Entry information : SpolPrx[P]33 (Spipo1G0079000)
Entry ID 13235
Creation 2015-06-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-17 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-06-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SpolPrx[P]33 (Spipo1G0079000)
Name (synonym) SpolPrx[P]33 (Spipo1G0079000)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Araceae Spirodela
Organism Spirodela polyrhiza (great duckweed)    [TaxId: 29656 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SpolPrx[P]33
start..stop
S start..stop
SpolPrx32 468 1.2e-167 2..320 4..324
SpolPrx29 437 1.61e-155 1..320 1..322
CescPrx62 378 4.28e-132 37..320 36..320
CescPrx61 367 4.96e-128 34..319 31..317
Literature and cross-references SpolPrx[P]33 (Spipo1G0079000)
Protein sequence: SpolPrx[P]33 (Spipo1G0079000)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (349)
PWM (Da):   %s   36574.72 (38762.3)  
PI (pH):   %s   10.04 (6.25) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-373
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGSRISREIG FWPYCLACVS VLRQNLQFES GIMKRHPHAE FIVKKVVTKA TKDKGLLADF IRMDFHNCFV RGCNG*ILIN STLNNTAERD SSINNPSLEG FQIINEDKAK LGK*CKGVPF  CTDILTFASR DSFQLSRGFW YEVPSGRKDG TISHSLETFN YLPPPMFNLS QLTQNFARKG LNHDNLVTIS GAHTIGKSHC TSINSRLHNF SSTATTDPSL DPAYAKKLKK KCPKGSTDPN 
LTVPMDPPSP EVFDSSYYKN ILVHKGLFHS D*ALLSSSKT ANLVKQNAAN KHFFKKRFAE AMVKMGNIEV LTRKKEEIRL IFDMKLNNV* 

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Remarks Pseudogene from genomic. Several frame shift and stop in frame. Duplication of Spipo1G0079200
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTCAA GAATAAGTCG AGAGATAGGG TTCTGGCCCT ATTGCTTGGC ATGTGTCTCA GTGCTACGGC AGAACCTACA ATTTGAGTCG GGTATTATGA AAAGACATCC CCATGCAGAG  TTCATTGTGA AGAAGGTTGT AACGAAGGCG ACGAAGGACA AGGGTCTGCT CGCCGATTTC ATCAGGATGG ATTTCCACAA CTGTTTTGTG AGGGTGTGTT GCGTAGCCAG TAATGCCGAT  ATTTTTGTCT CTCATCGAGA AGAGGATTAC GCTCGATTAC CATAACTCGT CAATGCTAGT TTACCTTCAT TCCTTCTGAT GTTTTCAGGT TGCAACGGAT GAATTCTTAT CAACTCCACC  TTAAACAACA CTGCCGAGAG GGACTCATCC ATCAATAACC CTAGCCTAGA AGGGTTCCAG ATCATCAACG AGGATAAGGC CAAGCTGGGG AAGTAGTGCA AGGGTGTTCC TTTCTGCACC  GACATCCTCA CTTTTGCTTC CAGAGATAGT TTTCAGCTGG TAGAATCAAT ACACTAATGT TCTTCACTAG ATCCTGTCAC TTATGAACAT AAGACTTGGT GTCCCTGTGG ATGCGCATGA  CTGCTCGGTT GACTTTGTTC CGTGACAGCA GAGCAGAGGA