View Redoxidase 14513

Entry information : HaTrxO (HanXRQChr09g0258391)

Entry ID	14513
Creation	2017-11-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes	2017-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status	complete
Reviewer	Not yet reviewed
Last annotation changes	2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))

Peroxidase information: HaTrxO (HanXRQChr09g0258391)

Name (synonym)

HaTrxO (HanXRQChr09g0258391)

Class

Thioredoxin Type O [Orthogroup: TrxO001]

Taxonomy

Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus

Organism

Helianthus annuus (Sunflower) [TaxId: 4232 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue type

N/D

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	HaTrxO start..stop	S start..stop
ThasTrxO01	165	1.76e-52	68..188	72..192
AtTrxO01	160	2.31e-50	67..189	72..194
AtTrxO02	158	5.05e-50	67..189	37..159
MyspiTrxH15	155	1.49e-48	6..189	6..192

Gene structure Fichier

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	143882574..143882802	227	N° 2	143885098..143885163	64	N° 3	143885253..143885303	49	N° 4	143885443..143885522	78
N° 5	143885879..143885923	43	N° 6	143886097..143886195	97
join(143882574..143882802,143885098..143885163,143885253..143885303,143885443..1 43885522,143885879..143885923,143886097..143886195)

Literature and cross-references HaTrxO (HanXRQChr09g0258391)

DNA ref.	HanXRQ genome: HanXRQChr09 (143882574..143886195)

Protein sequence: HaTrxO (HanXRQChr09g0258391)

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	189 (294)
PWM (Da):	20728.47 (32213.5)
PI (pH):	8.79 (9.96)	Peptide Signal:	cut: 25 range:25-318

Sequence
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Send to Peroxiscan

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MRGIFAVRRMLRNGVYCGSLYSSVGEIASASSSNPATIPYSYSLS
SVTKPSWSLTVSKFQSGQHPSNRNHFSSSSSGQSRVVTVESEDQFNSLLRKVQDESLPAIFYFTAVWCGPCRFISPLIGELSEKYTNVTTYKIDIDEGLRSALEKLDISAVPTLHFFVGGKKVSEIVGADVQRLKTTMESLYK*

