1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : CrubPrx91Carubv10025622m.g
Entry ID 15089
Creation 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-08 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CrubPrx91Carubv10025622m.g
Name CrubPrx91Carubv10025622m.g
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx011]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella rubella    [TaxId: 81985 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CrubPrx91
start..stop		 S start..stop
CagraPrx53 710 0 1..349 1..349
BstrPrx84 638 0 1..349 1..349
AlyPrx24 629 0 1..348 1..346
TsPrx24 606 0 1..349 1..358
Literature and cross-references CrubPrx91Carubv10025622m.g
Protein sequence: CrubPrx91Carubv10025622m.g
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   348 (323)
PWM (Da):   %s   37940.67 (35102.1)  
PI (pH):   %s   8.96 (9.10) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-348
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKGLEIRIL FPLALFLVVL LCVDGKRFNN NGHKMRLGRW EGKLKMNFYH KSCPQAEQIV KEIVSKKVAA NPSLAPKLLR VHYHDCFVRG CDASLLLDSV PEKAASEKEA RPNLSLSGFE  IIDEIKSTLE KQCPETVSCA DILTLAARDA VSYEFQRPLW NVFTGRVDGR VSLATEAARD LPSAGANFTT LQNLFAESDL DVVDLVALSG AHTIGTARCG VFGRRLLNFT GKGDTDPSLD 
PNYAAFLKSK CSDKSLRLNS SAVVGMDPTG PLSFDSGYFV SLLRHKGLFT SDAALLTDPS AARIAGIFQN SGTFLAQFGR SMIKMSSIKV LTRGDQGGEI RKNCRLVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAAGG GTTTAGAGAT TAGGATTCTA TTCCCACTTG CTTTGTTTTT GGTTGTGTTA CTTTGTGTTG ATGGTAAGAG ATTCAATAAT AATGGCCATA AGATGAGGTT AGGAAGGTGG  GAAGGTAAGC TGAAGATGAA CTTCTATCAC AAAAGCTGTC CTCAAGCCGA GCAAATCGTT AAAGAGATTG TGTCCAAGAA AGTTGCGGCA AACCCTAGCT TGGCTCCCAA GTTATTGAGG  GTTCACTACC ATGACTGCTT TGTTAGGGTA TGATATACAT ATAGTTTTTT CGTTTATTAT TGGAACCTCT TTATTGTAAA GATACGTCTA ATGTGTATGA TTGATGATAT ATAGGGGTGC  GACGCATCTC TGCTTTTAGA TTCAGTCCCT GAGAAAGCCG CGTCTGAGAA GGAAGCGAGA CCTAACCTCT CGCTGTCCGG GTTTGAAATC ATCGATGAGA TCAAGTCTAC TCTCGAAAAA  CAATGCCCTG AAACAGTCTC TTGCGCTGAC ATCCTCACCT TAGCCGCCCG AGATGCCGTC TCCTATGAAG TAAGCAAACT CGTCTTCATG AATAGAAATA GTTACAAATT TAGTGTTTTA  CATAATAATC ACTTATGGTA GTTTTAGCTT CTTGCTGAAC AAATTAAACC AAGAATCCAT TCTCATTCGC TTTGTTTCAG AAGAGAATCA TGTTTTTACA TGCATGAAGT CGTGGATTAG  TTTGGATTTT GGTATATGAT TCAGAAAGTG ATGAAATTTA TGAATTTTCG AAAATAAAAT GCTAAAATCG GGAATTTCAT ATGTTATAGT TCCAACGGCC GCTATGGAAT GTCTTTACCG  GACGTGTTGA TGGAAGAGTT TCATTGGCGA CGGAAGCAGC CAGAGACTTA CCTTCTGCTG GGGCAAACTT CACCACTCTA CAGAACCTCT TTGCCGAGAG CGATTTGGAC GTCGTTGACC  TTGTCGCTTT ATCAGGTTTA GCATATTTCA TATATATTAT CTTTTGTTAA TCATCACATA GACGTTACTG ATATAGAAAG AAGTATAATA ATAATTAAAC TTATGAAATT GGGAATAATT  ATAAGAAAAT CGCGGGAATA TCAGACCACG TGCATGTCCA TGTTACGAAA TTGTTTGGGA TGCTACGAAT TTAATCCTTC CAATCTTCAA GAAATAGTAT ATTATATTTA CATATTTTGA  ACATCATGCA TGTATGTAAA AATTCAATTA ATTTTCTTAT ACATTATCTA ATATTTATCA TTTAATTGTG TAAAGTACTC ATTAGTCAGC TAGTTTTATT TATTGCCATT ATTAGTCAAC  TAATTTTATT TTTCGATTCT ATACTAAAAG AAACGAAATT GAATGAAACA GGAGCACACA CGATAGGAAC AGCACGTTGC GGTGTGTTTG GTCGGAGGCT GTTGAACTTC ACCGGAAAAG  GGGATACAGA TCCATCCCTG GATCCTAACT ACGCCGCTTT CCTCAAATCC AAATGCTCCG ACAAATCTTT AAGACTCAAC TCTTCCGCAG TAGTTGGAAT GGATCCTACC GGACCTCTCT  CCTTTGACAG TGGCTACTTC GTCTCTCTCC TACGACACAA AGGGCTCTTC ACCTCCGACG CCGCCTTGTT GACTGATCCC TCCGCTGCTC GCATTGCTGG TATTTTCCAA AACTCCGGCA 
