Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein) |
Length (aa):  |
138 (310) |
| PWM (Da): |
15235.39 (34617.3) |
Transmb domain: |
o10-32i39-61o |
| PI (pH): |
8.97 (8.70) |
Peptide Signal: |
cut: 26 range:26-335 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
| *.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2 |
MVHPHSLLVI TINGAGLFIE TVYLLLFLIY SNHKQRIKVL LIMLAEIVFV GVLSALVLTV AEIVFVGVLQ QQSSMVAQPK KTLYDFTVMD AKGNDVDLSV HKGKVVLIVN VASKCGLINN
NYDELNQIYL KYKEKGLH
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Retrieve as FASTA
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| Remarks |
5' part only , 100 AA are missing |
DNA ►
Send to BLAST
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| .........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2 |
ATGAGGAAAA GAAAGGGGTG TCAATCAAAA ACCCTAATTC ACTCTAACGG AGAACAAGAA GATGAATTCA GAGATCAACA GTCTAATGAT TCAGAGATCA ACCCGAATTC AACCAATTGA
TCAAAATTTC AGGCCAACAT TCATCCAGAT CGTGAAGAAA GGGGCAGTGG AGTAGTTCTC ACCGGTGTCG TACCTCGCGA CATTTGTGAA CTGCGGGATA TGGGTGTTGT ACGGGCTGCC
AATGGTGCAT CCACACAGCT TATTGGTCAT CACAATCAAC GGTGCGGGTT TGTTCATCGA GACCGTTTAT CTGCTCCTTT TCTTGATCTA CTCTAACCAC AAGCAGAGGA TCAAGGTGCT
GCTCATAATG CTGGCTGAGA TAGTGTTTGT TGGGGTTTTA TCTGCTTTGG TGTTGACTGT GGCTGAAATA GTGTTTGTTG GGGTTTTACA GCAGCAATCA TCCATGGTTG CCCAACCTAA
GAAAACCCTC TACGATTTCA CAGTCATGGT TTCAACTTTC TCTCTCAATA ACCCTAATTT CAATTTTCAG TTTTGTTTTA TTTTTCTTGT GTGTCTGTAG AATTGATTAA CTATGATTAG
AATTGACATG CTACTCAAAA CCTAGAAATC ATGAACAAGT TAATTCTGCT AATCTGTTTA AAAGATAGAA AAAATCAATC TTTTCTTCTT TTTATGGGGT CAAGTTATTC TACAAAGGCT
TCTAATTGTA AGAAGTGTAA GAAAGATTTA TAGAGTGACA AGTGTCCAAT AAGCTAAAAC TAAACCCACT ACATCACCAC CAAAAACCTA AACACCCACC CCCACCCCAC CCCACCACCA
CCCAAAAACC TAACCCCCCC ACCACCCAAA AACCTAAACC CCCCCCCCCC CGCGGCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAACTA TACCTCACCA GAAAAACCCC
CAAAAAACCT AACCCCCCAC CCCCCAAAAA CCTAAAAAAA CCTAACCCCC CCCCCCCTCC CAAAAAAAAA CCTAAAAAAA CCTAACCCTC CCCCACCCCC CAAAAACCTA AAAAAAATCT
