Entry information : EglRboh05
Entry ID 11031
Creation 2012-05-18 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-03-13 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglRboh05
Name EglRboh05
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglRboh05
start..stop
S start..stop
EgrRboh05 1919 0 1..940 1..967
EguRboh05 1881 0 1..940 1..967
AgluRboh02 1407 0 18..940 13..931
PtRboh04 1390 0 19..940 14..926
Literature and cross-references EglRboh05
Protein sequence: EglRboh05
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   940 (302)
PWM (Da):   %s   104169.42 (31662.9) Transmb domain:   %s   o368-387i508-530o550-572i732-749o
PI (pH):   %s   9.81 (5.34) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRNEEIGMGT FNYSSDNNNS SDTESVGSDG RTAFSGPLGS ALRSSKRGSR KSARFNIPAE TAGLRSAGAT SKDEQEDGDP YVEITLDIRD DGVADPELAL LAKRTFETRR SSSFGSSVFR  STSSRFRQVS QELKRIASLT RRPTAPPARR FDRTRSAAAH ALKGLKFIAA KTGGGGGGAG SAAxxxxxxx xKFDQLTASS GGLLHCSQFC ECIGMNKESK EFATELFRAL AQRRNIFGDS  ITKDQLKEFW EQISDESFDS RLQTFFDMVL QIITLSASAN KLSNIQKQAD EYAALIMEEL DPDNKGYIMV QNLETLLLQA PNQSVRVGDS KVLSQLLSQK LKPTIDNNPV RRWCEHAKYF  LMDNWKRLWV MVLWIAIMAG LFTYKFIQYR NRAAFGVMGY CVCVAKGGAE TVKFNMALIL LPVCRNTITW LRNKTRLRVA VPFDDNLNFH KVIAAGIAVG VGLHVISHLT CDFPRLLLAS  PEAYEPMKPY FGEKQPPNYW WFVKGVEGVT GILMLVLMAI AFTLAMPWFR RSKINVPGPL KKLTGFNAFW YSHHLFVIVY TLLIVHGIKL YLAHDWYKKT TWMYLAVPVT LYACERLIRA  FRSSIKPVKI LKVAVYPGNV LALHMSKPHG FKYRSGQYMF VNCSAVSPFE WHPFSITSSP GDDYLSVHIR TLGDWTRQLK SVFSEVCQPP SVGKSGLLRA DCVPGGSIPR FPKILIDGPY  GAPAQDYQKY EVVLLVGLGI GATPMVSIVK DIINNIKVKE NEQDHMGSLE SGGRPVSPLT PDDSNSHYPK AGHRSSHGRG AFKTRKAYFY WVTREQGSFE WFKGIMDEVA GMDERQVIEL 
HNYCTSVFEE GDARSALIAM LQTLNHAKHG VDVVSGTRVM SHFAKPNWRQ VYKKIALHHP DKRVGVFYCG APALTKELNH LALDFSRKTS TKFDFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from NGS. Short PS is missing due to NNN.