Entry information : CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Entry ID 16102
Creation 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-01-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Name CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx037]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Cuscuta campestris    [TaxId: 132261 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcampPrx24
start..stop
S start..stop
CcampPrx31 654 0 1..344 1..344
InPrx14 457 8.12e-163 12..342 2..333
IaquPrx85 454 9.73e-162 43..342 30..328
PpePrx21 358 4.35e-124 42..342 19..323
Literature and cross-references CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Protein sequence: CcampPrx24(Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1/523.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   344 (306)
PWM (Da):   %s   36660.53 (32448.4) Transmb domain:   %s   i21-43o
PI (pH):   %s   5.85 (4.87) Peptide Signal:   %s   cut: 39 range:39-344
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPSSHFCLS YLKMPHPSKS AFHAFFITYL LLAGLAFSGD TAGGGGLSYG FYDRICPQLE HVVRAATEAF FLSDPTTGAA LLRLLFHDCQ VRGCDASILV DDSGQPEILS GKNLGIQKRG  LVGAIKSAVD ATCPPQVVSC ADILVLAARD SVALYGGPAI EVPLGRRDSS EPPSFELADS LLPPASTGVD QMLSLFAEKG FTVEESVAII GAHTIGATHC INVRRRLFDP EAQQGNEIPL 
DLRALLTLNC PLGPLTSNVS FVPNDRTSMT FDNRYYANGG ATGVINIDAE MPLDPRTAGH VRRFAADQDA FFRAFSSAFV KLSSWEVLTG EKGVIRRNCN ALSS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from FGeneSH (two independent predictions: Cuscam_OOIL01000014.1_FGenesh525.1 (5') and 523.1 (3')).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCGT CATCCCATTT TTGCCTCTCT TACCTCAAAA TGCCCCATCC CTCCAAAAGC GCCTTCCATG CATTCTTCAT CACCTATCTT CTCCTAGCCG GACTTGCCTT CTCCGGCGAC  ACCGCCGGCG GCGGCGGCCT CTCGTACGGC TTCTACGACC GCATCTGCCC GCAGCTCGAG CACGTAGTCA GGGCCGCCAC CGAGGCATTC TTCCTCTCCG ACCCCACCAC CGGCGCCGCC  CTGCTGCGGC TCCTCTTCCA CGACTGCCAG GTCCGGGGCT GCGACGCCTC CATTCTCGTC GACGATTCCG GGCAGCCGGA GATCCTCTCC GGCAAGAACC TGGGCATCCA GAAGAGGGGA  CTGGTCGGCG CCATCAAGTC GGCGGTGGAC GCCACGTGCC CCCCGCAGGT CGTGTCCTGT GCCGACATCC TCGTACTCGC CGCCAGAGAC TCTGTGGCTC TGTACGGTGG TCCGGCTATC  GAGGTTCCGC TGGGCCGCCG GGATTCCTCG GAGCCTCCGA GCTTTGAGTT GGCCGACTCT TTGCTCCCTC CGGCGAGCAC GGGAGTCGAC CAGATGCTCA GCCTTTTTGC CGAAAAAGGG  TTCACCGTAG AAGAGTCGGT CGCCATCATA GGTACGGACA ATTAATTATC TTCCCTATGT CCCTAGAAAT AGTTTTTTGT TTGACTTTTT ACTATCTTAT CTTTAATGTA ATACTTTGAT  CATTAATATC