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Entry information : HaGrxS05 (HanXRQChr16g0504211)
Entry ID 14436
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaGrxS05 (HanXRQChr16g0504211)
Name (synonym) HaGrxS05 (HanXRQChr16g0504211)
Class CGFS Grx    [Orthogroup: GrxS002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaGrxS05
start..stop		 S start..stop
HaGrxS02 303 5.01e-108 1..158 1..156
ThasGrxS14-1 228 2.65e-78 2..158 9..165
ThasGrxS14-2 227 1.43e-77 8..158 15..165
AtGrxS14 215 7.02e-73 2..158 9..167
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '14436' 'join(26670431..26670481,26671278..26671412,26671506..26671605,26673936..26674002,26674113..26674191,26674285..26674329)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 26670431..26670481 49 N° 2 26671278..26671412 133 N° 3 26671506..26671605 98 N° 4 26673936..26674002 65
N° 5 26674113..26674191 77 N° 6 26674285..26674329 43  
join(26670431..26670481,26671278..26671412,26671506..26671605,26673936..26674002 ,26674113..26674191,26674285..26674329)


exon

Literature and cross-references HaGrxS05 (HanXRQChr16g0504211)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr16 (26670431..26674329)
Protein sequence: HaGrxS05 (HanXRQChr16g0504211)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   158
PWM (Da):   %s   17831.83  
PI (pH):   %s   6.35
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MLFKGFRSMEYSRTTASASGSFLQHGMRFSTSVPNDPDTHDDFKPTNKLENSEITLKDIVEQDVKDNHVMIYMKGDPEQPRCGFSSLAVRVLSEYRVPIHSRNILEDPELKNAVKAFSMW
PTFPQIFINGEFIGGSDIILNMHNGELKEKLNKTSSD*

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCTTTTTAAGGGATTTAGGTCCATGGAGTATAGTCGTACAACTGCTTCGCGGTATGATTTGTTTAACTTATAACGGTTTTTTATTTGTTTATAGGTCAGAGTTAGGGTTATAAATTGT
TTTAATTTGATGTTTTCGCCATTAATTTATGCTCTCTTGAGAAGATTTGTTTTAGAACGGACCAGAAGTAGTTTTCGTTTGACATAATTGATTGCTGAAAGTGCAAGTGTAGTAGGTATA
TTGTTTTCGATAGAATTGAGAGTTTTATGTCAGTTTTGGTTATGTTTTTTTGTTGTTTTCGACTCGAGTGGAGTTTTCTGAGTAGCTAGGGCTTGGAAATTGGATGTTGAATGAGTTTTG
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AACTTGTAGATGGTTTGCTATACATGATTCAAGTAACTAATAATTGATAACAGGGATACTCTGTCGAAGAACAACTGTTGTTAATTTGATGTGTTGTTTTGTTTTCTGATCTGTTTGTCG
TTCTTTGGATAACTAGACGATAACAGTGGTTAAAAGGGTTAGTTTTATTAAAAAAACATTGATGCTTTGTAGAATTGTAGTACCAAATTTTGTATTATCTTACACAAGTTGTATGCTTCA