AAAAAAACTA AACACCCACC CCCACCACCA CCCAAAAACC TAAACCCCCA CCCCCTAGGC AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAATTGGGGG GGGGGGTGAT GTGGGGGGGG GGGGTGATGT
GGGGGGGGGG TGGGGGTTTA GGTTTTTGGT GGTGGTGGTG GATGTTTAAG GTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG CAGTGGGGTT TTTTTGTGTA GTGGGTTTTT
TTAGGTTATT GAATACTTAT CACTCTATAA ATCCTTCTTA CACTTCTTAC AATTAGGATC CTTTATATTT GATCCTAATC CCTTTTTATG TTTTAAAAGA TAGAAAAAAT TAAACCTTTT
GTTCTTTTTA TGATAAATCT TGGTGTTTGA CCATGTAAAA TTCTTGTTAC TAATTTCTAA TCATGCATGT GGCTTTTTTA ATGTTTATTA CAGGGTTTTA GTTAGTTAGT TATTGAAATT
GGATTGGAAG TTTCAAGATG TATGTTAGTT TTTCAGTTGG AAGCCTCTGT TTGACACACA AAAGTCAATG ATCCAGATTA AGTCTTTCTT TGAAACTCTA TAGTGTATAT AGTATACACC
TTCAGTTTTT AAATTAACAA AAAAATATTA GGCCTCCAAT ATTAAGTTAA ATTAAATTTA TTAATTAGTT TGGACCTCTG CCATTTACTT TAGGTTGATC TAGCTTTGGA TTGATCTCAT
AAGTTTTGTA TTATTTTTTA GTATTTAATT TGGCTTTTTG GTGATTTAAT CTTCGATTCA GTGCAGGATG CTAAGGGTAA CGATGTAGAC CTTAGCGTAC ACAAGGGAAA AGTTGTACTT
ATTGTTAACG TTGCGTCCAA GTGGTACGCG CTCACTATTT TCACTACTAT TTTGTTTGAA TGTTCTTGCA GCCCATTTGC CCTTTTGTAA TTTAAAAGCA AGCTCAGCTT TTCTTTCCTT
TTTTCTTTTT TTTTTTTGAT ATTTAACTAC CTTTTTAAAT AGGCTTTGTG ATTGTATCTC CTAAAGTTTC TTACAGTCAA TTGTGTTGTT GGTTCTTTGT GGCAGTGGGC TTATAAACAA
CAACTATGAT GAACTGAATC AGATTTATTT GAAGTACAAG GAGAAAGGTT TGTAGTTTTT GGTTTCGGTT TCAAGTTTCA TATAAAACCC GTTTCATTCA TACCGAAGCT GATGTTCAAG
AAGTTAGTTT AGTATGGAGT GATAGGAATT ATGGAAGATG ATGTTTGACT TTTTATTTGT TGCAAAACAT ATAAAAAGAT GGTAAATTGC AGAAAATTAA CCTGTTTGTT AATTTGTTAC
ACCTTTTATA AAGAAAAAAA ATATAATCAT TGCCAGTTAC ACCTTTTATA AAGAAAAAAA ATACGTTCTT TCATTCCAGG TATAAATCGT AAACGTGTTT GTTAATTTGT TTCATTGTGT
GTGTGTAAAT GTATTCAATT GTTTAAAAAT ATCGGAACCT TAGTTGCCGC CACCCATGTT CTTCAAGTTT CTTTGTATTT GATTTCTAAA TATTTGGATT TTGATTTATA GGGCTTCACT
GATTTGGGAA TGTGATGGAA GAGAATATGT AACATCAACT ATCCAGACCG TAGACGCTTT CTTCTTTCTC AAATCATCCA AACCTGCTTG AAAGACTTGT GAATATTGCA GAGGAAGATA
ATGAGAAATT CTGTTTAAAA GTCAAGATCG CATTGACCGG TAATTTAAAC TCAACGTCTT TATCTCGTCT TGAATCATTT CTTCTCGTCG TTTTTAGATT ATAAATGGCT AAAGACTTGC
