Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
124 |
PWM (Da): |
14572.38 |
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PI (pH): |
9.67 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MTAWGFRSKQPCGNLAKCFKEVKDDVFQGDDGYPLKACYPLMLHVFFKFLETVIPKYNDFKQPGDRYRSWDLARQERFIVRMCKILSDPRVTHELRSIWISYWTAYQSLGQKIASRLNVH PNY |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Pseudogene from genomic (first 420 aa are missing) |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGACGGCTTGGGGGTTTCGGTCGAAACAACCATGTGGAAATCTAGCCAAGTGTGTGTATACACTTGAGGTGAGTTCATAACCCCTCTTTTCTAATTGTTTTTAAATATCATTGCGACTG ATCATGTAAAAGGAGTTAATTGTCTCGGAAGGGTTTATTAAATCGTATATTGTATATTGACGGTTATAATTTAAGTAGCTGAATGTCCCATTTAGGTGACCTCCAGTGTTGTTTTGAATA GGATTGAAAGGGATATGTTTTAATGAGTTAATTAACCAAAGATTGTGTGAAAAATTTGGGTAACATACTGGTTAAAGGGTTAGTATGTTTAGACATTACAATAGCTTGAAATTGTGAATA CGTGTATTGTTAACCATATAAAATATTTATGTGTTGTAGAGATGATTGTGAGCTGAGTTTAAAGAGGTCAAAGATGATGTGTTTCAAGGTGACGACGGCTACCCACTTAAAGCATGCTAC CCACTGATGTTACATGTGTTCTTCAAATTCTTAGAGAGGTATATATATGCTCTCATAGTGAAATTATATATGTATTAAGATGATAAGTTGAAGTAGATCTGTTTTCTTGATAAATTAAGA TGATAAGTTGAAGTAGATCTGTTTTCTTGATAATAAAATGTGGATTTTTTTTCCAAGAAAGCCCTTTCACCAATGGCTATTGTTGTGCTTCTAAAGGTTACTTTTTCGCTTTCAATTTAA ATTTGTGTTAAATATCATGTATTAGTAGTTTTCTTATGGTGTTGATTGGTTTTTTATTGGTTCGGTTCAACTTTAAAGTGGTTTCAAATGAGAGGAATACAAACCAGTTAAAAACCTACG GTTTGTACCAGCTCTGAACCGGTTCTATATATACCAACTATAAACCGGTTTCTGTTCGGGTTGGTTAGCCGGTTTTAGTTTTCAAACCGGATTGAATGTGCATCTTTACACTCCTCTGCT ACCACACTACACCAACACCCAAACATACTAGCTTCCAGAAACCGCTCATTCATCGTAAATTTTTTACAAGGTTCTTGCTGCTTCCTTCTTATCAACGATTTCAAAAGCTATTGCACCCCT TCTTTTTTTTTTCTTGGTGCTTTTAGTGATTGTTATTGTCATTCCTCAATTTATAAAAATACTAATTAAGGGGTTATGTAACAAAATCGGGTTGTTGATAAGGATCAAGATAGTGGTTCT GCCAATTCTAGGTCTAAGGTCAACGATGGTCGGTGAGTAAATAACTAACCATGTATGTTTCTATAGATCGAAAATAAACTCATGTTATTCAAAATTGTTTGGTTTAGTTTTACAGTGATT ATGACAATTATGTTTTTTGTTTGTTTTGTATTATAATAGGATGAAGATGTGATTGCTTGCATATAAACAAGGGTTTCAGATGAACTAATACATGGTGTTCTCTTTTATAAATAATTCTTA ACAATTTGTGATTTTTTTATTCGATTTTTTCAGTTCAATGTTATAATTTAACATTTTTATAAGTAATGGAATTTTTTCTTTCACTTCAAACGTGTCATTTAAATAAAGTGTCGGTTTGGT CGGGTTAAGAAGGTTACATGTAGAGTTAGTTACTTCGTTTATTTTTTTAATTAAGAAATAAGTTACCTCATGTATTCTTTATTTCTTTATATTTACAAACCGAAAGATAGTATTGTTGAT GCTCCTTAATACCCCCTATTCATGAAATTATAATCAGTGGCGGAGCTTGACCAAAAGTTTCGATGGGGCGTAAAGTGATGGGATCCAACTTTTTTCCTATCGTTATGTTTCGGGTCGGGT CAGCTATTGATTCGGGTCAGGTCAAATAATAATAGTTGCAAATAAAGTCAAAAAATTTCATTCATTCAAAGGACCCGTTCTTACACATAAAAACTTGCGATTAAGTTTATTGTGTGGTGT