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Entry information : PtaPrx130(PTA00083703)
Entry ID 12728
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-08 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-04-21 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx130(PTA00083703)
Name PtaPrx130(PTA00083703)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx241]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx130
start..stop		 S start..stop
PtaPrx131 575 0 1..342 1..340
PabPrx226 574 0 1..342 1..341
PabPrx27 547 0 1..342 1..341
PtaPrx15 423 3.55e-149 25..341 49..359
Literature and cross-references PtaPrx130(PTA00083703)
Protein sequence: PtaPrx130(PTA00083703)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   342 (316)
PWM (Da):   %s   36518.44 (33939.1)  
PI (pH):   %s   6.6 (6.61) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-342
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MANIECCKSA LFALLLCAIA AGSVVSDELQ VGFYHATCPI AESIVFEVVE RAFLSSPGTA AGLIRMHFHD CFVRGCDASV LIDSNPKLGI VAEKDAPANN PSLVAFDVID IAKTKLEAIC  PKTVSCADIL AFAARDSVKL ASPPGTPLSL KDYAVPAGRK DGRISLASEV QANVPAPTFN VKQLTQSFSA KGLSQEDMVI LSGAHTIGVS HCSSFTDRLY NFNTTVQTDP SLDPYYANLV 
LKAQCPKGDY RNNQTTVPME SKTSLILDNL YYAEVKAHRG LFTSDAALLT DPNTLNIVNQ NSGIDMIAWH KKFTAAMVKM GQIGVLTGSQ GEIRVNCRCT NN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Incorrect prediction (5' is missing).
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAATA TAGAGTGCTG TAAGTCTGCC CTCTTTGCCC TGTTGCTTTG TGCCATAGCT GCTGGCTCTG TTGTGAGCGA TGAACTTCAA GTGGGCTTCT ACCATGCTAC TTGTCCAATC  GCCGAATCCA TTGTGTTTGA GGTTGTTGAA CGTGCATTCT TGAGCTCCCC TGGAACAGCT GCCGGGCTCA TACGGATGCA TTTCCACGAT TGTTTTGTCA GGGTAGGTCC TCCCAGATCT  ATGATTCAAA TATAATGCTT TGTTTACATC ATAATTTAAT TTCAGATTAT TTTTTCATTT TCCATTTTCT ACCACATCAC CTGTATAGGT TTGTCATAAA TGTCCAATTT TATTTTCATG  GGTGATTTTA AAAATATTTT GGAATTTTAT GGACAAGAAC GAGGTTATTG ATTGGTTTTG TTTGGCAAAC AGTTGGACGA GTGAGATCAA ACCATTGTCA AGATTGTTAT AAATAGGCAT  TTTATCTTGA TTGTGGATTC TGAAAATATT TTAGAATTTC ACTAATAAGA ACAAGGTTAT TGACTCACTC AAACCATTGT CAGGATTGTT ATAAATAAGC ATTTTTATCT TGATTGCGGA  TTCTGAAAAT ATTTTAAAAT TTCACTAATA AGAACAAGGT TATTGATTAC TTAAGTTCCA CAGACATTTA GACAAAAGTG AGATAAAACA TTTTTTTAAA ATAAAATACT TCTTTTCATT  AAAAAAAGAG AGAGTACATT TTCATAGTTT CATGAATTCG TATAGTTTCA TACACTCATA GTATTTTTCT ATCCCAAAAC CATATACATA AAACAACCAT ATTTAAGTGT CTATTTATCC  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GACAGATTGG CGTATTGACT GGCAGTCAGG GAGAAATTCG TGTCAACTGT AGGTGTACCA ACAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAATA TAGAGTGCTG TAAGTCTGCC CTCTTTGCCC TGTTGCTTTG TGCCATAGCT GCTGGCTCTG TTGTGAGCGA TGAACTTCAA GTGGGCTTCT ACCATGCTAC TTGTCCAATC  GCCGAATCCA TTGTGTTTGA GGTTGTTGAA CGTGCATTCT TGAGCTCCCC TGGAACAGCT GCCGGGCTCA TACGGATGCA TTTCCACGAT TGTTTTGTCA GGGGATGCGA CGCCTCCGTT  CTCATCGACT CCAACCCCAA ACTCGGCATC GTTGCGGAGA AAGACGCGCC TGCTAACAAT CCAAGTCTCG TAGCATTCGA TGTGATTGAC ATAGCGAAAA CGAAGCTGGA GGCCATCTGC  CCGAAAACGG TTTCCTGTGC AGACATCCTG GCGTTTGCCG CTCGAGATAG CGTAAAGCTG GCCTCGCCAC CTGGAACACC TCTCAGTTTG AAAGATTACG CTGTTCCCGC TGGACGAAAG  GATGGAAGAA TTTCACTAGC TTCAGAAGTT CAGGCAAATG TACCTGCTCC GACTTTCAAT GTAAAACAGC TCACACAGAG TTTTTCAGCC AAAGGTCTAT CCCAAGAAGA CATGGTTATA  CTCTCCGGGG CGCACACAAT TGGGGTGTCG CATTGCTCTT CATTCACGGA CAGGCTCTAC AACTTCAATA CCACTGTTCA GACGGACCCG TCTCTGGATC CTTATTATGC TAATTTAGTG  CTCAAGGCGC AGTGTCCCAA GGGCGACTAC CGCAACAACC AGACGACCGT GCCCATGGAA AGTAAAACAT CCCTCATCCT CGACAATCTT TACTACGCTG AAGTTAAAGC CCACCGCGGT  CTGTTTACTT CTGATGCGGC TCTGCTCACA GATCCAAACA CACTGAATAT CGTGAATCAA AACTCGGGCA TCGATATGAT CGCCTGGCAT AAAAAATTTA CTGCTGCGAT GGTAAAGATG 
GGACAGATTG GCGTATTGAC TGGCAGTCAG GGAGAAATTC GTGTCAACTG TAGGTGTACC AACAACTAA 

Retrieve as FASTA