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Entry information : BstrGOX01
Entry ID 15103
Creation 2018-03-22 (Bruno Savelli)
Last sequence changes 2018-03-22 (Bruno Savelli)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrGOX01
Name BstrGOX01
Class Glycolate Oxidase    [Orthogroup: GOX004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrGOX01
start..stop		 S start..stop
BstrGOX05 337 3.35e-120 1..187 1..216
BstrGOX03 228 4.49e-75 1..124 1..123
BstrGOX03 127 6.84e-36 111..186 292..365
HaGOX09 227 1.32e-74 1..120 1..120
HaGOX09 129 2.05e-36 111..181 292..362
AtGOX04 223 5.4e-73 1..120 1..120
AtGOX04 148 8.68e-44 111..187 292..368
Literature and cross-references BstrGOX01
Protein sequence: BstrGOX01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   186 (333)
PWM (Da):   %s   20522.5 (35087.4)  
PI (pH):   %s   6.54 (4.97) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-353
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEITNVTEYD AIAKQKLPKM VYDYYASGAE DQWTLQENRN AFARILFRPR ILIDVSKIDM TTTVLGFKIS MPIMVAPTAM QKMAHPDGEY ATARAASAAG TIMTLSSWAT SSVEEALALG 
ASGIFIGRPV VFSLAAEGEA GVRKVLQMLR DEFELTMALS GCRSLKEISR NHITTEWDTP RPLARL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCCCTAGAG CTCCATTACA ATCAAGGTGT GTGAGATTCT CTGTTTAGAC CAAACAGTTC ATGGACATGT TTCGCTCTAG AGATTAGAAA CGTATCTATG ACTATGTCTG AATTTCACAA  GAAATAGCTA ACTCAGGCCT TTTTTGCTCT TTTTGACAGA TCAACATCGG AAAATGGAGA TCACAAACGT TACCGAGTAT GACGCCATCG CAAAGCAGAA GTTGCCTAAG ATGGTTTACG  ACTACTATGC CTCTGGTGCA GAGGACCAAT GGACTCTTCA AGAGAACAGA AACGCTTTCG CAAGGATCCT GTGAGTTTTT CTTTTCTTTT CTTACTACAT GATATTTTAT TGTTTGCGAT  TGGTTTTTAC AAGAGATGTG ATGCATACCT TGGGCTGTTT AATAGCTTTC GGCCTCGGAT TTTGATTGAT GTGAGCAAGA TTGATATGAC AACCACCGTG TTGGGGTTCA AGATCTCGAT  GCCCATCATG GTTGCCCCTA CCGCCATGCA AAAGATGGCT CACCCTGATG GTAAATACTG AGTTATGTAG AGACTACAGA ATGAAAACTT GTTTAGTATA TCTAGAGACA AAGACTAAGG  TTGCTCTAAC GACTCTGTTG GAAACTAATG CAGGGGAATA TGCTACAGCT AGAGCTGCAT CTGCAGCTGG AACCATCATG GTATGTTATT AAATCATTAC GAAATATTTC ATCCAAAGCA  AGATTCTTAA CCTTTTCAGT GTTTCGAGAT TTTAAATCCG CGACCCATGC ATACCTATGT TTCAGACACT ATCTTCATGG GCTACTTCCA GCGTTGAAGA AGTTGCnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn TTGGATGGTG GTGTTCGACG TGGCACAGAT GTCTTCAAGG CACTTGCACT TGGAGCCTCC GGAATATTCG TAAGCATCAT ATGTCCATTT  ATCAGAAAGC TGACTGAAAC CAATGACAGT AATAACACAT TATTATTATG CCCTCTCAAT CTCAGATTGG AAGACCAGTG GTATTCTCAT TGGCTGCTGA AGGAGAGGCT GGAGTTAGAA  AGGTGCTTCA AATGCTACGT GATGAGTTCG AGCTGACCAT GGCACTGAGT GGATGCCGGT CTCTAAAGGA AATCTCCCGT AACCACATTA CCACCGAATG GGACACTCCC CGTCCTTTGG 
CCAGGTTATA A 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATCA CAAACGTTAC CGAGTATGAC GCCATCGCAA AGCAGAAGTT GCCTAAGATG GTTTACGACT ACTATGCCTC TGGTGCAGAG GACCAATGGA CTCTTCAAGA GAACAGAAAC  GCTTTCGCAA GGATCCTCTT TCGGCCTCGG ATTTTGATTG ATGTGAGCAA GATTGATATG ACAACCACCG TGTTGGGGTT CAAGATCTCG ATGCCCATCA TGGTTGCCCC TACCGCCATG  CAAAAGATGG CTCACCCTGA TGGGGAATAT GCTACAGCTA GAGCTGCATC TGCAGCTGGA ACCATCATGA CACTATCTTC ATGGGCTACT TCCAGCGTTG AAGAAGCACT TGCACTTGGA  GCCTCCGGAA TATTCATTGG AAGACCAGTG GTATTCTCAT TGGCTGCTGA AGGAGAGGCT GGAGTTAGAA AGGTGCTTCA AATGCTACGT GATGAGTTCG AGCTGACCAT GGCACTGAGT 
GGATGCCGGT CTCTAAAGGA AATCTCCCGT AACCACATTA CCACCGAATG GGACACTCCC CGTCCTTTGG CCAGGTTATA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCCCTAGAG CTCCATTACA ATCAAGATCA ACATCGGAAA ATGGAGATCA CAAACGTTAC CGAGTATGAC GCCATCGCAA AGCAGAAGTT GCCTAAGATG GTTTACGACT ACTATGCCTC  TGGTGCAGAG GACCAATGGA CTCTTCAAGA GAACAGAAAC GCTTTCGCAA GGATCCTCTT TCGGCCTCGG ATTTTGATTG ATGTGAGCAA GATTGATATG ACAACCACCG TGTTGGGGTT  CAAGATCTCG ATGCCCATCA TGGTTGCCCC TACCGCCATG CAAAAGATGG CTCACCCTGA TGGGGAATAT GCTACAGCTA GAGCTGCATC TGCAGCTGGA ACCATCATGA CACTATCTTC  ATGGGCTACT TCCAGCGTTG AAGAAGCACT TGCACTTGGA GCCTCCGGAA TATTCATTGG AAGACCAGTG GTATTCTCAT TGGCTGCTGA AGGAGAGGCT GGAGTTAGAA AGGTGCTTCA  AATGCTACGT GATGAGTTCG AGCTGACCAT GGCACTGAGT GGATGCCGGT CTCTAAAGGA AATCTCCCGT AACCACATTA CCACCGAATG GGACACTCCC CGTCCTTTGG CCAGGTTATA 
A 

Retrieve as FASTA