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Entry information : HaRboh04 (HanXRQChr05g0155831)
Entry ID 13780
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh04 (HanXRQChr05g0155831)
Name (synonym) HaRboh04 (HanXRQChr05g0155831)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh04
start..stop		 S start..stop
HaRboh11 1688 0 26..930 13..913
HaRboh01 1556 0 25..930 14..917
HaRboh10 1526 0 1..930 3..928
NbRboh02 1493 0 25..930 16..939
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 191014291..191014912 620 N° 2 191014041..191014203 161 N° 3 191013610..191013658 47 N° 4 191013257..191013370 112
N° 5 191012733..191013155 421 N° 6 191012026..191012409 382 N° 7 191011846..191011941 94 N° 8 191011619..191011734 114
N° 9 191011427..191011529 101 N° 10 191011099..191011166 66 N° 11 191010446..191010990 543 N° 12 191010075..191010184 108
complement(join(191010075..191010184,191010446..191010990,191011099..191011166,1 91011427..191011529,191011619..191011734,191011846..191011941,191012026..1910124 09,191012733..191013155,191013257..191013370,191013610..191013658,191014041..191 014203,191014291..191014912))


exon

Literature and cross-references HaRboh04 (HanXRQChr05g0155831)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr05 (191014912..191010075)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr05g0155831
Protein sequence: HaRboh04 (HanXRQChr05g0155831)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   930
PWM (Da):   %s   103800.02 Transmb domain:   %s   o371-393i513-535o555-577i735-752o
PI (pH):   %s   8.86
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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Remarks
DNA ►
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Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
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GCACTTTTTGGAGAATGCATTGGGATGAACAAGGATTCGAAAGACTTTGCCGGAGAACTCTTCGATGCACTTAGCCGCAGACGGAATATCACCGGAGCCGTGATTAACAAAGCTCAGTTA
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Retrieve as FASTA  
cDNA►
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