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Entry information : StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Entry ID 13518
Creation 2015-12-11 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-11 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-12-11 (Qiang Li)
Peroxidase information: StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Name (synonym) StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx034]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx300
start..stop		 S start..stop
LePrx58 698 0 1..346 1..346
NtPrx88-1A 598 0 1..344 1..344
NtPrx88-1B 592 0 1..344 1..344
MguPrx89 435 3.45e-154 3..338 2..338
Literature and cross-references StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Protein sequence: StPrx300 (PGSC0003DMT400015043)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   345 (315)
PWM (Da):   %s   38873.78 (35567.0) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.65 (8.66) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-345
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEKYSGILLL LLPILMSFVA VSLNAGYANA AVFLPPEDKP LVRHYYKKLN TCANVEPFVQ HQVKLYWDKD KTITAKLLKL LYADCMVNGC DASILLTGPN TERNSSKNAR LDGYLLIDKI  KKVLEIRCPR AVSCADILNL AVRDAVHYAG APSYPVFLGR RDGVESKTEW IDYPSPSMSW EEGLAYFESK NLDVQDFVTL LGAHTMGQAH CSSFYDRLYD FKGTGKPDPS MKRSVLVKLR 
DQCPKNSKND SPVYFTEEYG SNYTFSNKFY TKVLVHESLL RVDQQLSYGG DTGELVNEYA KSLEQFRRGF ALSISRMGGL KVLTGKNGEI RQDCKFTNKN NPNIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns). Containing motif 'YSDC'. chr08:4271499..4277221 forward
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAAT ACTCAGGGAT TCTTCTTCTT CTTCTTCCGA TATTGATGAG TTTTGTTGCA GTGAGCTTGA ATGCAGGTTA TGCAAACGCC GCAGTGTTTT TGCCACCGGA GGATAAACCA  TTGGTGAGAC ATTACTATAA GAAGCTAAAT ACATGTGCCA ATGTGGAACC ATTTGTTCAA CATCAAGTGA AGCTCTATTG GGACAAGGAT AAGACTATTA CTGCTAAACT CCTCAAGTTA  CTCTATGCTG ATTGCATGGT TAATGTATGT CTCTTTGTCT CTCTCTTTTA TTTCCTGCAC AATTTTTAAT ATTAATGAAC GGATATTGTT ATTTTTGTAT TATTCCATTG TTATATTAAA  AAGCGCATGC AATTGAGTTT GAGAAAGTTG GGCAGTGTGA CTGTTTTCTT AGCTTGTTGA ATATGTGACC CATAGATCAC ACAAAGATAA TTTTATCATT GCTGCAAGAC GTACTCTCCT  TCATATTATT TCAGTGCTAT TTTAGTTTCA ATTACTGGAC TATCACTATA ACAAAAACAA CTTTTAGCGG CAATAAATAA ACACATTAAT AAAGAGTGCT AAAGTTTTTT ACCAACACTA  ATTAAGTACC ATTAGGTCCA ATGTCGCTAA AGGCTTTAGG GACATATACA AATAGTGCTA ATTGTCACTA AATATACATA TTTAGACATA ATTGAGCTAT TGCCGTTAAT TAATTAATTG  CCGCTAAATT AAATCATTTT TGATGTAGTG TATAATGATG AATCTAAGAT