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAAACG AAGAGATTGG GATGGGAACT TTTAACTATT CATCGGATAA CAACAATAGT TCCGACACGG AAAGCGTCGG GAGCGACGGC CGCACAGCCT TCAGCGGGCC GCTCGGATCG  GCCCTTCGCA GCTCCAAGCG AGGCTCAAGA AAGAGCGCGA GATTCAACAT CCCTGCGGAG ACGGCGGGGC TCCGGAGTGC CGGCGCCACC TCGAAAGACG AGCAGGAAGA TGGCGACCCG  TACGTCGAGA TCACCCTCGA CATACGGGAC GACGGCGTCG CCnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnAGGACCCC GAGCTGGCGC TGCTCGCGAA GAGGACGTTC  GAGACCCGGA GGTCGTCGTC GTTTGGGTCG TCCGTCTTCC GGAGCACCTC GTCCCGTTTC CGGCAGGTCT CGCAGGAGCT GAAGCGCATC GCCTCCCTGA CGCGGCGGCC GACGGCACCA  CCGGCGAGGC GCTTCGACCG GACGAGGTCG GCAGCGGCGC ACGCGCTCAA GGGCCTCAAG TTCATAGCCG CCAAGACGGG CGGCGGCGGC GGCGGCGCTG GCTCCGCCGC CTnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnAAATT CGACCAGTTG ACCGCTTCGT CCGGCGGCCT CCTGGTAAAT TAAAAATCCT GAAAATTACT CCCATTTTAT TTTTATTTTT TGGGTTGTTG CACTATAATT  TGGTACCTCC TTTACAGCTC AATAATGTCT ATTACGTCTG TAAATAATTG CAATTAGGAA TGAACAAAGA GTCTAAGGAA TTTGCGACCG AGCTCTTTCG AGCACTCGCG CAGAGGCGCA  ACATATTTGG CGACTCCATC ACCAAGGATC AGCTCAAGGA ATTCTGGGAA CAAATTAGCG ACGAGAGCTT CGACTCGAGG CTGCAAACTT TCTTCGACAT GTAAGCAAGC AAAACGCTCT  CGGCTAGTCT TAGATTTTAT TTCCGTGTAG GTATTGAATA AGTTAATGTT ATTATAAAAA GTTTTCTTGA TTATTAAAAG CGAAATGGTT GGTGGTGCAA TAAAATGTTA GGGTGGACAA  AGACGCGGAT GGGAGAATCG CGGAGGAAGA AGTCAGAGAG GTATATAATT TTTTTCTCCC GTTCTTTGAA ATACGTTGAA GGATTATGAT TTTTTTTTCT GTGAGTTAAT TAATAAAAAG  AAGTTGTCTG GACGTAGAAT TGTTTAATTG TGTTGAAAGA GAATAAATCC TTGGTTTTGC AGATCATCAC CCTGAGCGCA TCGGCGAATA AGCTGTCAAA TATCCAGAAG CAAGCCGACG  AATATGCAGC TCTCATCATG GAGGAATTGG ACCCTGATAA TAAGGGATAC ATCATGGTAT ATATATATCA TTAAACAATC GTTTATGTAA TTTGGACAAA AATTTGCACT TTTTACGAAA  TTTAACGTAG TCATCATCGG TATTAAATTA GGATCGCTAT TGGAAAATGA GCTTTTTCAC TAGCCACGTC TATGAAATAG CCATCCATGT GTAACACGTT CTTGATTTGC CCTACACAGG  TTCAGAACCT GGAAACACTG CTCTTGCAAG CTCCGAACCA GTCCGTGAGA GTCGGAGACA GCAAAGTCCT GAGCCAGCTA CTGAGCCAGA AGCTCAAACC GACCATCGAC AACAACCCAG  TCCGCCGATG GTGTGAGCAC GCCAAGTACT TCCTGATGGA CAACTGGAAG AGGCTGTGGG TCATGGTGCT GTGGATTGCG ATCATGGCGG GCCTCTTCAC CTACAAGTTC ATCCAGTACC  GGAACAGGGC GGCATTCGGC GTGATGGGCT ACTGCGTCTG TGTTGCCAAG GGCGGTGCCG AGACAGTCAA GTTCAACATG GCCCTCATCC TGTTGCCCGT TTGTCGAAAC ACCATCACAT  GGCTTAGGAA CAAGACCCGG TTGCGTGTTG