Retrieve as FASTA

Remarks

DNA ►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGAGAGGAATCTTTGCAGTTCGTCGTATGCTTCGCAATGGAGTTTACTGTGGATCTCTCTACTCATCTGTCGGTGAAATTGCATCAGCTTCTTCTTCCAATCCAGCAACAATTCCGTAC
TCCTACTCCTTATCTTCTGTGACGAAACCTTCGTGGTCACTAACTGTCTCCAAGTTTCAATCTGGACAGCATCCTTCCAATCGGAATCACTTCTCCTCATCCTCATCTGTGGTGCGATTT
CTTATGTTATTCATTGATTTATGATATGCGTGTCTTGCTGGAATTAGGGTTTTCTGTTTATTATGTTTGTCATTTATTTGGTTATACAGTAACTTTTGTGATAATGTTAATGTTATTTGG
ATTAATAGATTGTGTCTCTTACTCAAGTTATCACAACACATATAAGCAATGTTTTCATTTTAAAATAAGATTTTGTCAAGCAATTGAACAACTAATTATTGATTTTTGCAATCGGATTCT
GGTTATTATTTAATTACTTTCAAAGCACACATTTAAGCATTCACTGCAGATCCTTGTATATATTATTTTTTTGTGATTTTCGACCTTTAATGTTATGAAAGTTCGTATTTATAATAAGTT
TTTGCCCAACACTCTAAATAGGGGTTAAATGCACATCCAAATACCCCATTTGGTCCATATACTTTTCGTTTGGTTTTTAGTAACATTTTTGTCAACAGAAGCATCTAAACCAATATTTTG
TCTTGAACTAAGCAGTTAATGCAGTAAAAAATTCAATATCGGTAATCGCGGTGTGATATTGGTAATTTTAATATCATGCTGAATTTATATATATAGCAATTTAACACTAACAATTCAGTA
TACTCTCCCACCATTAACAAATTAACCTTTTGCAACTTGCAAAACACTAACAATTAACAATTAAGACTTAAAACACTAATAATTGAAAGACAAATGCTAGAACTAAGAAGAAAGGTACTG
ATATCGGGAAAATTGATGATATATCAGTCCAATATTGGTCAATATCGCTGATAATATTGGTACCGATATTCTGACCGATATTTTGCACTGATATCTCACCTGGGGACTGAAGCCATATAT
CACCGATATTTCGGTGATATATCGCGATATTAACTACATAGGTCTTGAAGACCATCGTCTATTAATAATCACTGGCTTCTTTAATATAGTTAAAACAGTCAAACCTAAAACCATGCACAG
TCTATTGAGAAAAAATGGAACTAATACCGATACGAACCCTGATGCAGGTCAGATTGCGTCAGGTTTTAACCAGCTGCTGGGTGTTCCGATTAACCCAGATTAACCCAGTCCAGTTCTGTC
GCCGATCTTTCCCCGCCTAAACCTAATTGAACAAATTAATTTTCAGAAGTAGAAGTAGTGGAGCAGTTGTGTTCTATAACCATTAGCAATAGTATTAGATAGCATTCTTGTTCATTTGTT
GAGGTGTCGATGTTTTACTTATCAATTTAGGTTTCTAACCTTGTAACCAAAGACTAGTCCATCTCGAATCGGGCCGATTATTGTTTGTATTTCTAGTGAATCAGTTTCTGAATTCCAGTT
CTCAACACCTACCCTTAACAAGCAAGAATTATTTACAGAACATGTTCATTAACCATGTTGTTTATTAACTCTAACAATTATAAATAAATTCTTATCCATTGTCGTCAATAGTGGTCGCTA
TAGCGAATAGCGTAGCGTATAGGCCGAAGGTCGCTAGCTACAGGTATGTAGCCATAAAAAGCGGGATTTCAGTTTAGTTTTTTTTTAATATAAATAGCGATTAATATAGCTATAAAATAG
CTGGATTTTAGGTTTTTGTTAAATATACATGTAAAATAGCGTATGTAGCAGGGTATTTTGATATAATATACATACAAAATTTTTTTCTAGTGCATCGCTATTTATCGCTATTCGCTATGT
AGCATATAGGTACCTTATCGCTATTCGCCATTAACAACTATGCTCTTATCTTAAGGCATGTTATTCATATTGTGATCACCTTTACACTTAAAATTTATAAGACAAAGCTGTAGTTATTGA
CTTTGCATGTTCTTTATCAACCCAAAGAGACCGAGAAGGGTCCTTAACTTTACTTAGTCATGTGAATGCAGTTCTATGACAAACTTGCCATCCGTGTGCTTTGTGACACATGTAGTCAGT
TTCCGATATTACTTGCTATTATTTAATACTTGTTACTCTATAGCTATAAAATAAATCTTAAAGTGATGCTATCAACCTAATGGAGATGGCAACATGTATAAGATTTAGAAACAAAGACTA
TTCTCTAAATTTTAATCTGATTTAATGCTTGACATAATCTAATAAATGGGTAAAAAGTTTCACTGTTTATTTTGTATGCAAGCACCATGTGTATAGCATGGCTAAACTATATCCCACGAC
ATGCTAATTGCTAACATATTCTTGGTGATGGCACACAGGCTACTGCAGTTAATGTTTTTTCATAGAATGCATGCATTTTCTTAAATATTTTCTTTTAAAGATATACTTAAAGAACGATTA
TAACAGGTCAATCTAGAGTGGTGACGGTTGAGTCAGAAGATCAATTTAATAGTTTACTTCGCAAGGTTCAAGAGGTAAATAAACTTGCATCCATTATAATCATTCAACCATTAGTATATA
CTTACATGTTACGTGACTCATGTATGTCCGTAATGCTATCCAGATGAATCCTTGCCAGCAATCTTCTACTTTACTGCGGTTTGGTGTGGCCCATATGTGAGAATTATTCAATTTGCCTAT
TTATCTAGTTTTTTAAATGCAAGATTGAATTTTATATGTGCTGAATGCGTGAATATATTTTCCAACAATTCATGTTTATTCACAATATAACGCGTGTATATTTCTTCTCGCACAGGCAGG
TTTATATCCCCACTAATTGGGGAGTTGAGTGAGAAATACACTAATGTCACCACCTATAAGATTGACATTGATCAAAAGTAAGTGTCTTTCACGCTTGCAAGTGTTATTATTGTGTTGATA
AAGAATTAAAGAGAGCGAGTTATAGAAGTTTCAAAAATATAATATGTTGTGATGGTTGTAAATACTTTCTCTATGAAACTTGAATCGCCTACTTAAGTAGTTATATACGGTCTAGCTCCT
ATACGTTTTTTTATTAATCAGTCAACGTTTGTTCATGGTGCACATGGGTTTCTTATTGGGTTGAGTTGTGACGGTGAAACAAAGGGATGCCTTTTTGTAGATAATTTTTCTTTCGTCTTT
GAACAATGATGCTTTCTGCCTTAATGTATTGTTATGAAATTTTCTTACATGTTCATTTATGTCCCAATTACAGGAAGGTCTGAGGAGTGCATTGGAGAAGTTAGACATTTCTGCTGTGTG
GTAAACAACTTTTGTTTAATTTAATAATTATTAATTATATTGTTATGGTAAAAATTCCATGAGGAGTATTTATAGTACAATTAGGTCGAGCAATTTATACCATAATCAAACTACAAAGGT
ATTTAAATATGGACATAATTTAGGAAATAATGATTGGCTTGTTGTGTGTGCAGCCAACTCTTCATTTCTTCGTAGGAGGGAAAAAAGTGTCGGAAATAGTTGGGGCAGATGTTCAACGAC
TGAAAACCACCATGGAGAGTCTCTACAAGTGA