CTTTCCTTGC TCAGTTTGGT CGGTCCATGA TCAAGATGAG TTCCATCAAA GTCCTTACAC GTGGAGACCA AGGTGGTGAG ATTCGCAAGA ATTGTCGCCT TGTCAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAAGG GTTTAGAGAT TAGGATTCTA TTCCCACTTG CTTTGTTTTT GGTTGTGTTA CTTTGTGTTG ATGGTAAGAG ATTCAATAAT AATGGCCATA AGATGAGGTT AGGAAGGTGG  GAAGGTAAGC TGAAGATGAA CTTCTATCAC AAAAGCTGTC CTCAAGCCGA GCAAATCGTT AAAGAGATTG TGTCCAAGAA AGTTGCGGCA AACCCTAGCT TGGCTCCCAA GTTATTGAGG  GTTCACTACC ATGACTGCTT TGTTAGGGGG TGCGACGCAT CTCTGCTTTT AGATTCAGTC CCTGAGAAAG CCGCGTCTGA GAAGGAAGCG AGACCTAACC TCTCGCTGTC CGGGTTTGAA  ATCATCGATG AGATCAAGTC TACTCTCGAA AAACAATGCC CTGAAACAGT CTCTTGCGCT GACATCCTCA CCTTAGCCGC CCGAGATGCC GTCTCCTATG AATTCCAACG GCCGCTATGG  AATGTCTTTA CCGGACGTGT TGATGGAAGA GTTTCATTGG CGACGGAAGC AGCCAGAGAC TTACCTTCTG CTGGGGCAAA CTTCACCACT CTACAGAACC TCTTTGCCGA GAGCGATTTG  GACGTCGTTG ACCTTGTCGC TTTATCAGGA GCACACACGA TAGGAACAGC ACGTTGCGGT GTGTTTGGTC GGAGGCTGTT GAACTTCACC GGAAAAGGGG ATACAGATCC ATCCCTGGAT  CCTAACTACG CCGCTTTCCT CAAATCCAAA TGCTCCGACA AATCTTTAAG ACTCAACTCT TCCGCAGTAG TTGGAATGGA TCCTACCGGA CCTCTCTCCT TTGACAGTGG CTACTTCGTC  TCTCTCCTAC GACACAAAGG GCTCTTCACC TCCGACGCCG CCTTGTTGAC TGATCCCTCC GCTGCTCGCA TTGCTGGTAT TTTCCAAAAC TCCGGCACTT TCCTTGCTCA GTTTGGTCGG 
TCCATGATCA AGATGAGTTC CATCAAAGTC CTTACACGTG GAGACCAAGG TGGTGAGATT CGCAAGAATT GTCGCCTTGT CAACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAAGG GTTTAGAGAT TAGGATTCTA TTCCCACTTG CTTTGTTTTT GGTTGTGTTA CTTTGTGTTG ATGGTAAGAG ATTCAATAAT AATGGCCATA AGATGAGGTT AGGAAGGTGG  GAAGGTAAGC TGAAGATGAA CTTCTATCAC AAAAGCTGTC CTCAAGCCGA GCAAATCGTT AAAGAGATTG TGTCCAAGAA AGTTGCGGCA AACCCTAGCT TGGCTCCCAA GTTATTGAGG  GTTCACTACC ATGACTGCTT TGTTAGGGGG TGCGACGCAT CTCTGCTTTT AGATTCAGTC CCTGAGAAAG CCGCGTCTGA GAAGGAAGCG AGACCTAACC TCTCGCTGTC CGGGTTTGAA  ATCATCGATG AGATCAAGTC TACTCTCGAA AAACAATGCC CTGAAACAGT CTCTTGCGCT GACATCCTCA CCTTAGCCGC CCGAGATGCC GTCTCCTATG AATTCCAACG GCCGCTATGG  AATGTCTTTA CCGGACGTGT TGATGGAAGA GTTTCATTGG CGACGGAAGC AGCCAGAGAC TTACCTTCTG CTGGGGCAAA CTTCACCACT CTACAGAACC TCTTTGCCGA GAGCGATTTG  GACGTCGTTG ACCTTGTCGC TTTATCAGGA GCACACACGA TAGGAACAGC ACGTTGCGGT GTGTTTGGTC GGAGGCTGTT GAACTTCACC GGAAAAGGGG ATACAGATCC ATCCCTGGAT  CCTAACTACG CCGCTTTCCT CAAATCCAAA TGCTCCGACA AATCTTTAAG ACTCAACTCT TCCGCAGTAG TTGGAATGGA TCCTACCGGA CCTCTCTCCT TTGACAGTGG CTACTTCGTC  TCTCTCCTAC GACACAAAGG GCTCTTCACC TCCGACGCCG CCTTGTTGAC TGATCCCTCC GCTGCTCGCA TTGCTGGTAT TTTCCAAAAC TCCGGCACTT TCCTTGCTCA GTTTGGTCGG 
TCCATGATCA AGATGAGTTC CATCAAAGTC CTTACACGTG GAGACCAAGG TGGTGAGATT CGCAAGAATT GTCGCCTTGT CAACTAA 

Retrieve as FASTA