View Redoxidase 12890

Entry information : GrPrx32 ( Gorai.010G131800)

Entry ID	12890
Creation	2014-03-17 (Maxime Neel)
Last sequence changes	2014-03-17 (Maxime Neel)
Sequence status	complete
Reviewer	Christophe Dunand
Last annotation changes	2016-02-16 (Christophe Dunand)

Peroxidase information: GrPrx32 ( Gorai.010G131800)

Name (synonym)

GrPrx32 ( Gorai.010G131800)

Class

Class III peroxidase [Orthogroup: Prx005]

Taxonomy

Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium

Organism

Gossypium raimondii [TaxId: 29730 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue type

N/D

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	GrPrx32 start..stop	S start..stop
PtPrx67	576	0	4..348	5..352
GrPrx33	572	0	1..343	15..361
GhPrx33	571	0	1..343	15..361
FvPrx01	544	0	10..347	12..351

Gene structure Fichier

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	28982021..28982266	244	N° 2	28982550..28982738	187	N° 3	28984554..28985168	613
join(28982021..28982266,28982550..28982738,28984554..28985168)

Literature and cross-references GrPrx32 ( Gorai.010G131800)

DNA ref.	Phytozome 12: chr10 (28982021..28985381)
EST ref.	GenBank: CO087369.1

Protein sequence: GrPrx32 ( Gorai.010G131800)

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	349 (322)
PWM (Da):	37879.08 (34825.5)
PI (pH):	8.39 (8.20)	Peptide Signal:	cut: 28 range:28-349

Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MAKATSFTAFLLMSSLFLSSHFSVSKADNSAPIVSGLSWTFYKTSCPKVESIIRKQLQKVFKKDIGQAAGLLRLHFHDCFVQGCDASVLLDGSASGPSEQDAPPNLTLRGFEIINDLRAR
VHKECGRVVSCADIAALAARDSVYLSGGPDYDVPLGRRDGLSFATRNATLQNLPAPFANATAILSSLATKNFDPTDVVALSGGHTIGISHCSSFTGRLYPTQDTTMDQTFAKNLKQVCPT
ANSSNTTVLDIRTPNKFDNKYYVDLMNRQGLFTSDQDLYTNSRTRGIVTSFAVNQTLFFEKFVAAMVKMSQLSVLTGKAGEIRANCSVRNANNNSLLASVVEEEARSEY*

Retrieve as FASTA

Remarks

Complete sequence from genomic (introns 1 and 2) and 1 EST.

Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis

.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2

CTAATTTCTC TTTTCATATT TATTCCTTTC ATTTCTATTC AGACATACAA TTCATTTATG GTTTCAATAA GCTAGAGGAG GGACCGATTG AACATATGTA GTTGAGGATC AAATGATTTA TAATTAAGTT CTGGCTTTTC TCCTATTAAT TATAAACTCA TTTAGTCACA AAGTCATTCC ATTATAGTAT CGTGACTGAG CTCTTCCCAA CGACATACCA TTACGAAAGC AACTATTCAG TGCTCGTCCA ATGACCTTGT CATAAGTGTG TTACCTTCAT ATGATATCCT TGATCTCTTT TAGATAATAT CTATTCTCCC AATATGATCC TATTTTATCT CATGGGAACA ATTACATATT CCTTCATGGA AAGTCAATCA CTATCAAATA GTGATCAAGT CATCCATCAC AAATACGGAC GACCCGTGAC CACATTTACT TTTCATCAAC CATGTAATGT CAATGAGAGG ATATCATTTA CCTGTGTTTT GAGTTATGAA TTCCACTATT GTGAATGACG TTACATACTA CAAAAGTTGT ACATCCAATG CACCAACTTT CGGTTCCTTA TCTATTTGAA CTCAGACTTT TACTTACATC AAAGTGTACA AGTCACGCAT ACATAGTCTG TCGTCTACTC AGGATTTAGG TATGCCACAC TATGAACATC ATAAGTGAAT AAATCCATAA ACGAATTTAG GATCTATTCT GCTTAGGTTA TGTCTGATGT ACTATCAATC CAGTCAGCCA GTCAGTCACA TCTTTGTCTC TATCTTTTGG AAGTCATTCG CTCTGATGCC TAAGACAAGA CATCTCCCAA TTGGACTTGA TAGACGACAT ATTAGTCTTT CAATTAGTTT TCTCATTCCC GATTAGACTA AGGACATATT TAGGTTCATC TACTAATACA AGCTGTCTTT CCGTACTACG ATCCAACCAT GTAATACCGC TTAGCATCAG TTTAAACAAT AGACAACCAA TGAGCGACAT TTTCTTCTAT TTTGCTTTAC GTGCAAAAAT CATTTCAGGA AAATAATACA ATGTATATTA ATGTAATTTA TGAATAATTT TATTAACTAA TCTGCTCGAA AAAATTACAA GTGAACTTAG ATGAAAATAC TACACTTAGG GCACCAGATC TAACATATCA AAGTATACAA GTCACACATA CATAGCTAAT CGTCCACTCA AGATTAATGT ATACCATACT ATGAATGTCA CAAGTGAATA AATCCATAAA CGAATCTAAG ATCTATTCTA TTTGGGTCCT ATCTGTTATA CTGTCAGTAT AGTTAGTCAC GTCTATGTCT TTATCTTTTA GGAGTTTTTC GTTCTAATAC TTAAGACAAG ATATCTCCCT ATGAGACTAG ATAGATGACA TATTAGTCTT TCAAATTGGT TTGCTTATTT CCGATTAAAA TTAAAAAATA TGTTTAGATT ATCTACTAAT ATAAGTTGTC TTTCTGTAAT ATGATCCGAC TACATAATAC CTCTTAGTAT TAATTAAACG TTAGATAACC AATGAGCCAA TATTTGCTTC CATTTTGCTT TGTGCACAAA AAACGGTTGA GAATAATATA CAAAAGATAT TAATGTAATT AATTGATATT TTATTAAACT AATTTATTTG AAAAACACAA GTATACAAAG ACGAAAATAT TACACTAAGA GCACTATATC TAACAAAATA ATATTCCAGT AGATGGAATG TTGAGCTGGT TGGTCCTAAA GAACAACCCA TTTCACTTAC TTATCAATCA ATTTTTCATT GCATCCAAAT AAGGTTCTTT TTATAACTGA TATGATCCGA GATATTCTAA ATATTATTTT AGGTATAAAT CATTCTAGTA AAATCGATTT TGGCTGAAAA ATTTAAAATT TGTTCTAAAA TTGTCTTAAT TTGGTAATTT GTTATTTTTT AATAGCATTT GGGTAAAAAA AAAATCCTAC TATTATGTTA CTGATAAGGG AAAATGTGTT CACCACATGC CATTTCCTAT TTCATTGATT ATTCTCCTAT TTATAGAAAG AATAAAGGTC TTTGTCAAAA TGTTTTCTTT TTTATTCTTC TTTTAAATCT TTACCTTGGA CACGCGTGAA GAAAAGGGGA GATATGTGGA AAATAGAAAT AAAGAGATAA AGAATGGGTT GCTCAGGCTA
TAAATCAGAC TGTTGTGGTC TATCCGAAAC ACAAGAAACA