ATCGATTAGGCCTCTGGATCATTCTTGCAGCATGGGATGAGATTTTCAACTAGTGTGCCCAATGATCCTGATACACATGATGATTTCAAGCCCACAAATAAGCTGGAGAATTCTGAAATT
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ATGTCAAGGATAACCATGTGATGATTTATATGAAAGGGGATCCAGAACAACCGCGCTGTGGATTCAGCTCATTAGCAGTCAGAGTATTGAGTGAATACCCCGTACGTTTTCGTATTATAA
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CAACACCAAACAGCCTATACACATAGTTACATATCTACGACCATACACTACACCTAGAAACACAACTGTACAAAACATCCTATACACATAGTTACTTATGTACGCCCATACACTACACCT
AAAAACACAATTGTACCCTCTCCTAGAAATCCTTAACCTTAATCCTACGTCTCCACGAGCTCCTATCATGGACCATGTTCTCAGAGAGGTGCAATTTTTGCAAATCCTGCCTAATCCGCT
CATCCCAAGTAATTTTGGGTCTGCCTCTACTCCTCCTCCCCTCCACCTCGAGGGTTTCAACCACTCTAACTGGTTCTATCGTCTGCCTCCTCTTCACCTGCCCAAACCATCTCAATCTTC
CCTCCTTTATCTTATCTGATATACTAGTTACTTCTAACATTTCCCTAAAAACATCATTTCTTATCCGGTCTAACCTTGTGTGGCCACACATCCATCTTAGCATTCTCATCTCTGCTACCT
CCATCTTGCGTGCCTGTACTTCCTTAATGGCCCAACATTCAGTTCCATATAACATAGCAGGTCTAATTGCAACCCTATAAAATTTCCCTTTCAATTTCGTTGGGAACCTCCTATCGCACA
ATACCCCAGTGGCAGCTCTCCACCTACACCATCCGACCTGGATGCGGTGGGCAACGTCACTATCTATCTCCCCATCCCTCTGGACAAACGATCCTAGATACTTGAACTTAGTCACCTGCG
GGACCGCTTGACTGTCAATGGTGATCTGAATGTCCTCATCGTTGTCTACTCCACTAAAGTCGCAATACAAGTACTCAGTCTTAGATCGACTAATCTTTAAACCTCTTCCCTCTAAAGCTG
CTCGCCACTCTTCTAACCTCGCATTCAGGCTTTGTTTACTATCAGCAACTAACACGATATCATCTGCAAAAAGCAGGCACCACGGAAGAGCCCCCTGAATTAACTTTGTCAACTCATCTA
GGATAACTGCAAATAGAAAAGGGCTCAAAGCGGACCCTTGGTGGAGTCCTACCTCCACCGGGAAAGAATCAGTATCCCCTACAGGCGCTCGGACACTAGTCTCAGTCCTAACATACATAT
CCCTAATTAAGTCTATATACTTCCCAGAAACTCCTCTACTCTCCAAACTATCCCAAATCAGTCTACGTGGCACACTGTCATAGGCCTTTTCAAGATCAATGAACACCATGTGTAGGTCCC
GTTTCTTCTCCCTATACTTCTCCATTAGTCTCCTTAGAATATGTATTGCTTCCGTAGTCGATCGCCCTGGCATAAAACCAAATTGGTTTACCGTGACTTGGGTTTCTCTTCGGATTCTCG
TCTCAATTATTCTCTCCCATAATTTCATAGTATGCCCTAGCAACTTAATCCCTCTATAATTCCCACAACATTGGGCGTGTATACACATAATATAAATCTTAAATTGTATACGAACAATCA
GTTTAAAAAGAACAAAAACTTGAATGTGTTTATTCTTGCTTCAGTTTAGTTTGGTTGTTTTCGATTCCTTTGTCTACCTCTAGTTCGATGATGATTTATGGCGTATAAAAACCATTTCAT
CTGCGACATACCTGAATATATCATCAAATATAGTAACAATAATTAATTAATTATCAAATAAATAGGTAACAATTACACACTATTCTATAAGAACATGTTTAAATTTTGGTCACCTTCATA
ACTTAACTCTAATATTTATGTGAATGTGAATCTGGTAGAAGCAGCTTAATTGCCAAATTTGTTGCATTTTTGCATATGATCTCTTCTTTTTTTCATTTGGATTTAGTGTATTTTAGTTAT
TATTCTGATTATTAATGTGGTTTCTTCACAGGAGTCCCTATACATTCAAGAAACATACTAGAAGATCCCGAGCTTAAGAATGCTGTAAAAGCTTTCAGAGGTAACAAGCACTTTACATAG
AAATTTATTTCAAAATAAGCAGTTTAGGAGGTTGCATGTAAATTACGCATTTGGTGACTCCGCTAATTTCTTTGTACGGTTTATGTGCAGCATGTGGCCTACATTTCCTCAGATATTTAT
