Entry information : PretPOX04
Entry ID 13814
Creation 2016-06-27 (Harold Duruflé)
Last sequence changes 2016-06-27 (Harold Duruflé)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-06-27 (Harold Duruflé)
Peroxidase information: PretPOX04
Name PretPOX04
Class Non mammalian vertebrate peroxidase     [Orthogroup: POX001]*
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Actinopterygii Poeciliidae Poecilia
Organism Poecilia reticulata (guppy)    [TaxId: 8081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PretPOX04
start..stop
S start..stop
PretPOX02 357 1.22e-122 281..503 1..226
SiniPOX 266 5.67e-81 287..461 583..759
SiniPOX 213 1.89e-61 11..156 9..154
SiniPOX 151 1.83e-39 190..279 21..110
TrubPOX01 247 8.06e-74 287..447 582..740
TrubPOX01 214 1.67e-61 1..156 1..154
TrubPOX01 159 4.54e-42 168..279 1..110
DrPOX01 208 1.28e-59 287..470 583..756
DrPOX01 181 1.12e-49 2..153 3..153
DrPOX01 129 6.84e-32 190..279 23..112
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13814' 'join(1..64,146..233,348..523,624..756,10031..10068,10264..10329,10413..10500,10598..10773,13974..14241,14337..14548,14655..14692,14802..14960,15121..15129)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1..64 62 N° 2 146..233 86 N° 3 348..523 174 N° 4 624..756 131
N° 5 10031..10068 36 N° 6 10264..10329 64 N° 7 10413..10500 86 N° 8 10598..10773 174
N° 9 13974..14241 266 N° 10 14337..14548 210 N° 11 14655..14692 36 N° 12 14802..14960 157
N° 13 15121..15129 7  
join(1..64,146..233,348..523,624..756,10031..10068,10264..10329,10413..10500,105 98..10773,13974..14241,14337..14548,14655..14692,14802..14960,15121..15129)


exon

Literature and cross-references PretPOX04
Cluster/Prediction ref. Genebank:   103473904
Protein sequence: PretPOX04
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   504 (486)
PWM (Da):   %s   56941.47 (55089.4)  
PI (pH):   %s   8.25 (8.16) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-504
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MLLSVLLVLGVCLVPSKSKPMEERLGSPFLHKCFEEAKKIVDDAYKYSREESLRRVRKDEVQPRDALHLLKQPRGDTRSAVRSADYMAQTLRLVQEKVHRVHKRSLNATDLLTEQDLREL
ARITGCEARIRNPPCHNTPNINKYRTITSVCNNFRTCSSRKGGEALEMLLSVLLILGLILVPSQSKPTGERLGSPFLQKCFEEAKKIVDDAYMYSREESLRRVRRDVVKPHDALRLLKQP
RGDTRSAVRSADYMAQTLRLVQEKVHHVHKRSLNATGLILMISITSGYNAWRRFCGLSQPRNQAELAQVMRNPTLAQKLLELYGTPDNIDVWLGGVAEPFVPGGRVGPLFACLIATQFQK
IREGDRLWFQNPGVFTPQQRQALFAVTLSRVICDNTGITSVPSDAFSVVSNRNRLVRCSALRRLDLFPWRERPCGFGSPEDCLRSSDGENPTQTDELNTLDPQDPLDLQDPLDPVDPFDL
QDPLDPQDPVDPQDPLELETNEIQ