Retrieve as FASTA

DNA ►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGGCTAAAGCTACATCTTTTACTGCTTTCCTTTTGATGTCTTCTCTATTTCTTTCTTCTCACTTTTCTGTCTCAAAAGCAGACAACTCCGCTCCCATAGTGAGTGGTCTCTCATGGACT
TTCTACAAAACTTCATGTCCCAAAGTAGAATCCATTATTAGAAAACAACTGCAGAAGGTTTTCAAGAAGGACATAGGCCAAGCTGCTGGCTTGCTCCGTCTTCATTTCCATGACTGCTTT
GTTCAGAGGTGCCGGTTAATTAATATGCAAACACAGAGTCTCTTGGAGTAATAGTTATTGTATTCTGAATATTCTTCTTCCTAGAGTATTCTGAATATTACTCACAGCTTGAGTTACAAC
TAAAAGAAGAAATATTGCTTCAAATCCTACCATTTTCAGTTTTCACTAACAAGAATCTGCTTCATTAAAAGACACTTTAATGTGGCTACAGTGAGTTGGTGAATTTTTAATGGAAAATTG
AATATGATCAGGTCATGATTTATATATAATAATAATGAATAAATATTGCAGGGATGTGATGCATCGGTGCTGCTGGATGGATCAGCGAGTGGACCAAGCGAGCAGGATGCTCCGCCGAAC
CTGACCTTGAGAGGATTCGAAATCATCAATGACCTGCGTGCGCGTGTCCACAAGGAGTGTGGAAGAGTCGTCTCTTGTGCTGATATCGCTGCTCTTGCTGCTCGTGACTCTGTTTACCTG
TGGTATATTCTTTTACCACTCAATTTTCTTAAATATTTAAATTACTTCAACTTATTTGATTCTTCGAGTCAAGTTTAGTATTAATTAAACATAATAAATAATGATTTTTTTTTAGAGATA
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GAAAAGAGGTTATATATTAGGTAAAATAAAATTATATATTTTAGTTAAAAGATTTATGATTTGAATATGGTATTTCAATTTACTGATTTATGGGTCTACTTCATATTAGAAATTGAAAGT
TCAAAGGAAGGAAAAGTCAGCTTTTTGGTGCGATAAAGCTTAAATTTCTTAAAGATTAGAGTATGGAATAAATATATTTGTTAGTTTATTTAATTTTTAATACGTTTTCTACATATCCCA
TACTTAAAAAAAAGGAATCATCATTAACAAGGGTGATAACCATAATGAAAAATTTTAAATAATTCCAGTCATTCCATTAAAAGATACCCATTTTAAATCATAAAATTATAGATATTATCA
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GGTAAAACTTTCAAAGCTAAAGTTCAAAAATGGTTGGAGGTTAGGTTTATTTTTTGATAAATAGATAAATGATTTGATTTAAAAGATTTTCCTTTTTTGCTTACCGCAATTAAAGAAACT
TCTGCATAAACTTGTTATATTCACAAAATTATTAAATTAAATTAGATTTGTTTATACAAATCATGCATTGTCCCAACAAAATCTCCTACTAAATTTTGATTGAATATGGTAAATCGAATT
AGACTCTAAAAGAAGATAAACTCTCCTATTTTCTTTCAATTCAAAATGTTATATAAAAGAAATCGAATTTCATTCTAGGGAGCTCATAGATTACCTTCAATCACAACGCTCTAATGATTT
TTTCTTGATTGCTGCAGTCTGGAGGTCCGGACTATGACGTGCCATTGGGAAGGCGGGATGGACTGAGCTTCGCCACAAGAAATGCTACATTGCAGAACTTGCCCGCACCCTTCGCCAATG
CTACCGCCATCCTCTCCAGTCTCGCTACCAAAAACTTTGACCCCACAGATGTTGTGGCTCTCTCTGGTGGCCACACCATCGGCATCAGCCATTGCAGCTCTTTCACTGGCCGCCTTTACC
CTACTCAAGACACCACCATGGATCAAACCTTTGCCAAAAACCTCAAGCAAGTTTGTCCTACTGCAAATTCTTCAAACACCACGGTGTTAGATATAAGGACCCCTAACAAATTCGATAACA
AGTATTACGTTGATCTCATGAACCGCCAGGGTCTTTTCACCTCCGACCAAGACTTGTACACAAATAGTAGGACCAGGGGCATTGTTACTAGCTTTGCTGTTAACCAGACTCTCTTCTTTG
AGAAGTTTGTGGCGGCCATGGTAAAGATGAGTCAGTTGAGTGTCTTGACAGGCAAGGCCGGTGAAATTCGTGCCAATTGCTCCGTAAGGAATGCCAATAACAACTCCCTCTTAGCGTCTG
TGGTGGAAGAGGAAGCTAGGTCTGAATATTAA