GTAATCTAGGGTTAAACAAATAAGACTTAAAATATATTTACAAAACTACCCATCACTTATATACAAAGTGATAACAAATTTTACTTTAATTTGTATATTGTATAAATATTTAGGATATAC AAAGTGGTAACAAACTTTACTTTAATTTATATATTGTATAAATATTTAGGAAAAATAATTGGGGGGAGACGATCCTATATAATTTTTAAAATTTTCGGACGAAAAATTGGAACCTGTACA CTTCTAACCGAAACATTGGGGTGGGCGGGTGCACCCCCGAACACCAACTAACCTTCGCCACTGATTATAATATATATTTAATTCATACACTTTAGTATTTCTCATAAGAGTACTGTAGCT ATTGTAGTTGCTTTTAAATTATGTCATATAGCTTTTAATTTTACAGCTCAACTTTCATCTTAATAAATATATATTTGGTACACAGGTAGAGAGAGAACGGACGGGTTGGGTGATGGGCCA CTTGAGTTTGGGCAAAAGGGCCACCTCAATAGTAACAAGCACCAAGTAAATGAATGTGTTTATTTATTTATTTTTTTTATTTTAATTTTGTGAATGCAGACTGTGATCCCAAAATATAAC GATTTCAAGCAGCCCGGAGACAGATACCGATCATGGGATCTAGCCAGAGGTACGTGTTTTATATGGTTTGTTTTTTTAAAATATTCCAAGATGCCATAAATTTGCTAAACTATGTCTGAT CTTTCTATAGGCAAGAGAGATTCATTGTCCGAATGTGTAAGATATTGTCTGACCCACGGGTAACCCATGAACTCCGCAGTATTTGGATCTCCTACTGGACCCAGAGGTTTGTACACGCTT CCCATCTTAAGTCTTACTTTCATTCCCACAAAAGAAAACGTTCATCCATCCCATTATATTTACAAAAAAAATACCTTTAGTATAGTTTAGAACTTCAATGCATCGTGTTCTTAATAAGTT TACGTCAAATGGAAGAAGTTACAGCTGGTAAAATGGGTGGGTTGAGTAACGGATAAACGGGCCAATCTAAACATGTGATTTTTTAGTACGAGCCAAAACAGGCTTAAAAACTTTCTTTAG AAATATATGCTGAGTTGGTACATTTTGGGTGGTGTTGTTGCAGGCTTACCAGTCTCTGGGGCAGAAGATAGCATCACGCCTCAATGTGCACCCCAATTAT |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGACGGCTTGGGGGTTTCGGTCGAAACAACCATGTGGAAATCTAGCCAAGTGTTTTAAAGAGGTCAAAGATGATGTGTTTCAAGGTGACGACGGCTACCCACTTAAAGCATGCTACCCA CTGATGTTACATGTGTTCTTCAAATTCTTAGAGACTGTGATCCCAAAATATAACGATTTCAAGCAGCCCGGAGACAGATACCGATCATGGGATCTAGCCAGGCAAGAGAGATTCATTGTC CGAATGTGTAAGATATTGTCTGACCCACGGGTAACCCATGAACTCCGCAGTATTTGGATCTCCTACTGGACCCAGGCTTACCAGTCTCTGGGGCAGAAGATAGCATCACGCCTCAATGTG CACCCCAATTAT |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGCTGTAGGG GCTGCCGGTG TCAGTTGAAA GCGCCAGTGA ATGACGGCTT GGGGGTTTCG GTCGAAACAA CCATGTGGAA ATCTAGCCAA GTGTTTTAAA GAGGTCAAAG ATGATGTGTT
TCAAGGTGAC GACGGCTACC CACTTAAAGC ATGCTACCCA CTGATGTTAC ATGTGTTCTT CAAATTCTTA GAGACTGTGA TCCCAAAATA TAACGATTTC AAGCAGCCCG GAGACAGATA
CCGATCATGG GATCTAGCCA GGCAAGAGAG ATTCATTGTC CGAATGTGTA AGATATTGTC TGACCCACGG GTAACCCATG AACTCCGCAG TATTTGGATC TCCTACTGGA CCCAGGCTTA
CCAGTCTCTG GGGCAGAAGA TAGCATCACG CCTCAATGTG CACCCCAATT ATTGAACACG GTTATCTTGA GTTTGGGCCC GCTTAAGCTA GATTGATGAT CATGCTATAG TAGGTCCATC
TCTAAGATTG TTATGTTACA CAAGCGGTGT TGTATGTATC AGTCCTACCT TTCGTCTGTA ATATTTTATC ATACTTAAGG AACCTGAAAC TTAGAATAAG TGCACACCTA GATGTGTGAG
T
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Retrieve as FASTA
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