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGTTGGTATT CTGGACTTAT TTGCCTCTTG GACAAAAAAA TATATATAAT TGGCTTTTGT TCTACATATT AATTAGACAC AAATTGACAT TGGAGACTAT CTGGATAAAA TTCAGATTTG  TCTTTTTAGG CTTTTAGAAT CCAAAAACTC TTTAGGAATC AAATATCTTA CAATCCCATC AAAACCTAGA TCAGCAACAC ACCTATCACA ATTTTTTTAA AATCAGATTT TCATGTCAAA  ATCAGATTAA CTTCTTGTTC AATAATACCC TTTACTCCCA GTAAGAAAGA CTTTGCCTTC ACCTCTCTCT TGTGCAACAT TTGCATGTTT AAGCCCATGT CCACCTCTGT TTATACTGAA  CAGTCCAGGC AGTCTGGAAA ATTAAGATTC ACCCAGCTGC CAAATCTGGA TTCTAAAGAA ATTAGTCAGC TGAAGACAAA AGAAAGCACC ACATTAGTTT TGTTTTTCAG TTATAAACAA  AAGTGAGCAT TTTCAAGCAA TGCAAGGCTA TTTTTTCATT TATTAATATT TTCTTTTCTA TCATATAATG TAGGTTGAAG GATTCATTGT GTAACTGAAG ATTTTGAATA TAAGTGAGGA  GTTTAGTGAT ATTTTAAAAT GTGGCAGAGG AACATTGGCT CCCTCTGTTG GTCACACTCT GATAACTTGA CTCTCTTTTG AAAATAATTT CTTGCTGCAA ATTAAAGCAC CGGACCAATC  AGAACGACTG AAAAAAAGAG AAGATTATCC TATAAATTAT ATATAAAAAA ACATATAAAT AAAAAGAGTA CTTCTGCTGA AGCATAAAGT AATCACATTC TTTCTTATTT ATTTATTTTT  TTTTATTTTG GTTCAAATAG TCTCAATTTT AATTTTTATA CTTTACCTTG TATTGGTACA AACATATATT TTTTATTTTT CACTTTAACA TTTTTTAATA AAATAATTTC ACATTGACAG  AAGAGCTGTA TTTCTGAGGG AGAATGCAAT TCAATTTAAG ACTACAGAAT TGCAGTAAAA CAAAAATATT GGCAGACAGA GCATAAAATA TAACATTTTC ATTTTTAAGC TACCATGATT  TGTATAGCAT AGCATTAATG TTAGTTAATC CAGTCAAAAC TGACTGAGTG CTGATTTTTG TTTTAATGGA CTATAAGCTG TAATAGAGTT AAACAGATTA ATTCAATAAA AACCCATGTT  TATTTAGCTA AAACCATCAA AAGTGTCTTA TTATTATAGT AAATGAGGAT ACAGTTGTAT GGTGTGTCTT TAAAAATAAA TCATCATTAA AAAACTCATA CAAAACAGTG ATCGCTCAAT  TGCTTTATTG AATACAACAT TCAACATTCA ATGCAAAACA ACAAAGTTGC AGTAAAACAA AAATATGATC AGATAAATCA TAACACAATA TTTGAAGGTA AAGGATTTAA TGTAAAACAT  GTTCATAAAT TAATACTGGT TGATCCCATC AAAATTATCC TAATGATTTT GTTTTTTGTA AAATAGACTA AGTTGTAACA GAGTCAAACA CATTTGTTCA ATTAAAACCC ATTGGTATGA  AGCTAAAACT AACAAAAATG CCTTATTATT ACAGTGGAGA GTAAAATGAG GATGCAGTGG TATGGTGTGT CTTTATCTAG TCATCTGCTG CTGTGAATGA CTGACGTAAA CAAATTTAAA  AGCCCACGAG TCACTGGTGT TTTCTAACGG GAAGTTCATC CAGGAAAGAG AGTGTTTCTG TCCCATAGAG AAGAAAATGT CCTGAGAAGA AGACGTTGAC GGCCAGCTTG ATAAATTTCA  TCGTAATCCC AGCTTTCTGC TTCGATGGAA GAAGTGCAGA GTCAATGACT GAGGAATATA AACAGGTGTG TCCTAGTTCT GTGTTGGCTT GTTTTGTTTC TTTATGACGG AAACAAATGA 
GTCTCTCTGG GTAAAGGCCG TCATCCCAAA ACTGATGTTT GAATATCGGT GATCCTAGAG GGCATATGGG GCTGAATGGC C 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTGAAGCA AAGCATCAAA CAAACATCAA CTGGTTAAAA AATACAATGA ATCGAAAACA TTTTCCTCTA TGGATTAAAA GAACATTTTT ACCTCTGTCT GTGAAGGTTT CTGTGGCGTT  CTAAGATGTT ATTTGATGTC TGGAGGTAGT GATGCCGTGT TCTTTCCCTT CTTATACTCG GTGAATTGGC CCAACGCCTC GCCTCCTTTA GAGGATCAGC AGGTGTGGCT ACGGTCACTT  TCTTGTTCTT TGTCAAAGTA CTGTAGGAAA CACTGCTTTT ACCTAATCAA