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Entry information : HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
Entry ID 14432
Creation 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Last sequence changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
Name (synonym) HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
Class CGFS Grx    [Orthogroup: GrxS001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaGrxS01
start..stop		 S start..stop
AtGrxS17 703 0 3..489 5..488
ThasGrxS17-2 702 0 3..489 5..490
ThasGrxS17-1 689 0 3..488 5..494
ThasGrxS17-1 271 1.18e-85 282..489 152..388
MpGrxS04 587 0 2..489 6..498
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '14432' 'complement(join(168229540..168230055,168231068..168231781,168232517..168232591,168236146..168236310))' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 168236146..168236310 163 N° 2 168232517..168232591 73 N° 3 168231068..168231781 712 N° 4 168229540..168230055 514
complement(join(168229540..168230055,168231068..168231781,168232517..168232591,1 68236146..168236310))


exon

Literature and cross-references HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr04 (168236310..168229540)
Protein sequence: HaGrxS01 (HanXRQChr04g0124081)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   489
PWM (Da):   %s   53219.06  
PI (pH):   %s   5.39
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MGVKDVKSKQELDNLVKDGSAVMVHFWASWCEASKHMDQVFNHLSGDFPHAHFVRVEAEEQPEISEAYSVSAVPYFVFLKNGKTVDTLEGAHPSELANKVSKIVGSIHAGEPAAPASLGM
AAGPSVLEAIQDLAKIDNSPRGKTQPPAPAGISDSLKTRLEKLTRSHPIMLFMKGNPEAPQCGFSKKAVEILKTENVKFGTFDILSDNEVREGLKKFSNWPTYPQLYCNGELLGGSDILI
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SELIGGSDIVLEMQKSGELEKVLVENGIMSLEDRLKKLVNSKPVMLFMKGTPDAPKCGFSSKVVNALKEEGIKFGSFDILSDEEVRQGLKTFSNWPTFPQVYYKGELIGGCDIILELKSN
GELASTLSE*

