Entry information : PtaPrx101(PTA00019439)
Entry ID 12684
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-02-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx101(PTA00019439)
Name PtaPrx101(PTA00019439)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx425]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx101
start..stop
S start..stop
PabPrx38 613 0 1..331 1..331
PabPrx173 436 4.9e-155 1..329 1..323
GbPrx69 430 1.03e-152 5..329 2..323
PtaPrx100 426 9.17e-151 1..329 1..323
Literature and cross-references PtaPrx101(PTA00019439)
Protein sequence: PtaPrx101(PTA00019439)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (312)
PWM (Da):   %s   36008.09 (33939.9)  
PI (pH):   %s   5.38 (4.98) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-331
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSAKLIVSLL VVIIHGLSGD LSAVLGQLSP DFYRFSCPNV DQIVFETMRT LSGRSNVVAP STLRLFFHDC FIQGCDASIM ISSTPFNRAE RDLAENNIAQ TAFDTIVEIK RAVERACPGV  VSCADIIALA ARDSVALLGG PNWQVPKGRL DGLTSEAASS FGRIPSANIN ARQLINTFAA SGFSLAEMVV LSGAHTVGFS HCREFTDRLY NFSPVMRTDP NMEPGFVRTL KANCPLLGDP 
SKFQAIDIST PFVFDNTYFK NLVAGRGLLF SDQDLFSGDN ETRDIVMRLA SSQDLFFTNF AAAMIKLGSL GVRTDRSDGE IRQDCTAFNS H* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAGCCA AGTTGATTGT CAGTCTTCTT GTTGTGATAA TCCATGGACT CTCGGGGGAT CTCTCCGCAG TCCTCGGCCA ACTGTCACCG GATTTTTACA GGTTTTCGTG TCCAAATGTA  GATCAGATAG TGTTTGAAAC GATGAGAACG CTGTCAGGCC GATCAAATGT GGTTGCCCCT TCCACTCTGC GCCTCTTTTT TCATGACTGC TTTATTCAGG TGCCCATTTT TTCACTATAT  GAATTGGTTT TTTCTGAATT CCTGATTATT CTGACTGTTA TTAGGATTTA AATTACAGTT AAAAAGATTT GAAGTTTTAT TTAACAACGT CCATGTTTTA TTCTATATTT TTAAGCGAGT  TATAGGTCTA GCAAGATAAT GACCATAGCA TATACTGATT AGAAACATGG TCTTTACGAT AATATATTTC CTATATCGGT GTGAAGATAA ATTTGGCAGG TTAGAAAAGT TATTGGAGCA  GTTGGTTTGC CTAATTCCAA ATTATGGAAA AATATCATCC ATACAACTAC TTTGATGCGA TTTTTCACAT AGGGTTCCTT TATATTTCAG ATAGAGTCGT TGGCCAAATA ATAATATGCC  GTAGAATATA TGATCAATCT CCTTCAGTTA GGAAAAGTTA CAGTGCGAAC AAGCGAGTCA AAATAGGGTA TGATCATCTG CGTTATTATG TATATATCAG GACGTGCAAG AAATCGATAT  GTAGAAAATT CACGGTCGTT GGCCAAATTC AATCAAATCT GACATTATTG GCAACCCACT CCCAGCTTGT CAGACAAATT TAGTGAACGA TACAAATTTT CAGGGTTCCA AACTATTGCC  GCCAAAATGG CAGCTGATTC AATCAGTTCA ACTATGATTA ATATGCTAAT ATTTTTGTCT TTCTTTTATT AAATAAGGGA TTTAATTCAG TCTTATTTGA TTGTCAAGTC TACAAAAGCA  TACATTATTT TCTTTAGTTT TAAACTCTTA ACTTTTTAAG AGCAAACACA CACTCTTAAT CATTAAACCC ACTCAAATCA TTAAACCCAC TCAAATGCTA TTTTCCCATT AAATTCCATT  TTTCAATATA TAAATTCATA TTGATTATAA GAAATTTGAT ATAAGTAATA TTAGTAATAA AAAACATAAT AATATATGTA CTTTGATAAA TCTAAATAAT AGTAAATGGC TAAATTAGAT  TTAGGTTGGA TGAGTGGTTT GGAAGGATGA ATATTATTTT TCTTATGAAA TTGAATTTTT TTTGCAAATG GCATAATAAA TTTTTTTCCC TGTGGGAATT TTGAGATGAC TAGATATTTA  ATCTTTGTTT TAAAAAATTG TAACTCAGAA GCATCTAAAC TGTCAAAATT ATCTAAAAAA TACATCTAAT CTGTCAAATT TATCTAAAAA ATACACCTAA TCTGATCACG CTAACCCTAA  