1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : CroPrx36(CRO_T013425 / cra_locus_40450_iso_1_len_365_ver_3)
Entry ID 11301
Creation 2012-09-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx36(CRO_T013425 / cra_locus_40450_iso_1_len_365_ver_3)
Name CroPrx36(CRO_T013425 / cra_locus_40450_iso_1_len_365_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx038]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx36
start..stop		 S start..stop
IaquPrx73 490 3.36e-176 1..329 1..323
InPrx86 488 1.33e-175 32..330 31..329
MguPrx33 474 4.49e-170 32..330 32..329
NtPrx79-1A 472 4.09e-169 1..329 1..324
Literature and cross-references CroPrx36(CRO_T013425 / cra_locus_40450_iso_1_len_365_ver_3)
Protein sequence: CroPrx36(CRO_T013425 / cra_locus_40450_iso_1_len_365_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (310)
PWM (Da):   %s   37525.84 (34927.5)  
PI (pH):   %s   7.47 (7.25) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-331
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKYFCISFLL IFFVVVEVVS AYDVPKLVDL PFDDSDLSFS YYHKSCPEAE RIIHNKVKEW VTKDYTLAPA LMRLHFHDCS VRGCDASILL NHKGSERWAN ASKSLRGFEV IDEIKEEIEK  KCPKTVSCAD ILTAAARDAT VAAGGPFWQV PYGRKDGCVS LAKEAELVPM GHERITDLVE FYQSKGLNVL DMVVLSGAHT IGRSTCGSLQ HRLYNYKGTG KPDPTINPQY LNYLRRKCRW 
ASEYVDLDAN SPKKFDVQYF KNIQHKMGLL QTDQMLYFDS RTSPLVNALS SQPEVFKHQF AAAMVKLGNI QDYLSDENGE IRVNCNSVNK Y* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST (3' and 5' are missing).
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTACT TTTGTATTTC ATTCTTGTTA ATTTTCTTTG TTGTTGTTGA AGTAGTTTCA GCCTATGATG TCCCAAAACT AGTTGATTTG CCTTTCGATG ATAGTGATCT TTCTTTCTCA  TACTATCATA AAAGTTGTCC AGAAGCTGAG AGAATTATCC ATAACAAAGT TAAAGAATGG GTTACTAAGG ATTATACTCT TGCTCCTGCC CTTATGAGGT TGCACTTCCA TGATTGTTCT  GTTAGGGTAA GAGTACTCTA AAATTCTTCT ACCTACTTTT ACCATGTGAA ATATAGTTCT TATTGAATTC ATGTTATGTT CCGGATCCTC AATTGCAGCG TGTAACATTA TGGTATTAAA  TCATATTTAA TAGATGAAAA TGTGAGATCA TCAAATGCTA CTCCCTCTTT TTTCTCTTTT TTTTTTTTTT TTGTCATATT TTAGACATCA CACTCTTTAA AAAGATACAA AATTAATTTA  AAAGTTTTTT ACATGGACTA GAATCTCCTT CAAATTAATA TATCTCCTCA TTATTTCTAC AAGTTTCCAT ATTTAGAGCA ATTTAAAAAG CTTTGAAATT TATCTTTTAT GAAAGAGTAT  GATGTGAAAA ATTTATTAAA TATTGTTGCA CTGATTTTAC AATATGACAA GTAAAAGATG AGGCAATTAA TGAAATGTGA CAAGTAAAAA AAAATCGAGT GAGTACATCT CATGTTGGAG  ACACTTTTAG AATCTCATAC TTTGGTATAT GCTCTTGAGT TAAAGTCTAA TAGGAAACTA AAGCTTTAAA GGGGTGAAAA TTTTACCATA ATTAATCACA TATGATGGGA TAAGTGTAAC  GCGATCGTAT GATATAAAAA TATGTAACTA ATTATCTGCG ATCATCATTA CATATCAATT TTGATATAGA AAGAAATATT ATGACAAATA ATTTATTCTA GATGTTATAA GTTCTATTAG  TCACACTCAA ATCTGCGGGC ATAACATGTG AAAATTTACT TGAGAATTTA GCTCTTTTTT