Entry information : OcPrx20(OcIN23r2_Chr12g0293641)
Entry ID 16180
Creation 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Last sequence changes 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: OcPrx20(OcIN23r2_Chr12g0293641)
Name OcPrx20(OcIN23r2_Chr12g0293641)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx024]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Orobanchaceae Orobanche
Organism Orobanche cernua    [TaxId: 53590 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value OcPrx20
start..stop
S start..stop
MguPrx70 414 3.91e-147 16..272 70..326
LePrx45 372 1.36e-130 16..272 77..334
NtPrx31-1B 371 2.24e-130 16..272 70..327
SaPrx35 370 3.95e-130 16..272 70..326
Literature and cross-references OcPrx20(OcIN23r2_Chr12g0293641)
Protein sequence: OcPrx20(OcIN23r2_Chr12g0293641)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   272
PWM (Da):   %s   29475.85  
PI (pH):   %s   5.12
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
METLLISYGW IRGLIFQYGC DGSILLDDSS NIRGEKNAIP NKNSIRGFEV IDAIKEMVEQ ACPSTVSCTD ILTLVARQAV FLAGGPFWPV SLGRQDALTA NETAANTDLP SPFEPLENIT  AKFISKGLDV NDMVLLSGGH TIGFAQCSSF KKRLFDYDGA GNPDSSIDES LLSKLRGDCP NRDSSDTNLV SLDSTSSRFD NSYYKNIANR SGILGSDQVL VSDNTTAALV LTYARFPFLF 
KKGFAKSMVK MSNITVLTGQ QGEIRKNCRV VN 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTGAATTTG CAAATCTAAT TTTACAAATT TAAACCTCAA ACGTTAAAAA AAAAAAAAGC CCTCAAATGC GTTACCCTAT CCGTAAGACC TATAAGACTT CAAAATTGTT AACCTTAGTG  GAAATTCTCT CGGAACCCTA ATATTCAAAA TTATCCCTAA AACATAAACC CTAGCGATCA GAGTTCGTCT CTTGTATAGT TGATTCTTCA ATCGTCAATT TCCAATCCCG ATGGAAACCC  TACTCATCAG CTATGGGTGG ATCCGTGGCT TGATTTTCCA GTACGTCTCC ACTTTCCTAC ATTTTGTTAC GTTAATTTTT TGTAATTCCT TTTATTTTCA TAATGGTGGT TCTAGATGCC  CCACTCAGTG GCTTAGGTTA TAGGATATTG GACCAAATTC CCTATCAAAT CATTCCTCGG ATTGAATTTG TGTCTGCAAA TGGCTGACAT CATTGCGCAC TGTGTATTCA TCTGCCTTTG  TTTTGTTTAA ATTTGTTTTC CTATTTTTTT CCTTTTGTAT AAGCAGCGCC TGCTTGAGAT GGGAATTTGA TTAGACAACG TTTTATCAAG GACACTGGTC ATTTTTTTTC ATGTAAAGCG  TGCTGCTCAG TGATGACCTC TTTTGTTTTT TTTTTTTAAA