Retrieve as FASTA

CDS►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

Retrieve as FASTA

cDNA►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

AACAATCGAT TCAACCCCCA TTTGAGAAAC TTTATACGAA GTTGAAGGAC CCAGACGAAA CTATATTAGG GTAAATAATA ACCCCCAAAC CAAACCTTCA TCAAACCACC ACTTGGATTA TCTATCAAAA CCCACACAGT CACACACACA ACACAAATGA GAGGAATCTT TGCAGTTCGT CGTATGCTTC GCAATGGAGT TTACTGTGGA TCTCTCTACT CATCTGTCGG TGAAATTGCA TCAGCTTCTT CTTCCAATCC AGCAACAATT CCGTACTCCT ACTCCTTATC TTCTGTGACG AAACCTTCGT GGTCACTAAC TGTCTCCAAG TTTCAATCTG GACAGCATCC TTCCAATCGG AATCACTTCT CCTCATCCTC ATCTGGTCAA TCTAGAGTGG TGACGGTTGA GTCAGAAGAT CAATTTAATA GTTTACTTCG CAAGGTTCAA GATGAATCCT TGCCAGCAAT CTTCTACTTT ACTGCGGTTT GGTGTGGCCC ATGCAGGTTT ATATCCCCAC TAATTGGGGA GTTGAGTGAG AAATACACTA ATGTCACCAC CTATAAGATT GACATTGATC AAGAAGGTCT GAGGAGTGCA TTGGAGAAGT TAGACATTTC TGCTGTGCCA ACTCTTCATT TCTTCGTAGG AGGGAAAAAA GTGTCGGAAA TAGTTGGGGC AGATGTTCAA CGACTGAAAA CCACCATGGA GAGTCTCTAC AAGTGAAGGT AGCCTTTTCT GTTATGTCAG AATCTTAAGC AATACAAGGT AAAAAGATAT AGATTGTTTA CAAATCATGT ATTAGGGCTC GACTTCTGCA TAGCCTTTGC GATTGTAAAC TCTACTTAAG TCAAACGCTT GAATTACTCA CTTGAATGCA TTGATCTTTT CGTTTTCCTC AAAGTTTCAC ACACATAGCT TTCAGCCTTT CACTCATGTT ATTATCTTCG ATTGTGACAA CCAACTTCAT TACTTGAGCC AACCCTCTGG GTTGCATGGC TGTGTTATCA CAGAATAAGA GTAGAGTTAT TGTACATTGA ATATTCACTT AAGAAACTAT TTGGAGATAA CTACTAACTT ATGGTATATG ATTTGTCTAA TCACTAAGTT GACAGGCACA CAGTCAACTT ATATAAAGTT GGCAGCTTCA CTTGACGACA ATTCTTAATT CTAACCAAGT GAAAGTTGTC AAAGCTGGCC AACGCATAGT TAGCTTTTAC ATAACTTGGA CGATTCATCA AGTATGTGCA CCGATCAACA CAAATACGTT CCATGTATAA AACATGTGTC ATTAATTCTA CTCTTTAACA CAACTGGACT GACAAACCAT ATAAGTGACC TTTAACCAGA CCTGTGTTGT ACCAACTTAG TTATATGTAT TTAGCTCGAG ATCAAAGGAA CTAGAGATCG AACAGTTAGT ATTTAGATAT AATGAACTAA
AATTGTTAGC AATGAATTGT AATTAG

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