Entry information : CfasRboh01
Entry ID 16210
Creation 2020-03-11 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-12 (Baptiste Sarrette)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CfasRboh01
Name CfasRboh01
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Chamaecrista fasciculate    [TaxId: 53854 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CfasRboh01
start..stop
S start..stop
CausRboh02 1494 0 1..914 1..937
LjRboh01 1456 0 1..914 1..930
CcaRboh02 1444 0 1..914 1..941
CcajRboh05 1440 0 18..914 11..920
Literature and cross-references CfasRboh01
Protein sequence: CfasRboh01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   914
PWM (Da):   %s   103682.99 Transmb domain:   %s   o351-373i493-515o535-557i719-736o
PI (pH):   %s   8.83
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MESHEASTSS SDLHSHGSDI ELIHSSPLNK RVVGRKKNEE NAEEADYVEV TMEIQGDSVA LHSVKTVNNA GNGGDDLRED ERFGLLNNKG LEKKTSFGGS LVRNASFTVK HVSQELKRLA  SFSKTPNPMK KHYDRTKTAA AHALVGLKFI SKSDGSGAGW DEVEKQFDKL TATTNGILHR SLFGKCIGMN KESEEFALEL FDALARKRCV LGDSINKDQL KDFWEQISDQ SFDSRLQTFF  DMVDKDADGR ITEEEIKQII CLSATTNKLS NIQKQAEEYA ALIMEELDPD DTGFILIENL ELLLLHGPNH SKRGDSKYLS QMLSQRLKPI YDTNPIKRWY RDTIFFLQDN WQRAWVLALW  ITVMLVLFVY KFVQYRRRAA YQVMGHCVCM AKGAAETLKL NMALILLPVC RNTVTWIRNK TKLDIMVPFD DHLNFHKVIA VAVAIGVGIH TIYHVACDFP RLLHATKEEY KPMEKFFGAQ  PSSYWHFVKS WEGVTGIVMI VLMTISFTLA TPWFRRGRVK LPKPFDKLTG FNAFWYSHHL FIIVYAMLIV HGIKLYLTKE WYKKTTWMYL AVPITIYTLE RFIRALRSSI EPVRILKVAV  YPGNVLTIHM SKPHGFRYRS GQYMFVNCAA VSPFEWHPFS ITSAPGNDYL SVHIRIVGDW TRSLKAKFSE ACQPPPNGKS GLLRAECFPG DGSPSSSLPK VLIDGPYGAP AQDYQKYEVV  LLVGLGIGAT PMISILKDIV NNFKAMEEEQ EALEEGVGGD NKIPKKPHNH QNHRSFKTRK AYFYWMTREQ GSFDWFKGVM NEVAEADHGG VIELHNYCTS VYEEGDARSA LIEMLQSLNH 
AKNGVDIVSG TRVKTHFAKP NWRTVYKRIA LSHPHARVGV FYCGPPTVIK DLRQLASDFS HNTSTKFDFH KENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Chafa1882S17531
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAATCAC ACGAGGCTTC AACTTCTTCA TCAGATCTTC ATAGTCATGG TTCAGATATA GAGCTCATTC ATAGTAGCCC TTTGAACAAA AGGGTTGTTG GAAGGAAGAA GAATGAAGAA  AATGCTGAAG AAGCAGATTA TGTTGAGGTC ACCATGGAAA TCCAAGGTGA CTCTGTGGCT TTACACAGTG TTAAAACTGT TAATAATGCT GGTAATGGTG GTGATGATCT CAGAGAAGAC  GAGAGATTTG GTTTGCTTAA TAATAAAGGG CTTGAAAAGA AAACTTCATT TGGTGGCTCA CTTGTGAGAA ATGCTTCTTT CACAGTGAAG CATGTGTCTC AAGAGCTAAA GCGTTTAGCT  TCCTTTTCAA AAACACCAAA TCCCATGAAA AAACACTATG