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Entry information : HaPrx45 (HanXRQChr03g0085081)
Entry ID 13599
Creation 2016-05-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-05-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaPrx45 (HanXRQChr03g0085081)
Name (synonym) HaPrx45 (HanXRQChr03g0085081)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx014]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaPrx45
start..stop		 S start..stop
HaPrx96 625 0 1..329 1..329
HaPrx134 620 0 1..328 1..328
HaPrx62 605 0 1..329 1..329
HaPrx74 437 2.94e-155 10..329 7..327
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13599' 'complement(join(142584309..142584730,142588789..142588951,142589089..142589271,142589381..142589602))' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 142589381..142589602 220 N° 2 142589089..142589271 181 N° 3 142588789..142588951 161 N° 4 142584309..142584730 420
complement(join(142584309..142584730,142588789..142588951,142589089..142589271,1 42589381..142589602))


exon

Literature and cross-references HaPrx45 (HanXRQChr03g0085081)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr03 (142589602..142584309)
Protein sequence: HaPrx45 (HanXRQChr03g0085081)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (304)
PWM (Da):   %s   36048.36 (33229.8)  
PI (pH):   %s   5.06 (4.92) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MKLIKMNMGVLTIIIIFEFLVVANSQDQLKVGFYNQVCPKAESVV
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TGSNGNIRRQCTSFN

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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TGTGCGGATATTGTGGCCATGGCTGCAAGAGATGCTGTTGCATTCAGTCATGGACCAGTTTATCAAGTTGAAACAGGAAGGAAGGATGTTCTAGTGTCAAATATTGATCTTGCTAATAGA
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Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TATTTGATAC CACTCTCCCT TCCTTTCTTC ATCCATTTCA TATTCTTTTT AACAAATACA TCATGAAATT GATCAAAATG AACATGGGGG TGCTGACTAT CATAATAATT TTTGAGTTTT  TAGTTGTAGC TAATTCACAA GATCAACTCA AAGTAGGGTT TTACAATCAG GTGTGTCCAA AAGCAGAATC GGTGGTTACT AATATCGTGA GAGACGCAGG AAAGTTCGAC CATCGTATTC  CTCCTGGCTT GCTCAGGCTT CACTTTCATG ACTGCTTTGT TGAGGGGTGT GATGGGTCCA TATTAATAGA TAAGGGTAAC ACTTCAGAGA AAGGTGCATT CGAGCATCAA GGGTTAACAG  GGTTTAACAT AATAGAGGAT GCAAAAGCAA AGTTGGAAAG TATATGTCCT GGTGTGGTTT CGTGTGCGGA TATTGTGGCC ATGGCTGCAA GAGATGCTGT TGCATTCAGT CATGGACCAG  TTTATCAAGT TGAAACAGGA AGGAAGGATG TTCTAGTGTC AAATATTGAT CTTGCTAATA GAATGCCTGA TGTGAGAGAT TCAATTGAGC TTCTGAAACA AAAGTTCATT GAGAAGGGGC  TTAATGAAAA AGACCTTGTG ATTCTTAGTG CTGCACATAC TATTGGTTCA ACTGCGTGCT TCTTCATGGA GGAACGACTC TACAACTTTG CATCGCTTGG TGGTCCAGAC CCGAGTATCA  ACCCTCGTTT GCTACCTGAA CTGACATTGA CATGCCCTAT AAATGGAGAC GTTGGCATCA GATTACCAAT GGATCTTGGG AGTGAAGACA CATTTGACAT TCAAATCCTA CAAAACATTA  GGAGTGGTTT TGCGGTGCTA CAATCTGATG CAAAGCTTAT GGACGACCTG ACAACAAGGG GAATAGTAGA TTCGTATTTC GATGTGTGGG CTCCGTTTTT TGGACCATCA TTTGAGGCGG  ATTTTGTGAT TTCCATGTTA AGAATGGGCA GAATTGGGGT CAAGACCGGT TCTAATGGAA ATATTAGGCG TCAATGTACA TCATTTAATT AACATGATAG AATAAAAGGA GCTAGTGTCT 
CTTG 

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