TATATTTATG TATAAATATA TTTAATAAAA ATTTAGTATT TCAAAATTAT GTTTAAAATA AACTATTGAT ATTATATTTA TACCAAAGGA CGCTGTATTT TTTACGTAAG  AAAATCAAAA TTTATAAACT TTGACCAGAA AATTAAAATC AATGAAATAT CATTTCTCGA GGAGTACTCT ATTATTCTAT TTGCTCATAG TACTGGATTA CTTACTACCA AATTAATTTT  GTCTTTGACT TGTGTGGAAT AAATGAAAGC CATGCTTTAA AAAGAATTTG TAAAATTAAT TTTAAAAATG TTAAATTTAA GTGTTGGGTT CCGTTGACAA TGACCAGCAG TTCCACTATC  GGTGCCACTA CATTTTTGGA GTATCTCCGG TGCTCCGTTC AGAAATTTGA TGGTTCCAAC GGTGCAACTA GCGGTGTATT GCATAATAAC CACGCATAAG GATGTGGGCT TAGAGCGAGG  CTGGGTGGGG CTAAGGTGGG AAATTTAGGG GGTGGGATAA AGTGGGTAGG ACCCCTCAAA TTTCTAAACG GTGCATCAGA GGTGCTCCAA GAACACAGTG ACACTGCTAG TGGTACTATT  GACACTTGTT AACGGGAGAG TGTCAACGGA ACCATGCTCT AAATTTAAAT ATATTGTCAA GTGGGGAGTA AGAAAAAGTT TGAAAAAAGT ATTGAATAGT AAATGTGAGG GGTAAAGAGA  GTACGATCCG GTTCCATAGC CACTGGATTC AAGTGGCCAC GGAAGTCACT GCCCTCCCAC GGAGCTCCGT TCATAAAATT GATGATTCCT ACACCCCCTC CAACCCCCGC CAAGTCACGA  CCCAAACTCA TCCCCCCACC CACGTCAATT GCACCTCGTA AGCATAATTG ACTTTAAAGT CAAAAGTTTT GACTTTATGC TTACGAGGTG CAATTGACGT AGGTGGGGGA TGAGTTTGGG  TCGAGATTTG GCGGGGGGAT TTACCGGGGG ATTAGGGGGT AGGAATCATC AATTTTATGA ACGGAGCTCC GTAGGGGGCA GTGACTTCCG TGGCCACTGG AATCCTGTGG CCATGGAACC  GGGCCGAAGA GAGTATTGGA GTATTTAACA TTGTTGAAAA GCAAAAGGGA ATTTAATTAA ATGAGTACGT ATAATATTTT CCTCCTCCCC AAATGAAAGT TAGAGAGAAT TTACGAAGTA  AATAACCCTT TCAATTGTTT TATTTAAAAA TTAGCATAGA TGAAACTACT CCGTATATGA CATGACTATA TTATATCAAC ATATAATCCA TGAGAAATAC TCCCACTGTT CCAAAATTAT  CTTTTCATTT ACTATTTATT TTAGGTTTCT AATGCATATT ATTGATCATG AAATCGATAA AATAATATAG AGGATACATT ATTAATTGTT TTGTATAATT TTTTATTTAT TTATAAATAT  ATAAGTTGTA CTTTTAAATT CTATAGCAAT TTGTAAATAA ATTAAAATAA TTTTAAAAAA TAGATTTATT ACACGGATGG AGTACTACGT AATTAGACCT GATCACGAAT TCGGGTATCC  GGCACGCCCG TAAAATAACG AGTTTGGGTT TGATATTCTA GGGTACGGGC TGAGCTTGAG CCTTATAAAT GATGGCCCGA ATGTTTTAGG GCTGGGCTCG AGTTTTATGC TCCCAGGGGC  CGGGCCGGCC CAAATAAATT AAAATACTTA TTATTAGTAT AATGGCCAAA TAGCGCCAGT ACCCCTCGTG GTTTGCAAAA TAGGCACCAA AACCCCCTCT GTTTTCAAAA ATTATTTCTA  AAGTCCTTAT GGTTTCAAAA TGCTGCACCC GTGCCCCCTC TGATCATTTT CCGGCCATTT TTCCGGCAAA GAAGGGGGGC TACATATTTA CCAAACCACA GGGGTATCAG TGCTGATATT  TATTTTTCGC TTATTTGTTT GTTTTTTTTC ATTTTTTCCT TTATTTGTTT CTTTTATTAA TAAAGGTTTT TTTAAAATTA TTTTTATAAT GTTCATAAAA TTTAAAGTTA TTTTTGTTTG  AAAAAATTAA CATATAATGT ATATGTACTT CTCAAATCAA CAATTTTTGT TTTTTCTGAA AAAAGTAAAC TTTTTTTTGA GAATTTCAAA AAAATGACGA ATAAAATAAG AAACAAAATA  ATAGAAAAAT AAAAATGAAT ATCTTTTTCG