Entry information : LeFRO06(Solyc06g036220.1)
Entry ID 15962
Creation 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-10-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LeFRO06(Solyc06g036220.1)
Name LeFRO06(Solyc06g036220.1)
Class Ferric reduction oxidase     [Orthogroup: FRO002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LeFRO06
start..stop
S start..stop
AgluFRO01 432 9.85e-147 26..382 196..571
AgluFRO01 52 0.000000326 387..420 678..711
LeFRO03 419 1.99e-141 26..420 198..615
LeFRO03 57 0.00000000725 376..421 672..720
LeFRO02 395 4.87e-132 26..382 194..570
LeFRO02 48 0.00000415 387..421 680..714
AgluFRO02 323 4.49e-107 75..382 2..349
Literature and cross-references LeFRO06(Solyc06g036220.1)
Protein sequence: LeFRO06(Solyc06g036220.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   420 (295)
PWM (Da):   %s   47299.61 (32294.0) Transmb domain:   %s   o43-65i85-104o108-130i359-381o
PI (pH):   %s   8.39 (5.06) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-319
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKEFFSTRTT ISLSFADMRE MTFHLGSSIL RLFGLTSESS VKYHIWLGNA VMALFTAHGL CFIIFWADTH QLEYENRAIM EWNKVGISIV TGEVSLFAGI AMWMTSFLRV FHVGFIYSCI  TPPGFYLFLI DWYLRFLQSL QCVSLVSARV LPCQAVELNF SKSPGIRYNP TSSVFINVPS ILKLQWHPFT VTSNSNMEPE KLSIVIKSEG KWSQKLFEKL SSTTPGHHLQ VSIEGPYGPS  STQFLRHDML IMVSGGSGIT PFISIIRELI YIAGSTSCKI PKVLLVAAFK KSTNLAMLEL LLPLSGTNYN ILRLQIQTEA YVTRETEPLK DNQKFLKTLW LKPNASERPV SAVLGQNNWL 
CLVAIIISSS LMFLLLIEIV TECEESIFVS GPRRMKQEIA IICSASVATN LHFESISFSW * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. No EST found.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTCTTTTCT TTAATTTTGT GGGATTTTCT TCAACCAAAT TTACTCCAGA TATTGCTGAA TTACCACATG ACCTCTTTTC TGCAGCCTTA TTATCCTCTT CGATTCTCAA CCTTACTATA  AGATCTTCAA CAGTCATCTC CTTGCGTTTG TGTTTCAAGT AATTTTTGAA GTCCTTCCAT AATGGAGGTA ATTTTTCAAT AATTGCAGCC ACTTGAAAAA CATCATTCAC AATCAATCCT  TCAGCAAGGA GATCATGGAT TATGACCTGC AATTCTTGAA CTTGGGTGAC GACAGTCTTA CTGTCTATCA TCTTATAATC CAGAAATTTT TCCACAATGA ATTTCTTTAT TCCGGCAGCT  TCTGTTTTGT ACTTCTTTTC TAAAGCATCC CAGAGTTCTT TTGAAGTTTT GGCATTGCTG TACACATTGT ACAGATCATC TTGCATACCA CTCAAAATAT AATTTTTACA CAAAAAATCT  GAGTGTGTCC ATGCTTCTGT TACCAAGAAT CGTTCATCAG CCGGAGTTTC ATCTGACATA AAAGGAACAT TCnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn