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Entry information : HaRboh05 (HanXRQChr06g0166241)
Entry ID 13781
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh05 (HanXRQChr06g0166241)
Name (synonym) HaRboh05 (HanXRQChr06g0166241)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh05
start..stop		 S start..stop
PtRboh03 1516 0 5..927 7..948
CcaRboh05 1510 0 5..927 6..945
CcaRboh01 1510 0 5..927 6..945
AeveRboh05 1509 0 5..927 6..924
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13781' 'join(5219154..5219742,5219994..5220153,5220241..5220289,5221794..5221907,5224855..5225277,5225839..5226225,5226302..5226397,5227049..5227164,5227263..5227430,5227752..5227911,5227986..5228189,5228279..5228407,5228476..5228554,5228742..5228851)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 5219154..5219742 587 N° 2 5219994..5220153 158 N° 3 5220241..5220289 47 N° 4 5221794..5221907 112
N° 5 5224855..5225277 421 N° 6 5225839..5226225 385 N° 7 5226302..5226397 94 N° 8 5227049..5227164 114
N° 9 5227263..5227430 166 N° 10 5227752..5227911 158 N° 11 5227986..5228189 202 N° 12 5228279..5228407 127
N° 13 5228476..5228554 77 N° 14 5228742..5228851 108  
join(5219154..5219742,5219994..5220153,5220241..5220289,5221794..5221907,5224855 ..5225277,5225839..5226225,5226302..5226397,5227049..5227164,5227263..5227430,52 27752..5227911,5227986..5228189,5228279..5228407,5228476..5228554,5228742..52288 51)


exon

Literature and cross-references HaRboh05 (HanXRQChr06g0166241)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr06 (5219154..5228851)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr06g0166241
Protein sequence: HaRboh05 (HanXRQChr06g0166241)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   927
PWM (Da):   %s   105743.08 Transmb domain:   %s   o363-382i502-524o544-566i723-740o
PI (pH):   %s   9.22
Sequence
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Send to Peroxiscan
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Remarks
DNA ►
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CAAAACACCCCTTGATCCGCCACTGAGACTGGGTGGTGTGGTCTCACGCCTCTAGGGGCTTTATCACGCTACATAAGTGTCATGTAGGCAACACATAAGTGTGGGGCCTAACGTTAACTT
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AAGTAAACATTTAAAGTATGCAAGTGTGTTATATGGAACTGGTATACTAAACATATAAGGGGGGTTGGTGAGGACTTTTTCTTAAACATTAGAGAAATTAAGATCAAATTTGAAAAATGT
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AGGTGTGTGGGTTCCACCTTTTACCTTTTCACTTTAACAATATATAATTTTATATATACATATTGTTTATAAAAATTATGATTAATTTATGCCCGTTTAGAGTTATATAGGCTTTATAAC
TGATTGTTGCACAAGAAAATGTCAGAGAATGTTTTTTGTTCCATGTATACGGGTCGTATAACATTTTACGACTCGTATAGAATGTTATACGACCCATATGATGTTATACGACTCAATATT
TGTTAAGTCAGATTATTCTATATGGGCGTATAACGTTATACGACCCGTATATAGGGTGTGAAATTAAGATATTAAGGTGTGACTTTATTAGGACCCTTAATTTAATTTAATGAACGTATA
TAACAATCTATGTACGCCTCTTCCTATTTAAATGTTTAGTGTCGTTTTAATACTTCTTCCATTCAAGTAATAAGTCTTATTTTCTTGTATGTTATAATAATAAATAGCCATCATGAAATC