AAATTGAATA TGTCTAAAAC TGGACAATTT TTTTATTTTT ACTTTAGAGA CACTTTTCAT  TTCACAGTCT AACTACTTTT TTTTTTTTTT TTTTTCATTT GGATCAAATT GAAATCCATT GCAAATACAA AGTTACTAAT CTTTTGATGA ATGTATATAT ATAGGGTTGT GATGCCTCGA  TTCTTTTGAA TCATAAGGGA AGTGAAAGAT GGGCAAATGC GAGCAAGTCA TTAAGAGGAT TTGAAGTGAT TGATGAAATC AAGGAAGAAA TTGAAAAGAA GTGTCCAAAA ACTGTTTCTT  GTGCTGATAT TCTTACTGCT GCTGCTAGGG ATGCCACTGT TGCAGCTGGT GGTCCTTTCT GGCAAGTTCC TTATGGTAGA AAAGATGGTT GTGTTTCCCT TGCCAAGGAA GCTGAATTGG  TTCCTATGGG TCATGAAAGA ATTACTGATT TGGTTGAATT TTACCAGTCC AAAGGATTGA ATGTACTTGA CATGGTTGTC CTCTCAGGTT AGTATATACT ATATTCTTTG ATACATCACA  AATTATACTA TGCACTCCAT ACACCTTTTA TTGTACACAA TGGAGTCTTA ACACAGCATG AAATCTGTAT TCTATTCCCA TTTGAACCAT AACATAGATC ATCTATGGAA TCATAAGGAC  ACAAGGTCTG CCTTACGTTG TGCTATGGAA ACTTTATTCT CTTCACATAG AAGTATAACA CAAGATTCAT GGAACCATCA CACATGGTAT ACATTACATT GTGCAATCGA GTGGATAGTA  TAAAACTCCT GAAATATTTA CCGAAATGCC TATGTGGCTC TTTTTTTTTT TTTTTGGCTG AGTAACTCCT TTGATAGAAT TCAATCACGA TTCTCCAATA TATTTTCTAA TACACTTTTT  TTACCATATT ATTTTTAGGA GCTCATACTA TTGGAAGAAG TACATGTGGT TCACTCCAAC ACAGATTATA CAACTACAAA GGAACTGGAA AACCAGATCC AACCATCAAC CCACAATACC  TGAATTACTT GAGAAGAAAA TGCAGATGGG CATCAGAATA TGTAGATCTT GATGCTAATT CTCCCAAGAA ATTTGATGTT CAATATTTCA AAAATATTCA ACACAAAATG GGACTTTTAC  AAACGGATCA AATGTTGTAC TTTGATTCAA GAACTTCTCC TCTTGTCAAT GCATTGTCTA GCCAACCTGA AGTTTTCAAA CACCAGTTTG CAGCAGCTAT GGTGAAGCTT GGGAATATTC 
AAGATTATCT GAGTGATGAA AACGGTGAAA TCAGAGTGAA TTGCAACTCT GTCAACAAAT ATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTACT TTTGTATTTC ATTCTTGTTA ATTTTCTTTG TTGTTGTTGA AGTAGTTTCA GCCTATGATG TCCCAAAACT AGTTGATTTG CCTTTCGATG ATAGTGATCT TTCTTTCTCA  TACTATCATA AAAGTTGTCC AGAAGCTGAG AGAATTATCC ATAACAAAGT TAAAGAATGG GTTACTAAGG ATTATACTCT TGCTCCTGCC CTTATGAGGT TGCACTTCCA TGATTGTTCT  GTTAGGGGTT GTGATGCCTC GATTCTTTTG AATCATAAGG GAAGTGAAAG ATGGGCAAAT GCGAGCAAGT CATTAAGAGG ATTTGAAGTG ATTGATGAAA TCAAGGAAGA AATTGAAAAG  AAGTGTCCAA AAACTGTTTC TTGTGCTGAT ATTCTTACTG CTGCTGCTAG GGATGCCACT GTTGCAGCTG GTGGTCCTTT CTGGCAAGTT CCTTATGGTA GAAAAGATGG TTGTGTTTCC  CTTGCCAAGG AAGCTGAATT GGTTCCTATG GGTCATGAAA GAATTACTGA TTTGGTTGAA TTTTACCAGT CCAAAGGATT GAATGTACTT GACATGGTTG TCCTCTCAGG AGCTCATACT  ATTGGAAGAA GTACATGTGG TTCACTCCAA CACAGATTAT ACAACTACAA AGGAACTGGA AAACCAGATC CAACCATCAA CCCACAATAC CTGAATTACT TGAGAAGAAA ATGCAGATGG  GCATCAGAAT ATGTAGATCT TGATGCTAAT TCTCCCAAGA AATTTGATGT TCAATATTTC AAAAATATTC AACACAAAAT GGGACTTTTA CAAACGGATC AAATGTTGTA CTTTGATTCA  AGAACTTCTC CTCTTGTCAA TGCATTGTCT AGCCAACCTG AAGTTTTCAA ACACCAGTTT GCAGCAGCTA TGGTGAAGCT TGGGAATATT CAAGATTATC TGAGTGATGA AAACGGTGAA 
ATCAGAGTGA ATTGCAACTC TGTCAACAAA TATTGA 

Retrieve as FASTA