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Entry information : HaMDAR02 (HanXRQChr07g0198871)
Entry ID 14256
Creation 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaMDAR02 (HanXRQChr07g0198871)
Name (synonym) HaMDAR02 (HanXRQChr07g0198871)
Class Monodhydroascorbate Reductase    [Orthogroup: MDAR002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaMDAR02
start..stop		 S start..stop
HaMDAR04 804 0 1..480 1..480
LeMDAR01 779 0 1..480 1..481
ThasMDAR03 732 0 1..480 1..490
AtMDAR03 731 0 1..480 1..488
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '14256' 'complement(join(77318048..77318779,77319344..77319462,77319984..77320203,77320307..77320425,77321679..77321759,77321895..77321946,77322448..77322567))' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 77322448..77322567 118 N° 2 77321895..77321946 50 N° 3 77321679..77321759 79 N° 4 77320307..77320425 117
N° 5 77319984..77320203 218 N° 6 77319344..77319462 117 N° 7 77318048..77318779 730  
complement(join(77318048..77318779,77319344..77319462,77319984..77320203,7732030 7..77320425,77321679..77321759,77321895..77321946,77322448..77322567))


exon

Literature and cross-references HaMDAR02 (HanXRQChr07g0198871)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr07 (77322567..77318048)
Protein sequence: HaMDAR02 (HanXRQChr07g0198871)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   480
PWM (Da):   %s   51974.9 Transmb domain:   %s   o451-473i
PI (pH):   %s   7.01
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MGRAFVYVILGGGVAAGYAALEFTKKGVSHGELCIISEEPVAPYERPALSKGFLLPEAPARLPAFHTCVGANEERLTPKWYKEHGIELILGTRVKSADVRRKTLLTAAGETISYKYLIIA
TGAALRLEEFGVSGSDAENVCYLRDLADATRLADVMQTSTGGNAVVIGGGYIGMEVAASLVINKINVSMVFPEPHCMGRLFTPKIASYYEEFYKAKGVNFVKGTVLSSFVFDEDGKVTGV
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Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGAAGAGCGTTTGTGTATGTGATACTTGGTGGGGGAGTTGCTGCCGGTTATGCAGCTCTTGAATTCACCAAAAAAGGTGTTTCTCACGGTGAACTCTGCATCATCTCCGAAGAACCT
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TTATTTAGGCCCAATAGTCTTTAAATAGGGTTTAAATGAAGCCACTACTTCTTTACCCTAAAAAAAGAACGTTAGCTATCTTTTAACATATTCAGCCGCTCCCTTCCGCTTCTCCTGTGA
TTCTTCATACTTTCTCCAATAATCAGCATTAAAGACTATTTTTATGTTTATGTTTATGTTTTAAGTGTGCTTCGACTTTAATTTATGTTTTAACTATGTTTTTTATGTGTTAAGTGTGTT
TTTAAATCATGTTTTATTGTTTATTATTGATTAACAAGTAGAATAGGTCATATTGATGTGTACAATATTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTGAGCGCTTCGTATACGTGAAGCTCTCGCTT
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AAGTTCATGAACGTTCGGTTCGTTTACAGGCCTAAGTACTGCTACAAATATTATCATATTTATAGATTCACTTGATAACAAAAACATAATACATAAATTATTTCAGGAGAATCGAACTGA
TTCTGGGTACGCGCGTAAAGTCTGCTGACGTGAGGCGTAAAACATTACTCACTGCAGCAGGAGAAACCATTAGCTATAAGTATCTTATCATTGCAACAGGTGCTCGGGTACTGAAACCGG
TTCTCAAAGGATATCATACATTCATACTTCGTTTCTTTACAATTTTTTTAACAAGACTATATTTCCTAATTGATTTGTTGGATTAAATAGGCGCTTTGAGACTTGAAGAGTTCGGTGTAA