TTTTGGTACG AAGTCCCCTC AGGAAGGAAG GACGGGACGA TCTCCCATAG CTTGGAGACA TTCAATACTT ACCACCTCCG  ATGTTCAATT TATCACAGCT CACACAGAAC TTTGCCAGAA AGGGTCTAAA TCATGACAAC TTGGTCACCA TATCTGGGCT GAAGAATATA AACGTTTAAA GAGATCTGTC AGTGGAACTT  GAACACAATT GAACCCATAT ATTGTGATTC CTACGATTTT ATTTTCTCAT GCGGAACTAT TCTTGTAATT TCAGGGGCGC ACACCATTGG CAAGTCTCAC TGCACCAGCA TCAACAGTCG  GCTGCACAAC TTCAGTTCGA CAGCCACCAC CGATCCGAGC TTGGATCCGG CTTACGCGAA GAAATTGAAG AAGAAGTGTC CCAAAGGGAG CACCGACCCG AACCTGACCG TCCCGATGGA 
CCCTCCCAGT CCTGAGGTCT TCGACTCTAG CTACTACAAA AATATTCTTG TTCACAAGGG CCTCTTCCAT TCAGACTAG 

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DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCATAA GCTCAAGTCA AATCACAAAC AATAGAAGAA GTATTAACCT CGCATTAGTT CTGAAGGTGT TGAATTACCC CAGTGAATTG GCAACTCGTA TATGAAGTAC ACACTGCCAG  GAGTTGTATC AGTTTCTATG ATGTACTGAC GAATGTTGCC TTGGCACATA CTTTCTTGTC CACGGATAAA CTATTAAGAA AACTTAATGC ACACCCTTTT TTTCTGAAAC GGCAGCCACT  AGCACCTTCA TCCCTTTTAG GGAATTCCGC TTCGTTTAGT TTTCTACTAC TTTAGAGCCG TCAGAAAAAT CAGGCTCCAT TGTTCGTCAT CTTGATAGAA TTACTGATGG CAATCCCACG  TCAACCGCTG TTCTGCGAGT TTACTCTACC TTCATATTTT GCACAGAAAG TTATTGGTAG AGATGTTCCT AGTAGTCAGG TATCAATTTC AGTAGTTCTG TATACAAGTA CCTAAACACA  GATCGCTCAA CTTTGACTAT CCAATTTATG CATGTACTTC ACGGTTTGCC TAATGTTTTG AATTTACTCT AGATTTTCTT GGTCTTGTAG TCAGAGCCTA TCAATAGCAT GGTAGTCTTA  TTTGTTAGAG CAATATCTTT TATGTGACCT CAGAAAAAAG CAATGCTCAC ATTTTATATA ACATGAAGTA AGGTGGAAGA AAGAGAGCAA CTCACCAAAA GAACACTGAC GCAAGGCTTT  TAGGTGGTTT AGAGGTTGAC CTTCTACATT CACGAGTGAT GATGAAAGCT CCACTAGATA TGAAATTAAT ATAAGAAAAC ACTCAAGAAC TTAGATAATA ATTGTTAATC TTGGCCCTTC  CAAGATCTCA AGGAATGAAT CCCTAATCTT AGCCCTTTGA TGCACTCATC AACCCAAAGG AGATCTCCCT TAGAAGTTGT CTCCCAAACA CACACACACA CACACCCTCT CTCTCTAGCT  AATGTAACAA GGGTACAATG GATTTATCCA ACAAGGAGAA AGGACCTGCT ATTTATAAGA ACCTTGGAGC CACCATGGTT ATGTGCCTAG TGAAAACCTT AGGAGATGTT TCTTTCGGGC  TGAATGGTTC CACTTTGTTG CCCATTCACC CAATAGGTGG CCATTGGGTC CGCAAGAAAT GGTCTTTGGT GTGACCATCT CTCCCTTGTA CTGTGTCTCC TCATGCCGCA TTTAAAGGTG  GGCACATTAA ATAACTAGAA GGGTCCATCT TAGAGCCATT CTTTCTTCCA TTTTTCCTAT TTAAGAACTA AGAAGTAGAT TTCAGTTTCT TAGGTTTCCA AAAGCATTGC TTATTATGAT  GATGTCTTTT ATTCTTTAGG TACAAAAAAA ACTTTTATGT GTTGTAGTTG CATTAAGCAA AAATTTTACT TTATTTTGCA TATGATAATG AGAAAACCAC CTTATCTTTC TACCCCAAAC  CTTATTTCCT ATTGATGCCA TTAGGTATTA GTTTTGATAT