Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
315 |
PWM (Da): |
33283.92 |
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PI (pH): |
6.15 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MGFLRTVAAASTTTAITAALTLNSISPSSSSSHNNHNFTKPFFNQPFSSPNRFGLIKNLTSPPSALHMDTKQAPKLDAELPEVMTEFMVDMSCEGCVKAVKNKLQTVNGIKSVDVDLSNQ VVRIFGSSPVKTMAEALEQTGRKARLIGQGLPGDVLITAAVAEFKGPQIFGVVRLAQVSMELARIEANFSGLSPGKHGWSINEFGDLTRGAASTGKVFNPVNQLSEEALGDLGTLEADEN GEAFFSGVKKNLKIADLIGRAIAVYENEDRGDAGLAAAVVARSAGVGENYKKLCTCDGTTIWEATNADYVSSKV |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
SOD copper chapperone containing two domains: Heavy-metal-associated domain (HMA) and Copper/zinc superoxide dismutase. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGTTTTCTTAGAACAGTTGCAGCAGCGTCAACAACTACGGCCATTACAGCAGCACTCACCCTTAACTCCATTTCACCATCTTCATCCTCATCACACAATAATCACAACTTCACAAAA CCCTTTTTCAATCAACCCTTTTCATCCCCAAATCGTTTCGGCCTCATCAAGAATCTCACCAGCCCCCCTTCTGCTCTTCACATGGACACTAAACAGGCTCCAAAGAGGTTGCAACTTTTT GCTTCAATTTGAACAATTGAATTGAGTTCAATATGGGTTTTGGTTTTAATTTGTGGGTTTTTGTTTTCTTGCAGCTTGATGCGGAATTGCCGGAAGTTATGTGGTGCGTTTTTTTTTTAA AATTATTGTTTTTCTGTTGGGTTTTTGATTGGAATAATCTTGTGGTTTCTAGGGTTTCTTTGTTAATTTGGGAATAGTTAAGTTGATATGGATTGGTTAATAGAAATTAACAGAAACTAG GGGTGTTGATCGTGTTTATTATTCGGGTTTCGGGCAGTTCGGGTGGGGTTTTTTTGTGTATGATGCTGTATCTGATAACCGATCCATATCACTATCAGGTTCAGTCGGGTTGTTTGGTTA TCGGGTTATCGGGTCTGGTAGTTCGAGTTTGGACATATTTGTTAATAACTCTCTTACTATTTGGAAAGTTATGTTTACTCAGGAATTCTTGATAACATGCCAAACGAAACCAATGTAATT CGGGTTTTGGGTTAATCAGTTTGGTTTATTTGAGTTTTTGATGTTTATATAGGTCGATTTGGCACCCGGCCCTAATAACAATCGGTTTAATCGGTTTTCGGGTAACAGGTTTGTTCGGGT TGGGTTAATCGGGTATGGGTGAAAGCGGGTCAGGCCGTCAAGTTACTCGGGTATGGCTAAAATCGGCGTGCCTAAACAGAAACCTTAAAAATTGAAAATGTGGGATTAAGTTTTGGTAAT CTGAGATCTTGTATTCCTGCAATTACAGACAGAGTTCATGGTGGATATGAGTTGTGAAGGTTGTGTTAAAGCTGTCAAGAATAAGTTGCAAACAGTCAATGTGGTCAGTATTATGAGCAC GATCACATTACAGTTGGTGTTTTATGTGTTTAACATCTTGTTTATATTATGTTCTTATAGGAATTAAGAGCGTTGATGTGGATTTGAGCAATCAAGTAGTTAGAATTTTTGGGTCTTCAC CGGTTAAGACCATGGCTGAAGCCTTGGAGCAGACCGGTAGGAAAGCCCGGCTAATTGGTCAAGGGTTACCAGGAGAGGTTAGTGAGTCAAATAATTCATTTCAAAACACATTCAAAGACC CTCTAAACTCTCTTTCTGCCCATTTTGCCATTCAGATGTCTTAATTACTGCTGCTGTTGCTGAATTCAAAGGCCCACAAATATTTGGGGTGGTCCGTCTGGCCCAAGTGAGTATGGAATT