GTGGATCAGATGCTGAAAATGTATGTTATCTACGTGATTTGGCTGACGCAACCAGGCTTGCGGACGTGATGCAAACCTCTACTGGCGGCAATGCGGTGGTCATTGGCGGTGGCTACATTG
GAATGGAGGTTGCGGCGTCGTTGGTCATTAATAAGATTAATGTTTCAATGGTGTTCCCTGAGCCACATTGCAGTAAGCGCTTAGCTATTTTCTTCTTTCTTTTATATATGAGTAAAATGC
CATTTTCATCCTTGAGGTTTTGCCATTTTGCGGCTTTTATCCAAAGGTTTGTTTTTTCGCTGTTGGATCCAAAAGGTTTGAAAGCTTGCTATTTTCATCTGGCCCGTTAACTCCATCCAT
TTTTCTCCGTCAAGTCAGCGGTATATCAGTCTTTTTTGCTAACGTAAACGGCAATTCGGTCTTTTTCACTTTATGTAAAACACACTGAATACCCCTGAAAAAGACCGAATTGCCCTTCAA
GCTAACAAAAAAGACGGAAGTACCCCTGACTTAACGGAGAAAATTGGATGGAGTTAACGAGCCGGATGAAAACAACAAGATTTCAAACCTTTTGGATCCAGATGCGGAAAAACAAACCTT
TGGCACGAAAGTCTCAAAACTGGCCAAACCTCGGGACGAAAATGGCATTTTACTCTTTATATCATTTATTAAGTTCTAGTCGAGCTGAAGAATATTGATATATATTTTTTCAGTGTGGGC
CGTTTATTCACCCCCAAGATTGCAAGTTATTATGAAGAGTTTTATAAAGCTAAGGGTGTAAACTTTGTCAAAGGCACAGTTCTGTCATCATTTGTTTTCGATGAAGATGGGAAGGTAAAT
TTTAAGCTCTTTTTTGCTCGGTTAGGGTGTTAAACGGGTGGTGTTTGCGGGCTGGCGGGTACAACGCGATATGAACCTGGAAATTTGACATGAACCCGAACACGACACGAATCCAATAAT
AGTGTCTGATATATGAACCCAGAAACGACCTGAATATTCGCGGGTCGACACAAACCGTTGAACTCGATTTTTATTATTATTATTGAAAATCATTTCTGCATTTTTGTACTTGAAATTTAT
AAATTTCTAACTAAATATACAAAAACGTATAAAACAATTATGTTTAAATTATAAAACTTGATGTGAATTTGTCTTTTTAACTTTTAAATTTTCACAAAAGAATGCCAAATCATGACATAA
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CTGACTTGGTAGTCGTCGGAATCGGAATCCGACCAAACACAAGTCTATTTGAAGGGCAACTCACTTTAGAAAAAGGCGGGATCAAAGTTAACAGCAGGTTGCAAACGAGCAACAGCTCTG
TGTACGCAGTAGGTGACGTGGCATCGTTTCCAGTCAAGATCTTTGGCGAAAGCCGACGACTCGAACACGTCGATGCCGCCAGAAAATCAGCTCGCCATGCTGTCGCCGCAATAATGGAAC
CCGACACAACACCAGAATTCGATTACTTGCCGTTCTTCTATTCCAGAGTTTTCTCATTTTCGTGGCAGTTCTACGGAGACAATTTAGGGGAAGTCATTTATTTCGGTGATTTTTCGGGAC
CCAGTTTCGGCGCGTACTGGGTGCACAAAGGTCATCTAGTTGGATCGTTTCTTGAAGGCGGAAGTAAAGAAGAGTATGAAGCGATAGCGAAAGTGACGAGGCTTAAACCAGCTGTTGATG
ATTTGAGTGAGCTCGAGCGGCAGGGTCTCGGGTTCGTGGTGGCGTTGAGCGAGAAGTTGCCGGTGGCGCCGGTGATAAACGTGGGTGGTTCGATGTCGACGGTTGTTTTGGAGAAACCGT
TGTACGCGTGGCATGCGACTGCTGGGGTGGTGGTGGCGGCGTCGATAGCGGCGTTTGCGTATTGGTATGGAAGAAGACGTCGACGATGGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGAAGAGCGTTTGTGTATGTGATACTTGGTGGGGGAGTTGCTGCCGGTTATGCAGCTCTTGAATTCACCAAAAAAGGTGTTTCTCACGGTGAACTCTGCATCATCTCCGAAGAACCT
GTGGCTCCTTACGAGAGACCCGCACTCAGCAAAGGCTTTCTACTTCCAGAAGCTCCGGCACGTCTTCCCGCATTTCACACTTGTGTCGGTGCCAATGAAGAAAGATTAACGCCGAAGTGG
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ACAGGTGCTCGGGCTTTGAGACTTGAAGAGTTCGGTGTAAGTGGATCAGATGCTGAAAATGTATGTTATCTACGTGATTTGGCTGACGCAACCAGGCTTGCGGACGTGATGCAAACCTCT
ACTGGCGGCAATGCGGTGGTCATTGGCGGTGGCTACATTGGAATGGAGGTTGCGGCGTCGTTGGTCATTAATAAGATTAATGTTTCAATGGTGTTCCCTGAGCCACATTGCATGGGCCGT
TTATTCACCCCCAAGATTGCAAGTTATTATGAAGAGTTTTATAAAGCTAAGGGTGTAAACTTTGTCAAAGGCACAGTTCTGTCATCATTTGTTTTCGATGAAGATGGGAAGGTCACCGGA
GTTAACCTCAAGGATGGAACCGATCTTCCTGCTGACTTGGTAGTCGTCGGAATCGGAATCCGACCAAACACAAGTCTATTTGAAGGGCAACTCACTTTAGAAAAAGGCGGGATCAAAGTT