AAGAGATTTG GTTTTGTAAT AACTTCGTTT GGATTTGTCA TCTTATGACT TACGAGAGAT CGTTTGGTTT AATTTGTTGT TAATTTTGAT TTTTGCGAAT GAGTTGATGG CGGCTGCGGC
GGAGAAGCGA ATGGCAGCAT CTGCATCGGC TGCTGTGGCG AAGAGTGGTT TTCAGTAAGG TATGTTAAAT TCTTCAATTA ATCAAGGTTT TCGGTATCAG CTCTTTGAAA TTAGGGCTTA
GCATTAAAAA TTTTCATTTA TATGGCTATA TTATAAATAA TGTTTGTGCT GATTTGATAT TTTTACTTTA TTCTTGGCCA GTTCCAAATC CTATGTGTAG AAATTGTGCT GAGTACAAAT
ATGTGAGTGA TTTTCTTTAA GATACGTTTT GGTAGTAAGT TTATACGTTT TGGTAGTAAG TTTATATATT GAAGTGGTGA AATATGTGAC TGATTTTCTT GCTATGTTAC AGATTAATCA
ACAGAACGCA GATGGTAATT TATAAGTTTA TACGTTTTAC TTAGTTTAAA TTTATTAGTT TTAATCAGAC ATTATTAATA GTTCTTTATT TGCCTAATAT GAAGGATTTG CAAGGACAAC
CAGGATAAAG CTTTTATAAA TTGCTCAGTT CCACAAAGAG AAATCAAACG CTGACATTAA CGAGGAGTTG GATTTATTTG AAGGATCTTG TGAGGAAGAT GCTTGTAAAA ATACTCGAGG
GAACTCCAGT CAGTTGCCTC AAAAGCAATC TACAGGTACT TATTGTCTTT ATTATGCTTT TGAATACACT GTGTAAGACT TCCGAAGTGA CCCATTTGAG AAAGTTCGTT TGTAGTTAAG
TATGTATAGA TTAATCTGTC TGACCTGCTA GGGATAAAAA TGTAACCAAA GTGTCGTGAT GAATGCCTCA ATAGGATGCT GAACATAGAA TGTGTAAAAG GAACATGCCC ATGTGGCGAT
TTATTTTTAT TATCAAACAT TCAACCATAT AATGAAGCAA TTCGTTATTA TATTAAACTT ATTTTTATTA TCAAACATTC AAGTATTTTA ATGGTGTTGT ATACGATAAC TTTATAAAAC
CTGTTTTGAA TTATGTTATA AATCCTATTA TGTGATATAG AGTTTGTCAT TGAATCAGTT TTGTTAGGTT GTATTTTTGT GAGGTATTTT GTTAGGTTGT ATTTTTGTGA TATAGAGTTT
GTGTGGTATT TTGTTAGGTT GTATTTTTGC GATATAGAGT TTGTCATTGA ATCAGTTTTA TTTCCATGTG TTTGTTAACC GGTAATGTTG ACGTATAAGG ATCTTGATCT TTCTTTGTTG
TCGTTTTGTT TGTTGGCATC TCCGTTTTAT GTGGATTTTG TTGTTGATTT GGATGGTTCG GGTGTTTAGC AGGTAACCTT TGGCCCATCG GATTTGAGTA CTAGAAAGGG ATTTCGAGAT
GTCAATGAAT TTGGCGATTC GGTATCGGGG AAGCCGTTGC AGTTAACAAA TGAGTCCAGT GAATTGTATT TATTTATTTG CTACTTAGAA TTTATGGGTT AAGGTTACTT TTTTATATAT
ATGATAACAT TCGTTGACAT CTGACAAATA CAGAACTCAA GTTCAAACCA TTTGGGCCGC ATTGCTTTGG CGAATCAAAA CAACGAGCAA GAGAATTGTT TTTTGTGAAG ATGTTTTCAG
ATTAAAAAAT GTGAGAACTT GAAGAAAGTC AACTTTGAGA GTAGGTTAAT TATGCCGGTT TTGGATTGAA CATCGTCACT AGATGTTGTA TGAAACTGGA TTGGCTGGTA ATTTCTTTTA