ACATAACTAA ATTTTTACCC ACAAACCTTA GAACAAGTAA TGTTAACCTT CGCAATAAAT AAATATATAT AAAAGTTAAT CATAGGTATA TTAATTTTTT TTTTCTGTGT TGGAGGGAAT  TGAAAAAATA GAAATTTATC ATGAAACCCA ATAAATTTAA AATAAGAGTT TTGTTGGTTC ATATATTAGA AAGAAAGCAT CGTATTCATA TGATCTTCAC TGTAAAGTTC TGTTCTAAAA  CAAAAGGAAA AGTCTTGCAG TAACGATATT CGATATTTAT TTTGGAACAA TACTAATTAT AGGTAATTGA TAGGGCTGCG ATGCATCAAT CATGATCTCT TCTACCCCAT TCAACAGGGC  AGAAAGAGAT TTGGCAGAGA ATAACATTGC CCAAACAGCA TTCGACACAA TCGTTGAGAT TAAGAGAGCA GTGGAAAGGG CCTGCCCGGG CGTGGTGTCG TGTGCGGATA TCATAGCATT  AGCAGCCAGG GATTCAGTGG CATTGCTTGG AGGTCCAAAT TGGCAAGTCC CAAAAGGAAG ATTGGACGGG CTTACGTCTG AGGCTGCCTC TAGTTTCGGT AGGATTCCCT CAGCTAACAT  CAACGCTCGC CAACTCATCA ACACCTTTGC TGCCTCGGGC TTCTCTCTGG CGGAAATGGT GGTTTTATCA GGTAAACATT ACGGAATACT ATAAGCTTAT TCATTAATAG ATTTTTGATT  ACTATTATTA TCAAGAAAAA TTGTTACTGG GGTTGAATTT ATTTTTATTA TAAATTTTGG GAATATTTTA AAATTTAATA TCACAAAAGT TATATATTTC AAAAATAACC AAAGTTATAT  ATTTCAAAAT TTTTATTAAC GTAGTTGGCT GTCTTGAAGA TTAGTTGATA TTATACAAAT CTACAATCAA AATAGAAGTA AAAATCCCTA AACTTATATC GATTACAAAT TCTTAAAATA  TCTCAAAATC TGAAAATCTG ACCTTTATTA ATATTACCTG AATCTGGATC ATAAAAATAT CCCCGTAAAA ATAACGTTCA ACTTGATTGA TATTACTGAA AAGCTTTTGT ATATCTAAGC  AGGTGCACAT ACTGTGGGTT TCTCCCACTG TCGAGAATTT ACCGATCGGC TCTACAATTT TTCTCCGGTG ATGAGAACTG ATCCGAACAT GGAGCCGGGC TTCGTCAGAA CACTAAAGGC  CAACTGCCCC TTACTAGGCG ATCCCTCCAA ATTTCAAGCA ATTGATATAA GCACGCCCTT CGTATTTGAT AATACTTATT TTAAGAATCT GGTAGCAGGC AGAGGGCTTT TGTTCTCAGA  CCAAGATCTG TTTAGCGGAG ATAACGAAAC GAGGGACATA GTAATGAGGT TGGCGAGCTC TCAGGATCTT TTTTTCACCA ACTTCGCAGC CGCCATGATA AAGCTGGGGA GCTTGGGAGT 
CAGAACTGAT CGAAGTGACG GAGAAATTCG CCAAGATTGC ACTGCATTTA ACTCCCATTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAGCCA AGTTGATTGT CAGTCTTCTT GTTGTGATAA TCCATGGACT CTCGGGGGAT CTCTCCGCAG TCCTCGGCCA ACTGTCACCG GATTTTTACA GGTTTTCGTG TCCAAATGTA  GATCAGATAG TGTTTGAAAC GATGAGAACG CTGTCAGGCC GATCAAATGT GGTTGCCCCT TCCACTCTGC GCCTCTTTTT TCATGACTGC TTTATTCAGG GCTGCGATGC ATCAATCATG  ATCTCTTCTA CCCCATTCAA CAGGGCAGAA AGAGATTTGG CAGAGAATAA CATTGCCCAA ACAGCATTCG ACACAATCGT TGAGATTAAG AGAGCAGTGG AAAGGGCCTG CCCGGGCGTG  GTGTCGTGTG CGGATATCAT AGCATTAGCA GCCAGGGATT CAGTGGCATT GCTTGGAGGT CCAAATTGGC AAGTCCCAAA AGGAAGATTG GACGGGCTTA CGTCTGAGGC TGCCTCTAGT  TTCGGTAGGA TTCCCTCAGC TAACATCAAC GCTCGCCAAC TCATCAACAC CTTTGCTGCC TCGGGCTTCT CTCTGGCGGA AATGGTGGTT TTATCAGGTG CACATACTGT GGGTTTCTCC  CACTGTCGAG AATTTACCGA TCGGCTCTAC AATTTTTCTC CGGTGATGAG AACTGATCCG AACATGGAGC CGGGCTTCGT CAGAACACTA AAGGCCAACT GCCCCTTACT AGGCGATCCC  TCCAAATTTC AAGCAATTGA TATAAGCACG CCCTTCGTAT TTGATAATAC TTATTTTAAG AATCTGGTAG CAGGCAGAGG GCTTTTGTTC TCAGACCAAG ATCTGTTTAG CGGAGATAAC  GAAACGAGGG ACATAGTAAT GAGGTTGGCG AGCTCTCAGG ATCTTTTTTT CACCAACTTC GCAGCCGCCA TGATAAAGCT GGGGAGCTTG GGAGTCAGAA CTGATCGAAG TGACGGAGAA 
ATTCGCCAAG ATTGCACTGC ATTTAACTCC CATTAA 

Retrieve as FASTA