Entry information : LePrx[P]109(Solyc09g018590.1.1 [2.3])
Entry ID 15861
Creation 2019-04-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-04-19 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-01-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx[P]109(Solyc09g018590.1.1 [2.3])
Name LePrx[P]109(Solyc09g018590.1.1 [2.3])
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx010]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx[P]109
start..stop
S start..stop
NtPrx91-1A 528 0 1..316 1..314
LePrx71 514 0 1..316 1..317
NtPrx59-1B 505 0 18..316 18..314
NtPrx59-1A 504 0 1..316 1..314
Literature and cross-references LePrx[P]109(Solyc09g018590.1.1 [2.3])
Protein sequence: LePrx[P]109(Solyc09g018590.1.1 [2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   314 (293)
PWM (Da):   %s   32984.45 (30681.1) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.4 (8.40) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-314
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MANISLVFLI IFPFLLILSS AQSLSTNFYS SSCPNVLSII KTAVNSAVSS *ARMGASLLR LHFHDCFVNG CDASVLLDDT SNFTGEKTAA LNSGSIRGFD VIDTIKTQVE SSCAGIVSCA  DILAVAARDS VVKLGGPSWT VLLGRRDSTT ANLSAANNNL LGPTSNLSAL ISSFSNKGLT TREMVALSGS HTIGQTRCTS FRTRLYSEAN INASSATTVK ANCPQSGGDN NLSPLDITSP 
TSFDNAYYKN MQIQKGLFHS DQVLFNGGST DSIVNT*SSN SATFSTDFAN AMVKMGNLSP LTGTNGQIRK NCRKTN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic ( 2 Stop in frame). Incorrect prediction from Phyotozome
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCAAGGGAG ATTGCATCCA TCAAAGTTCA GTGGAAGAAT CGGCCAGTTG AGGAGTCCAC TTAGGAGAAG AAGGCTGATA TGCAAGAAAG ATATCCACAT CTTTTTACAG ATCCAGGTAC  TCTTTCTCAC CCTTGTTTTT CTTCTTGTAA TCTTTCGGGG ACTAACGATG GGTAAATTGG TATCTATTGT AACGACATGT TTAGTCATTT CGAGAAGTAG AATCATTTGT GATAAAAACT  GACCGGGTTG ACGGATCACG CGACGGACCG TCATAGGCAC TACAGTCCGT CAAGCTTCTT CGTTTCAAAA CACTTCAACT CTGAAATCTG GGTACTGGGG CCAACTCTCT GAACTTCACG  ACGAAACTGC AGAATGGACC GTCGTAGGTA CGACGAACCG TCACAAACCT CTTCACTGAA TTTGACTCTC TAAACTTTGT GACGGACCCG CAGGACGGAC CGTCACAGAT ACGACGGGCC  GTCACAAGTT GCGTAACCCC AACTAGGTCG GAATTCTGCT AAAAGTTTTT GAGGGGTTTT TTGGACTATT CATGATTATA AGTATGAAAT TAGAGGGGTA TGTTTAATAA TTTATTTACT  TGGGGGTTAA AGAAGTTAAT AAGGAAATAA ATAGTGGGTT ACTTTTACCA TCTTTTATAC TTGATTATAT GATAATTAGA GTAAAAGAAA AAGAATCTGG CGAAGGAAAA ATAAAAAGAA  CAGAGAGAGG AAGAACGAGC GAGAAAAGAA AGAAGCGAAG