCAACTC CTACCAAGTG GGGCATGGGC TACCTTGAAT ACCTTTACAA GTTTGACTGG GAGCCGACAA AGAGCCCTGC TGGTGCCAAC  CAGTGGGTGG CCAAGAACGC CGAGCCCAGC ATCCCAGATG CCTACGATCC CAATAAGAAG AAGCTCCCGA CCATGTTGAC GACCGATATT GCCCTGCGCA TGGATCCCGC CTATGACAAG  ATCTGCCGTG ATTACCTCGC GAACCCAGAC AAGTTCGCCG ATGCGTTTGC CCGCGCTTGG TTCAAGCTGC TTCATCGTGA CATTGGTCCG CGTACTCGCT GGATCGGCCC CGAGGTCCCG  TCCGAGATCC TACCTTGGGA AGACTACATT CCCCCCGTAG ACTACCAGAT CATTGATGAT AACGATATCG CGGCCTTGAA GAAGGAGATT CTGGCCACCG GTGTCGCTCC AAGGAAGCTG  ATCTTCGTTG CCTGGTCCTC GGCTTCCTCT TTCCGTGGTT CAGACAAGCG GGGTGGTGCC AATGGTGCCC GTATCCGTCT CGCTCCTCAA AACGAGTGGA AGGTCAACGA CCCCTCTACG  CTCCGCGAGG TCCTTGCTGC TCTCGAGTCT GTGCAGCAAA AATTCAACAA CAGTTCTAGC GGTAAGAAGG TCTCCTTGGC TGACCTTATC GTCCTCGGTG GTGTCGCCGC CCTTGAGCAG  GCTTCTGGCT TGGTGGTACC TTTCACCCCA GGCCGCAACG ACGCCACTCA GGAGCACACC GATGTGCACT CTTTCAATCA CCTCGAGCCT TATGCCGACG GCTTCCGCAG CTACGGCAAG  GGTACCAAGC GCGTACGCAC CGAGCAGTTC CTCATTGACC GCGCCGCGCT GCTCACTCTC TCGGCTCCCG AGCTCACTGC CCTCATTGGT GGTCTCCGTG TGCTAGAGGC CAATTACGAT  GGCTCATCCT ACGGTGTGTT GACCAAGACA CCCGGCAAGC TTACCAACGA CTACTTTGTC AACCTGTTGG ACACCAACAC GGCATGGAAG GCGGCGGATA ACGAGGGCGA GGTCTTCATC  GGCTATGACC GCAAGACACA CGACAAGAAG TGGACGGCAA CAAGAGCCGA TCTCATCTTT GGGGCGCACG CTGAGCTTCG CGCGCTCGCG GAGGTGTATG CTGCGGCGGA TGGCGAGGAA 
AAGTTCAAGC GCGACTTTGT GGCGGCGTGG CACAAGGTCA TGAACCTTGA TCGGTTCGAC CTTGGGCAGG AGGGTCAGGG CCAGAATGCC CCTAAGCTTT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCCGAGT GCCCCGTCCG CAAGTCCAAC GTCGGCGGTG GTGGCACCAA GAACCACGAG TGGTGGCCCG CCCAGCTTAG GCTCAACATC CTCCGCCAAC ATACCCCCGT CTCCAACCCC  CTCGACAAAG ACTTCGACTA TGCCGCTGCT TTCAAGAGCC TCGACTACGA AGGCCTCAAG AAGGACCTCA CTAAACTCAT GACCGACTCG CAAGACTGGT GGCCTGCTGA TTTCGGCCAC  TATGGCGGTC TCTTCATCCG CATGGCATGG CACAGCGCTG GTACCTACCG TGTCACGGAT GGCCGTGGAG GCGGTGGTGA GGGTCAGCAG CGCTTTGCTC CTCTCAACAG CTGGCCCGAC  AACGTCTCCC TCGACAAGGC CCGTCGTCTC CTGTGGCCCA TCAAGCAAAA GTACGGCAAT AAGATCTCGT GGGCCGACTT GATCCTGCTG ACTGGTAACG TGGCTCTCGA GTCCATGGGC  