TCATTAATGA  ACTTCTGCAA ACTCAATGTA GTGAGATAGA AGAACATCTT TTGCTGCCAT CTCTTAAAGT CGACTCCAGA AAACTTTGCA TGTTTCTCAG TCGGCGCTAA GGCAGCATTT GAACGATTAT  GTGCAACCGT TGTTGTTGCA GCACTTACTG TTCCAGCATT TGTTTGACTT GAATTAGTCA TTTTTTTTGT CAGAAATGGC AGATAAGTTA AGTATTTGAA ATACTAACAG TAAAGAACAA  ATTTTTACAC AAAATGTTTC TGATTTAACG ATAAAGATTT TATGTTCTTT TAATCGTTAA TCGAATGAAT TTTAAAAATT CAAACATAGT AGAAAACCAT AAAGGTTTTA ATCTCCAGAA  ACCTCAAATA CAGAAACTGT TAAATTTCTT AATATTGTTA TTCTAATAGT AACGTGTATT TATAAGGTTA ACCAATGAAC AGAAACAGAT ATAAGACGAA GCATAAAATA CATAAAATAC  AAGAATTAAT TCGAGTCCAC AGAAACTACT GTGTGTCCTT TAGAAATTTA ATCCCCTCAC TGTACCCAAG GTTATGGATT AATTTCTCCC AAGATAAAAC ATATTAAACC TGTTAAAGAA  ATAGCGGTAC CTCAAACTTC TTTAGCTTCA ACGAACTTAA GAACCACAAC AAGTCACACA GACTCAGTCG ATCGACGCTT TTATTTTATT TGAGAGAAAA AATAAATGCA GAGAAGGAAA  ATTTTTCAGT GTTTTAAAAA ATCAAAAAAT TGACTTCCTT TTATAGCCAT TTTCAGCAAG GAACGTGTCT GTTCAGTGAA ATCCGTTCAG ACCCATTTTA TCCAGAAAAT TGTGTCTTTT  GGAAAAAATA ACAACTTTTC AAAAAATTGT GTTTGTTAGG AAAATAACAA CTTTTTGGAA AGTAACGACT TTTCGGAAAG AGTAACGTTT GCCCGCAAAT TTATAAGAGA TAATTTTAAC  AGGATTTATT AGTTTAACAA AAACTGATTA AATAAATTTT GTCCAAAAAA TTTATCAATC AAATCATTTG CCAAATCCAA ATCCAAATCC GAAGCCGAAG ACGAGGCCGA GCTTCTTAGC  TCTTTAAGAA GTAATGGAAG TGTTTCCTTC TATAAGGACA ACAATTTCCC TTTCTTTTGC CGATATGAGA AATGACTTTT CCTTTGCACT TTGCAAATGA CTTTTCATTT TCCCTCTAAA  GTAGTTCCCT CACTTTTCAT ATTCTCTCTT TTCTTTTCCT ATTCACACTT GCTAAATCCC AACTACTAGA GGATCATCCA TTTTGCGTCT CTTCGGACTT AAATAAATTT TGTCCAAACA 
ATTTATCAAT CAAATAATTT GCCGAAGCCG AAGCTGAAGT CGAGGCCGTA CGAGCGACGA CGACGGCGCG AGGAGACATC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAGAGT TTTTTTCTAC AAGGACAACA ATTTCCCTTT CTTTTGCCGA TATGAGAGAA ATGACTTTTC ATTTGCACTT TGCAAATGAC TTTTCATTTT TCCTCCAAAG TAGTTCCCTC  ACTTTTCATA TTCTCTCTTT TCTTTTCTCA TTCATACTTG CTAAATCCCA ACAACTAGAG GATCATCCAT TTTGCGACTC TTTGGACTTA CATCAGAGTC CAGTGTTAAG TATCATATTT  GGCTTGGGAA TGCTGTCATG GCTCTCTTCA CTGCTCATGG TTTATGTTTC ATAATCTTCT GGGCTGATAC TCATCAGCTT GAATATGAAA ATAGAGCAGT ACATAGGTGA CCTACTTACA  ATTTGTTTTA CAAAAAATGC AGATCATGGA GTGGAATAAA GTTGGAATTT CCATTGTTAC TGGAGAAGTG TCTTTGTTTG CAGGAATAGC TATGTGGATG ACAAGTTTCC TGCGAGCTTT  TTTTCTATAC ACATCATCTC TACATTATCT TCCTAGGTAT TCCATGTTGG ATTTATCTAC TCCTGCATCA CTCCTCCTGG ATTTTACCTC TTCTTGATTG ACTGGTATTT GAGATTCTTA  CAATCCCTAC AATGTGTTTC CTTGGTTTCT GCACGTGTTT