Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
254 |
PWM (Da): |
28112.55 |
|
PI (pH): |
7.97 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MSAIRINSPTTALTLSIKHLTCNPSFPTNCRRFKRNTVAMSSAPLQVCAKSSLTVPNKLGDCPFTQRVLLTLEEKHLPYDLKLVDLGNKPDWFLSISPEGKVPVAKVDDKWIADSDVITQ TVEEKFPDPSLVTPPEKASVGSKIFSTYIGFLKSKDANDGTEQALLNELSAFNDYIKEGPFINGKDISAADLSLGPKLYHMEIALGHFKKWSVPDSLPHLKTYMKTVFSLDSFIKTMPLT EDVIEGWRPKVMG* |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
|
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTCGGCCATTAGAATAAATTCGCCCACTACGGCGTTGACGCTTTCCATCAAACACCTTACCTGCAACCCTTCTTTCCCCACCAATTGTCGCCGTTTCAAGCGAAATACCGTCGCCATG TCTTCCGCTCCTCTCCAAGTCTGCGCCAAATCTTCTCTCACTGTCCCTAACAAGCTCGGCGATTGTAAGTATTTCACGTTTTTATAACAATTTATTTGTTGATTACTTTAATTTGGCTCA TATTATGTTATGAATAAAATGGTAATCAAAATAACACTATTACATTTTGGCCCTTGTACTTCTAAACATATTAGTAGGATTACGTGTTGTGGATATGATTTAGACTATTTAGTAATGTCT TTGATTCAATAGTGCGATGTTTGATGCTGTTGTTTGAGATGATGATTGCCTGATCGATTATTTTTGTAATTAGATATATATTTTGCCTTAATAATAACCTAGATATTTGGACATGATGTG TTTCTGTAATTTGATGATAATCAACCAGTGGCAGAGCCAGATTTTTTTTTACTGGTCGGATTTTTATCACTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAGTTAACTTCATTAGAAACGCTGACACAC CTCAAATCGAGGCGGCCGAAACACAACTACATATTTACAAACTTACACCAATCCTCCCACTTAGTGTTCCTATTCTTTGATCTCCTTTTATACCATAAAAATCCCACCGATTTGGTCTCA GCGATAATATTTTCGATCTTCATAGGATTGTTGTTGAACCTGAGGCCATTTCTTCCCCTCCATAAACTGCAAAACCCTATTCTAACCATCCCTTTCAATACTTCTTTCTGCTGCTCCCTC AACCCAACATGCTCATGAACCTCGATAAGATCTTTAAAAGAAAATATAAAGAAGTTTGGAATCCTGCACCAGTTACAAATATGCCCCCATAGAGCCGCAACATCATAACATGAGCAGAAT AAATGTTCCATCGTCTCTTCCACTTCGCCGCAGAACAAGCATGACGGATCTGTCACTTCAATATTTCTTTTTTTTTTTTAAGCCTCCGTCGTCGTCGCAATCCTGTTCAGCTCGGATCTC CAAATAAAAACGTTACACTTTAAGGGAAGCCATTTGCACCAATCATGAACATGAACCACCGGATCAGACCTGTTTTTGTTTAGGAGCTTTTTCACGGCTGCCACGCTAAAATCTTCATCA GCTGACCCAATCCAACTCCAACTGTCGCTATCATCTTTCAGCTCAAAATTGTATAACAAGCTGCATAAATCCAATAACTCATTAACCTCTTGACTTGCTGATATGGATCTGCTCCACTGC CACTCCAAAAACCTACCGTTATCCAGGTGCTTAATCCGATCAGCCACCCTACATTTCTTATCCAGCTCAAGTTTGAAAAGTTCCACTGTTTCAGAAATCTATCTTTCAGTGGCTCGTTAA TAATCCAAGGATCAAGCCAAAACACCGTATTCAAACCGTTACCTACCGAGCTTTTAAAAAATCTCCTTAATTGGATTCCGTCAACTTGAATTTTCGATTGCAAACCCGCTATGTTGCACC ACACCCCTCCCATCGATTTTCTTGCCGGAATAAAATCCCATCCCGATCTCGTCACATGAATAGCTTCTCTTACCTTTGTCCAAAGTTTATTTTTGTCGGATAAAAACCTCCATCCCCACT TTAGCTAGAAGAGACGTGTTAATACTTTTTAGCTTACTGATCCCGAGCCCACTTTAGCTAGAAGAGACGTGTTAACAACTAAAAGCACTAAAATATTGCAATTAATTTCAAACAAGTTTC