CTACAGCTTC TGGTTAACTT ATAAGACTTA TTTAGGACCT ATTAATGCAC CGATTGCAGT TTTCTGGTAG  ATTGCGACTA CCAATATTTA AAAAGCCTGA CCGGCCGATT CCGATTTTGG CCGATACCAA TGCTTCTTGT CTGAAATGTT GTTGAGTTGG CAATAGTGGG GTGACTATTG TTAACTGGAA  ATGTGCAGAC ACGATCTGGT CAGTGGGTCT GTCAGTCATA TCTCTCTCAC AGCAGAGTAT TAGGGGACAG TAGTTGATTT TTAGACCTTT GTTGAGGTAG ATAAGATCGT CCGATCTAAA  AAATTTGGTT GGTTGCACCC CTATTAGAAA CCTACAGTGG TGGGAAGTAA TGTACTTAAG TACAGTTTTC GTGTATCTGT ACTTTACTTA AGTAGATTTA ATAATGGGGA CTTTCTACTT  TTACTTCACT ACATTTTACA GTAAGTATCT GTACTTTCTA CTTCACTACA TTTCTACAAA ASTGTCGCGT TACTCGTTAC ATCCAAGTCG CGTTGCTCTT TTCTTCCGTT AAAATGTGAA  GTTCAGGGAT TTAAGGTGGC GCCGTAAAAT CCGAGCAATA ACGTGACTTA GTGTCTGTTG TCACCCATCG GCTCCACCTT TACTCGCACT CGGAGCTCCA GACATGCGCA GTGGTTTCCT 
CTGAGCGGGA GGAGATGTTT GTCTATAATA TAATAGCTGC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TTACTGGATCTGAGGAGAAATAAATATTTTGTCAAAATGCTGAGAAGATGAAATGAGTAGAGTATATTGTTTGCACATAATAATCAAAATTCATAAAACAACCAAATCTGAGTTATGATA
AAAAAAATTATACAAATGATCTTTATGAATTTACTACTCAGAATCAACTACCTCATTGGTCTCAAGTTCCAGTGGGTCTTGTGGATCCACAGGGTCCTGGGGGTCCAGAGGATCCCCTGA
AGGTCGAAAGGGTCCACGGGATCTAAGGGATCCTGGAGATCCAGTGGGTCCTGCGGGTCCAGAGTGTTCAGTTCATCTGTCTGGGTTGGGTTCTGTTTATCAACAAGAAATAAACATCAC
ACTAAGTGTTTGGATTTCAAAAGATCACATTATTCCTTTGACAATGTGCGACATTATTTCAGTAATAAAGGTGAGACTGACCTCTCCGTCACTGGACCTCAAACAATCCTCAGGAGATCC
TGAATCATCAAACATAATAAGTTTTTATACACATAATTTCCAAAAAG
AGCACATTACATTGTCTAAAACTGTGCTTTGATTGGTCCCTTGTATGAAAAAGTTCTCACCGAAGCCACAGGG
TCTTTCCCTCCATGGGAACAGATCCAGACGACGCAGAGCGGAGCACCTCACCAGACGGTTCCTATTTGAGACGACGCTGAAAGCGTCACTGGGCACAGACGTGATGCCGGTGTTGTCACA
GATGACTCTGGAGAGTGTAACAGCGAACAGAGCCTGCCTCTG
TGCTGTGGCGTGAAAACACCGGGGTTCTGGAACCACAGCCTGAAAAATTACAGAACTTTGGTAAATTATTCTATTCAA
ATCTACGATTTGCTTTTGAGAAAAGAAATCAAACAGTCCTACTCTGCTTTACTGACCTGTCACCCTCACGGATTTTCTGGAACTGAGTTGCAATGAGGCAGGCGAACAGAGGACCCACGC
GGCCGCCAGGCACAAATGGCTCTGCGACTCCTCCAAGCCACACATCAATGTTGTCGGGGGTCCCGTAGAGCTCCAGCAGCTTCTGAGCCAGCGTGGGATTCCTCATAACTTGAGCCAGCT
CTGCCTGGTTACGAGGCTGGGACAGACCACAGAACCTGCGCCAGGCATTGTAGCCTGAAGTGATAGAAATCATGAGGATGAGACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TAATCCGGGCAAGTTCTATAATGTCTTGGTCCGTGAGAAAATCTGAAATGTATAGTTCAGCGATCCATGAGTCCTTTTTGACTTTTAAGTATAATTAGATTGTTATTTAGAAGCACAAGA
CTTTTAACCAGAAAAGGAAAAAATCAGCTTTGACTGAGCCTTACCTGTTGCATTGAGGGAGCGCTTGTGCACATGATGTACTTTCTCTTGGACCAAACGGAGAGTCTGTGCCATGTAGTC
AGCAGAGCGCACAGCTGAACGAGTGTCACCGCGAGGCTGCTTCAGGAGGCGAAGAGCATCATGCGGCTTCACCACATCCCTGCGGACCCGTCTGAGGCTCCTGCAGGAGAGAGAATGGAA
ATGTCTCTCAGTTTTAACAAGAAATCCAGAGCTCTGCAGTTCAGAAAACTGCTCATCACTCAAGATGATGAACTCACTCTTCTCTGGAGTACATGTATGCGTCGTCTACTATTTTCTTTG
