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Entry information : HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
Entry ID 14492
Creation 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
Name (synonym) HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
Class Other Thioredoxin    [Orthogroup: Trx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaTrx04
start..stop		 S start..stop
ThasTrx04 239 3.67e-82 7..175 20..184
AtTrx04 236 5.61e-81 36..175 45..183
PpaTrx05 157 5.44e-49 3..175 10..190
CbraTrx07 140 1.36e-43 64..175 16..127
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 116361653..116361859 205 N° 2 116362272..116362394 121 N° 3 116363331..116363411 79 N° 4 116364316..116364432 115
join(116361653..116361859,116362272..116362394,116363331..116363411,116364316..1 16364432)


exon

Literature and cross-references HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr11 (116361653..116364432)
Protein sequence: HaTrx04 (HanXRQChr11g0341201)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   175
PWM (Da):   %s   19559.07  
PI (pH):   %s   5.29
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MLLAPTPFSFCAPPKLLSSATLSHPLKQRDAVTIFSTTTKSPVSSIQSSPRKLLATPPPGKFLRQDYLVKKYSAKEIQELIKGERNVPLVIDFYATWCGPCILMAQELEMLAVEYESNAM
IVKVDTDDEYEFARDMQVRGLPTLYFISPDPNKDAIRTEGLIPLQMMRDIIDNSM*