AGGAAAGCAA AGACATTGAG AAGTAGCTTG CTTGATCACA ATTCTTCGGT GGAGGTGGGT TATGGTTTGT TTCTATTTGA  TAGATAAACT CTAAATAGCA ATTGATATGT GTTGGGTAGT ATTGTAAAGT CTTCTATATG CTGGATTGTG TGTTGGTATG TTGTGATTAT GTAATTGTGA TGGATTAGAA CGATGAGACT  GTTGAATATT AAATCCTCTC TATTAAGATG ATGCCACATA AAGAAGGCTT GATGAACTAA AACAATGAGA TAAATGGATC GCGTGTCACG TTCCGACACG TAGAATTAGG GGATCGGAGT  GTCACGTTCC GACACGTAGA ATTAAGGGAT CGGGTGTCAC GTTCCGACAC GTAGTATTAG GGGATCGGAA TGTCACGTTC CAACACGTAG TATTAGGGGA TCAGAGTGTC ACATTCCGAC  ACGTAGTATT AGGGGATCGG AGTGTCACGT TCCTACACGA TAATAATAAA GAGAAGTAAT ATTGAATTAT GTTAATATAC TCAATTCAAA GAAACTATTT TCCCAAATGA GTATGGCGTG  GAGGCTTGAG TCCTCATGGG TGTGCTTGGT GTTGTTGCCA ATGGTTCTTG TACTTGTTGT TGTCACCTGT TAAGTATTGT GGTTGAATTT ACATTATTAT TCAGTATATA TTGCTTTCTA  TTCTGAGTTG GCCGATGATA CCTACTCAGT ACTTGTTCCT TGTACTGACC CCTACTTGTA TTTTCTTCTT TGTTATTTTG TGGAGTGCAA CAAGTGCGCC ATCGACTTCG ACTCGCCCTC  AACTCTAGCC AGTCTCTAGC ATATCAGAAT TCAGTGTGAG CTATTGTTCC TAGCTCGTGC TGGATTCTCT CCTTCACGTC TTGATGTCTT GAAGTTCGGA CATGGACCAT TCTTTTACTT  ATTTTAGCTT CTTAAATACT CTTAGATTTA GAAATTTGAG GATAAATGTT CTTGATGTGA TGACTTCTAG ATTTTGGGAA TAATAAGTAT TAACTTTAGA AGTTTGTTTA ATTGATTTTC  GTTAATGTGT TTTGAGTCTT CCGCATTATA TTTTGTTCGC TATGGTTGAG ATATTGGTAA ATGTTGGGGT TTAGATTTGT TGGTTCGCTC ACATAGGAGG ATAAGTGTGG GTGCCACTCG 
CGGCTTGTTT TGGGTCGCGA CAGAAGCAAA AGCATTTTTT CTTTCTACTT AGTAGTTACT ACTCTTTCTT TTTAGTAGCT 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGTTTATGAA AAGAAAAAAA TGAGTACCAA ATATTTGATT TAAGTTATTA AGGGTTGCAA TGTTTAGTCC CTTTTTCTAT TTATAGCAAA CTTTAATGTT TTGCAACTTT TTTGGAGGTA  AAGGTGGTAA GTAACGCTCC CCTCCAAATA TCAATATGTA AAACGTTCCA AGTAGTGAAA TAAAAAAGAC TGTTTAATTA TATATCTTGT TACTATATTA AAAAACAAAC GTTTATTATG  CATAGAACAC TAAAAAGGAT ATTAACATAT AAGTCAATGA CTTTGGAATA TAAATGGAAA TCTTAATTTG GTCTCAATTG ACAATCAAAT ACTCTAAATT TGGGATACAC ATCTACACAC  TCTAACTCAT TTCCATGGTA TTAATTGAGT AACATAACTT GTAAAATGAT CATATAAACA CCTCCAAATA ATTTATGTTC CGTATTAGCA TCGAATGTCC ACAAGATATA ATTAGCAAGG  ACGAGCTGAT GTGCTAGATA TGCATTTTTA TAGTTGGAAT ATTTACTTAT CAGCGAGGCC AAGTTAAAAT TTATATGTAA GTAGTATGCC TAAATTAATC ATAGCCAAAA ATTGTTGAGG  ACAAGTTAGT GTGTATATCT AAGTAGTATG CCCAAATCAA TCATAACAAA AACTTATTGA AGCCAATCAA AGGTATATTA TAAGAGATAT ATGGGTATAC ATGAAGAATA TCCAACATAC  ATACAAGAGA AAATTCATTG ATATATAAGA AAGATATATA GTCTTCTTCA ATGTTCAATT TTAAATTAAA AAATAAATTA ATTAAACCCT TCCTAAATCA TTTCTAAACA TCTCCAAAAT  