Entry information : OcAPx05(OcIN23r2_Chr14g0320931)
Entry ID 16183
Creation 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Last sequence changes 2020-02-05 (Bruno Savelli)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-02-05 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: OcAPx05(OcIN23r2_Chr14g0320931)
Name OcAPx05(OcIN23r2_Chr14g0320931)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Orobanchaceae Orobanche
Organism Orobanche cernua    [TaxId: 53590 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value OcAPx05
start..stop
S start..stop
MguAPx03 597 0 1..366 1..361
LeAPx07 570 0 24..364 3..345
SaAPx03 561 0 1..368 1..370
InAPx06 560 0 1..365 1..353
Literature and cross-references OcAPx05(OcIN23r2_Chr14g0320931)
Protein sequence: OcAPx05(OcIN23r2_Chr14g0320931)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   369
PWM (Da):   %s   40278.21 Transmb domain:   %s   i13-35o
PI (pH):   %s   6.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
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GFSLDDKSP 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCAAGGACGT TTCGTCTTGT GTATTTTAAT TTTAATAATA TATAGACTCC GATTGATGAT CGGACATATT TATTTTAATC TCCACGAGCC TATATTTTGG AGATGTTTTT GTACTTCAAA  TGAAAGAAAA TGCGCCAAAC ATACCCTACT CGATTCCGTT TATTAACTTG ATAAAATTTG AGGAAACATA ACAGGAGAGA GACTCCGCCC GAATACGCTG ATACGACCTC CACGCGCATC  CCACACATCC CGAAACCAAA GGAGACAATA GCCAATGACT GATCGTCTGA CTGTCACTAA CACAGCAGCA ATGTCTACTC TCTCAGCCGC CGCCTCCGCC ATCACCACCA CCACAGCCGC  TACTCTCTTC CTCCCTGCTG TCACCGCCTC CTCCACCAGA TTCTCCTACC GTTCATCCCT CTCTCTCAGC TCCGCCTCTG CCAGATCGTC TCCTCTCGTC ACCCCCCTCT TTTCCCCCCA  GGTAGCTACA TATTATTCAT TCATTCGGAC TATGCCTTTT ATTTTACTTG ATTTCTTTTT GATGATTTTT TGTAGCGAAG CTCTCTGCCA CGATTTTCGA GGGGGAGAAT ACGTTATTCG  ACGGTGTCGT CGCCGAAATG CGCAGCATCG GACGCTGAGC AGCTGAAGAG TGCGCGTGAG GATATAAAGG AGCTTCTGAA CACTAAGTTC TGTCACCCTA TTCTGGTAAG CTTCTTTTGA  TTTTTCTCTA TTTATTTCTC TTTTTGAATT AATTGTTAAA GAGATTCGGG TTTGGAGCTA TACATAAGAC TCATTTTCTT ATAATGTTAT TAGTCATGGA TATGCTTCTT CTTTCCCACC  TACTATGAAT ATGGTTGATT CCCTTTAGCA TTGTAGGTAG GCGAACTCTA TGTATTGATG TAGCTTTTAA CTGCCTAAGG GGATCGAGCT TCATCGCCTT TCGTTATAAA TGCACATGAT  ATTCTGTTTC TAGAGCAACA CAGACAATAA GGAAGCTAAA CTTGAATCGA CATAGCGAAG TTGGCTTACG GAAAATGTTA GATCGAATTT TGGCCATTGA CAAATAGAGT TACATATTAC  TGTTTACTAA TTACTACCAC CTCTATAATT ATTGTTGTTG TCTTTACTTA GTTTACTACT TCTACTGTTA CTATTAAAAT TATTATTAAT CTATGATTAT TGTTATTGTG TTGTAGGTTC  GACTGGGTTG GCATGATGCC GGTACATATA ACAATAATAT TGAGGAGTGG CCGCAAAGGG GTGGCGCTAA TGGAAGTTTA AGATATGAAA TAGAACTAAG ACATGGAGCA AATGCTGGTA  AATTTTTCAT TTTTATGGCT TGAGTGTTTA TTTTTTGATG AGTATGGTGC ATGAGAAGTT GGAGCTGGAC AGGGCTTGTC AGTGCTCTTA AACTTCTTCA GCCCATCAAG GACAAGTATC  CTAGCATGAC ATACGCAGAC TTATTTCAAT TGGCTAGTGC TACTGCTGTA GAGGTTAGTT CTTTTGACTC AGCTTCAATG AGAACACATA TTTTTTGCGG TGTTTGACTA ATATGTTTTT  TCTTTTTTTG GTGAAATATA ATTATTTTAT CCAAAAAAAA ATTAGATGTA CATCAGATGG GGATCTTAGT CATTTTGTTT AAATTGTTAT GGTGGAGCCT AGGGGAGGGA ATTATAATAA  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TGAAGGGTTT