ATCTATTTTGACACATCTTCTATATATCTGTTTCATTATCACATGTGGGTATTTTATACAAGTAGTTAATAATTAGGTATGTTAATTATAATTTATGTTAAGGTCAATCACCCTATTTCT
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GGCAGGAGGGGTCCCCGATTGCAAATCGGTGGGTACCCCGCCCACCCTAACTTTTAAAATTTTACATATCATCTATGCTATGTGCTTAATTAATACCCCATATTTAACCCAAAGTTAGAT
GAAAAAAAATAATATGAGAGAGAGTTATATATATTTGACTTTGGAATAAATATTAATAGAAGGTGAGGTGTCCTCATCAAAAATATTTAGCCATGTGAAATAGAATAATGAAGTTGAAAT
ATTTATTGTAGTAGGATGAACATGATAGAATTCATGAAACCAGGGAATATTGCCTAAAAGGATATAATATATTTTTTTTTTCACTTAATTAAATCAAGTTGTGTATGTTAGATTTCAAAG
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TTGTTCAACTGCTGTCTTTAGGAAGGAAAATATACAACACAAATTCTTAAAAGTCTATAAATTACTAACTTTAGGTTAAAATACTGTTTTAAAACAAAATAAAACATTATCCTCAAGCAT
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GATGTCTTTTGGCTTAGTGGCACCAGATGTTTATGACTATATCACCAACAAAGTGGTGCGGATTCAAATCTCACAAAGTGAACAATAGGTGGATTCTAAAAGTATATTTTAGATTAGTGT
GTGTTCGTCGTTAAAATAATAAAATATTCCATCTAAGATGATGAAGTTGTTTTATTCTTTAGAAAAGAGTAAATAACGATTTTGGCCCCTATGGTTATATCACTTTTACTCTTTTAGCCC
AAAAAGGAATGTTTTAACATTTGAGCCTCCAACGTCTTTTTTTCTAACCCTGTTGGCCCCTAACACTAACCCCATTCATTTACTTTTAGGGGCCAAAAGGGTTAGAGAAAAGACGTTGGG
GGCTCAGATGTTAAAAAATTCATTTTTGGACTATATAACCGCAGAGGCCAAAATCATAATTTAATTTTTAGAAAATGAAAGTTAGTGACATTTTTATTCAACAATGTATCCTAATAATTC
CTTTTCTTTTCTGTCACTTTTTTCCACTTCTCTTCCATACCTCATCTTAGCATCTTGACACATGTTCAGCCAGGTTGCTATCATTCTCATTCACATTATTTGTTCTCATCATTGGGTTTG
TGGTATAGTCCCTCATTTACGCGTATCCTCCACTATCCCATGTGTATAAAGTGGTCAACCATATATTCTTATCATGACTTATGAATACCATAAAAACACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT
CAACATTTCACTCTCATTTGTGTGTACATAAAACATTCATAGTTATACCATAACACTTTACATTTATGTAGTCAAATGTAAAGAAACTTTAGCTTTGATAATCATCTTAATTATATTGCA
TATTTGCATAAACATTTGAATTAGCTAATTAATTTTTAATAAAAATGATTTTTTGTTATGATTATCCAGCTATGGCAACTCGAAACACTTCTCTTACAAAAGGACACTTACCTCAACTAC
AGTCAAGCTTTGAGCTACACGAGCCAAGCGTTGAGTCAGAACCTACACGGGTTAAGAAATCGGAGCCCGATAAAGAGAATGAGTTCCAAATTTATTTACTATCTACAAGAAAACTGGAAA
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GGCGCAGCCGAAACTCTCAAACTTAATATGGCTATCATATTATTGCCGGTGTGCAGGAACACTATTACTTGGCTGAGGTCCACCAGGTTGTCTTCTTTCGTACCGTTTGATGACAACATC
AACTTTCACAAGAGGTCAATATTTTTATTTATATTTCTACTTCTGTTTTAGCTAGATCATGGATTACAATTGGTTTGGGTTGAGACACGCCATTTTCATTATGGTTGAATTGGGTCGAGT
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GAATTGTCATTAAAAAAATTGGATTACTTAATACGAAAATTACATAAGAACGGCAGGTAAACAGACAACAAGTTGCGCCACAACCCATATCTATCCATTGATACGTACGTGAATTGTCTA
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AATGGAGGAACTAGAAAAGTAAGGAACTTTTACTAGTAGCATTGGACTTGATTTGTACGAATCGAGTGATTAATATTTAAACTTGATATTAGTTTCAGGACTCAACATCGGGCCACAGTA
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ATAAACAAATTGGGTGGCAATGTGTAGGGTGTGATAGAGATGCATAACTATCTAACCAGCGTCTACGAAGAAGGTGATGCTCGATCAGCTCTCATCACCATGGTCCAAGCTCTCAATCAT
GCCAAAAACGGGGTTGACATTGTATCCGGAACAATGTGGTAAGATCAATATCATTTTATAATATTCTTATATAACACCTTCCTTAATAACGAATTTTCATTAACAGGTTCGGACCCATTT
CGCAAGGCCAAATTGGAAGAAAGTTTTGTCCAAAACTTGTACAAAACATGCCGGTGCTAGGATAGAGGTGAGTATATTCATCGTCACAATCGATATACATAGTTTGGGCTTTATGTTTGT