CGGTCCCCTT CGACGACAAC CTTAACTTTC ACAAGGTAAT ACGGCAGCGA GATGCTTTTA TTTCGATTGT TTTTATTACT GAGAATATCA  TTAATCTAAT GAAATGAGAG ACTCCACATA AGAATACTCA TATAATTAAG CAATGGAAAT ATTTTGGGTA TTATCTACTA TTGTGTGTGA TGAAGTATAC AATGAAATGT CAAGATTTTG  CTTGCAATTC ATACTCACAT TTTGCTAATT GTAAATTACT ATATCTTGTT AACTTCATCT GACTTTTGTT GCTCAAAATA ATCTCGACTC CGAGATCTTG ATGAATAGCT TGATCTAATA  TCATATTCCC TATATGTGTA CAATTCCAGG TGATCGCGGC AGGGATAGCT GTCGGGGTCG GGTTGCATGT AATCTCGCAT TTGACGTGCG ACTTCCCAAG GCTCCTACTC GCGAGCCCCG  AGGCGTACGA GCCCATGAAG CCCTACTTCG GCGAGAAGCA GCCCCCGAAC TACTGGTGGT TCGTGAAAGG AGTGGAGGGC GTGACGGGGA TCCTGATGCT GGTTCTGATG GCGATCGCCT  TCACGCTGGC CATGCCGTGG TTCAGGAGGA GCAAGATCAA CGTGCCCGGG CCCTTAAAGA AGCTCACGGG CTTCAACGCC TTCTGGTACT CGCACCACCT CTTCGTCATC GTCTACACGC  TGCTCATCGT CCACGGGATC AAGCTCTACC TCGCCCACGA TTGGTACAAG AAGACGGTAA GCTTCCTTCT CCCTCCTTCC AATTACTACA AATCTAGCCA CAATTGTTGC TTCCAAGGCT  ATTCTTCCCT CTTTAATCAC TGTTTCTTTT GACTATAATC GCAGACATGG ATGTACTTGG CAGTGCCGGT GACCCTCTAT GCGTGTGAAA GGTTGATCCG GGCTTTCAGG TCCAGCATCA  AGCCGGTGAA GATTCTCAAG GTTATTATAA TATAAACCCT GAACCAAACG GCCATATTTA ATCTGCATAT TTCTGATCAT CGTCATCTGG AGCATATAAT TAACGAATAA TCTATTCATT  AGCCGATGAA GATGTCATGA ATGTTGAATT AAAATTTGAT GGGCATTCAT GCAGGTGGCG GTTTACCCGG GGAATGTACT GGCACTGCAC ATGTCGAAGC CCCATGGGTT CAAGTACAGA  AGTGGGCAAT ACATGTTCGT AAACTGCTCG GCTGTTTCTC CCTTTGAATG GTATATCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCA TATGACATTT GTGATGATCC ACGATGTTTG  AGCAATCATT GCTAGAGAAG ATGCTAACGT TTAATTATGA GCAGGCACCC TTTCTCGATC ACTTCGTCCC CGGGAGACGA CTACCTCAGC GTCCACATTC GGACATTGGG AGATTGGACA  AGGCAACTGA AAAGCGTATT CTCGGAGGTT GGTTGGATCG ATTGATTAAT CATGTCTAGT GGGGGATTCA TAGTTCCAGA ATTTCTGCGA GCCATTTGAT TATTGATTTG TTCTCCATTT  TATGGACTGG TAGGTATGCC AACCTCCATC CGTTGGGAAA AGTGGACTGC TGAGAGCTGA TTGCGTTCCA GGAGGAAGCA TCCCACGGTA AGACTTTTTT CCTCGGTTGC ACTAGCTTCA  AAGAAAACAG ACATTTTGAT CTTGAAATAA TCAACGGATT TTCCGAGATA TACGnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnTTTGACAA TCAAACATGT ATTATTGAAT GCTTAGTAGA GCCATGATTG ATTGTCCTTT TCCCAATGCG TTACAGCTTC  