CTCATTAGAT GACAAGTCAC CCTGAAAATT TTGTGGCAGC AAAGTACTCA ACAGGAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTGATC GTCTGACTGT CACTAACACA GCAGCAATGT CTACTCTCTC AGCCGCCGCC TCCGCCATCA CCACCACCAC AGCCGCTACT CTCTTCCTCC CTGCTGTCAC CGCCTCCTCC  ACCAGATTCT CCTACCGTTC ATCCCTCTCT CTCAGCTCCG CCTCTGCCAG ATCGTCTCCT CTCGTCACCC CCCTCTTTTC CCCCCAGCGA AGCTCTCTGC CACGATTTTC GAGGGGGAGA  ATACGTTATT CGACGGTGTC GTCGCCGAAA TGCGCAGCAT CGGACGCTGA GCAGCTGAAG AGTGCGCGTG AGGATATAAA GGAGCTTCTG AACACTAAGT TCTGTCACCC TATTCTGGTT  CGACTGGGTT GGCATGATGC CGGTACATAT AACAATAATA TTGAGGAGTG GCCGCAAAGG GGTGGCGCTA ATGGAAGTTT AAGATATGAA ATAGAACTAA GACATGGAGC AAATGCTGGG  CTTGTCAGTG CTCTTAAACT TCTTCAGCCC ATCAAGGACA AGTATCCTAG CATGACATAC GCAGACTTAT TTCAATTGGC TAGTGCTACT GCTGTAGAGG AAGCTGGGGG ACCCAAAATC  CCTATGAAGT ATGGAAGAGT AGATGTGTCT GCACCTGAAC AATGTCCAGA AGAGGGAAGG CTCCCAGATG CTGGCCCTCC TTCCCCTGCT GCTCATTTGC GAGATGTCTT CTACCGGATG  GGATTGAATG ACAAGGAAAT AGTTGCTCTC TCTGGTGCGC ACACACTCGG TAGGTCAAGG CCGGATCGCA GTGGATGGGG AAAACCTGAG ACCAAATACA CGAAAGATGG ACCAGGAACC  CCTGGAGGAC AATCATGGAC AGTGCAGTGG TTGAAATTTG ATAATTCCTA CTTTAAGGAT ATCAAAGAAA GAATGGACGA GGATCTTCTA GTTTTACCTA CAGATGCTGT TCTATTTGAA  GATCCATCAT TCAAGGAATA TGCAGAGAAA TATGCCGAGG ATCAAGGTGA ATTTTTCAAG GATTATGCTG AAGCTCATGC TAAGCTTAGC AATCTTGGAG CTAAATTTGA CCCTCCTGAG 
GGTTTCTCAT TAGATGACAA GTCACCCTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCAAGGACGT TTCGTCTTGT GTATTTTAAT TTTAATAATA TATAGACTCC GATTGATGAT CGGACATATT TATTTTAATC TCCACGAGCC TATATTTTGG AGATGTTTTT GTACTTCAAA  TGAAAGAAAA TGCGCCAAAC ATACCCTACT CGATTCCGTT TATTAACTTG ATAAAATTTG AGGAAACATA ACAGGAGAGA GACTCCGCCC GAATACGCTG ATACGACCTC CACGCGCATC  CCACACATCC CGAAACCAAA GGAGACAATA GCCAATGACT GATCGTCTGA CTGTCACTAA CACAGCAGCA ATGTCTACTC TCTCAGCCGC CGCCTCCGCC ATCACCACCA CCACAGCCGC  TACTCTCTTC CTCCCTGCTG TCACCGCCTC CTCCACCAGA TTCTCCTACC GTTCATCCCT CTCTCTCAGC TCCGCCTCTG CCAGATCGTC TCCTCTCGTC ACCCCCCTCT TTTCCCCCCA  GCGAAGCTCT CTGCCACGAT TTTCGAGGGG GAGAATACGT TATTCGACGG TGTCGTCGCC GAAATGCGCA GCATCGGACG CTGAGCAGCT GAAGAGTGCG CGTGAGGATA TAAAGGAGCT  TCTGAACACT AAGTTCTGTC ACCCTATTCT GGTTCGACTG GGTTGGCATG ATGCCGGTAC ATATAACAAT AATATTGAGG AGTGGCCGCA AAGGGGTGGC GCTAATGGAA GTTTAAGATA  TGAAATAGAA CTAAGACATG GAGCAAATGC TGGGCTTGTC AGTGCTCTTA AACTTCTTCA GCCCATCAAG GACAAGTATC CTAGCATGAC ATACGCAGAC TTATTTCAAT TGGCTAGTGC  TACTGCTGTA GAGGAAGCTG GGGGACCCAA AATCCCTATG AAGTATGGAA GAGTAGATGT GTCTGCACCT GAACAATGTC CAGAAGAGGG AAGGCTCCCA GATGCTGGCC CTCCTTCCCC  TGCTGCTCAT TTGCGAGATG TCTTCTACCG GATGGGATTG AATGACAAGG AAATAGTTGC TCTCTCTGGT GCGCACACAC TCGGTAGGTC AAGGCCGGAT CGCAGTGGAT GGGGAAAACC  TGAGACCAAA TACACGAAAG ATGGACCAGG AACCCCTGGA GGACAATCAT GGACAGTGCA GTGGTTGAAA TTTGATAATT CCTACTTTAA GGATATCAAA GAAAGAATGG ACGAGGATCT  TCTAGTTTTA CCTACAGATG CTGTTCTATT TGAAGATCCA TCATTCAAGG AATATGCAGA GAAATATGCC GAGGATCAAG GTGAATTTTT CAAGGATTAT GCTGAAGCTC ATGCTAAGCT 
TAGCAATCTT GGAGCTAAAT TTGACCCTCC TGAGGGTTTC TCATTAGATG ACAAGTCACC CTGAAAATTT TGTGGCAGCA AAGTACTCAA CAGGAA 

Retrieve as FASTA