1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : CrubPrx118Carubv10027498m.g
Entry ID 15032
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx118Carubv10027498m.g
Name CrubPrx118Carubv10027498m.g
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx118
start..stop		 S start..stop
CagraPrx81 698 0 1..337 1..337
AhalPrx01 672 0 1..337 1..337
AlyPrx72 671 0 1..336 1..336
NoffPrx72-1B 670 0 1..336 1..336
Literature and cross-references CrubPrx118Carubv10027498m.g
Protein sequence: CrubPrx118Carubv10027498m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336 (313)
PWM (Da):   %s   37392.02 (34796.7)  
PI (pH):   %s   9.09 (9.19) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-336
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKSLNIFVM ALSLIALSPL CLCSKSYGTG GYLFPQFYDH SCPKAQEIVQ SIVAKAFAND PRMPASLLRL HFHDCFVKGC DASILLDSSG TIISEKRSNP NRNSARGFEL IEEIKYALEQ  ACPETVSCAD ILALAARDST VITGGPSWEV PLGRRDARGA SLSGSNNDIP APNNTFQTIL TKFKRQGLDL VDLVSLSGSH TIGNSRCTSF RQRLYNQSGN GKPDLTLSQY YATLLRKRCP 
RSGGDQNLFF LDFATPFKFD NHYFKNLIMY KGLLSSDEIL FTKNRESKEL VKLYAENQEA FFEQFAKSMV KMGNISPLTG VKGEIRRICR RVNHAY* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAGT CATTGAACAT CTTTGTCATG GCTCTCTCTC TCATTGCATT ATCTCCTCTT TGTTTGTGTT CTAAATCCTA TGGAACTGGC GGATATCTCT TTCCTCAGTT CTACGACCAC  TCTTGTCCTA AAGCTCAGGA GATTGTTCAG TCCATTGTGG CTAAAGCATT CGCAAATGAT CCTCGCATGC CTGCCTCCTT GCTCAGACTC CATTTCCACG ATTGTTTCGT CAAGGTATCA  AACTTATCAA ACTTGATCTT AATTAAGCTT TAACAACATA CGATAATTTT TTTTATAACA ATTTTACATA TTGTTTCTCG TTGTGTATAT ATTGGTACCG CAGGGATGCG ATGCTTCGAT  ACTATTGGAC AGCAGCGGAA CCATAATCAG CGAGAAACGA TCAAATCCTA ACCGAAACTC AGCCCGTGGT TTCGAACTTA TCGAGGAAAT CAAATATGCC TTAGAACAAG CGTGTCCTGA  AACAGTTTCT TGCGCTGATA TCTTGGCTCT AGCCGCTAGA GACTCAACTG TCATCGTAAG TCATAACAAT TATTATTCAC CACACGCAAA ACTATATCAT GTTCATTCTC ATCAATTCGA  AAAATTAATT AAATGAACAT ATATATATAT ATACAGACGG GCGGACCGAG CTGGGAAGTA CCTCTAGGAA GAAGAGACGC GAGAGGAGCA AGCTTGAGTG GTTCCAACAA TGACATTCCT  GCTCCAAACA ACACTTTTCA AACCATCCTC ACTAAGTTCA AGCGTCAAGG ACTCGATCTC GTTGATCTTG TCTCCCTCTC TGGTAATATA TCCATCCATC ATAATCAACA GATTATAGTT  TACATTAGCT TTGCTGGTTT CGGTTGTAAG TTACAGAAAG GCTTGTAAAA CGTTATATAT GACATATGTA ATGATTCGCA GGAAGTCACA CCATAGGAAA CTCGAGATGC ACAAGTTTTC  GGCAGAGGCT ATACAACCAG TCCGGCAACG GAAAGCCTGA TCTGACTCTA AGCCAATACT ATGCAACCCT GTTGCGTAAA CGATGTCCGA GATCCGGGGG TGACCAGAAC CTCTTCTTCC  TCGACTTCGC GACCCCGTTC AAGTTCGACA ACCACTACTT CAAGAACCTG ATCATGTACA AAGGTCTATT GAGTTCTGAT GAGATTCTGT TCACAAAGAA CAGAGAGTCG AAGGAGCTTG  TGAAGCTATA CGCTGAGAAT CAAGAGGCCT TCTTCGAACA GTTTGCCAAA TCGATGGTGA AGATGGGAAA TATCTCTCCG TTGACTGGCG TGAAGGGAGA GATCCGACGC ATATGTCGGA 
