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Entry information : CrubPrx79Carubv10005239m.g
Entry ID 15077
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx79Carubv10005239m.g
Name CrubPrx79Carubv10005239m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx032]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx79
start..stop		 S start..stop
CagraPrx32 668 0 1..326 1..326
BstrPrx05 619 0 1..326 1..326
NoffPrx45-1A 614 0 1..325 1..325
TsPrx45 613 0 1..326 3..328
Literature and cross-references CrubPrx79Carubv10005239m.g
Protein sequence: CrubPrx79Carubv10005239m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   325 (300)
PWM (Da):   %s   35977.2 (33240.8) Transmb domain:   %s   o396-415i528-550o578-600i758-775o
PI (pH):   %s   9.96 (9.98) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-325
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGKNNAQTIF SIFALLLLLS SCVSAQLRTG FYQRSCPNVE NIVRNAVRQK FQQTFVTAPA TLRLFFHDCF VRGCDASIMI ASPSERDHPD DMSLAGDGFD TVIKAKQAVE RDPNCRNKVS  CADILALATR EVVVLTGGPS YPVELGRRDG RLSSQASVQN QLPQPGFNLN QLNSMFSRHG LSQTDMIALS GAHTIGFAHC GKFSKRIYNF SPRTRIDPSI NSRYALQLRQ MCPIRVDPRI 
AINMDPVSPR TFDNAYFKNL QQGMGLFTSD QVLFTDQRSR STVNTFANSE GAFRQAFISA ITKLGRVGVL TGNAGEIRRD CSRVN* 

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Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAATTTTTAT ATATATTTAA ATAACCCAAA TTGTACAATT CATTTCAATC TTAACTTGCC TTTCTATCTA CTATAAAAAG AGACTCTCTA ACAACTCTGA AGATTAAAAC ATTTTCATTG  GATATTATTA GCCATGGGGA AGAATAATGC TCAAACCATC TTCTCCATCT TTGCTCTTCT TCTTCTCCTT TCTTCATGTG TCTCTGCTCA GCTCCGGACA GGTTTCTACC AGAGGTCATG  TCCCAACGTC GAAAACATCG TCCGTAACGC CGTCCGTCAG AAATTCCAGC AGACTTTCGT CACCGCCCCG GCCACTCTCC GCCTCTTCTT CCACGATTGC TTCGTTCGCG TACGTTACAA  TATTTCTATA TATCTATATT CATATATAAT ATAGGAACCT TTATATATTT CAAAACCTCT AGATTAGTTA GAGTTTATAT TATCTTTACG TACGTTCTTA TTTTGATATG GATTATTTCA  GGGATGTGAC GCGTCGATAA TGATAGCATC ACCGTCGGAG AGAGACCATC CAGATGACAT GTCATTGGCC GGAGACGGGT TCGACACGGT GATTAAGGCG AAGCAAGCCG TTGAAAGAGA  TCCTAACTGC CGCAACAAAG TCTCATGTGC TGACATTTTG GCTCTCGCCA CTCGTGAAGT CGTGGTTTTG GTAATTTATT TACCTTTCTT TAAATTATTA CATAACTTAG TATATATATA  TTCCTTTCCT TTTCCCCCTT TATTACATAT AACGTCCTAG GTATTGAAAA ACCGGTTTTG TTATTTGTGT GAAAAGGCTA ATCATATTAT TAAAATATAC AAAGGAAGCA TGGTTCGATC  AGACTTCGAG TTAACAAAAT AAAGTAATGT TAATTTGTCA GTTTTGACAC CTTTTATTGG CGGCTTGTGA TTATTTTTTA TACAAGTACA AGTGATCACA GATCACATAT AGATATAGTC  CGAATTAAAA CGTATTATTG AACATTGATA TTTAGACTAT AATAATATAA CTAAAAATTG CAGACCGGAG GACCGAGCTA CCCGGTGGAG CTAGGGAGGA GAGACGGCAG ATTATCATCA  CAAGCCAGCG TACAAAACCA ATTGCCTCAG CCCGGTTTTA ACCTAAACCA GCTCAATTCC ATGTTCAGCC GTCACGGTCT TTCACAAACT GACATGATCG CCCTCTCAGG TACCTAACCG  AACTAAACCG ATATATTTTC GTACTTCTAA TTAATCTTAT GTTATGATAT ACACACACAG TAGCTAGTAT TTATGTTATT GGTGTATTTG TTCAGGAGCG CATACGATAG GATTCGCACA  TTGTGGGAAA TTCTCAAAGA GAATATACAA TTTTAGCCCT AGAACACGTA TAGACCCAAG TATTAACAGT CGATACGCAC TTCAACTACG ACAGATGTGC CCGATCCGGG TCGACCCGAG  AATCGCTATC AACATGGATC CCGTGAGCCC ACGTACATTC GACAACGCCT ACTTCAAGAA TCTACAACAA GGGATGGGTT TGTTTACGTC AGACCAAGTC TTGTTCACGG ACCAACGTTC  TAGGTCTACG GTTAATACGT TTGCCAACAG TGAAGGAGCT TTTAGACAAG CTTTTATCTC GGCTATCACC AAACTTGGTC GGGTTGGTGT TCTCACTGGT AATGCTGGTG AGATTCGAAG  AGATTGTTCA CGTGTCAATT AGTCTCCTTT TTTTTTTTCT TTTATTCCTT GAGAGGATTT GTTTTTTATT CTGTTAAATA AAAAGTTAAT TTTCTTGTTG TTAAAAATAA GGAGTATAAA 
AGTGTTCCAT TGGGAAACTT GAATTAATAA GATGGA 

