1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : LsalCP03
Entry ID 10145
Creation 2012-01-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-01-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-01-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LsalCP03
Name LsalCP03
Class Catalase peroxidase    [Orthogroup: CP001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Arthropoda Maxillopoda Caligidae Lepeophtheirus
Organism Lepeophtheirus salmonis    [TaxId: 72036 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LsalCP03
start..stop		 S start..stop
SamCP01_SB2B 974 0 1..733 1..737
IlCP01 972 0 38..733 42..749
CpsCP01 953 0 36..733 31..738
SHspCP02_ANA-3 939 0 7..733 2..738
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '10145' 'join(1010..3214)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1010..3214 2203  
join(1010..3214)


exon

Literature and cross-references LsalCP03
DNA ref. GenBank:   ADND02107822.1 (1010..3214)
Protein sequence: LsalCP03
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   734 (300)
PWM (Da):   %s   80958.01 (32262.1) Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   5.95 (6.39) Peptide Signal:   %s   cut: 0 range:Ymax-299
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MERQLSKKSK LGKAIYALTL GSLLVAGYVN ATPMGASTNK FWWPEQLNLD ALRAHDQRSN PYGSDFDYAA AFAKVDYAAL KADIEEMLSD SQSWWPADWG HYGGLMIRMA WHSAGTYRTH  DGRGGADGGQ QRFDPLNSWP DNVSLDKARR LLWPVKKKYG SSVSWSDLMI LAGNVSLESM GFETLGFAAG RIDDWEADEV YWGKEKKWLE SDSRYKDGEL EKPLAAVQMG LIYVNPEGPN  GNMDPLAAAK DMRESFGRMA MSDEEIVALV AGGHTLGKAH GARKTECIDA EPGAAPIEEQ GLGWRNKCGK GHSEDTMTSG LEGAWTQTPT AWSILYLDNL MRFEWEKHQS PAGAHQWRPS  DKSLHSLIPD AHIEGQRNPP MMFTTDIALK EDPGFRKVAE RFWKNPKAFD KAFARAWFKL THRDFGPRSR YIGPEVPEEV FIWQDPVPVG DKVGEGYVEE LKKTIMGSGL SIQELVRTAW  ASASTFRGSD MRGGANGARL QHSPQRDWAV NDPAELARVL KTLRDIQKGS RERVSLADLI VLGGNAAIEQ AANQAGYTIT IPFESGRGDA SQAMTDTASF AALEPMADAF RNYYSDKAYG  SPVNMLVDKA DLLTLTVPEM TVLVGGMRSL GANSNGSNHG VFTNKQGTLS NDFFINLLDM STTWAKKGNG IYEGKDRATG KFKYTATSVD LVFGSNSELR AVAEVYASQD GSDRFINDFV 