TTATAATGAA ATTGTTGAAG ATGTTTCAAA GAAAACTTAA TATCTCTAAA TCAAAACAAA TCACCAACTG TTAGGACCGA AAATAAGCAG GTGTAAATGC GAAAGCTAGC AATGCAAACA  TCGAAAGACC ACGAGTAAGA AGACAACAAG AAATATACCA AAAGACACAA TGATTTAACG TGGTTCGGTC AATCGACCTA CGTCCACAAA GGAGATGAGC AATCCACTAT AAATATGAGA  GTACAAAATA CAGAGGGAAA CAACCTCAAC CAATTCACTC AGAATACATG GGAGGTTCAC ACAAGCGATA CCGTATCAAG CTTGTGACCC ATAAATTCTC CCCCTAACCA AAACTCTCAA  AGCCCTTAAG ACTACATTGT GAATGCTGAT TAAGTTAGAA GGAACATGCC TCTATTTATA GAGCCCTAAA CCTTTTCCTA CCAAAAAAGG ATTAGTCAAT TCAAAACCTT TTCCTAAGAG  GAAAACCTAT TTATGGTAAG AAATCAGGGC AAATAAAACC CAACAAATCT CCCCCTTGGC CTGAATTTCT GACAAAATAA ATTTGTCCAC CTTCTTGACT TAATATTCAA CAACTTGCTT  CTCCTCTGAA ACAATTTCTC CAACAGAATC TTCATTACTG TCAAAAAAGG TTACTGTTAG AACTACACCA CCCAGATGAA CACATCTTTC TAACCTGGTT CAATCATCGA TTATCGAACC  ACTGAACCTG ACTCCGTCAT TGAATCTGGC TCTGATACCA CTTGATCGAA TCCTCCACCT GTAGAGCCTC ATCAAAAGAC TCTGGTTCCC CCTCATCAGT CAGCAATAGA TAGTGTAATG  AAGGTGAATA CCTATCTTGT GCCCTGATGG ATCTGGATGA TCTCCTTAAC ACCTGCTCAG GTGTAACTTG CTCCACTTCA GATTCTTCAG TAGGAGTTGG TTGAGTATAT GCTTCGACAT  CTCTGGGGTT ACTCTTCTCC AACTCAACCT CAACTCCCAC TTGCCTTCTA ATCTCTAGAA CCTTCTGCTC TCTATCCTTG TACAGGACAG ACTCATCAAA TGTCACGTCA CAATGTCTCA 
GGATCTTTCT GTTCTTGTCA TCCCAAAACC TGTAACCAAA CAAATCAGAA CCATATCCTT TGAAGTAACA CTTCACAGCC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAACA TATCATTGGT TTTTCTAATA ATATTTCCTT TTCTTCTTAT ATTGAGCTCT GCTCAATCTT TGTCCACCAA TTTCTACTCT TCATCATGCC CAAATGTCCT ATCGATTATT  AAAACTGCGG TGAATTCTGC TGTTTCTAGT TAGGCTCGAA TGGGGGCTTC ATTGCTTCGT CTTCATTTCC ATGATTGTTT TGTTAATGCA AGTTAATTTT TAACCTTATT TCCTTCTCTA  GCAAATATAT AACATTCTTG CTTCATAATT AGTGTCCATG CATGCATATA TTGGTGCAAA TAATTTTCTT TTTCATTTTT GTCATATAGA TAGATGACTA AAACACTCTA GTTAATAATA  TGACCCTTTT GTACATATTA AGTGGATTTT TGAGCACATA TGTACATAGC CTATGTCAAA ATCAATGGGC TCCGCTTGAA CCTATAGGTT ATGTGTCGGA TACGTCCGTC TAATTTGAGA  TTGAAGCACA GTTAATTGAG TGGTATATAT GAAACTTAAA TAGTAGAGTT ATTCAAGATT ATAGTATCAC TAGGTAGGTA TGGTATAAGA CATTGATATT GACCAATAAT TAAGTGTGTG  TGTTTTGACT AACACGCCAT TGACTTTCAA ATATAAGTTC TTCAATCTTG AAAATAACAT CTTAATTAAT TTAATAATTC TTGTCTTCTT CTCCATGTTA ACTATTGAAG CTACTATTGA  TGATGATGAG ATTAAGAAAC CTTTGAGATT ACAAGCAACC ACTAATGTGA CATACACTAA TTAAATTAAT ATGTGACCGA TTAATTTATA TTTATAACAA CTTTTATTCG ATGTGAAATA  AATTAAACAT GTCATGTGAC ATTTTTACCT AATTCGTTAG GGTTGTGATG CATCCGTGCT ACTAGATGAT ACATCAAACT TTACGGGAGA