Entry information : EgrPrx[P]147
| Entry ID | 10474 |
|---|---|
| Creation | 2012-02-08 (Qiang Li) |
| Last sequence changes | 2012-02-16 (Qiang Li) |
| Sequence status | theoretical translation / pseudogene |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2016-03-12 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: EgrPrx[P]147
| Name | EgrPrx[P]147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Class III peroxidase [Orthogroup: Prx161]* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Eucalyptus grandis [TaxId: 71139 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '10474' 'complement(join(13115397..13115792,13115937..13116095,13116189..13116380,13116456..13116644))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references EgrPrx[P]147
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_10 (13116644..13115397) |
|---|
Protein sequence: EgrPrx[P]147
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Pseudogene from genomic (stop in frame and short 5' end is missing). No prediction from Phytozome. No EST. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