TACCTTGCCA AGCAGTGGAG CTGAACTTCT CTAAAAGTCC AGGTGATTAA CTCACTTTAT GGTACAATGG AATTTGAATC  TATCGTTCTC ACGGTGTATT TTTCTATTCT GATTTCAGGG ATAAGGTACA ATCCAACGAG TTCAGTTTTC ATAAATGTTC CTAGTATTTT AAAGTTGCAG TGGCATCCAT TTACAGTGAC  TTCCAACAGT AACATGGAAC CTGAGAAACT CAGCATTGTC ATAAAAAGTG AAGGGAAATG GTCTCAGAAA CTGTTTGAAA AGCTCTCATC AACTACACCA GGACACCATC TTCAAGTTTC  CATAGAGGGT CCTTATGGAC CGAGTTCAAC CCAATTCTTG AGGTATCAAA CAAATTAATT TCTCAGATGA TCACTCAACT AACCATTATT ATCTCAGAAA GAGAGTCACT TTCTTTGTTG  AAGAAAATTG AAATCAAGAA GAATGATGAC TTCTGAGAAA ATTGAATATT AGTTTAGTGA AAATCTACCC GATATCAAAC TGTAGATGGA ACATCTACTT TTGGTTTAAA AAAATTCTTA  CTCAATGTGG AAAATTGCTT GCAGACATGA TATGCTAATT ATGGTGAGTG GAGGCAGTGG CATAACTCCT TTTATATCAA TCATCAGAGA GCTGATTTAT ATTGCTGGTT CAACAAGCTG  CAAGATCCCA AAAGTTCTCC TTGTTGCAGC TTTCAAGAAA TCAACGAATC TCGCCATGCT GGAACTTCTC CTTCCTCTTT CAGGAACCAA CTATAATATT TTGCGACTGC AGATACAGAC  TGAAGCATAT GTAACACGAG AGACAGAACC TCTAAAAGAC AACCAGAAGT TCCTCAAAAC ACTATGGCTT AAGCCCAATG CATCAGAAAG ACCAGTTTCC GCAGTTTTAG GCCAGAACAA  TTGGCTTTGT CTTGTAGCTA TAATCATATC CTCTTCCCTC ATGTTTCTTC TGCTCATTGG CATTCTGAAC AGATATGACA TATACATAAC ACGGGGATGA TATATTCGTA TTCAGAAAGA  GCAGCTCTCA GTACATTGCA TTTATGTGTC TATAGCTGTA ACAACATCAA CTGCCTCTGT TTGGAATATG AAACAGAAGG AAGGCTAAGG AAATGGTGCA GATTCAGATT AACGACATAC  CAACACCGAT GACTTCTCCA GGTCCAGGCT CATGGTTTAA CAACACGGAT ATAGAGCTGG AAATTCTACC CTTTCAAACG TTTACTTGAC CAACACAAGT ACACTATGGT GTAAGGCCTA  ATCTAAAAAG TATGTAAAGC TTTAACTCTT TGCTCTTTTT ACTACTAGCT AAGATAAGAA GCACAAGTAC ATTGTTTCAA TGAATTATCT GATATTTTCA TTTCTCAAAC ATAGGAATAT  TTGTTTTGCA GAGATAGTTA CAGAGTGTGA AGAATCAATT TTTGTTAGTG GTCCAAGAAG AATGAAGCAA GAAATAGCTA TCATTTGTTC AGCCTCTGTG GCCACCAACC TTCATTTTGA 
ATCCATTAGC TTTAGCTGGT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAGAGT TTTTTTCTAC AAGGACAACA ATTTCCCTTT CTTTTGCCGA TATGAGAGAA ATGACTTTTC ATTTAGGATC ATCCATTTTG CGACTCTTTG GACTTACATC AGAGTCCAGT  GTTAAGTATC ATATTTGGCT TGGGAATGCT GTCATGGCTC TCTTCACTGC TCATGGTTTA TGTTTCATAA TCTTCTGGGC TGATACTCAT CAGCTTGAAT ATGAAAATAG AGCAATCATG  GAGTGGAATA AAGTTGGAAT TTCCATTGTT ACTGGAGAAG TGTCTTTGTT TGCAGGAATA GCTATGTGGA TGACAAGTTT CCTGCGAGTA TTCCATGTTG GATTTATCTA CTCCTGCATC  ACTCCTCCTG GATTTTACCT CTTCTTGATT GACTGGTATT TGAGATTCTT ACAATCCCTA CAATGTGTTT CCTTGGTTTC TGCACGTGTT TTACCTTGCC AAGCAGTGGA GCTGAACTTC  TCTAAAAGTC CAGGGATAAG