GACAAGATGTCAAACAGGTTGAGCAACGTGTCAAAACACATGCGTGTTCAACCGTGTTATTGTTACTCTCTTGGTCCCACCATTATATTTTACTTTGTCCTTAAAGAAGTAATATTTGGT
GTTTTGTGGAGCAGGTGTGTTCTACTGTGGCGCGCCGGTGCTAGCCAAAGAACTGAGTAACCTATGTCACGAGTTTAACCAAAAAGGTTCAACAAAATTTGAATTCCATAAGGAACACTT
TTAA

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CDS►
Send to BLAST
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ATGACCGGCGGTCGTCACGAACGCCGGTGGGCGTCCGACACCGTTCCGGACAACATGTTGAGCGGCGGTTCATCTCCGGCGTACACCGATACGTCGTCGTTGAATCCAAACGATGAGTTC
GTTGAAGTCACGTTAGATCTTCAAGACGACGACACTATTATTCTACGTAGTGTGGAGCCTGCGACGGTTATCCACGTGGATAACAACACCGATACGGAGAATATTCCGGCGTCCACGTCA
TCATCCCGATCGTCAACTATGCGCCGGAGTTCGTCCAACCGGTTACGCCAGTTCTCGCAGGAGTTGAAGGCGTTTTCGATGGAGTTGCGCCGGTTTCCGTGGAGTTATGGCCGCGCGTCG
TCGTCCAACGCTGGAGGTTTGGATTCGGCCTTGGCTGCGCGCGCTATCCGGAGACAGCGCGCGCAGCTCGACCGGACTCGGTCCGGTGCTCATCGAGCTCTAAAAGGACTTAGATTCATT
AGTAGCAATAAAATTAATGGTGTGGATGGATGGAATGAAGTTCAGAATAATTTTGATAAGCTTCAGAAAGATGGATATTTGTATCGTGCTGATTTCGCGAAATGTATAGGAATGGTGGAT
TCGAAGGAATTTGCGCTTGAGGTTTATGACGCGATAAGTAGAAGACGAAGGCTTAAAGTTGATAAGATTAGTAAAGACGAATTGTATGCGTATTGGACTCAAATCACCGATGAGAGTTTC
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AAAAGACTATGGATTATTATCTTATGGATTTTGATTATGACTGGTTTGTTCCTTTGGAAATACTATCAGTACAAACAACGGGCTGCTTTTGACGTTATGGGCTACTGTGTACTTACGGCT
AAAGGCGCAGCCGAAACTCTCAAACTTAATATGGCTATCATATTATTGCCGGTGTGCAGGAACACTATTACTTGGCTGAGGTCCACCAGGTTGTCTTCTTTCGTACCGTTTGATGACAAC
ATCAACTTTCACAAGACCATAGCCGCAGCGATTGTAATCGGTGTAATACTCCACGCGGGTAACCATTTGGCATGTGATTTCCCAAGGCTTATAAACGAAGACGAAAGTCAGTACGATCTT
GACATGAGTAAATTCTTCGGTACAAACAAACCAGCCTACATAGACCTGGTCCGGGGGGTGGAGGGTGTGACCGGAGTTATAATGGTGGTTTGCATGGTGATTGCCTTCACACTCGCAACC
AGATGGTTCAGGCGGAGCCTAGTGACGCTACCAAAGCCGTTTGATAGGCTCACTGGCTTCAACGCCTTCTGGTATTCACATCACTTGTTTGTTATCGTTTATGTTTTGCTACTAGTCCAT
GGGTGGTTCCTGTATTTTGTGAAGAAGTGGTACAAAAAGACGACGTGGATGTACCTTGCATTTCCGGTTTTGCTTTATGCGGGTGAAAGAACGCTCAGATTTTTCCGATCAGGTTCCTAT
ACTGTCCGGATTCTAAAGGTTGCAATATATCCGGGTAAAGTTCTCACATTGCAAATGACCAAGCCTCCCCAGTTTCGATACAAGAGTGGACAATACATGTTTGTGCAATGCCCGGTTGTA
TCGCCATTCGAATGGCATCCATTTTCGATTACTTCTGCTCCAAACGATGATTATCTCGCAATTCACGTAAGGGGGCTTGGTGATTGGACGCAAGAATTAAGTAGAGTATTCTCGGAGGTC
TGTGAACAACCCGTGGCTGGCAAAAGCGGGCTGCTCAGAGCCGATGAAACTACCAAAACAATCTTGCCAAGACTGTTGATTGACGGGCCGTATGGCGCACCAGCACAAGACTACCGTAAA
TACGACGTTCTTTTGCTTGTTGGACTCGGCATTGGAGCAACGCCTTTTATTAGTATTCTTAAAGATTTGCTTAACAACATTGTTAAAATGGAGGAACTAGAATTTCAGGACTCAACATCG
GGCCACAGTAGGCGATCGGATCAGAGCTCTGGGAGTGCTGACTCATCCTCTCAGAGTAAAGTTTCTCCAAGTAAGAAGAAAAGCTTGAGGACTACAAATGCTTACTTTTATTGGGTGACT
AGAGAACAAGGTTCGTTTGATTGGTTCAAAGGAGTCATGAATGAAGTTGCGGAACTTGATCACCGGGGTGTGATAGAGATGCATAACTATCTAACCAGCGTCTACGAAGAAGGTGATGCT
CGATCAGCTCTCATCACCATGGTCCAAGCTCTCAATCATGCCAAAAACGGGGTTGACATTGTATCCGGAACAATGGTTCGGACCCATTTCGCAAGGCCAAATTGGAAGAAAGTTTTGTCC
AAAACTTGTACAAAACATGCCGGTGCTAGGATAGGTGTGTTCTACTGTGGCGCGCCGGTGCTAGCCAAAGAACTGAGTAACCTATGTCACGAGTTTAACCAAAAAGGTTCAACAAAATTT
GAATTCCATAAGGAACACTTTTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
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