ATGATGCAATTAAGTATCAAGTTTCACATCTATTGTCAACATTATTGAAGTAATGAAGTGTAAAATCACTAATTGTATGATAAACGTTCTTGATGTAATTACTTATAAGCTTTGAGTTGT TTAAGTAAAAGTTATTTGATTTTAAGATAGATATTAAAATTCAAAGATATTATCATAATATCACCACTAAACTAAGTACATGTAAAGAAGATTACTGCATCAACATGCATCGTTCTCAAA CAAGTGAGCTTTGTATTGCTGCTCGCTTTTGCGTTCTATGAAGTGAACCTCATTTCCAACACAACAACTTGTATTTCCATTTCTACTTAAAATCACACCAGGATCCCTCTTCTTTAACGG AGTGCTTCCCATCACAGATTCATAATTTTGAAGTATTCATTTTTGTTAATTCGATTCAAGTTTCATATTTGTTTTTTTTTTTTCCTATGAAACAATATTTATGTATTTTGCACTATGATG AGTTTTATCTTGCAACACGGAAAAAATAAAAACAAACTGTTCCGGTGTCCCACTTTGATTTCCATACAAAGTTAAATACAGTGAGGCATTCCATAAATATCCATTCTGAATAAACCATCA TTTTTAGGGTAGAAAAGACAATTAAAATGTAGTTGTAATTTGAAGAAGGCAATTAGGTAGAAAAAGGCAATCAAAAATCTCCTTGGGTTCAGTTGAAAATTTAGGATTTAATTAAGATTA AAACGGCTAGCAAAAAAAGGAACAGAAAGTTAAAACAAAAATCCGCTGGAAGTAGGGATTGAACCCGCCACTAGAGAATGATAAAGGACGGGTATTATACACTTCATATAAATTTCAAAA ATCATTGGTGTCGCTTGACCCGTTCCAATATATGTAGCTCTGCGCCTCTGCCCCTGATAATCACAATCGTATTACCAAAGGGTACAATTGGTAAAAAAATTTGGGTGCACAGTTATTTTT ATATATCTGTTGTTTCAGGTGTCCGTTTACACAGAGAGTTTTGCTGACACTGGAAGAGAAGCATCTTCCTTATGACCTAAAGTTGGTTGATCTCGGTAACAAGCCAGACTGGTAATCATA CAGTATTCCGTTTATAACATGTCGTGTTTTCTTTCAACCTTTCATAATTTGATCTACGCGTGACACTCTTGGTTTTACGTAGGTGTTTTTAAGTATTAGCCCAGAAGGTAAAGTCCCAGT GGCGAAGGTTGATGACAAATGGATAGCAGATTCCGATGTTATTACACAGACAGTAGAGGAAAAGTTCCCTGACCCGTCACTGGTGACCCCACCTGAGAAAGCTTCTGTGTACACTCATGC TCTTTGTCTCCCCTTTGTTCAGTTTACATTCATTTTTGCAAATTGATGTTGTATAATGGTATTTCTGATTCGTATATCTAGTGTGGGTCGAAGATCTTTTCGACATATATTGGCTTCTTA AAAAGCAAAGATGCGAATGATGGAACGGAGCAAGCTTTACTGAATGAACTCTCTGCTTTCAATGATTACATCAAAGAAAATGTGGGTTCTGTTCTATCTCTCCACACACGCACATATATA TATCAAACTGTTTGTTGAATTAGCTTGCTGATTTTAAATTTTGTTTTCGCGTGTTTGTTGAAGGGGGTCCGTTTATCAACGGAAAGGATATCTCTGCTGCAGACTTGTCGCTAGGTCCGA AGCTGTACCATATGGAGATCGCTTTGGGTCATTTTAAGAAGTGGTCAGTCCCGGATTCACTTCCCCATCTGAAAACATACATGAAGGTACACTTATCTTTGTTGAATTGCATAAAGTTAT CTTTTTATGAGAGCAGCCTTAATTGTTCTGTTCTTTGATTTTTATCTTTTTCATAACATCTATAACTAACATGATATTATTACATGGTGACTACCCCTTGTAAAACGTTTCACTAATATG GATTTATTATGTTTTCAGACACTGTGTTCTCATTGGACTCGTTCATCAAAACAATGCCGCTAACAGAAGACGTAATTGAGGGATGGCGGCCAAAGGTCATGGGTTAA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTCGGCCATTAGAATAAATTCGCCCACTACGGCGTTGACGCTTTCCATCAAACACCTTACCTGCAACCCTTCTTTCCCCACCAATTGTCGCCGTTTCAAGCGAAATACCGTCGCCATG TCTTCCGCTCCTCTCCAAGTCTGCGCCAAATCTTCTCTCACTGTCCCTAACAAGCTCGGCGATTGTCCGTTTACACAGAGAGTTTTGCTGACACTGGAAGAGAAGCATCTTCCTTATGAC