GGCTAGAATCGAAGCCAACTTCAGTGGGTTGTCACCTGGAAAACACGGTTGGTCCATCAACGAATTCGGTGATCTTACTCGAGGTGCCGCCAGTACTGGCAAAGTGTTTAATCCTGTTAA TCAGCTCTCAGAAGAAAAGAGGTCAGATTTTATTAACATATCAATAACTTTTAATTGGTGTAGTGTAGGCTGTTTATTATACGGTTAATACCATATCCCTGAACTTAATTTTGGTATATT AAAGTCCCAAACTTGTCAAAAATACACACAAAAAGTCCCTCAACCTAATATCGGTATATTCAAGTCCCTAAACTTTTGTATAATGCATGTACATGTGAAATAAAAATAAAATAATGACTT ATTACCCACCAGTAAGGGTGTAAATGAGCCGAGCCGAGCCGAGCCGAGCCTGAGCCTTCTACTACTCGAGCTCGGCTCATCATATTTTTTGAAGCTCGACCTCGGCTCGGTTCCAGCCTA CTATTTTGAGATCGAGTTCGGATCGCAAGTAACACCCAAAGATCGAGCTCGGCTTGGCTCGAGGTAATTTGAGAACTATCTCAAACAAGCTAAAAGCTCGGCTCAAGCTCGCTTCGATAT AGCTTAAACGATCCAAAGCTCGTCTCGCCAATGTTACAATAGTTGTATTTTATATATAAAAATAATTTAAAATTACGTTTGGGCTTGCAGGCCTAAGCGAACTTTGTATGTCTAGCTCGA GCTCGGACTCGATAACCAAAGTCCAAACGAGTCATGTTTTAAGCTCGGGCCCGGGCCCGGGCTTGTTTGAGCTTTTTATCAATCTGATCCCGAGTAGCCCTCAAGCCGCTGTGCATCGTT CACACTCCTACCCACCAGTCAAAATTAGATAAAGTGATATTCAATACTTTTTGCACAAAACAATTCAGACCATCTTATTTTTATCAATTTAAGAGCTAACAAGTTATGCTAAAAAAACTT ATTAGTACGTTCATTTTTATACAAATTTATTGACTTTTTAATATGCTAATTAGAGACTTTTTCGTGTATATTTTACAAGTTTAGGTTAATTGAATTTCATATACTAAAATTGGAGACTTA TTTGTGTATATTTTCAAGTCTAGGGACTTTAACATATACTAAAATTAGAAACTTTTTCGTGTATTTTTATAAGTTTAGGGACTTTAATGTACCAAAAATTAGTTTGGATTTTTTTGCAAA AAGAAAACGAAAGTATGTTGGTTTTTTATGGCATTAACCTTTTCTTATATGAAAAAGTAAATCGTCTTCTGGTTAAATAATAATATATGTAGGCGCTCGGTGACCTGGGAACACTAGAGG CTGATGAGAACGGTGAAGCGTTCTTCTCGGGTGTGAAAAAGAACCTTAAAATCGCGGATCTTATTGGTCGAGCAATAGCGGTGTATGAAAATGAAGACAGAGGTGATGCTGGGCTTGCGG CAGCGGTTGTAGCAAGAAGTGCAGGAGTTGGTGAGAACTACAAGAAGCTCTGCACCTGTGATGGCACCACCATTTGGGAAGCAACCAATGCTGATTATGTATCCAGTAAAGTT |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGTTTTCTTAGAACAGTTGCAGCAGCGTCAACAACTACGGCCATTACAGCAGCACTCACCCTTAACTCCATTTCACCATCTTCATCCTCATCACACAATAATCACAACTTCACAAAA CCCTTTTTCAATCAACCCTTTTCATCCCCAAATCGTTTCGGCCTCATCAAGAATCTCACCAGCCCCCCTTCTGCTCTTCACATGGACACTAAACAGGCTCCAAAGCTTGATGCGGAATTG CCGGAAGTTATGACAGAGTTCATGGTGGATATGAGTTGTGAAGGTTGTGTTAAAGCTGTCAAGAATAAGTTGCAAACAGTCAATGGAATTAAGAGCGTTGATGTGGATTTGAGCAATCAA GTAGTTAGAATTTTTGGGTCTTCACCGGTTAAGACCATGGCTGAAGCCTTGGAGCAGACCGGTAGGAAAGCCCGGCTAATTGGTCAAGGGTTACCAGGAGATGTCTTAATTACTGCTGCT