GAAAAATGAA TTCGTCCACC TTCGTTTTTC AAAATTTAGT AATAGTACTA GCAGAATGGC AGACTATGAG ATTAATCTTA  ATCATCTCGA AAATGGATGA TGTACTGTCA CTGGTCTGCG ATGTTTATTT ACGTTGAAAC CTGATTTGAA GTTACCCATA ACCTGCTCTG TATAGTGATT AATTTTATCT AAACAAAATA  GCACATCCTC TCAAAAGAGG CTGATTCTAT AATTGATTTA ATTAGGTTGT GCCTGTGTGA TTATTGTAAC TATATATTGC ATAACTGCAG TGAAATTTCT TAAATGCGAA CATGTTATGG  ATGTGCCCAA ATGCCTTCTT TGACTCTGTT TTGCACAACT TGTAGCATAT TTGTGACTAT TGGCACAACT TTAGTATCTG CTTTACAAAA GGGATAATTC AACCATTCAC TTGAGAATTT  TACTGACTCA TGGGTGTAGT TTGGGAGACT TTTTCACCAG TGCTGAGACT TTATGGGATT TTGCCAACCT TAATTGAAAA GGACATCCTA GGTGGCTTTG CCACTCTCTA GTAATAACAA  TGGACCGATC AGTTTCATTC TCCTATAAAT TGCTGCCCCT GCTGATCATC CTCGGGCAGG TTGCAGTTCC TTTTAAAAAT AAATAAATTA TTAATAATAG AGAAAAAGTA CTTTTTCTTT  CAGAATTATG AATTCAAGTG CTTCTAACTT TTCGGTTACT TTTGTTTTTG GTTTTATGTT ACTGCTTACA TTTGGTAACT GTCAACTCGA TTACAAATTT TACGCTAATA CTTGCCCAAA  CTTGGCAGAG ATCGTAAGTT ATGGAGTTCG ATCTGCCATA GCCAACGAAA CCAGGCTTGC AGCCTCTCTC CTGCGCCTGC ATTTCCATGA CTGTTTTGTT AATGTAACTA CATTAGCTCA  ATCACGCTTC TTACTTGTAG AGCTTTCCTT AGAGCAAGCA TAAAGAAAAT GCATTTACCA TTTTTTTGTG ATCCAATACC CACAAAATCA CTAATTTCTC GGAATTTGCT CGTCTTGCTG  TAATTTATAC AAATTTCCCG TGAATTTTGT ATTTTAATGT TGCTACTTTT TTGTTTTCTT TTGGGGAGTG TAGGGATGCG ACGGATCCAT ACTACTTGAT GATAGCAGCA ATATCAGGGG  AGAGAAGAAT GCAATTCCTA ATAAGAATTC GATCCGTGGA TTCGAAGTCA TCGATGCAAT AAAAGAAATG GTTGAGCAAG CTTGCCCGTC TACCGTCTCG TGTACTGATA TATTGACTCT  TGTTGCAAGG CAGGCTGTAT TTTTGGTAAA AACATACGAG TAGTCTAAAG ATGTCATACA GTAGTCCAAC TTTAACTTTT TTTTAAATGA TCCACTAACA GGTCTGAGAA ATTAAAAAAA  AAAAAAGATT GGCAGAATTA ACAAATGAAC GCATAACTGG CTAAAAAAAC CTTGTTTTGA AAATAATGGC TAAATAACTC TTTGTATTTG GCTAAAGGCC ACAAAAACAG GGGACTTAAT  TTTTTTTTTT TTTTGTTTTT TTTGACAACT TTGCTGATTC TAACAAATTA ATAATATCAT TAGGCTGGAG GTCCCTTTTG GCCTGTGTCT TTGGGACGTC AAGATGCCCT AACAGCAAAT  GAGACTGCAG CTAACACAGA CCTCCCATCA CCTTTTGAGC CCTTGGAGAA TATTACTGCA AAGTTTATCT CCAAGGGACT TGATGTGAAT GACATGGTAC TTCTGTCAGG TACTAATTTT  GGATCATCCT GTTTCTCTTA ATTCTGTTAT ATCTTGCTAC TTGCTTTTGT TAAGCGTTCC AAGATGAATT