CTTCTTCAAAGCATTTCTGAAGAAAAGGACTGCCCAGTCTTTCACCTGAAGAATAAGAACAGCTTAAACATCATGCATTTACAAAGCAAATATGTAAAAAAAAAAAAATTATGTCAGGAG
AAATTTACCTGTAGGTTTGGATTGACTGGGCACCAGGATGAGGCCCAGGATAAGAAGTACAGAGAGAAGCATCTCTAAAACAAAACATCAAACAAACGTCAACTGGTTAAAAATACAATA
AATTGAAAACCTTTTCCTCTGTGGATTAAAATAAATCTTTCTACCTTTGTCTGTGAAGGCTTCTGTGGCTTTCTAAGATGCTCTTTGAGATCTGGAGGTAGTGATGCTGTGTTTAACTCT
CTGGCTCTCCTTATATTCAGTCGACTGACCCAACGCCTCGCCTCCTTTACGGGATGAGCAGGTGCGGCTATACCGTCAGGAAATGCAGTTCCTTCTTCCTTATCAAAGTCCTGCAGGAAG
CACTGCTTTCAGCTAATCATTCACAGCTTCTGGTCAACCGATATGACTAATGGTCTACTTTAGAAACCTAAAAACAACAATACAATAAGTTCTGCTGGATGGGTTGGCCAGAAAGCAGCA
TAAACATAGTAACACTGACATATGGGGATAAAACGTTTAAATAACTTTAATCAAAACTCATTTTTCAATGTCCTTTTTCAAAGATAATTTGATGAAGGTAAAGGAGTAACAAAAAAAATC
CAGCCAAACACTGAAATGAAATGATATAGATTTGTTTGGTTTCAAATAATTTTTCTGTGTTGAGTTATACTTTGGTAAACTAAATAACAACAAGCAAGTTTAACTTTAGCATTTAACATT
ATAGTGTTTTCTGCTTGAACCACAAATGAGAATTAAAGTGGAATAAACCAACATATTGCGTTAGATTCATATCAAAAGGTTTAATCTAGCTTCATGAAATTTTATTATGATATGAAATAA
ATGACAAAGGAAAAGAAGGACACTTGCTTTTGGAAAAAGCTTTTCTTCGGAATACTTTACTGATAGTAGAACAACACAGAAACTACAGATAAGAAAAATAAAATAAAAAGCAGAAACAGT
TTAGTCTTTACCAAATGAAGACAAAAAAATCTAAATAATATGGAAATTCGAAGAATCAATTTTGTTTACATAGCATTTAATGGAAGAAAAAAAAATCCAAAATATTTTCATTTGAAAACA
ATGCTGTAATGACTGAAAATGTGAATCACAGAGGTAAGGAAATAAGAAAGCAATCCTGCATTTGTGCAAGACAAGGAAGTGAAACAATAAATGTAAAGTTAATCATTATGTTTCTTTGAA
AAGCACAGTGTGTGTATTTTATGCTAGTGTGATGGACCGAGTTAAAACAGGAGGAGTCACAGGATATTAATTAGAAAAATAGGGTTTTTTATTTTAACCCAAAGATTACAAAAGGACAAA
AAGATGAACTGAGCTCACAAAAGAGGCCAAAGAAACAAAACTGAACTCAGGCAAAAAAGTAAACAAACTGGCTGCACAAACAAACATAACTGACCTAACAAAGAGATGACACACAGGGGT
TTATATACTGGCTGATCAGACCAATTAAGACACAATAGGGGTAACTAAACAGAATACAATTACAAACACAAAAACAAATAACAGTACAGCTAAGTTTGGCTAAACTAAAGATTCTCAAAA
TGAAAATCAAAAATATTAAAGTTTAAATACTAATATTTACTTAAATACAAAACTTATCTAAACAAAGAAACTACAAATTTCCCCTGCCAGCAGGAACTAGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACTTACAAGTTGTTG
CAGACGCTGGTGATTGTGCGATACTTGTTGATATTTGGTGTGTTGTGACATGGTGGATTCCTGATTCGAGCCTCACATCCAGTAATTCGGGCAAGTTCTCTCAAATCCTGCTCCGTGAGT
AAATCTGAAAGGTGTAGTCCAAATATCTGTGTGTCCTTATAGGTTT
TTTTAGATGTAATCAGATTGTTAAAAGTACCAGATATGGAAAGATATGACTGAGCCTTACCTGTTGCATTGAGG
GAGCGCTTGTGCACACGATGTACTTTCTCTTGGACCAAACGGAGAGTCTGTGCCATGTAGTCAGCAGAGCGCGCACAGCTGAACGAGTGTCACCGCGAGGCTGCTTCAGGAGGTGAAGAG
CATCACGAGGCTGCACCTCATCCTTGCGGACCCGTCTGAGGCTCCTGCAGGAGAGAGAATGGAAATGTCTCTCAGTTTTAACAAGAAATCCAGACCTCTGCAGTTCAGACATTCAGAAAC
CACCCTTCACTCAAGATATGAAAGCATTCTGAACTCACTCTTCTCTTGAGTATTTGTATGCATCGTCTACTATTTTCTTTGCTTCTTCGAAGCATTTATGAA
AAGAAAAGGACTGCCGAG
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CDS
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