Retrieve as FASTA

CDS►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

Retrieve as FASTA

cDNA►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

GGGTTGCTCA GGCTATAAAT CAGACTGTTG TGGTCTATCC GAAACACAAG AAACAACAAG TAGGCATGGC TAAAGCTACA TCTTTTACTG CTTTCCTTTT GATGTCTTCT CTATTTCTTT CTTCTCACTT TTCTGTCTCA AAAGCAGACA ACTCCGCTCC CATAGTGAGT GGTCTCTCAT GGACTTTCTA CAAAACTTCA TGTCCCAAAG TAGAATCCAT TATTAGAAAA CAACTGCAGA AGGTTTTCAA GAAGGACATA GGCCAAGCTG CTGGCTTGCT CCGTCTTCAT TTCCATGACT GCTTTGTTCA GGGATGTGAT GCATCGGTGC TGCTGGATGG ATCAGCGAGT GGACCAAGCG AGCAGGATGC TCCGCCGAAC CTGACCTTGA GAGGATTCGA AATCATCAAT GACCTGCGTG CGCGTGTCCA CAAGGAGTGT GGAAGAGTCG TCTCTTGTGC TGATATCGCT GCTCTTGCTG CTCGTGACTC TGTTTACCTG TCTGGAGGTC CGGACTATGA CGTGCCATTG GGAAGGCGGG ATGGACTGAG CTTCGCCACA AGAAATGCTA CATTGCAGAA CTTGCCCGCA CCCTTCGCCA ATGCTACCGC CATCCTCTCC AGTCTCGCTA CCAAAAACTT TGACCCCACA GATGTTGTGG CTCTCTCTGG TGGCCACACC ATCGGCATCA GCCATTGCAG CTCTTTCACT GGCCGCCTTT ACCCTACTCA AGACACCACC ATGGATCAAA CCTTTGCCAA AAACCTCAAG CAAGTTTGTC CTACTGCAAA TTCTTCAAAC ACCACGGTGT TAGATATAAG GACCCCTAAC AAATTCGATA ACAAGTATTA CGTTGATCTC ATGAACCGCC AGGGTCTTTT CACCTCCGAC CAAGACTTGT ACACAAATAG TAGGACCAGG GGCATTGTTA CTAGCTTTGC TGTTAACCAG ACTCTCTTCT TTGAGAAGTT TGTGGCGGCC ATGGTAAAGA TGAGTCAGTT GAGTGTCTTG ACAGGCAAGG CCGGTGAAAT TCGTGCCAAT TGCTCCGTAA GGAATGCCAA TAACAACTCC CTCTTAGCGT CTGTGGTGGA AGAGGAAGCT AGGTCTGAAT ATTAAGGACT TAACATCTTA ACTATGTTTT TGTATCACAT CTTTTCTTTG TCGGTGTATT TGCTTGCTTA AGTTGGGGTG ACGGGGTTTG TATCCAGTGT TAACTTTTAA TAAAAGTATC CAAACTTTGA TGAAAACCAG ACCAAGTCTG AAATCAACCA GACAAGGAGC TTTACAAATT AGAGCTCAAG TTAATAATAT CAGCCATGGG
ATTAGCTT

Retrieve as FASTA