GGGTTAACCA TGCTTATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAGT CATTGAACAT CTTTGTCATG GCTCTCTCTC TCATTGCATT ATCTCCTCTT TGTTTGTGTT CTAAATCCTA TGGAACTGGC GGATATCTCT TTCCTCAGTT CTACGACCAC  TCTTGTCCTA AAGCTCAGGA GATTGTTCAG TCCATTGTGG CTAAAGCATT CGCAAATGAT CCTCGCATGC CTGCCTCCTT GCTCAGACTC CATTTCCACG ATTGTTTCGT CAAGGGATGC  GATGCTTCGA TACTATTGGA CAGCAGCGGA ACCATAATCA GCGAGAAACG ATCAAATCCT AACCGAAACT CAGCCCGTGG TTTCGAACTT ATCGAGGAAA TCAAATATGC CTTAGAACAA  GCGTGTCCTG AAACAGTTTC TTGCGCTGAT ATCTTGGCTC TAGCCGCTAG AGACTCAACT GTCATCACGG GCGGACCGAG CTGGGAAGTA CCTCTAGGAA GAAGAGACGC GAGAGGAGCA  AGCTTGAGTG GTTCCAACAA TGACATTCCT GCTCCAAACA ACACTTTTCA AACCATCCTC ACTAAGTTCA AGCGTCAAGG ACTCGATCTC GTTGATCTTG TCTCCCTCTC TGGAAGTCAC  ACCATAGGAA ACTCGAGATG CACAAGTTTT CGGCAGAGGC TATACAACCA GTCCGGCAAC GGAAAGCCTG ATCTGACTCT AAGCCAATAC TATGCAACCC TGTTGCGTAA ACGATGTCCG  AGATCCGGGG GTGACCAGAA CCTCTTCTTC CTCGACTTCG CGACCCCGTT CAAGTTCGAC AACCACTACT TCAAGAACCT GATCATGTAC AAAGGTCTAT TGAGTTCTGA TGAGATTCTG  TTCACAAAGA ACAGAGAGTC GAAGGAGCTT GTGAAGCTAT ACGCTGAGAA TCAAGAGGCC TTCTTCGAAC AGTTTGCCAA ATCGATGGTG AAGATGGGAA ATATCTCTCC GTTGACTGGC 
GTGAAGGGAG AGATCCGACG CATATGTCGG AGGGTTAACC ATGCTTATTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAGT CATTGAACAT CTTTGTCATG GCTCTCTCTC TCATTGCATT ATCTCCTCTT TGTTTGTGTT CTAAATCCTA TGGAACTGGC GGATATCTCT TTCCTCAGTT CTACGACCAC  TCTTGTCCTA AAGCTCAGGA GATTGTTCAG TCCATTGTGG CTAAAGCATT CGCAAATGAT CCTCGCATGC CTGCCTCCTT GCTCAGACTC CATTTCCACG ATTGTTTCGT CAAGGGATGC  GATGCTTCGA TACTATTGGA CAGCAGCGGA ACCATAATCA GCGAGAAACG ATCAAATCCT AACCGAAACT CAGCCCGTGG TTTCGAACTT ATCGAGGAAA TCAAATATGC CTTAGAACAA  GCGTGTCCTG AAACAGTTTC TTGCGCTGAT ATCTTGGCTC TAGCCGCTAG AGACTCAACT GTCATCACGG GCGGACCGAG CTGGGAAGTA CCTCTAGGAA GAAGAGACGC GAGAGGAGCA  AGCTTGAGTG GTTCCAACAA TGACATTCCT GCTCCAAACA ACACTTTTCA AACCATCCTC ACTAAGTTCA AGCGTCAAGG ACTCGATCTC GTTGATCTTG TCTCCCTCTC TGGAAGTCAC  ACCATAGGAA ACTCGAGATG CACAAGTTTT CGGCAGAGGC TATACAACCA GTCCGGCAAC GGAAAGCCTG ATCTGACTCT AAGCCAATAC TATGCAACCC TGTTGCGTAA ACGATGTCCG  AGATCCGGGG GTGACCAGAA CCTCTTCTTC CTCGACTTCG CGACCCCGTT CAAGTTCGAC AACCACTACT TCAAGAACCT GATCATGTAC AAAGGTCTAT TGAGTTCTGA TGAGATTCTG  TTCACAAAGA ACAGAGAGTC GAAGGAGCTT GTGAAGCTAT ACGCTGAGAA TCAAGAGGCC TTCTTCGAAC AGTTTGCCAA ATCGATGGTG AAGATGGGAA ATATCTCTCC GTTGACTGGC 
GTGAAGGGAG AGATCCGACG CATATGTCGG AGGGTTAACC ATGCTTATTA A 

Retrieve as FASTA