TTTTAGAATA TGAGTGCATC AACAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAGGAAAAA TGCAGTAAGT  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AAAAATCTTG ATGTTCAAGA CTTTGTCACA CTTTTAGGTA CACAAATATA TGACTTATAT AATTTTCTGT CATTTTAACT GCTTATTATA TGATCATTCA ACTAATAGTT ATTTTCTTAA  GAAGTATCTA GAATCAAGAA AAAAAATATG ATGTTCTGAG AAATCAACCA TTAGGTTAAC ATAACCTTTT TGACACAACT TAGAATAATT CTTCCTTCTT GGTTGTCTTT TTATAGACCC  GAATAGAGTA TTTACAATAT CGCAGATGCC ACCTACTTAG AATTGAGGAG TAGTTGTTTT GAGTTTCCCA CATCACCTAA GCGATGGGGG ACTTGGTCTC TTTATATGTA TTGGGAAATC  CTCAATTCTT GAACTAGCTT TTTGAGAAGT TAGTTCAAGA TTCAATTTCT TTACATGATA TCAAAGCTGA ACCTATTTTA ATTCCATGTT TCACTAACAT TGGGCTTCCA TATATTGTCC  ATGCTCTTAA TTCCACGTTT CACTAATATT GGGCTTCCAT ATATTGTCCA TGTTGTAGTT GACAGGTCTA GACGTAGGTT AGATGTACGA GGGTGTGTTG AGCCTCCTAC TCAGGGATGA  GGCACTTGGT CTCTTCATAT GTCTTGGACA TTAATCCTCA CCTCTTGAAC TAGCTTTTGG GGTCGAGCTA GTCAAACCCA AGATCCACTT TTATATAGTT GTTGTTGTCG TTTCCTCAAC  GTCCTTTTTC ATCTTCTTTA ACGACATTTA AAAAAAAAAA ATACACACTT ACTCTCCCTA GACCCTAGAT TATACTGGAT ATGTTGTTAT TGTTCTAAAC GCCGGCCATT TGGTTCCTAT  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TAAAGTGTTG ACTGGTAAAA ATGGCGAAAT TCGCCAAGAT TGTAAGTTTA CAAATAAGAA CAATCCTAAT ATCAATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAAT ACTCAGGGAT TCTTCTTCTT CTTCTTCCGA TATTGATGAG TTTTGTTGCA GTGAGCTTGA ATGCAGGTTA TGCAAACGCC GCAGTGTTTT TGCCACCGGA GGATAAACCA  TTGGTGAGAC ATTACTATAA GAAGCTAAAT ACATGTGCCA ATGTGGAACC ATTTGTTCAA CATCAAGTGA AGCTCTATTG GGACAAGGAT AAGACTATTA CTGCTAAACT CCTCAAGTTA  CTCTATGCTG ATTGCATGGT TAATGGTTGC GATGCATCAA TTCTACTAAC GGGTCCAAAC ACAGAGAGAA ATTCATCGAA AAATGCAAGG CTAGATGGAT ACTTGTTGAT CGATAAAATA  AAAAAAGTGC TTGAAATTCG ATGTCCTAGA GCAGTTTCTT GTGCTGATAT TCTCAATCTT GCTGTTAGGG ATGCCGTCCA TTATGCAGGT GCACCATCTT ATCCAGTGTT CTTGGGAAGA  AGGGATGGAG TGGAGTCAAA AACTGAATGG ATTGATTATC CTTCACCTTC AATGTCTTGG GAGGAAGGAC TTGCTTACTT TGAATCCAAA AATCTTGATG TTCAAGACTT TGTCACACTT  TTAGGGGCAC ATACAATGGG ACAAGCACAT TGCAGCTCCT TCTATGACCG CCTTTACGAT TTCAAAGGTA CCGGAAAACC AGACCCCAGC ATGAAGAGAT CTGTGTTAGT AAAGCTAAGG  GATCAATGCC CTAAAAACAG CAAAAATGAT TCACCTGTTT ATTTCACAGA AGAATATGGT TCTAACTATA CATTCAGTAA CAAATTCTAC ACTAAGGTTC TTGTTCATGA ATCACTTCTT  AGAGTTGATC AACAATTATC TTATGGAGGT GATACAGGTG AACTAGTCAA TGAATACGCA AAGAGTTTGG AGCAATTTCG AAGGGGATTT GCATTATCGA TTAGTAGAAT GGGAGGTCTT 
AAAGTGTTGA CTGGTAAAAA TGGCGAAATT CGCCAAGATT GTAAGTTTAC AAATAAGAAC AATCCTAATA TCAATTAG 

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