GTACAATCCA ACGAGTTCAG TTTTCATAAA TGTTCCTAGT ATTTTAAAGT TGCAGTGGCA TCCATTTACA GTGACTTCCA ACAGTAACAT GGAACCTGAG  AAACTCAGCA TTGTCATAAA AAGTGAAGGG AAATGGTCTC AGAAACTGTT TGAAAAGCTC TCATCAACTA CACCAGGACA CCATCTTCAA GTTTCCATAG AGGGTCCTTA TGGACCGAGT  TCAACCCAAT TCTTGAGACA TGATATGCTA ATTATGGTGA GTGGAGGCAG TGGCATAACT CCTTTTATAT CAATCATCAG AGAGCTGATT TATATTGCTG GTTCAACAAG CTGCAAGATC  CCAAAAGTTC TCCTTGTTGC AGCTTTCAAG AAATCAACGA ATCTCGCCAT GCTGGAACTT CTCCTTCCTC TTTCAGGAAC CAACTATAAT ATTTTGCGAC TGCAGATACA GACTGAAGCA  TATGTAACAC GAGAGACAGA ACCTCTAAAA GACAACCAGA AGTTCCTCAA AACACTATGG CTTAAGCCCA ATGCATCAGA AAGACCAGTT TCCGCAGTTT TAGGCCAGAA CAATTGGCTT  TGTCTTGTAG CTATAATCAT ATCCTCTTCC CTCATGTTTC TTCTGCTCAT TGAGATAGTT ACAGAGTGTG AAGAATCAAT TTTTGTTAGT GGTCCAAGAA GAATGAAGCA AGAAATAGCT 
ATCATTTGTT CAGCCTCTGT GGCCACCAAC CTTCATTTTG AATCCATTAG CTTTAGCTGG TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAGAGT TTTTTTCTAC AAGGACAACA ATTTCCCTTT CTTTTGCCGA TATGAGAGAA ATGACTTTTC ATTTAGGATC ATCCATTTTG CGACTCTTTG GACTTACATC AGAGTCCAGT  GTTAAGTATC ATATTTGGCT TGGGAATGCT GTCATGGCTC TCTTCACTGC TCATGGTTTA TGTTTCATAA TCTTCTGGGC TGATACTCAT CAGCTTGAAT ATGAAAATAG AGCAATCATG  GAGTGGAATA AAGTTGGAAT TTCCATTGTT ACTGGAGAAG TGTCTTTGTT TGCAGGAATA GCTATGTGGA TGACAAGTTT CCTGCGAGTA TTCCATGTTG GATTTATCTA CTCCTGCATC  ACTCCTCCTG GATTTTACCT CTTCTTGATT GACTGGTATT TGAGATTCTT ACAATCCCTA CAATGTGTTT CCTTGGTTTC TGCACGTGTT TTACCTTGCC AAGCAGTGGA GCTGAACTTC  TCTAAAAGTC CAGGGATAAG GTACAATCCA ACGAGTTCAG TTTTCATAAA TGTTCCTAGT ATTTTAAAGT TGCAGTGGCA TCCATTTACA GTGACTTCCA ACAGTAACAT GGAACCTGAG  AAACTCAGCA TTGTCATAAA AAGTGAAGGG AAATGGTCTC AGAAACTGTT TGAAAAGCTC TCATCAACTA CACCAGGACA CCATCTTCAA GTTTCCATAG AGGGTCCTTA TGGACCGAGT  TCAACCCAAT TCTTGAGACA TGATATGCTA ATTATGGTGA GTGGAGGCAG TGGCATAACT CCTTTTATAT CAATCATCAG AGAGCTGATT TATATTGCTG GTTCAACAAG CTGCAAGATC  CCAAAAGTTC TCCTTGTTGC AGCTTTCAAG AAATCAACGA ATCTCGCCAT GCTGGAACTT CTCCTTCCTC TTTCAGGAAC CAACTATAAT ATTTTGCGAC TGCAGATACA GACTGAAGCA  TATGTAACAC GAGAGACAGA ACCTCTAAAA GACAACCAGA AGTTCCTCAA AACACTATGG CTTAAGCCCA ATGCATCAGA AAGACCAGTT TCCGCAGTTT TAGGCCAGAA CAATTGGCTT  TGTCTTGTAG CTATAATCAT ATCCTCTTCC CTCATGTTTC TTCTGCTCAT TGAGATAGTT ACAGAGTGTG AAGAATCAAT TTTTGTTAGT GGTCCAAGAA GAATGAAGCA AGAAATAGCT 
ATCATTTGTT CAGCCTCTGT GGCCACCAAC CTTCATTTTG AATCCATTAG CTTTAGCTGG TAA 

Retrieve as FASTA