GTTGCTGAATTCAAAGGCCCACAAATATTTGGGGTGGTCCGTCTGGCCCAAGTGAGTATGGAATTGGCTAGAATCGAAGCCAACTTCAGTGGGTTGTCACCTGGAAAACACGGTTGGTCC ATCAACGAATTCGGTGATCTTACTCGAGGTGCCGCCAGTACTGGCAAAGTGTTTAATCCTGTTAATCAGCTCTCAGAAGAAAAGGCGCTCGGTGACCTGGGAACACTAGAGGCTGATGAG AACGGTGAAGCGTTCTTCTCGGGTGTGAAAAAGAACCTTAAAATCGCGGATCTTATTGGTCGAGCAATAGCGGTGTATGAAAATGAAGACAGAGGTGATGCTGGGCTTGCGGCAGCGGTT GTAGCAAGAAGTGCAGGAGTTGGTGAGAACTACAAGAAGCTCTGCACCTGTGATGGCACCACCATTTGGGAAGCAACCAATGCTGATTATGTATCCAGTAAAGTT |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
TTCTCCATGG TTTTTCAACC ACAAGAGTGT CATCACATCA AGTCATGAAT GGCATGCATC CGGATGCCTC TAGAACCCAC ACCAGAATTT TAATAATAAT AATAATAATA CCTTAATATT
ATTATTCGAT TTTCATTAAA TTCGTCTATT CACAATGGGT TTTCTTAGAA CAGTTGCAGC AGCGTCAACA ACTACGGCCA TTACAGCAGC ACTCACCCTT AACTCCATTT CACCATCTTC
ATCCTCATCA CACAATAATC ACAACTTCAC AAAACCCTTT TTCAATCAAC CCTTTTCATC CCCAAATCGT TTCGGCCTCA TCAAGAATCT CACCAGCCCC CCTTCTGCTC TTCACATGGA
CACTAAACAG GCTCCAAAGC TTGATGCGGA ATTGCCGGAA GTTATGACAG AGTTCATGGT GGATATGAGT TGTGAAGGTT GTGTTAAAGC TGTCAAGAAT AAGTTGCAAA CAGTCAATGG
AATTAAGAGC GTTGATGTGG ATTTGAGCAA TCAAGTAGTT AGAATTTTTG GGTCTTCACC GGTTAAGACC ATGGCTGAAG CCTTGGAGCA GACCGGTAGG AAAGCCCGGC TAATTGGTCA
AGGGTTACCA GGAGATGTCT TAATTACTGC TGCTGTTGCT GAATTCAAAG GCCCACAAAT ATTTGGGGTG GTCCGTCTGG CCCAAGTGAG TATGGAATTG GCTAGAATCG AAGCCAACTT
CAGTGGGTTG TCACCTGGAA AACACGGTTG GTCCATCAAC GAATTCGGTG ATCTTACTCG AGGTGCCGCC AGTACTGGCA AAGTGTTTAA TCCTGTTAAT CAGCTCTCAG AAGAAAAGGC
GCTCGGTGAC CTGGGAACAC TAGAGGCTGA TGAGAACGGT GAAGCGTTCT TCTCGGGTGT GAAAAAGAAC CTTAAAATCG CGGATCTTAT TGGTCGAGCA ATAGCGGTGT ATGAAAATGA
AGACAGAGGT GATGCTGGGC TTGCGGCAGC GGTTGTAGCA AGAAGTGCAG GAGTTGGTGA GAACTACAAG AAGCTCTGCA CCTGTGATGG CACCACCATT TGGGAAGCAA CCAATGCTGA
TTATGTATCC AGTAAAGTTT AATCCAAACC GTTTAAACAC ATTTTGTTTG TTTGTTTGTT TTCAATAAAG TTTAATCCGA TACAGTTTAA ACTATACCTA GGTGTGATTT GAATGCAGAG
AGATTGTTTT ATGTCAATTT GATTGTATCT ACTTGTCTTT ATGTGTTGAT ATTATTGCAC CATCTCTATG TTAAGGGGTC AATGAGCAGT GGCGGATCTA GAAAACTTTC ATAGGGGTAA
CGTCTTAAAA GAAAGGGGTA ACGAAATCGA AAAA
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Retrieve as FASTA
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