ATCTCAATTT TAAGGACTTT TTTAGGCTTG TCCGTTTTTT TGTATCTGAC TTTTTTCGTG TATTTTTATT TTTCATTTTA TTTTTCCATA  TTTTTATTTT TTTGTTCTAG GTTTTTCTTT TTGAACTTTC CAAATAAGTA CGTAACAAAA AGTGAAAATG TTTAATTTCA AATAGATGCA ATGTACGTTA ATTTTTTTAT TTTTATTTCA  AACACAAAAA ATTTTAAAAT TTTAAAACAT TATAAAAAAT TGAAAATAAA TTAGACAAAT ATCTAGGAAA AGAAAAAAGA AATAGAAAAT ATTTTAAAAA AGAAAAACAC AAATAATAAA  CGAAAAATAA AAAATGAGCA CGAATGCCTC CTATGGTTTA AAAATTATGC GCAAATGCCC CCTCTTCGCC GGAAAATGGC CGGAAAATGA TCAGAGGAGG CACGGGTACA TCACTTAGAA  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TTATATAGTA ATAAATTAAA TGAAAAGTTC TACAAAACTA GAAGTGACAA GACTATATTA TTTTACAAAA TAACTAGTAA AAATGAGTAA ACAAAGTGAG TGAAATTTGA CCCTGTGAAT  AGTGATTGAG AAGATCTATG GTCGACAGAG GGAGTAATTA AAAGTATTAT TGTGATGTAG GAGCCCATAC AATCGGAGCA ACACACTGCA TTAACGTCCG AAGACGTCTG TTCGACCCAG  AGGCTCAACA GGGAAACGAG ATTCCGTTAG ATTTACGGGC GTTGCTGACG TTAAACTGTC CGTTAGGGCC GTTAACGTCC AACGTCTCCT TTGTCCCGAA CGACCGGACG TCCATGACGT  TCGACAACCG TTACTACGCT AACGGCGGCG CGACGGGAGT GATAAACATC GACGCCGAGA TGCCGCTCGA CCCGCGCACC GCCGGGCACG TGCGGCGGTT CGCGGCGGAT CAGGACGCGT 
TTTTCCGGGC GTTCTCCTCC GCCTTTGTCA AGTTGTCTTC TTGGGAGGTT CTGACGGGGG AGAAGGGTGT GATCAGGAGG AATTGCAATG CCTTGTCATC ATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCGT CATCCCATTT TTGCCTCTCT TACCTCAAAA TGCCCCATCC CTCCAAAAGC GCCTTCCATG CATTCTTCAT CACCTATCTT CTCCTAGCCG GACTTGCCTT CTCCGGCGAC  ACCGCCGGCG GCGGCGGCCT CTCGTACGGC TTCTACGACC GCATCTGCCC GCAGCTCGAG CACGTAGTCA GGGCCGCCAC CGAGGCATTC TTCCTCTCCG ACCCCACCAC CGGCGCCGCC  CTGCTGCGGC TCCTCTTCCA CGACTGCCAG GTCCGGGGCT GCGACGCCTC CATTCTCGTC GACGATTCCG GGCAGCCGGA GATCCTCTCC GGCAAGAACC TGGGCATCCA GAAGAGGGGA  CTGGTCGGCG CCATCAAGTC GGCGGTGGAC GCCACGTGCC CCCCGCAGGT CGTGTCCTGT GCCGACATCC TCGTACTCGC CGCCAGAGAC TCTGTGGCTC TGTACGGTGG TCCGGCTATC  GAGGTTCCGC TGGGCCGCCG GGATTCCTCG GAGCCTCCGA GCTTTGAGTT GGCCGACTCT TTGCTCCCTC CGGCGAGCAC GGGAGTCGAC CAGATGCTCA GCCTTTTTGC CGAAAAAGGG  TTCACCGTAG AAGAGTCGGT CGCCATCATA GGAGCCCATA CAATCGGAGC AACACACTGC ATTAACGTCC GAAGACGTCT GTTCGACCCA GAGGCTCAAC AGGGAAACGA GATTCCGTTA  GATTTACGGG CGTTGCTGAC GTTAAACTGT CCGTTAGGGC CGTTAACGTC CAACGTCTCC TTTGTCCCGA ACGACCGGAC GTCCATGACG TTCGACAACC GTTACTACGC TAACGGCGGC  GCGACGGGAG TGATAAACAT CGACGCCGAG ATGCCGCTCG ACCCGCGCAC CGCCGGGCAC GTGCGGCGGT TCGCGGCGGA TCAGGACGCG TTTTTCCGGG CGTTCTCCTC CGCCTTTGTC 
AAGTTGTCTT CTTGGGAGGT TCTGACGGGG GAGAAGGGTG TGATCAGGAG GAATTGCAAT GCCTTGTCAT CATAA 

Retrieve as FASTA