CCAAAGATAC TGATAGACGG TCCATACGGA GCCCCAGCAC AAGACTACCA AAAGTATGAG GTAGTGCTCC TGGTGGGGCT AGGGATCGGC GCCACGCCCA TGGTGAGCAT CGTGAAGGAC  ATCATCAACA ACATAAAAGT CAAAGAAAAC GAGCAAGACC ACATGGGCTC GTTGGAGAGT GGAGGACGAC CCGTCTCGCC ACTAACCCCG GACGACAGCA ACAGCCACTA TCCCAAGGCG  GGCCACAGGA GCAGCCATGG CAGAGGAGCG TTCAAGACCA GGAAGGCCTA CTTCTACTGG GTGACCCGGG AGCAGGGCTC GTTCGAGTGG TTCAAGGGGA TCATGGATGA GGTGGCCGGG  ATGGACGAGC GGCAGGTCAT CGAGCTCCAC AACTACTGCA CGAGCGTGTT CGAGGAGGGC GACGCCCGGT CGGCCCTCAT CGCGATGCTC CAGACCCTCA ACCACGCGAA GCACGGGGTC  GACGTCGTGT CCGGGACCCG GGTCATGTCC CACTTCGCCA AGCCCAACTG GCGCCAGGTC TACAAGAAGA TCGCGCTGCA CCACCCCGAC AAGCGAGTTG GTGGGTCCCC GCTTAACCTA  ACCCCCGCGC CCGCCGTGTC TTTAGTGATT CTGCTTGATT CGAACGATTT GTCACATCTA TTTTTGTTAT GCATGCGTTG TTGATTTGGC CACGATGAAC AATTTTGCAG GAGTCTTCTA 
TTGTGGGGCG CCGGCGTTGA CAAAGGAGTT AAATCACTTG GCTCTGGATT TCTCTCGCAA GACATCCACC AAGTTCGACT TCCATAAGGA GAACTTTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAAACG AAGAGATTGG GATGGGAACT TTTAACTATT CATCGGATAA CAACAATAGT TCCGACACGG AAAGCGTCGG GAGCGACGGC CGCACAGCCT TCAGCGGGCC GCTCGGATCG  GCCCTTCGCA GCTCCAAGCG AGGCTCAAGA AAGAGCGCGA GATTCAACAT CCCTGCGGAG ACGGCGGGGC TCCGGAGTGC CGGCGCCACC TCGAAAGACG AGCAGGAAGA TGGCGACCCG  TACGTCGAGA TCACCCTCGA CATACGGGAC GACGGCGTCG CCGACCCCGA GCTGGCGCTG CTCGCGAAGA GGACGTTCGA GACCCGGAGG TCGTCGTCGT TTGGGTCGTC CGTCTTCCGG  AGCACCTCGT CCCGTTTCCG GCAGGTCTCG CAGGAGCTGA AGCGCATCGC CTCCCTGACG CGGCGGCCGA CGGCACCACC GGCGAGGCGC TTCGACCGGA CGAGGTCGGC AGCGGCGCAC  GCGCTCAAGG GCCTCAAGTT CATAGCCGCC AAGACGGGCG GCGGCGGCGG CGGCGCTGGC TCCGCCGCCT nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnAAATTCG ACCAGTTGAC CGCTTCGTCC  GGCGGCCTCC TGGAATGAAC AAAGAGTCTA AGGAATTTGC GACCGAGCTC TTTCGAGCAC TCGCGCAGAG GCGCAACATA TTTGGCGACT CCATCACCAA GGATCAGCTC AAGGAATTCT  GGGAACAAAT TAGCGACGAG AGCTTCGACT CGAGGCTGCA AACTTTCTTC GACATGGTTT TGCAGATCAT CACCCTGAGC GCATCGGCGA ATAAGCTGTC AAATATCCAG AAGCAAGCCG  ACGAATATGC AGCTCTCATC ATGGAGGAAT TGGACCCTGA TAATAAGGGA TACATCATGG TTCAGAACCT GGAAACACTG CTCTTGCAAG CTCCGAACCA GTCCGTGAGA GTCGGAGACA  