TACAATTAAT GAGAAAATAT ATTATTAAGA TTGATTTTAT CTACAAGATT ATTATAAATG TTTGGATACT TTTTATGTAT  CAATTCTATT ATTTATCTCA TGTGATTATA TGTAACTTAT TCATCTAAAG GATTGAATGT TTAGATTAAT TGATTTGATG AAATATGTGA AGTATCAAAT TTATGAGAAT AAATATTTTT  TAGCAAACAA ATATTTAAAT AGGTAAATGA TGGTTTTTAT TTTGATATAT TTATCTATAA TCATTTAACC TTTAAATTTA GCCATTTATG CATTAGTCAC GTACATTATG AAAAGAGAAT  AAAAATGATT CAAAATATTA AATGAGTTTT TATCAGTCTT GAACCAAAAA TCTAGATTAT GACACAAAGA CTACTTATGT AGAGAAAATA GTTGACTCAT TGTTCGAATT TGGAGACAAT  GTCAAAATAA AAGTTATTCA TCTATGAGGG ATAAACATCC AATTTAAATT TCAAATCAGA TGAAATAAGG AATAATAAGT TATCAAATTC ACAATAGTCA GAGGTCGTTA CCACATATTC  TGAAAAATTG TAAATATTTG AATCAATCTT CTAAATTTAT GTTTTGAGCA AAAAATGAAA AATCATTAGA GGGTAAAGCC TTACATGAAA GATAAGCTAG AAAAATGAAA AATGAGCATT  CCATCTTGAT CTATCAAGAG GAATCATCCT CACGATCAAG TAATTTTACT ATGGAGCTTC AAACATGTAC ATATTATATC CATCTTCATT GGCTGTTAGT GATCAACAAA ATGCTCAAAT  CTTTTAATAG GCTCTCTATT AGGCTTTAAG ATAATTGGGT TATGAGGGGA AAAGGTTTTT GGGTAAAGGC ATGAGGTGTT CTAAGCCCAA GTTACCCCAG AAGGGGTTAT ATCTCTATAA  AGATCAAACT TGAGTTATTG AGCTGCTGAT CTTGGGGAAT TCAATGTGTA TTTCTATGAG AAATAGTGAA ATATAATAAA CAAGATCCTG TAGAATTAAA AGTGGCCAAG TGAAGGATGA  ACCAATATAA AAAAATTGAG TCTTATTTGT GAAAGAGAGA AAATCACAAG ATAACTTATA GGAGGAAAGA GAAAAAAAGC TCACACATAG ATAATCATGA AGAATAGTGT TAGTAAGTGT  GTCGATACCT TTGTGATTTA GAAAGAAAAT TCAAAATTAT GGAAATACCA ATTCTTTCTC CCTCTTAATA TTTCATGTAG CCTCTTAGAT CTTTCATCTC ATCTACCACA AGACCATCAA  CTAACTACAC CCATTTGGAT TAAGAGGGAC TAAATGTATT GTTATTTTAA GAAAGAAAAG CTGGAAAAAA ATAAATACTA AGTAAAAGAG CCATATTCCT ACTTTTGGGA TATAACTTAC  TTCAAGATAT CATAAGGATC ACGATTCTTT TATGATGTAA ATGGTTTAAA ATAGATATTT GTATTAATAA TATATGTTAA AAGGATATTA TAAATTATGT TTGGGCTATA TATTAAGCAT  AGTAATCAAC ATTACTCTTC AAGATAACCA AGTTACTAGA CATTTAAAAA TTTTTTATTG GAGAATAAGG TTGTTGTTCA ATTTAGCATT AACCTTTAAT CTAGTTTTTC TATTATGGCA  TACGTAAAAA GATACTTGGG ATTGGTTGTG TAGAAGTTAG CCTATGTAAT GTGGAAGACT GTTGGCCAAA AATATTTTTA AATATATGTA ATGCCATCTT TACCAAAAAG ACATTAAATT  CAAGACTATA ATGATATAAA CGTAACAACC AGAGTGTCCA TAATATTGTA GATATATTTA TGTTTATAGA TCTTTTAGAT TTATTAGCAG ATCTTATCCA AACCTAGAAT AGCTCTAGAA  TAGTACATTT AAGCTTCTCA ATATCAAGGA GATCATAAGT GTAATATAAA TCAAAATCAT ATCTGTAAAT GAAAAAAGGA TACTTCCTTG AGATGTAAGC CAACTGAATG AATTGTCGAA  ATCAATCATG GTGCACATTC CATAATTTTT TACGCCACAA TAGAGATGCA AAACATTTTG CTTCAACTTT CATGAATAAA CCTGTTGAAA