TAAATTGGTT GGATCATTGG TTTTTATGTT GTTGTAATTT TATGGTAATC GGAGGTTTTC AGTTATTTTA ATTCTCAAAA ATTGATTGAT TGAAAATAAA TAAAGAAACA GGGTTTTAAT
GTTGTTTTGA TTGAAATTGT TATGTTTTTT AATATTGTTG TTGACTGATG ATGATTCTGT TATTCACAAT TTAAGTATAT TGCATGCATG TGATCCCAAT TGTGATTTTG TTGATTTATA
TGGATATGTA ATGTAGAAAA AATAGGGTAT TTTGTTCTAA ATGGTTAATT TCCATGAACA TCCTGTTTAA TTTGAGTGTT TATAATCTTA AATGTTTGTG AACAATGTAT GATCAATCTT
AAATTTATGT ATACTGGTCT GCAATTATTT TATTTGTTGG GTTTTAAGGA TTATTATATT TAATTTGCTT TTATGATCTT GATCAGTCTT AAATATGATT TTTCTTCGTC ATATATGGAT
TTTGACCTGA TTTTCTTTTA ATTAAACCGT AGGTGCTTAC GAATGGTATA GAGGTGAAGT TACAATGGAA CGTGCTTAGT GTGATTGAAG CTCCTACTGG TAATGAAGAA GATGATGATG
AGTTTGGGTT GTATTTTATA AACAATAGAC AAGTGTGGGC CAAAGTTAAT CACCATGCTT GGTAGTTGAG CATCATTAGG AAAGATCGAT CAAAGCAAAT CATAGAAATT TATTTGACAA
AAATGTGTTG TTTCTTTTAA TGATTTTGTT ATCATTTTTT TGGCCAAACT AATAGCTGCG ATACTGTACC GGAGAGTCCA GCCGCTCAGC ATCTGATTCG GATCATTCAA CGGAATATAA
TCGGAGATGG GAACCAGAAT CTCTGAATCT CTAGTGAGCT TTTCTGCCCA TGTTTTTCAA TATACATTAC AAGTTCTAAA TTTCAACCCA TGTAAATTTT ATTTTAGAAA AGATAATGAC
TCGCAGTAAA TTACTAAGAG TAGCTTTGAA AAGTAAGCAT GGAGCTTTTG AAAGCCTCAT ATATTCTTTG AGTTGATAAG ATGGGGGACG TTAAAAAACA ATTTAATTCG CCGCTATTCG
CTATTAACAA CTATGACCAA ACCGGTCAGG AACAGACAAC GAATCACTTG CAATTCGGTT ATTCGGTTTG TAACAGTAAC TGAATTGATT ATTCGGTTTG GTTATCAATT ATCCATAGAC
AAAGATGAAG TAGCTTCAAG TAGGGGTGTT CAGTATTCGG CTATTTGGTT CGTAACTGTA ACCGAATTGG TTATTTAGTT ATTCGGTTCG GTTATCAGTT ATCCATAGAC AAAAATGAAC
TAGCTGCAAG AATTAAGATC CAGCCAGATA AAACCAATTC TTCGTTCTGA ACTAATATAT GTGCATATTT TGTAGGAGGT TATACCGATC TTAAACTGGG AAACCGAGAC ATTCAGCAAG
CTCGCGTTAG CATTCATAAT ATTCTCATCA GTCGCAATAT TCCCAACCGT ATTTATACCA TCTATACCCT CCATGTGGGT CACAGGCATG AGCTTCGATT AAACATAGGG ATTTTACTAA
TAATGTTCGG TGTCACTATC GGAGCAACGC TTCCTTATTT CAACGGTTCC CTATTTTACA ACAAAATTCA AGTGAGTATC TTGATCAATT TATCAACATG GTAAGTTGTT TTTTTTTTTT
TTTTTTTTTT TTTTTGCATG GATGATAGGT CTGATTTCGT AGATCTCATT TTAGATTCAC TCTTTTTAAT ATTAGGGAAC TGATTTCGTA TATCATAACT TAATTCAGCT TTTATTGTTT
TGCACATTAA TTGTAGATCA AATGTAAGCG GACACGCTAG AAATTTGCTA AAGAGTGAAG ATCAAACTAA GTACATGGAC TGTTTTAAAG AGTCAAGATT CATGTCATGT TATTTGATCA