TAWVKVMNLD RFDE 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAGAC AATTGTCTAA GAAATCAAAG CTAGGAAAAG CGATTTACGC ATTGACACTG GGGTCTTTGC TAGTAGCTGG CTACGTCAAC GCTACACCTA TGGGAGCGTC AACTAATAAA  TTTTGGTGGC CAGAGCAATT AAACTTGGAT GCTTTACGTG CACATGATCA GCGCTCCAAC CCCTATGGTT CAGACTTTGA CTATGCTGCG GCCTTCGCTA AAGTTGATTA TGCAGCCCTG  AAAGCTGACA TTGAAGAAAT GCTGTCAGAT TCGCAAAGTT GGTGGCCTGC CGACTGGGGA CATTATGGTG GATTGATGAT TCGCATGGCT TGGCACAGTG CAGGGACCTA CCGTACTCAC  GATGGTCGCG GGGGCGCAGA TGGAGGCCAG CAGCGCTTTG ATCCTCTGAA CAGTTGGCCT GACAACGTTA GCTTAGATAA GGCCCGTCGT CTGTTGTGGC CTGTTAAGAA AAAGTATGGA  AGCTCGGTTT CTTGGTCTGA TTTGATGATA TTGGCTGGGA ATGTATCGCT GGAATCTATG GGCTTTGAAA CACTGGGTTT TGCCGCCGGG CGGATTGATG ATTGGGAAGC GGATGAGGTC  TACTGGGGCA AGGAAAAAAA ATGGTTGGAG AGCGACAGTC GCTATAAGGA CGGGGAACTG GAGAAGCCTT TAGCCGCTGT GCAGATGGGA CTAATCTACG TTAACCCTGA GGGACCTAAC  GGCAATATGG ACCCTTTGGC CGCAGCAAAG GATATGCGTG AATCTTTTGG CCGTATGGCA ATGAGCGATG AAGAAATTGT TGCCTTGGTT GCAGGTGGCC ATACATTGGG TAAGGCCCAC  GGTGCCCGCA AAACAGAATG CATTGATGCC GAGCCTGGTG CGGCTCCTAT CGAAGAACAG GGCTTGGGTT GGAGGAATAA GTGCGGCAAA GGCCATTCTG AAGACACCAT GACCAGTGGC  TTGGAAGGTG CTTGGACTCA AACACCGACC GCATGGTCCA TTCTATACTT AGATAATTTG ATGCGTTTTG AATGGGAAAA GCACCAGAGT CCTGCTGGTG CGCACCAATG GCGCCCCTCA  GACAAGTCCC TGCATAGCCT AATTCCTGAC GCACACATTG AGGGCCAGCG TAACCCTCCG ATGATGTTTA CTACAGATAT TGCACTGAAG GAAGATCCCG GCTTTCGTAA AGTTGCCGAA  CGCTTTTGGA AAAACCCTAA AGCTTTTGAT AAAGCCTTTG CCCGAGCCTG GTTTAAGCTA ACTCACCGGG ATTTCGGCCC CCGAAGTCGC TACATCGGTC CTGAAGTGCC TGAAGAGGTC  TTTATTTGGC AAGATCCTGT ACCTGTCGGT GATAAGGTCG GTGAGGGATA TGTTGAGGAA TTGAAGAAAA CCATTATGGG TTCGGGACTA TCGATACAGG AGCTCGTGCG CACCGCTTGG  GCTTCGGCAT CGACCTTCCG CGGTTCTGAT ATGCGCGGGG GAGCCAATGG GGCTCGTCTT CAGCACAGTC CACAAAGGGA CTGGGCTGTG AATGATCCTG CGGAGTTAGC AAGAGTACTC  AAAACATTGC GAGACATCCA GAAAGGTAGC AGGGAACGTG TATCCCTAGC TGATCTTATT GTTTTGGGTG GTAATGCCGC GATCGAACAG GCTGCTAACC AGGCTGGTTA CACGATCACG  ATACCCTTTG AGTCAGGGCG TGGCGATGCT AGTCAGGCAA TGACTGATAC AGCGTCATTT GCTGCACTAG AACCGATGGC TGACGCATTT CGCAATTACT ACTCCGACAA GGCTTATGGT  TCTCCAGTAA ATATGTTGGT GGATAAGGCC GATCTGCTGA CTCTTACTGT TCCTGAGATG ACAGTTTTAG TTGGTGGCAT GCGATCCTTG GGAGCTAATT CTAATGGTAG CAATCATGGG  GTCTTCACCA ATAAACAGGG CACCCTGAGT AACGATTTTT TTATAAACCT GCTGGATATG TCCACCACTT GGGCCAAGAA AGGAAATGGT ATATACGAAG GAAAAGATCG TGCTACAGGA  AAATTCAAAT ACACTGCAAC ATCGGTAGAC CTAGTCTTTG GTTCAAACTC TGAGCTGCGT GCTGTGGCTG AGGTCTATGC CTCTCAGGAT GGTTCTGATA GATTTATCAA CGATTTTGTT 
ACTGCTTGGG TAAAAGTGAT GAACCTAGAT CGCTTTGATG AATGA 

Retrieve as FASTA