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCTACTCGCACCCACACCCTTTTCATTCTGTGCTCCACCAAAGCTTCTATCTTCTGCAACTCTTTCTCATCCCCTAAAACAAAGAGATGCTGTTACCATATTCTCCACCACAACAAAA
TCCCCTGTTTCTTCCATTCAATCTTCACCAAGAAAGCTGCTTGCTACACCCCCTCCAGGAAAATTTCTCCGACAAGATTATCTTGTTTTGTATGTTTTACTCTATACCCACTTCACACTT
GTGTTAATTTTGCATAAAGTTATTGTCTTTTTTATGGGTTTTGTGTATAATTTGAGATATGGTAAACAATATGGCAAAACTCCCACCCTAATTGCTTTAATTCATATGGGTATTGTGGCA
ATTTTGACTTTTGAAGTCAATGTTCTGACTTTCTTTAGGAATTTTGATAATTGGTAGTTATAATTTCTGGGTGTTTTGTTTGTTTCTTGAAAATCCCCTTTTGTAGAGTAAAGAGAGGAG
AAAATGATTTGGAAATTGATGCAAATTTGAAAGTTTTAACTATGTTGGTAGTTTATAGGTTTATATAGTCTTTGTGTATTTGGATTTCTTTGAGGTTATGTTTTTGGTTTAATGGTTTTA
TGTTTTGGATTTGTGTTGCAGAAAAAGTATTCTGCTAAAGAGATTCAGGAACTGATAAAAGGAGAAAGAAATGTACCGTTGGTTATAGATTTTTATGCAACATGGTGTGGGCCTTGTATA
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GTGTCATAACGTCATTAACATAATCTTTTTTCTTTGTAACACATTATTTTGAAAACTGTACAAAGTATGGTAGATAGGATCAAACGCTCGATGCAGAAGTTTATTTGTTTAAAGAGTTAA
ATGCCATTTTAGTCCCTGTGGTTTGGTCCATATTGCCAGTTTAGTCCAAAGGTTTCATTTTTCGCCTGCGGATCCAAAAAGGTTTCACTGTTGCCATTTTAGTCCACTGGGTTAACTTCA
TCCATTATTTCTGTTAACGAGCAGGGCAATTCGGTCATTTTATATGGCTGAATTGCCTTTCTAGTAAACAAAATTACATATAAAATGACCGAATTGCCATGCTCGTTAACAAAAATAATG
GATGAAGTTAACCCAGTGGACTAAGATGGCAACAGTGAAACCTTTTTGGATCCGTAGGCGAAAAATGAAACCTTTGGACTAAACTGGCAAAATGGACCAAACCACAGGGACTAAAATGGC
ATTTAACTCTTTTTTAAATATTCGAATTATGTGAAATAATTATTGTGTATTAAATACTTAAGACGATGATGATTATGCCTTTTGACAGGATTGGGATGATTATGGTGTTCTGTTATTAAG
TGTTTTGACTCCATCTATTTTGCTAGTAAATAGGTCCAAAAACCAGTATCACCTAATTTGCTACATGAGTTGTTCATTGTTTAAATACGCGCGTATGATGTATACACAGAATAATATTAA
TATAGCAAATTAGCAGATATGTATTACAATTAGTGAATTGGGATAAAAGGCTTATTTTTGTTGAACCGTATACAATAATGGTTAACACTGATAGGTTCCTTGAATTTAATTCCTTTCTAC
AGCTTGCAGTCGAGTACGAAAGTAATGCTATGATAGTGAAGGTGGACACAGATGATGAGTATGAATTCGCACGTGATATGCAGAGGCAACTCCCTCATCTCTTCTTGTTTAGTCGTCTAC
ATTATGTTTCAATCACCTTTTGCTTATTGGTCTTATAAGTATGTCTACTTAACCGTATCTAGTGAAGGCATACTTGTAAGTTACTTTTTATTTTTCATCAGGAGAAATTGATTAAAAAAC
GATATAATAGCAAACTCTTTTTTAGAGTAAATTACAAAAAGCGTCCTTTATGTATGTCACTTATTGCAAACTGTGTCCTTTGTCTTCAATAATTACAGAAAACGTACTCGACGTTTGCAG
ACCCTTGCAAGTTATGTTCTTTAGCCCTAACTCAGTTAATTTTTTGTGGTTAAATCTGACCAAATGGACCCCACATGAGGGTATTTTGGTCATTTTACTCTCATGTGAGGTCCATCTGTT
CAGATTTAACCACAAAAATACCCTCATGTGGGGTCCATTTGGTTAGATTTAACCACAAAAATTAACTGAGTTAGGGCTAAAGGACATAACTTGCAAGGGTTTGCAAACATCGAGTACGTT
TTCTGTAGTTATTGAAGACAAAGGACACAATTTGCTGACATACATAAAGGACGATTTTTGTAATTTACTCCTCTTTTTTATTAGTTTAAAGTAATGGGTTTTAATTTGCACTTTGAAACT
AGTTTATATGAGCAGTTTTTAGTGTTTGAATAAACAGATTCTGTTTCCCAGTCGTCTTATACTCTTATTATTTACGGGCGATATAATGTTCATATATGCCACCCTTCCTTTCTTGTAATC
TAATGTGATCGACTTCTCATCCATCTCTTATTTGATTGTGATTAATTGACACTAATAATCACTTTCAGAGAGCATTCCTTTGTTCAAGAACAAACCATAAATATTTTTCATTTGTAGTAT
AATAAATATGATTGTTACATGACTGACAGGTAAGAGGTCTACCGACATTGTACTTTATTAGTCCCGATCCAAACAAAGACGCAATTAGAACCGAAGGCCTCATTCCGCTTCAAATGATGC
GCGATATTATTGACAACTCCATGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCTACTCGCACCCACACCCTTTTCATTCTGTGCTCCACCAAAGCTTCTATCTTCTGCAACTCTTTCTCATCCCCTAAAACAAAGAGATGCTGTTACCATATTCTCCACCACAACAAAA
TCCCCTGTTTCTTCCATTCAATCTTCACCAAGAAAGCTGCTTGCTACACCCCCTCCAGGAAAATTTCTCCGACAAGATTATCTTGTTAAAAAGTATTCTGCTAAAGAGATTCAGGAACTG
ATAAAAGGAGAAAGAAATGTACCGTTGGTTATAGATTTTTATGCAACATGGTGTGGGCCTTGTATATTGATGGCTCAAGAGCTTGAAATGCTTGCAGTCGAGTACGAAAGTAATGCTATG
ATAGTGAAGGTGGACACAGATGATGAGTATGAATTCGCACGTGATATGCAGGTAAGAGGTCTACCGACATTGTACTTTATTAGTCCCGATCCAAACAAAGACGCAATTAGAACCGAAGGC
CTCATTCCGCTTCAAATGATGCGCGATATTATTGACAACTCCATGTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGCAAGTTTG CAAAACCCTC TCTCAAAACC TCTCCTCCCC TCTATCCATC TAAAACATTG AAAAACCCTC TTCAAACCTT CCTCTTTATC CATATCTTCA GGATCATCAA CCAAAATGCT  ACTCGCACCC ACACCCTTTT CATTCTGTGC TCCACCAAAG CTTCTATCTT CTGCAACTCT TTCTCATCCC CTAAAACAAA GAGATGCTGT TACCATATTC TCCACCACAA CAAAATCCCC  TGTTTCTTCC ATTCAATCTT CACCAAGAAA GCTGCTTGCT ACACCCCCTC CAGGAAAATT TCTCCGACAA GATTATCTTG TTAAAAAGTA TTCTGCTAAA GAGATTCAGG AACTGATAAA  AGGAGAAAGA AATGTACCGT TGGTTATAGA TTTTTATGCA ACATGGTGTG GGCCTTGTAT ATTGATGGCT CAAGAGCTTG AAATGCTTGC AGTCGAGTAC GAAAGTAATG CTATGATAGT  GAAGGTGGAC ACAGATGATG AGTATGAATT CGCACGTGAT ATGCAGGTAA GAGGTCTACC GACATTGTAC TTTATTAGTC CCGATCCAAA CAAAGACGCA ATTAGAACCG AAGGCCTCAT  TCCGCTTCAA ATGATGCGCG ATATTATTGA CAACTCCATG TGAAAGAAAG AAACCGAAGA TGAGTGATTA TTTTTTCCTG CATGTGTTGA AAAGTAGAGT AGATATATTA AGTTCATTTG  TTGTTACTTT TAGCACATTA AAGTTGTCAA GTGTATTGAT AAGATTAATA GCACTTTTTG TTAGGTTAAA GACTCTGTAT CAATCTTTGT GAGCGGATTA TTTGTATCGA GAGCAATGTA 
CTTTGGTTTA GAAACCCATC GGTCTACTTA AAAACATCTA GACTATTATG TCCGAAACAT AATATTATGA GCTCTCTAAC GACTTTCGTA TCTTTAT 

Retrieve as FASTA