TATCACAAAA GGAATAAATT CTGACATGAC  TTCGGTATGT ATCTCGTCTT CTAGTGACAT ATTGCAAATA AAGTATATAG TAAATTCACA TGCATATCTG AATCATTTAT TTTTGCAGTT TCAAGTCGTC ATTAGTAATT GGATATTCAT  TTAATATTTT ACCTCTTATA ACAATTTCAA TAGTCATCCA AGTCCACTTT AAGATATTAA ATAAACCTTT TTATAGTTAC ATATATAAGT TTTTATTCAC AATATCACTA TTCACGTTAA  AGTATAATTT TATTTATGCT AACTGAATGA AATGTAAATA GAGTCATGTA ATATGCCATA GGGGGAGAGA GAAATTGAGC AAAATAACTC ATCAAGAAAC ATATTATATT AGGAACAAGT  CCAAACCACT TGACCATTGG ATATTTTGTA ACAATATCAC ATGAACTCAA ATTTCAAAGA ATATTCAGTG TTTTGACCGT GGTCACCTAT CGTGAATCTT ACATCTTATA GGAATGAAAT  TACATCTTAC ATTCGGTGGA AACATGGAGG ACCAAAATTT AAACAAATTA GCTAAAAGAA ATGATGTACT ATAATAGAGA AGATTAGGAA TTTAACTTAT TCTTTGATAG TTTAATATCT  CACCCTATAT TCAGCGAAAT TTATTAATGG ATCAATTTTT CTAATATAAA AAGAAGAAAT CAATTTTAGA GATTTTCTGA AAACCTACTG ATGGGTTTTG AGGGAAAATC AGTCTCTATA  TATAGGCATA ATGTGGCCAA TAGTTGAGCA CTACATCAGT ACAGTTGCGT TCACAAAATT CCTTGCCATG TAACAAACAG ATTTATAGCT CAACCTTAGA GACTTGTGCC CATTCAAAAG  AAAAAGAAAG CGGACAAAGT AGAGCATTTC ACGCCTGTGT CACAAATGTT GCTGAGAAAA CCGTTATCAG TAATCAGGGC AATTTATGAT TAAAATTGAA AATAGACAAA GCAAACAAAG  AGAACTCTAC AAACAGCTAA GATGGCCTTC TTTTGCTTGC ATTGAAGAGG AACTTTTTTC TCAATTATAG TAGCAAGATA AATAAGAAGG GTCAGCATGC ATTCGTAGAT AGTAAAACAG  TAAATACAAT GAAATTTAAA ATAGCTCCAA TTATCCATGC TTCACCTGCT AATTAAATTA GTATATGAAT TGAAGATGCT AGGGGTTTCA ATGGTCATTA TGATCATATT AATAAAAAAA  ATTAGGCGTT TCCGTTTTTT ATCAACTTAG TATTAAGGAA TCCATAAACT GAACTACCTA TTAAGCCATT TTGAATGATG CTTCAGGGTC AAGCTCTTGA CCCCAAGAAC TAAGATCTCG  ACTGACTGAT CTAGATGGCA ATGATTAGTC TGTGCTTGTG ATGGGATCCT CGTTAGGAGG ATCGGATCTG AGTAGATGAG AGGGAACTAG TAGTATAGAT TCTCAATGAA GTAAATGTTG  GCAGGATAGA ACCTCGAGAT GACGGTTCGT TACAAGAAAA AGAAAAGGGA AAAACGGGGG TGGGAAATAT GATCGAGAGG ACTTCTTCGG TGCCTTTTCT GTTCCTGTGA GGGCTATATT  TATAGCCCTC TGTCACCCTG AACAGAGACT TGTTCTACCA CATGCTATGC ACAAGTCCCC ACTTTCCTTC TATAGGTGAG TAACGGTGTC ATAATAATTT GTTTTCTCAC TTGTTAGTTT  TGAAATAGAA CGTTGGTCCT GAAACAACCT TTTACATTCC AGTTTTGTGA AGATCGAGGC AGGTTTCGAT GTCTTGAACC GCAAGATTGT ATTCAGACTA TTGGGCTTAT TGAGGACGAT  TGATCCTGTA TAGTAAACTC TGTCAGTTAA GAGAACTCCG TGTTCTTTGT TATTCGCAAA ATCTTCCAGA AAATGTGAGA GTTACGGGAT TTAATCATGG AATGACTTTG CAGGAGGATT  AGTATTCTCT ACATATTATC CTGACCTCAG TCACAATCCG TTTGAAATAG GTATCGACCA GGGCACCCTC TAAAAGTAGT TGTAAATTGT TACACGAACA TTTATCTGTT TTCTCCATTG  AGCTAGTCTT TGCGTGCCCA GACCGAATGT