Retrieve as FASTA  
Remarks Warnings: The paralog 100013581 is in an intron of the proteins.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTGTGAAAGATGTGAAGTCAAAGCAAGAACTTGATAATCTTGTGAAAGATGGGTCAGCTGTTATGGTTCACTTCTGGGCTTCGTGGTGTGAAGCTTCTAAGCACATGGATCAAGTT
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TTTCGTCCCTGAGGTTTGGCCAGTTTTGCGACTTTCGTCTAAAGGTTTGTTTTTCCGCATCCGGCTACAAAAGGTTTGAAATCTTACAATTTTCATCCGGCTCGCTAACTCCATCTATTT
TTCTCTGGAGTAAACTGCCATTTTGGTCCCTATGGTTTGTCACTTTTGCCACTTTAGTCCAAAACTCAAACTTTTTGCATCTGGTCCCTGTGGTTTCAGTTTATTGCCATTTTGGTCCAA
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GGATGGAGTTAACGAGTCGGATGAAAATGGCAAGACTTCAAACCTTTTGGATCCAGATGCGGAAAAACAAACCTTTGTATGAAAGTCGCAAAACTGGCAAATCTCAGGGACGGAAATGGC
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AATCTTGATAATCTATCAGGTGTAGTCGATATTCTCAGAGAAGAAAAGGTTGATTTCAAGACTTTCGATATACTCTCAGATGATGAAGTAAGGCAAGGTCTAAAAGTATACTCAAACTGG
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GATATCATTTTGGAGCTTAAAAGCAATGGTGAGCTTGCATCTACCTTATCAGAGTAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTGTGAAAGATGTGAAGTCAAAGCAAGAACTTGATAATCTTGTGAAAGATGGGTCAGCTGTTATGGTTCACTTCTGGGCTTCGTGGTGTGAAGCTTCTAAGCACATGGATCAAGTT
TTCAATCATCTTTCTGGTGATTTCCCCCATGCCCATTTTGTTAGGGTTGAAGCTGAAGAACAACCAGAAATTTCTGAGGCATATTCAGTTTCCGCTGTGCCTTATTTCGTTTTTCTTAAG
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GAAAAACTCACCCGTTCTCACCCCATAATGCTATTCATGAAAGGAAACCCTGAAGCACCCCAATGCGGATTCAGTAAAAAAGCCGTTGAAATATTGAAAACCGAAAATGTTAAATTTGGT
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AGCGACGAGGAAGTTCGACAAGGGTTGAAAACATTCTCAAACTGGCCTACTTTCCCTCAAGTTTATTATAAAGGTGAGTTGATTGGAGGATGTGATATCATTTTGGAGCTTAAAAGCAAT
GGTGAGCTTGCATCTACCTTATCAGAGTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CAAAAAGCAG CGTATTTCCT CGGTAGGTTT TCGTTTCTTT GCTCCCCAAG GCATCCATCG TCTTCTGCAA TTCAGATCAG TATCCCCTTT AGAAAGAAAG CAAAAATGGG TGTGAAAGAT  GTGAAGTCAA AGCAAGAACT TGATAATCTT GTGAAAGATG GGTCAGCTGT TATGGTTCAC TTCTGGGCTT CGTGGTGTGA AGCTTCTAAG CACATGGATC AAGTTTTCAA TCATCTTTCT  GGTGATTTCC CCCATGCCCA TTTTGTTAGG GTTGAAGCTG AAGAACAACC AGAAATTTCT GAGGCATATT CAGTTTCCGC TGTGCCTTAT TTCGTTTTTC TTAAGAATGG CAAGACAGTT  GATACATTGG AAGGCGCACA TCCATCTGAG CTGGCGAACA AAGTTTCAAA AATCGTGGGG TCAATCCATG CTGGCGAACC GGCTGCACCC GCGAGCTTAG GGATGGCAGC GGGACCCTCG  GTTCTCGAAG CAATTCAAGA TCTCGCTAAA ATCGACAACT CACCACGTGG GAAAACGCAA CCGCCAGCGC CAGCTGGCAT TAGCGATTCA CTGAAGACCC GTCTCGAAAA ACTCACCCGT  TCTCACCCCA TAATGCTATT CATGAAAGGA AACCCTGAAG CACCCCAATG CGGATTCAGT AAAAAAGCCG TTGAAATATT GAAAACCGAA AATGTTAAAT TTGGTACTTT TGATATCCTT  AGTGACAACG AGGTTCGTGA AGGTTTAAAA AAGTTTTCGA ACTGGCCCAC TTATCCTCAA CTCTATTGTA ACGGAGAGCT TCTTGGAGGG TCTGATATTT TAATTGCAAT GCATGAGGGG  GGTGAATTGA AACAAGCTTT TGCCGATCAT GGGGTCGGAA ATGATGATGT CAGCAAGTCA ACTGTGGCGG GACCCGATGG TCAACAGGCT GGAGTTACCA ATTCCACTGG GTTGAGTTTG  GCTTTGACTT CTCGCCTTGA AAGTCTCATT AAGTCGGCTC CTGTTATGCT TTTTATGAAG GGAACTCCAG ATGAACCTAG ATGTGGCTTC AGCCGAAAGG TAGTCGATAT TCTCAGAGAA  GAAAAGGTTG ATTTCAAGAC TTTCGATATA CTCTCAGATG ATGAAGTAAG GCAAGGTCTA AAAGTATACT CAAACTGGTC AAGTTACCCG CAACTCTACA TAAAAAGCGA ACTCATTGGC  GGATCAGATA TCGTTTTAGA AATGCAAAAG AGCGGAGAAC TTGAAAAAGT CTTGGTTGAA AATGGTATCA TGTCTCTCGA AGATCGTTTG AAGAAATTAG TTAATTCCAA ACCCGTGATG  CTCTTTATGA AGGGCACCCC AGATGCCCCA AAATGCGGTT TTAGCTCAAA GGTCGTAAAT GCCCTTAAGG AGGAAGGTAT AAAGTTTGGA TCTTTTGACA TTTTGAGCGA CGAGGAAGTT  CGACAAGGGT TGAAAACATT CTCAAACTGG CCTACTTTCC CTCAAGTTTA TTATAAAGGT GAGTTGATTG GAGGATGTGA TATCATTTTG GAGCTTAAAA GCAATGGTGA GCTTGCATCT 
ACCTTATCAG AGTAAAAGGT AAGACTTTTA TCAGTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTT 

Retrieve as FASTA