GCAAAGTCCT GAGCCAGCTA CTGAGCCAGA AGCTCAAACC GACCATCGAC AACAACCCAG TCCGCCGATG GTGTGAGCAC GCCAAGTACT TCCTGATGGA CAACTGGAAG AGGCTGTGGG  TCATGGTGCT GTGGATTGCG ATCATGGCGG GCCTCTTCAC CTACAAGTTC ATCCAGTACC GGAACAGGGC GGCATTCGGC GTGATGGGCT ACTGCGTCTG TGTTGCCAAG GGCGGTGCCG  AGACAGTCAA GTTCAACATG GCCCTCATCC TGTTGCCCGT TTGTCGAAAC ACCATCACAT GGCTTAGGAA CAAGACCCGG TTGCGTGTTG CGGTCCCCTT CGACGACAAC CTTAACTTTC  ACAAGGTGAT CGCGGCAGGG ATAGCTGTCG GGGTCGGGTT GCATGTAATC TCGCATTTGA CGTGCGACTT CCCAAGGCTC CTACTCGCGA GCCCCGAGGC GTACGAGCCC ATGAAGCCCT  ACTTCGGCGA GAAGCAGCCC CCGAACTACT GGTGGTTCGT GAAAGGAGTG GAGGGCGTGA CGGGGATCCT GATGCTGGTT CTGATGGCGA TCGCCTTCAC GCTGGCCATG CCGTGGTTCA  GGAGGAGCAA GATCAACGTG CCCGGGCCCT TAAAGAAGCT CACGGGCTTC AACGCCTTCT GGTACTCGCA CCACCTCTTC GTCATCGTCT ACACGCTGCT CATCGTCCAC GGGATCAAGC  TCTACCTCGC CCACGATTGG TACAAGAAGA CGACATGGAT GTACTTGGCA GTGCCGGTGA CCCTCTATGC GTGTGAAAGG TTGATCCGGG CTTTCAGGTC CAGCATCAAG CCGGTGAAGA  TTCTCAAGGT GGCGGTTTAC CCGGGGAATG TACTGGCACT GCACATGTCG AAGCCCCATG GGTTCAAGTA CAGAAGTGGG CAATACATGT TCGTAAACTG CTCGGCTGTT TCTCCCTTTG  AATGGCACCC TTTCTCGATC ACTTCGTCCC CGGGAGACGA CTACCTCAGC GTCCACATTC GGACATTGGG AGATTGGACA AGGCAACTGA AAAGCGTATT CTCGGAGGTA TGCCAACCTC  CATCCGTTGG GAAAAGTGGA CTGCTGAGAG CTGATTGCGT TCCAGGAGGA AGCATCCCAC GCTTCCCAAA GATACTGATA GACGGTCCAT ACGGAGCCCC AGCACAAGAC TACCAAAAGT  ATGAGGTAGT GCTCCTGGTG GGGCTAGGGA TCGGCGCCAC GCCCATGGTG AGCATCGTGA AGGACATCAT CAACAACATA AAAGTCAAAG AAAACGAGCA AGACCACATG GGCTCGTTGG  AGAGTGGAGG ACGACCCGTC TCGCCACTAA CCCCGGACGA CAGCAACAGC CACTATCCCA AGGCGGGCCA CAGGAGCAGC CATGGCAGAG GAGCGTTCAA GACCAGGAAG GCCTACTTCT  ACTGGGTGAC CCGGGAGCAG GGCTCGTTCG AGTGGTTCAA GGGGATCATG GATGAGGTGG CCGGGATGGA CGAGCGGCAG GTCATCGAGC TCCACAACTA CTGCACGAGC GTGTTCGAGG  AGGGCGACGC CCGGTCGGCC CTCATCGCGA TGCTCCAGAC CCTCAACCAC GCGAAGCACG GGGTCGACGT CGTGTCCGGG ACCCGGGTCA TGTCCCACTT CGCCAAGCCC AACTGGCGCC  AGGTCTACAA GAAGATCGCG CTGCACCACC CCGACAAGCG AGTTGGAGTC TTCTATTGTG GGGCGCCGGC GTTGACAAAG GAGTTAAATC ACTTGGCTCT GGATTTCTCT CGCAAGACAT 
CCACCAAGTT CGACTTCCAT AAGGAGAACT TTTGA 

Retrieve as FASTA