TGAGCTCAGT GATGAAGCTG AGTTGTAGAT GAGGATAAGG AGGAACGTCT CTTGAAGATT CTAAGATGGA TAGAAAGATG CTTAAACCAA AGTGCATCGA TTGCTACAGA TGAATTAAAA
CACTCTATCA AACACCAAAC ACTCATATTG ATGGTATTTA CTCTTCAACA CATTTTTTGT TACTTAAATA GTTTATCCTT ATAGTTTATT TATTTATAGT AACTATTGGT TTGGAACAGT
GTTGGTTTGG AATATATTGG TTTGGAACTA AATGATGTAT TAGATAATAT ATTTTTAATT ACTGCGTTTT CTGTGTT
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Retrieve as FASTA
|
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CDS►
Send to BLAST
|
| .........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2 |
ATGGTGCATC CACACAGCTT ATTGGTCATC ACAATCAACG GTGCGGGTTT GTTCATCGAG ACCGTTTATC TGCTCCTTTT CTTGATCTAC TCTAACCACA AGCAGAGGAT CAAGGTGCTG
CTCATAATGC TGGCTGAGAT AGTGTTTGTT GGGGTTTTAT CTGCTTTGGT GTTGACTGTG GCTGAAATAG TGTTTGTTGG GGTTTTACAG CAGCAATCAT CCATGGTTGC CCAACCTAAG
AAAACCCTCT ACGATTTCAC AGTCATGGAT GCTAAGGGTA ACGATGTAGA CCTTAGCGTA CACAAGGGAA AAGTTGTACT TATTGTTAAC GTTGCGTCCA AGTGTGGGCT TATAAACAAC
AACTATGATG AACTGAATCA GATTTATTTG AAGTACAAGG AGAAAGGGCT TCACTGA
|
Retrieve as FASTA
|
|
cDNA►
Send to BLAST
|
| .........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2 |
ATGAGGAAAA GAAAGGGGTG TCAATCAAAA ACCCTAATTC ACTCTAACGG AGAACAAGAA GATGAATTCA GAGATCAACA GTCTAATGAT TCAGAGATCA ACCCGAATTC AACCAATTGA
TCAAAATTTC AGGCCAACAT TCATCCAGAT CGTGAAGAAA GGGGCAGTGG AGTAGTTCTC ACCGGTGTCG TACCTCGCGA CATTTGTGAA CTGCGGGATA TGGGTGTTGT ACGGGCTGCC
AATGGTGCAT CCACACAGCT TATTGGTCAT CACAATCAAC GGTGCGGGTT TGTTCATCGA GACCGTTTAT CTGCTCCTTT TCTTGATCTA CTCTAACCAC AAGCAGAGGA TCAAGGTGCT
GCTCATAATG CTGGCTGAGA TAGTGTTTGT TGGGGTTTTA TCTGCTTTGG TGTTGACTGT GGCTGAAATA GTGTTTGTTG GGGTTTTACA GCAGCAATCA TCCATGGTTG CCCAACCTAA
GAAAACCCTC TACGATTTCA CAGTCATGGA TGCTAAGGGT AACGATGTAG ACCTTAGCGT ACACAAGGGA AAAGTTGTAC TTATTGTTAA CGTTGCGTCC AAGTGTGGGC TTATAAACAA
CAACTATGAT GAACTGAATC AGATTTATTT GAAGTACAAG GAGAAAGGGC TTCACTGATT TGGGAATGTG ATGGAAGAGA ATATGTAACA TCAACTATCC AGACCGTAGA CGCTTTCTTC