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CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAAGA ATAATGCTCA AACCATCTTC TCCATCTTTG CTCTTCTTCT TCTCCTTTCT TCATGTGTCT CTGCTCAGCT CCGGACAGGT TTCTACCAGA GGTCATGTCC CAACGTCGAA  AACATCGTCC GTAACGCCGT CCGTCAGAAA TTCCAGCAGA CTTTCGTCAC CGCCCCGGCC ACTCTCCGCC TCTTCTTCCA CGATTGCTTC GTTCGCGGAT GTGACGCGTC GATAATGATA  GCATCACCGT CGGAGAGAGA CCATCCAGAT GACATGTCAT TGGCCGGAGA CGGGTTCGAC ACGGTGATTA AGGCGAAGCA AGCCGTTGAA AGAGATCCTA ACTGCCGCAA CAAAGTCTCA  TGTGCTGACA TTTTGGCTCT CGCCACTCGT GAAGTCGTGG TTTTGACCGG AGGACCGAGC TACCCGGTGG AGCTAGGGAG GAGAGACGGC AGATTATCAT CACAAGCCAG CGTACAAAAC  CAATTGCCTC AGCCCGGTTT TAACCTAAAC CAGCTCAATT CCATGTTCAG CCGTCACGGT CTTTCACAAA CTGACATGAT CGCCCTCTCA GGAGCGCATA CGATAGGATT CGCACATTGT  GGGAAATTCT CAAAGAGAAT ATACAATTTT AGCCCTAGAA CACGTATAGA CCCAAGTATT AACAGTCGAT ACGCACTTCA ACTACGACAG ATGTGCCCGA TCCGGGTCGA CCCGAGAATC  GCTATCAACA TGGATCCCGT GAGCCCACGT ACATTCGACA ACGCCTACTT CAAGAATCTA CAACAAGGGA TGGGTTTGTT TACGTCAGAC CAAGTCTTGT TCACGGACCA ACGTTCTAGG  TCTACGGTTA ATACGTTTGC CAACAGTGAA GGAGCTTTTA GACAAGCTTT TATCTCGGCT ATCACCAAAC TTGGTCGGGT TGGTGTTCTC ACTGGTAATG CTGGTGAGAT TCGAAGAGAT 
TGTTCACGTG TCAATTAG 

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cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAATTTTTAT ATATATTTAA ATAACCCAAA TTGTACAATT CATTTCAATC TTAACTTGCC TTTCTATCTA CTATAAAAAG AGACTCTCTA ACAACTCTGA AGATTAAAAC ATTTTCATTG  GATATTATTA GCCATGGGGA AGAATAATGC TCAAACCATC TTCTCCATCT TTGCTCTTCT TCTTCTCCTT TCTTCATGTG TCTCTGCTCA GCTCCGGACA GGTTTCTACC AGAGGTCATG  TCCCAACGTC GAAAACATCG TCCGTAACGC CGTCCGTCAG AAATTCCAGC AGACTTTCGT CACCGCCCCG GCCACTCTCC GCCTCTTCTT CCACGATTGC TTCGTTCGCG GATGTGACGC  GTCGATAATG ATAGCATCAC CGTCGGAGAG AGACCATCCA GATGACATGT CATTGGCCGG AGACGGGTTC GACACGGTGA TTAAGGCGAA GCAAGCCGTT GAAAGAGATC CTAACTGCCG  CAACAAAGTC TCATGTGCTG ACATTTTGGC TCTCGCCACT CGTGAAGTCG TGGTTTTGAC CGGAGGACCG AGCTACCCGG TGGAGCTAGG GAGGAGAGAC GGCAGATTAT CATCACAAGC  CAGCGTACAA AACCAATTGC CTCAGCCCGG TTTTAACCTA AACCAGCTCA ATTCCATGTT CAGCCGTCAC GGTCTTTCAC AAACTGACAT GATCGCCCTC TCAGGAGCGC ATACGATAGG  ATTCGCACAT TGTGGGAAAT TCTCAAAGAG AATATACAAT TTTAGCCCTA GAACACGTAT AGACCCAAGT ATTAACAGTC GATACGCACT TCAACTACGA CAGATGTGCC CGATCCGGGT  CGACCCGAGA ATCGCTATCA ACATGGATCC CGTGAGCCCA CGTACATTCG ACAACGCCTA CTTCAAGAAT CTACAACAAG GGATGGGTTT GTTTACGTCA GACCAAGTCT TGTTCACGGA  CCAACGTTCT AGGTCTACGG TTAATACGTT TGCCAACAGT GAAGGAGCTT TTAGACAAGC TTTTATCTCG GCTATCACCA AACTTGGTCG GGTTGGTGTT CTCACTGGTA ATGCTGGTGA  GATTCGAAGA GATTGTTCAC GTGTCAATTA GTCTCCTTTT TTTTTTTCTT TTATTCCTTG AGAGGATTTG TTTTTTATTC TGTTAAATAA AAAGTTAATT TTCTTGTTGT TAAAAATAAG 
GAGTATAAAA GTGTTCCATT GGGAAACTTG AATTAATAAG ATGGA 

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