AACAGCAGGTTGCAAACGAGCAACAGCTCTGTGTACGCAGTAGGTGACGTGGCATCGTTTCCAGTCAAGATCTTTGGCGAAAGCCGACGACTCGAACACGTCGATGCCGCCAGAAAATCA
GCTCGCCATGCTGTCGCCGCAATAATGGAACCCGACACAACACCAGAATTCGATTACTTGCCGTTCTTCTATTCCAGAGTTTTCTCATTTTCGTGGCAGTTCTACGGAGACAATTTAGGG
GAAGTCATTTATTTCGGTGATTTTTCGGGACCCAGTTTCGGCGCGTACTGGGTGCACAAAGGTCATCTAGTTGGATCGTTTCTTGAAGGCGGAAGTAAAGAAGAGTATGAAGCGATAGCG
AAAGTGACGAGGCTTAAACCAGCTGTTGATGATTTGAGTGAGCTCGAGCGGCAGGGTCTCGGGTTCGTGGTGGCGTTGAGCGAGAAGTTGCCGGTGGCGCCGGTGATAAACGTGGGTGGT
TCGATGTCGACGGTTGTTTTGGAGAAACCGTTGTACGCGTGGCATGCGACTGCTGGGGTGGTGGTGGCGGCGTCGATAGCGGCGTTTGCGTATTGGTATGGAAGAAGACGTCGACGATGG
TGA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CATTTACTTT TGCCCCATTT TATTATCATG CGGAATATTG TAGAGAGAGA AAGAGTGATG AACAAACAAT AGTTTTAGAG AGAGAAACCC AGAAATAGAT AAACAATTTG AAATGGGAAG  AGCGTTTGTG TATGTGATAC TTGGTGGGGG AGTTGCTGCC GGTTATGCAG CTCTTGAATT CACCAAAAAA GGTGTTTCTC ACGGTGAACT CTGCATCATC TCCGAAGAAC CTGTGGCTCC  TTACGAGAGA CCCGCACTCA GCAAAGGCTT TCTACTTCCA GAAGCTCCGG CACGTCTTCC CGCATTTCAC ACTTGTGTCG GTGCCAATGA AGAAAGATTA ACGCCGAAGT GGTACAAGGA  ACATGGAATC GAACTGATTC TGGGTACGCG CGTAAAGTCT GCTGACGTGA GGCGTAAAAC ATTACTCACT GCAGCAGGAG AAACCATTAG CTATAAGTAT CTTATCATTG CAACAGGTGC  TCGGGCTTTG AGACTTGAAG AGTTCGGTGT AAGTGGATCA GATGCTGAAA ATGTATGTTA TCTACGTGAT TTGGCTGACG CAACCAGGCT TGCGGACGTG ATGCAAACCT CTACTGGCGG  CAATGCGGTG GTCATTGGCG GTGGCTACAT TGGAATGGAG GTTGCGGCGT CGTTGGTCAT TAATAAGATT AATGTTTCAA TGGTGTTCCC TGAGCCACAT TGCATGGGCC GTTTATTCAC  CCCCAAGATT GCAAGTTATT ATGAAGAGTT TTATAAAGCT AAGGGTGTAA ACTTTGTCAA AGGCACAGTT CTGTCATCAT TTGTTTTCGA TGAAGATGGG AAGGTCACCG GAGTTAACCT  CAAGGATGGA ACCGATCTTC CTGCTGACTT GGTAGTCGTC GGAATCGGAA TCCGACCAAA CACAAGTCTA TTTGAAGGGC AACTCACTTT AGAAAAAGGC GGGATCAAAG TTAACAGCAG  GTTGCAAACG AGCAACAGCT CTGTGTACGC AGTAGGTGAC GTGGCATCGT TTCCAGTCAA GATCTTTGGC GAAAGCCGAC GACTCGAACA CGTCGATGCC GCCAGAAAAT CAGCTCGCCA  TGCTGTCGCC GCAATAATGG AACCCGACAC AACACCAGAA TTCGATTACT TGCCGTTCTT CTATTCCAGA GTTTTCTCAT TTTCGTGGCA GTTCTACGGA GACAATTTAG GGGAAGTCAT  TTATTTCGGT GATTTTTCGG GACCCAGTTT CGGCGCGTAC TGGGTGCACA AAGGTCATCT AGTTGGATCG TTTCTTGAAG GCGGAAGTAA AGAAGAGTAT GAAGCGATAG CGAAAGTGAC  GAGGCTTAAA CCAGCTGTTG ATGATTTGAG TGAGCTCGAG CGGCAGGGTC TCGGGTTCGT GGTGGCGTTG AGCGAGAAGT TGCCGGTGGC GCCGGTGATA AACGTGGGTG GTTCGATGTC  GACGGTTGTT TTGGAGAAAC CGTTGTACGC GTGGCATGCG ACTGCTGGGG TGGTGGTGGC GGCGTCGATA GCGGCGTTTG CGTATTGGTA TGGAAGAAGA CGTCGACGAT GGTGAGGGTT  ATGGGTTGGT GGGGGATTTG TTTGCATTGA TTCCACTATT TGATACCTTT ACCCATGTTG TGCAATTTGA TTAGGAGGTT TGAAGAACAA GAACACTCAT GTAATAGATT GATAAGCTAC  ATAACATCAT CAATATTCTA TATTATTATG TATAACATGT GTCTAGATAA AAAGTTATAT GTTTCTTTAA AATCATGCAA CTTCTTTTTG TTGATTTTCT TTAATTACAT GAAAAGATCA 
AGAAAGTCAA AACCACAAGT ATGCAAAGAA AACAACAATC AAGAATTTTC 

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