CTAAAGTTGGTTGATCTCGGTAACAAGCCAGACTGGTTTTTAAGTATTAGCCCAGAAGGTAAAGTCCCAGTGGCGAAGGTTGATGACAAATGGATAGCAGATTCCGATGTTATTACACAG ACAGTAGAGGAAAAGTTCCCTGACCCGTCACTGGTGACCCCACCTGAGAAAGCTTCTGTTGGGTCGAAGATCTTTTCGACATATATTGGCTTCTTAAAAAGCAAAGATGCGAATGATGGA ACGGAGCAAGCTTTACTGAATGAACTCTCTGCTTTCAATGATTACATCAAAGAAAATGGTCCGTTTATCAACGGAAAGGATATCTCTGCTGCAGACTTGTCGCTAGGTCCGAAGCTGTAC CATATGGAGATCGCTTTGGGTCATTTTAAGAAGTGGTCAGTCCCGGATTCACTTCCCCATCTGAAAACATACATGAAGACTGTGTTCTCATTGGACTCGTTCATCAAAACAATGCCGCTA ACAGAAGACGTAATTGAGGGATGGCGGCCAAAGGTCATGGGTTAA |
Retrieve as FASTA
|
|
cDNA►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GCGAACAATC TTTTAAGGCG GAGAGATTCT ATTCCAGAAG CATCTGGCTC TGGTTTCAGT TTGCACACGT AATCAGCAAC CTCATCTCCA GCAACCACAC TCGCACTAAA ACAATAATAA
TCGTTGACGC AATTAAACTA CAGTATTATT GTGCATTCAC AAATGTCGGC CATTAGAATA AATTCGCCCA CTACGGCGTT GACGCTTTCC ATCAAACACC TTACCTGCAA CCCTTCTTTC
CCCACCAATT GTCGCCGTTT CAAGCGAAAT ACCGTCGCCA TGTCTTCCGC TCCTCTCCAA GTCTGCGCCA AATCTTCTCT CACTGTCCCT AACAAGCTCG GCGATTGTCC GTTTACACAG
AGAGTTTTGC TGACACTGGA AGAGAAGCAT CTTCCTTATG ACCTAAAGTT GGTTGATCTC GGTAACAAGC CAGACTGGTT TTTAAGTATT AGCCCAGAAG GTAAAGTCCC AGTGGCGAAG
GTTGATGACA AATGGATAGC AGATTCCGAT GTTATTACAC AGACAGTAGA GGAAAAGTTC CCTGACCCGT CACTGGTGAC CCCACCTGAG AAAGCTTCTG TTGGGTCGAA GATCTTTTCG
ACATATATTG GCTTCTTAAA AAGCAAAGAT GCGAATGATG GAACGGAGCA AGCTTTACTG AATGAACTCT CTGCTTTCAA TGATTACATC AAAGAAAATG GTCCGTTTAT CAACGGAAAG
GATATCTCTG CTGCAGACTT GTCGCTAGGT CCGAAGCTGT ACCATATGGA GATCGCTTTG GGTCATTTTA AGAAGTGGTC AGTCCCGGAT TCACTTCCCC ATCTGAAAAC ATACATGAAG
ACTGTGTTCT CATTGGACTC GTTCATCAAA ACAATGCCGC TAACAGAAGA CGTAATTGAG GGATGGCGGC CAAAGGTCAT GGGTTAACGC CAATTTATAT CAAGGAGTCA CCCATCAATG
CATCTATGAT AACGTTGTCG AATTTGTTCT CTTTTGGTTT CTGGTTCCTC GCATAGAGTT CGTTGTTCTC TCCTACGTTT CTTTAGATGG CCGAATGCAA CTTATTGCCT ACCATATATA
CATTTTAGTT GAAAACTACT GTAATTGTGT TGTTATGTCG GTTTCTGTAT ATTATCATGA ACAAACTTGT GTTAATATCT TGTCATCATG AATTACAAGT AATGTTATAA CACATCACAT
TCGGGTTCCA AGTCCAAAAT CAACTACATG GTTGACATTG GTTTGGCTTG GTGTTCTTGT CCATTCGATG GCTAAAAATA AACGCATCAT ATGTGTAATC CAACGGGACT AAAGATCGAG
CTTTCATTAT CCTCATATAT TTCTTTGATT CTTCCAATCT CCCTGCTCGG AAAAGACTAA CGATTAACCA TGTAAACACC GATGCACCGG GAGAGAGTTT CCTATATTCC ATTTCATAGT
AAAGCTTAAG AACTCCCTCA ACATCACCTT CTCTTCCATA ACCTGCGATA ATATAAGAAT ATGTATTTGC ATCCGGCATG AACCCTTTAT CTAACAAAAG GGTCAACACG TCATCTGCTC
GACGAACACT CTCATGTCCA TTTAGCCTCT CAACCACTTC ATTAAAAGCC AAGCAACTCG GAATGAATCC GTTCTGCAA
|
Retrieve as FASTA
|
|