GAAAACTGCT GCACTAAATA GTGGATCGAT  TAGAGGATTT GATGTGATAG ACACCATCAA AACTCAAGTG GAGTCTTCCT GTGCGGGCAT TGTATCTTGT GCAGATATTT TAGCTGTTGC AGCACGAGAT TCAGTTGTCA AAGTAAGTGG  ATTTGACCAT ATTTTGAAAT TTAAAAAAAA ATAAATTATT TTCAAAATGA AAAATGAATA ATTGTGGATT TCTTTAGCTT GGTGGCCCTA GTTGGACTGT TTTACTAGGT AGAAGAGACT  CAACTACTGC AAATCTGAGT GCAGCCAACA ACAATCTTCT TGGACCAACT TCAAACCTCA GTGCACTCAT TTCTTCCTTC TCTAACAAAG GGTTAACGAC TAGGGAAATG GTTGCTCTTT  CAGGTTTGTT TTATACATTC AAGTCACTTA TATTTACGAT TAAATCTCTT TAATAAAGTA ATTGGTTACT TGGTAACTAA ACAAGCTAGC ACATGTTAAA AATGATATTA TGCTTCACTT  GCATGTTGCA GCTTGCATAA GGTAATTAAT TAACCCTAAA TTTTTAATAG AGTAAATAAC TTGCACTAGT AAATAATATT ACATTATTAG AGTAAACGTC ATTTTCATTG TTCATTTAGA  TTTATCTTAG AGGATGGCAA GCCCGCGCAA GCACGGGTCT TATGGAAAAT GATTTAGTAA TAAAAATAAT TATAATTATA TTAATTTAAA TAAATTTTAT TGAGTAATAA TTTAATTAAT  TTAAATAATA TTCGTTAAAT TATAATTCAA TTGATTATAA TAGAATTTGT TCTAGTTTTA TAATTTTTAG TTCAAGCCAA CGACTTGATG AGTGCTAAAT TTTTCATGGA GGGTTCAGAT  TTCGATAATT TATATGAAGA AAAGATAGTC TTTTTCATGT TCCATATTCA ACATAAATTA CTTATTCCTC AAATTTTCAA GACTTAATAA TAAACACCAA TTATTAGAAA TAGTGTAGTA  ATTAAATAGT CATATCAATT ATTATTTTTT TAATAAATGT GTTAAATTCA TGTATGACAA GTAAAATAAA GGTAGAAAGT ATTAAAAAAA ATTGAAAGTA AATTAGTAAA AATTTTATTT  TTATTTATGT ACGTTTAAAA AATGTAAAAA TATTATAACA AATAATATGA AAGAATAGAA TCACGTATAA TGTATTGTGC ATAAGTAATT TTGTAGGTAT CCTAATATAA TGCATGTGGA  ATAACAAAAG ATAATACTTA AATACTAATC AGGAAATGAA AAAATATCAC CTAAAATTAA AAAATAATAC CAAGCACAAA AATACTAATT ACCAATTATA AAATGATAAA ATATTACGGA  AAAAAAATAA TATCAAGCAC ACATATTGAT ACAACGAAAT CAAACTCACT CTTCTATAAT AGTAAGTAAA AGTAAAGCAA TAATAATAAT TACTTAAAAG AGCATCAATT ATATATAGTC  ATTTGTTTGT TACTTATTGT CAATATATGC CCATTAAATA TTCCTAGCAA GTTGATTATT AATCTTCATA CCTGTCCTCA ACTTTACCAA TTATTTGGTA CTCCCTTCAT GTTACAGTAT  TATTGTCATT TACGACATAA ATAAGACTAT AATTATCAAA TACTCTATGT AAATAAAAAA TACGATAAAT ATTTTGAAAC GGAGAGTCTA TGGTTCTACT TTGTCACATA CATGTTTAAT  TTCTTGGAAT ATTTCAGGAA GTCACACAAT AGGCCAAACT CGATGTACTT CTTTCAGAAC GCGTTTATAC AGTGAAGCCA ATATAAATGC CTCATCTGCA ACAACAGTAA AAGCAAATTG  TCCACAAAGT GGTGGTGACA ACAATCTTAG CCCACTAGAC ATCACAAGCC CAACTTCATT TGACAATGCT TACTACAAGA ACATGCAAAT TCAAAAGGGT CTTTTTCATT CTGATCAAGT  ATTATTTAAT GGAGGATCTA CAGACTCAAT AGTTAACACT TAAAGCTCCA ATTCCGCGAC TTTCTCCACT GATTTTGCAA ATGCTATGGT GAAAATGGGA AATCTTAGCC CTCTTACCGG 
CACCAATGGA CAAATCCGTA AAAATTGCAG GAAAACAAAT TAA 

Retrieve as FASTA