ATGAACTTTT ATTTTGTGTG ATCACAATTT TGATCAAACA GTTTCTGATA  CAATATTAGG ACAATGTTTT CTAGTAATTA TTTGATGGAT CATCCATTTG TTTCCAGGAT ATTTACAAGA AGAAACTCTA GTTATCTTGC AAAGTTACGA ATAGACACTT AATGCCTGTT  TTGTTGCCCA ACCCTGGTTA TCGGGACCAA ATGGGGTTTT GGGGTGGTAC GATGGACATG TTGGGTGGTT TACTTGGGTT TGAGAAAACA AGTCATTGGG TAATTGGGTT TAGAATGGTA  GGATTATATA AAAGAGTGCG TTAAAGAGGT GGATATTACA ACCCATCCCC TTTGGGTTGC AAACAATCGG GCTCATGGGT TGGATTCAAC CGGACTAACC ACTCAAACAA ATGATGTATT  CACCTGGTTT TATAACTTAA TAGGGCCTTA ACCAATAATC CCCGCCTGAG AGTGTAATAT GTAAATAGGC AAATCCTTTG AACGTTCTGT AATTTTAAAA GATTAATGGG CGGCGTTTTT  GTAAATAGGC AAAAGTTCAG TAGTAGTAGT TAACCATTTT TAATATAATT ATTTTGGGAT GATTACCACA AAATCTACTC TTGTAATTAT ATGTGCTTCC CTCTTATGCA GGTGGCCATA  CTATTGGGTT TGCCCAATGC TCTTCGTTTA AAAAGAGGCT CTTCGACTAT GATGGTGCTG GCAATCCAGA TTCATCAATT GATGAGTCAC TTTTAAGCAA ATTGCGCGGC GATTGTCCAA  ATCGAGACAG TTCGGACACC AATTTGGTTT CTTTGGATTC CACGTCAAGC AGATTTGATA ACAGCTATTA TAAGAACATT GCTAACAGAT CCGGGATTCT AGGATCCGAC CAAGTACTCG  TGAGTGACAA TACGACTGCT GCCTTAGTGT TGACTTATGC CAGATTCCCT TTTCTATTTA AAAAAGGTTT CGCAAAGTCG ATGGTCAAGA TGAGCAACAT CACTGTCCTT ACAGGGCAGC  AAGGGGAGAT TAGAAAAAAC TGTAGGGTGG TAAATTGATA TTTTGTTTGT GGGGGGGTGA AATGTGAATT TGTATGAAAT GATGAAGTGG GTTTTATGGT TCTGGTGAAT TGTAAGATGT  AGTCTGGTAA ACAACACACA CACACACACA CACACGAAAC GCAGCGTGTG TATGTTAGCA CAATTGTCCC TACTACTTTT ATCTAAATAA AGATTGCAAG CACCCTCTTG GGTTTGTATT  TACTTCTAAT AGACATCCAA CTATTGAGGT GCAATTTGTC AAAGAGGAAA AATATCAAGA AGGTAATTTG TACTTGTGGA AAAAAAAAAT TGCGGCCTTT TCTTGTAAAT AGGCGAAACC 
TTGG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAAACCC TACTCATCAG CTATGGGTGG ATCCGTGGCT TGATTTTCCA GTACGGATGC GACGGATCCA TACTACTTGA TGATAGCAGC AATATCAGGG GAGAGAAGAA TGCAATTCCT  AATAAGAATT CGATCCGTGG ATTCGAAGTC ATCGATGCAA TAAAAGAAAT GGTTGAGCAA GCTTGCCCGT CTACCGTCTC GTGTACTGAT ATATTGACTC TTGTTGCAAG GCAGGCTGTA  TTTTTGGCTG GAGGTCCCTT TTGGCCTGTG TCTTTGGGAC GTCAAGATGC CCTAACAGCA AATGAGACTG CAGCTAACAC AGACCTCCCA TCACCTTTTG AGCCCTTGGA GAATATTACT  GCAAAGTTTA TCTCCAAGGG ACTTGATGTG AATGACATGG TACTTCTGTC AGGTGGCCAT