TTTCTCAAAT CATCCAAACC TGCTTGAAAG ACTTGTGAAT ATTGCAGAGG AAGATAATGA GAAATTCTGT TTAAAAGTCA AGATCGCATT GACCGGTAAT TTAAACTCAA CGTCTTTATC
TCGTCTTGAA TCATTTCTTC TCGTCGTTTT TAGATTATAA ATGGCTAAAG ACTTGCAAGA GATTTGGTTT TGTAATAACT TCGTTTGGAT TTGTCATCTT ATGACTTACG AGAGATCGTT
TGGTTTAATT TGTTGTTAAT TTTGATTTTT GCGAATGAGT TGATGGCGGC TGCGGCGGAG AAGCGAATGG CAGCATCTGC ATCGGCTGCT GTGGCGAAGA GTGGTTTTCA GTAAGTTCCA
AATCCTATGT GTAGAAATTG TGCTGAGTAC AAATATATTA ATCAACAGAA CGCAGATGGA TTTGCAAGGA CAACCAGGAT AAAGCTTTTA TAAATTGCTC AGTTCCACAA AGAGAAATCA
AACGCTGACA TTAACGAGGA GTTGGATTTA TTTGAAGGAT CTTGTGAGGA AGATGCTTGT AAAAATACTC GAGGGAACTC CAGTCAGTTG CCTCAAAAGC AATCTACAGG TAACCTTTGG
CCCATCGGAT TTGAGTACTA GAAAGGGATT TCGAGATGTC AATGAATTTG GCGATTCGGT ATCGGGGAAG CCGTTGCAGT TAACAAATGA GTCCAGTGAA TTAACTCAAG TTCAAACCAT
TTGGGCCGCA TTGCTTTGGC GAATCAAAAC AACGAGCAAG AGAATTGTTT TTTGTGAAGA TGTTTTCAGA TTAAAAAATG TGAGAACTTG AAGAAAGTCA ACTTTGAGAG TAGGTTAATT
ATGCCGGTTT TGGATTGAAC ATCGTCACTA GATGTTGTAT GAAACTGGAT TGGCTGGTGC TTACGAATGG TATAGAGGTG AAGTTACAAT GGAACGTGCT TAGTGTGATT GAAGCTCCTA
CTGCTGCGAT ACTGTACCGG AGAGTCCAGC CGCTCAGCAT CTGATTCGGA TCATTCAACG GAATATAATC GGAGATGGGA ACCAGAATCT CTGAATCTCT AGAGGTTATA CCGATCTTAA
ACTGGGAAAC CGAGACATTC AGCAAGCTCG CGTTAGCATT CATAATATTC TCATCAGTCG CAATATTCCC AACCGTATTT ATACCATCTA TACCCTCCAT GTGGGTCACA GGCATGAGCT
TCGATTAAAC ATAGGGATTT TACTAATAAT GTTCGGTGTC ACTATCGGAG CAACGCTTCC TTATTTCAAC GGTTCCCTAT TTTACAACAA AATTCAAGTG AGTATCTTGA TCAATTTATC
AACATGATCA AATGTAAGCG GACACGCTAG AAATTTGCTA AAGAGTGAAG ATCAAACTAA GTACATGGAC TGTTTTAAAG AGTCAAGATT CATGTCATGT TATTTGATCA TGAGCTCAGT
GATGAAGCTG AGTTGTAGAT GAGGATAAGG AGGAACGTCT CTTGAAGATT CTAAGATGGA TAGAAAGATG CTTAAACCAA AGTGCATCGA TTGCTACAGA TGAATTAAAA CACTCTATCA
AACACCAAAC ACTCATATTG ATGGTATTTA CTCTTCAACA CATTTTTTGT TACTTAAATA GTTTATCCTT ATAGTTTATT TATTTATAGT AACTATTGGT TTGGAACAGT GTTGGTTTGG
AATATATTGG TTTGGAACTA AATGATGTAT TAGATAATAT ATTTTTAATT ACTGCGTTTT CTGTGTT
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Retrieve as FASTA
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