TTCAAGACCT TTGGCTTTGC TGGTGGCCGT CCCGACACGT GGGAGGCTGA CGAGTCTGTG TACTGGGGTG CCGAGACTAC ATGGCTGGGT AACGAGGACC GCTACGCCGA GGGTCAGGAA  GGCCACGAGG GACACGGTAT CGTCCAAGGT GACGAGTCCA AGAAACAGCA CAAGGACATC CACAACCGTG ACCTGCAGAA CCCCCTTGCC TCCTCCCATA TGGGCCTCAT CTACGTCAAC  CCTGAAGGTC CCGACGGCAT TCCCGACCCC GTTGCCTCCG CCAAGGATAT CCGTGTTACC TTTGGCCGCA TGGCTATGGA CGACGAGGAG ACTGTCGCTC TGATCGCTGG TGGTCACACC  TTTGGCAAGA CCCATGGTGC CGGTCCTACT CACCATGTCG GCAAGGAGCC AGAGGCTGCT CCCATCGAGC ACCAAGGGCT CGGCTGGGCA AATAGCTTTG GCCAGGGCAA GGGTCCCGAT  ACTATCACCA GTGGTCTTGA AGTCACTTGG ACACCAACTC CTACCAAGTG GGGCATGGGC TACCTTGAAT ACCTTTACAA GTTTGACTGG GAGCCGACAA AGAGCCCTGC TGGTGCCAAC  CAGTGGGTGG CCAAGAACGC CGAGCCCAGC ATCCCAGATG CCTACGATCC CAATAAGAAG AAGCTCCCGA CCATGTTGAC GACCGATATT GCCCTGCGCA TGGATCCCGC CTATGACAAG  ATCTGCCGTG ATTACCTCGC GAACCCAGAC AAGTTCGCCG ATGCGTTTGC CCGCGCTTGG TTCAAGCTGC TTCATCGTGA CATTGGTCCG CGTACTCGCT GGATCGGCCC CGAGGTCCCG  TCCGAGATCC TACCTTGGGA AGACTACATT CCCCCCGTAG ACTACCAGAT CATTGATGAT AACGATATCG CGGCCTTGAA GAAGGAGATT CTGGCCACCG GTGTCGCTCC AAGGAAGCTG  ATCTTCGTTG CCTGGTCCTC GGCTTCCTCT TTCCGTGGTT CAGACAAGCG GGGTGGTGCC AATGGTGCCC GTATCCGTCT CGCTCCTCAA AACGAGTGGA AGGTCAACGA CCCCTCTACG  CTCCGCGAGG TCCTTGCTGC TCTCGAGTCT GTGCAGCAAA AATTCAACAA CAGTTCTAGC GGTAAGAAGG TCTCCTTGGC TGACCTTATC GTCCTCGGTG GTGTCGCCGC CCTTGAGCAG  GCTTCTGGCT TGGTGGTACC TTTCACCCCA GGCCGCAACG ACGCCACTCA GGAGCACACC GATGTGCACT CTTTCAATCA CCTCGAGCCT TATGCCGACG GCTTCCGCAG CTACGGCAAG  GGTACCAAGC GCGTACGCAC CGAGCAGTTC CTCATTGACC GCGCCGCGCT GCTCACTCTC TCGGCTCCCG AGCTCACTGC CCTCATTGGT GGTCTCCGTG TGCTAGAGGC CAATTACGAT  GGCTCATCCT ACGGTGTGTT GACCAAGACA CCCGGCAAGC TTACCAACGA CTACTTTGTC AACCTGTTGG ACACCAACAC GGCATGGAAG GCGGCGGATA ACGAGGGCGA GGTCTTCATC  GGCTATGACC GCAAGACACA CGACAAGAAG TGGACGGCAA CAAGAGCCGA TCTCATCTTT GGGGCGCACG CTGAGCTTCG CGCGCTCGCG GAGGTGTATG CTGCGGCGGA TGGCGAGGAA 
AAGTTCAAGC GCGACTTTGT GGCGGCGTGG CACAAGGTCA TGAACCTTGA TCGGTTCGAC CTTGGGCAGG AGGGTCAGGG CCAGAATGCC CCTAAGCTTT AG 

Retrieve as FASTA