AAGCGCGCCG AATTAACCTC ACATCAAGGT CAGTCCGAGT TCAAGCTGCT TTTACTAACT CCGTTAAAAT AAACGCGTAA ACCGTTAACA  TAATTCGGCA GAAAAGGCCA ACGGCAATAT TGCCATTATA TTCTGTGCTA TTACTTTTAT TAAATTATTC CCACACTTGC CATATTTTTC TCTACAGCTT AGCGAGAGAT GTTGGCATTT  ATACTCGCCC ACCAAAGCCT GAAGTATCAC ATCTTGGATT GGTTGAACCT AGTCAGAACA ATATTCTTTT ATTCGTCGCC GAAGTAACGT GATTCCGCGT AAATCAAGTT ACGATCAGAT  TATGACAGTC GAGAACTATG CCAATTTGGA TGGTGGCGAT TGGACCACCA AACCCATCTT AAATGGTTCT GGAAGAAAAG AATATTACTA ACGATGGAAG ATGGAATGGA GCTTTCAAAG  TTTCAGCTAT TATGTCCACT TGCCAGATAA TCATCAGACA TATCAAAAGC TAAAAAAAAC CTGATTAAAG ATGTCGTCCC AAGATAACGA AGCGGTTGAG TAGTCAATCG AGATGGATCT  CTTGATGCTG AGAATTTTGC GAAATTTCCC CGTCGGGTTC TGATTTCTCT ATTATTAGAC AGGAACAGCG ACTGGCTCCG TCGGGCCGAT AATAGTTCCT CACCAACTGC TTTCTTCTAG  TCCCGTCATA AGAGACCATC AGTACCGTTC GGGATGAGAG CGTTACCTTG GTACTCTCAT CTGCTCTTTA TCCGGGTTGC ACTTCCCTCC AACCGGAGTT TTCTTTCAGT ACAAATGTAT  AAATGAATAT TCCTAAGAGG AGCCAGAACC AGATTCAAAT TAAAACCATT GAAGATAGGG AAAGCAGAAA CAATGCCAGA GAAATCAGAA GAAAATACAT GATTCTCGTG CCATCATCTT  CTCGACTATC ATAAAGCTGC CATCACATTG AAGTGTGATG GACATGCATC TTTTGTCGGA AGAGCACATC ATATAAATAG CGCTGACCAG CTCCCATGAA TTCAATTTTT CATGCACAAA  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ATAATCAATA ATTTCGATTA AAATACCAGA GGGCTACCGA TGCCCTGGTT ATAAGTGACG TACCAGAATG CATGCAAAGC TATCAGAGAT CGACCGATCA TGGGGTCAAG AATAAGTCGA  GAGATAGGGT TCTGGCCCTA TTGCTTGGCA TGTGTCTCAG TGCTACGGCA GAACCTACAA TTTGAGTCGG GTATTATGAA AAGACATCCC CATGCAGAGT TCATTGTGAA GAAGGTTGTA  ACGAAGGCGA CGAAGGACAA GGGTCTGCTC GCCGATTTCA TCAGGATGGA TTTCCACAAC TGTTTTGTGA GGGTGTGTTG CGTAGCCAGT AATGCCGATA TTTTTGTCTC TCATCGAGAA  GAGGATTACG CTCGATTACC ATAACTCGTC AATGCTAGTT TACCTTCATT CCTTCTGATG TTTTCAGGTT GCAACGGATG AATTCTTATC AACTCCACCT TAAACAACAC TGCCGAGAGG  GACTCATCCA TCAATAACCC TAGCCTAGAA GGGTTCCAGA TCATCAACGA GGATAAGGCC AAGCTGGGGA AGTAGTGCAA GGGTGTTCCT TTCTGCACCG ACATCCTCAC TTTTGCTTCC  AGAGATAGTT TTCAGCTGGT AGAATCAATA CACTAATGTT CTTCACTAGA TCCTGTCACT TATGAACATA AGACTTGGTG TCCCTGTGGA TGCGCATGAC TGCTCGGTTG ACTTTGTTCC  GTGACAGCAG AGCAGAGGAT TTTGGTACGA AGTCCCCTCA GGAAGGAAGG ACGGGACGAT CTCCCATAGC TTGGAGACAT TCAATACTTA CCACCTCCGA TGTTCAATTT ATCACAGCTC  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CGACTCTAGC TACTACAAAA ATATTCTTGT TCACAAGGGC CTCTTCCATT CAGACTAG 

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