AAATGGAGAATTTATTGGAGGATCAGACATTATTCTCAATATGCATCAGAGGTTAGTTTCTGCATCTTTGGTCTCTCATTCTATGGTCATATTTAATTTTAAAATGTGAAAAACATACCG
CTTAATGTTTTTGGTTTTGTGCAGAATGGTGAACTGAAGGAGAAGCTAAATAAAACATCTTCAGATTAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCTTTTTAAGGGATTTAGGTCCATGGAGTATAGTCGTACAACTGCTTCGGCCTCTGGATCATTCTTGCAGCATGGGATGAGATTTTCAACTAGTGTGCCCAATGATCCTGATACACAT
GATGATTTCAAGCCCACAAATAAGCTGGAGAATTCTGAAATTACTCTAAAGGACATTGTTGAGCAGGATGTCAAGGATAACCATGTGATGATTTATATGAAAGGGGATCCAGAACAACCG
CGCTGTGGATTCAGCTCATTAGCAGTCAGAGTATTGAGTGAATACCGAGTCCCTATACATTCAAGAAACATACTAGAAGATCCCGAGCTTAAGAATGCTGTAAAAGCTTTCAGCATGTGG
CCTACATTTCCTCAGATATTTATAAATGGAGAATTTATTGGAGGATCAGACATTATTCTCAATATGCATCAGAATGGTGAACTGAAGGAGAAGCTAAATAAAACATCTTCAGATTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TCATTCTAGA GTTCCATAAC CTACATAAAA GGTCCTTGAG CTATCATTCT TTTTCACGTT TACACTCAAA AAGCAAAATA TAAAACCCCC CAGGGCAGTG TTGAGGACGA AAACAATCAT  CAAACAACCA TTAATCCTTC TTCCACCGAG TTATCTTTCT AATACGATGG CTAGGGTTTT ATCGAACATG CTTTTTAAGG GATTTAGGTC CATGGAGTAT AGTCGTACAA CTGCTTCGGC  CTCTGGATCA TTCTTGCAGC ATGGGATGAG ATTTTCAACT AGTGTGCCCA ATGATCCTGA TACACATGAT GATTTCAAGC CCACAAATAA GCTGGAGAAT TCTGAAATTA CTCTAAAGGA  CATTGTTGAG CAGGATGTCA AGGATAACCA TGTGATGATT TATATGAAAG GGGATCCAGA ACAACCGCGC TGTGGATTCA GCTCATTAGC AGTCAGAGTA TTGAGTGAAT ACCGAGTCCC  TATACATTCA AGAAACATAC TAGAAGATCC CGAGCTTAAG AATGCTGTAA AAGCTTTCAG CATGTGGCCT ACATTTCCTC AGATATTTAT AAATGGAGAA TTTATTGGAG GATCAGACAT  TATTCTCAAT ATGCATCAGA ATGGTGAACT GAAGGAGAAG CTAAATAAAA CATCTTCAGA TTAAGACAGG ATTCTTGCTG CTAAATGATA TTTGATTTAT TATGTGATTT TAAAGCGCGG  TTCTTATTAC TACCGAGTGT TGAAATAAAT GTTACTGTTG ACAGTTTAGA CTATGCGGCA TGGAGACTTG TTTACTTTTC TTGATTCTCC TTGGCAGTTT TCATGTCTCT TATATGTTGC  TTAGAAATGA CGACTACTGC AAAAACGATG CTCGTCTTTT TTAAAAGCTA TTGTTGTACC TGTATGGGCT GTATTTGGTA GGGATTGTCG CAATTGTGGT GCGTGGTGGG CTGAATTGAT  CAACCTAAAC ACGGCCTATG CATATTTGTA TCAAAAACAT CAACCCGACC CACTTGAAAT GGTGTACCTA AACACAAACT GTGTTGTAGT ATGCTTATCT ATGAGTTGTA AACAAGTTGA  AATGAATGTT AAAAAAAGGG TAGGTGGGTT GATCTTATAA AATATGTATT TTTTATTCTA ATTTTAAATG GGTTAACGGT TAACCTGTCT AATTAAAAGG AGTGAACATG TTAACCTGGA  TATAATCTGT TTGGTTAAAT GGATTATACA AGTCACCCGA ACAATGCATA TTAGACGTGA AAGACTAAAA CGTGTTTAAT TAAACCGGTT ACCAACTCTA TTATTTTTGT TAACAAGAAT 
TAGTAGTGGC TTTGCCCTCT TAT 

Retrieve as FASTA