ACTATTGGGT TTGCCCAATG CTCTTCGTTT AAAAAGAGGC TCTTCGACTA TGATGGTGCT  GGCAATCCAG ATTCATCAAT TGATGAGTCA CTTTTAAGCA AATTGCGCGG CGATTGTCCA AATCGAGACA GTTCGGACAC CAATTTGGTT TCTTTGGATT CCACGTCAAG CAGATTTGAT  AACAGCTATT ATAAGAACAT TGCTAACAGA TCCGGGATTC TAGGATCCGA CCAAGTACTC GTGAGTGACA ATACGACTGC TGCCTTAGTG TTGACTTATG CCAGATTCCC TTTTCTATTT 
AAAAAAGGTT TCGCAAAGTC GATGGTCAAG ATGAGCAACA TCACTGTCCT TACAGGGCAG CAAGGGGAGA TTAGAAAAAA CTGTAGGGTG GTAAATTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTGAATTTG CAAATCTAAT TTTACAAATT TAAACCTCAA ACGTTAAAAA AAAAAAAAGC CCTCAAATGC GTTACCCTAT CCGTAAGACC TATAAGACTT CAAAATTGTT AACCTTAGTG  GAAATTCTCT CGGAACCCTA ATATTCAAAA TTATCCCTAA AACATAAACC CTAGCGATCA GAGTTCGTCT CTTGTATAGT TGATTCTTCA ATCGTCAATT TCCAATCCCG ATGGAAACCC  TACTCATCAG CTATGGGTGG ATCCGTGGCT TGATTTTCCA GTACGGATGC GACGGATCCA TACTACTTGA TGATAGCAGC AATATCAGGG GAGAGAAGAA TGCAATTCCT AATAAGAATT  CGATCCGTGG ATTCGAAGTC ATCGATGCAA TAAAAGAAAT GGTTGAGCAA GCTTGCCCGT CTACCGTCTC GTGTACTGAT ATATTGACTC TTGTTGCAAG GCAGGCTGTA TTTTTGGCTG  GAGGTCCCTT TTGGCCTGTG TCTTTGGGAC GTCAAGATGC CCTAACAGCA AATGAGACTG CAGCTAACAC AGACCTCCCA TCACCTTTTG AGCCCTTGGA GAATATTACT GCAAAGTTTA  TCTCCAAGGG ACTTGATGTG AATGACATGG TACTTCTGTC AGGTGGCCAT ACTATTGGGT TTGCCCAATG CTCTTCGTTT AAAAAGAGGC TCTTCGACTA TGATGGTGCT GGCAATCCAG  ATTCATCAAT TGATGAGTCA CTTTTAAGCA AATTGCGCGG CGATTGTCCA AATCGAGACA GTTCGGACAC CAATTTGGTT TCTTTGGATT CCACGTCAAG CAGATTTGAT AACAGCTATT  ATAAGAACAT TGCTAACAGA TCCGGGATTC TAGGATCCGA CCAAGTACTC GTGAGTGACA ATACGACTGC TGCCTTAGTG TTGACTTATG CCAGATTCCC TTTTCTATTT AAAAAAGGTT  TCGCAAAGTC GATGGTCAAG ATGAGCAACA TCACTGTCCT TACAGGGCAG CAAGGGGAGA TTAGAAAAAA CTGTAGGGTG GTAAATTGAT ATTTTGTTTG TGGGGGGGTG AAATGTGAAT  TTGTATGAAA TGATGAAGTG GGTTTTATGG TTCTGGTGAA TTGTAAGATG TAGTCTGGTA AACAACACAC ACACACACAC ACACACGAAA CGCAGCGTGT GTATGTTAGC ACAATTGTCC  CTACTACTTT TATCTAAATA AAGATTGCAA GCACCCTCTT GGGTTTGTAT TTACTTCTAA TAGACATCCA ACTATTGAGG TGCAATTTGT CAAAGAGGAA AAATATCAAG AAGGTAATTT 
GTACTTGTGG AAAAAAAAAA TTGCGGCCTT TTCTTGTAAA TAGGCGAAAC CTTGG 

Retrieve as FASTA