ATAGGACTAA GACTGCGGCT GCTCATGCTC TTGTGGGACT CAAGTTTATA AGCAAGAGTG ATGGTAGTGG TGCAGGATGG  GATGAAGTTG AGAAGCAATT TGACAAGCTT ACTGCTACTA CCAATGGGAT TCTTCATCGT TCACTCTTTG GAAAATGTAT AGGAATGAAC AAGGAATCAG AGGAGTTTGC ATTGGAGCTC  TTTGATGCTC TAGCTAGGAA GAGATGTGTT TTGGGGGATT CCATTAATAA GGACCAGTTG AAGGATTTTT GGGAACAGAT TTCTGACCAG AGCTTTGATT CTAGGCTTCA AACATTCTTT  GACATGGTGG ATAAAGATGC AGATGGCAGA ATCACCGAGG AAGAAATCAA ACAGATCATC TGCCTTAGCG CCACTACCAA CAAGCTGTCA AATATCCAGA AACAAGCAGA AGAATATGCG  GCTTTGATTA TGGAAGAACT AGACCCTGAT GACACTGGAT TTATCTTGAT AGAAAACCTG GAGTTGCTCT TGTTGCATGG TCCCAATCAT TCCAAAAGAG GAGATAGCAA GTACTTAAGC  CAAATGCTAA GCCAAAGGCT TAAGCCTATA TATGACACCA ATCCCATTAA GAGGTGGTAT AGAGACACCA TCTTCTTCTT GCAGGATAAT TGGCAGAGAG CTTGGGTATT GGCACTATGG  ATCACTGTGA TGCTAGTTCT GTTTGTTTAC AAATTTGTGC AATATCGACG AAGAGCCGCT TACCAAGTAA TGGGCCATTG TGTGTGCATG GCCAAAGGTG CTGCTGAGAC ACTAAAACTG  AACATGGCTC TTATTTTGTT ACCTGTTTGC CGAAATACTG TCACCTGGAT CCGGAACAAG ACCAAGCTAG ACATTATGGT TCCTTTTGAT GATCACCTCA ACTTCCACAA GGTGATAGCT  GTGGCAGTAG CGATTGGCGT CGGTATACAC ACTATTTATC ATGTTGCTTG TGATTTTCCA CGGCTTCTTC ATGCAACTAA AGAAGAGTAC AAGCCTATGG AGAAATTTTT CGGGGCTCAA  CCTTCTAGTT ATTGGCATTT TGTGAAATCA TGGGAAGGAG TAACTGGGAT TGTGATGATA GTACTAATGA CAATATCTTT CACTCTAGCC ACCCCTTGGT TTAGGAGAGG CAGAGTCAAG  CTTCCAAAAC CCTTTGACAA ACTCACTGGT TTCAATGCAT TTTGGTATTC TCATCACCTC TTCATCATTG TCTATGCCAT GTTGATAGTT CACGGAATCA AACTTTACCT CACTAAGGAA  TGGTACAAGA AAACGACCTG GATGTATTTG GCTGTTCCAA TCACTATTTA TACGTTGGAA AGATTTATTA GAGCTCTCAG ATCGAGCATT GAGCCTGTGA GAATTTTGAA GGTGGCTGTT  TATCCTGGAA ATGTGTTAAC AATTCACATG TCAAAGCCTC ATGGGTTTAG ATACAGGAGT GGGCAATACA TGTTTGTCAA TTGTGCTGCT GTGTCTCCAT TTGAATGGCA TCCATTCTCC  ATAACCTCAG CCCCTGGCAA TGACTACCTT AGTGTTCACA TTCGAATAGT AGGCGATTGG ACTCGGAGCC TAAAAGCAAA ATTTTCAGAG GCGTGCCAGC CACCCCCAAA TGGTAAGAGT  GGGCTTCTAA GAGCTGAATG CTTTCCAGGA GATGGCAGTC CAAGCAGTAG TTTGCCAAAG GTGTTGATTG ATGGTCCATA TGGAGCACCA GCACAAGACT ATCAGAAGTA CGAAGTGGTA  TTGCTAGTAG GATTAGGAAT AGGGGCAACC CCAATGATCA GTATACTGAA GGACATAGTG AATAACTTCA AGGCCATGGA AGAAGAACAG GAAGCATTAG AGGAAGGAGT AGGAGGAGAT  AATAAAATAC CAAAAAAACC CCACAACCAT CAAAATCACA GGAGCTTTAA AACTAGGAAG GCATACTTCT ACTGGATGAC AAGAGAGCAA GGTTCGTTTG ACTGGTTCAA AGGGGTGATG  AATGAGGTGG CAGAAGCAGA TCATGGTGGA GTGATTGAAC TGCATAATTA CTGTACAAGT GTTTATGAAG AAGGTGACGC ACGCTCTGCT CTTATTGAGA TGCTGCAATC TCTGAATCAT  GCCAAGAATG GTGTCGACAT TGTGTCTGGC ACTCGTGTTA AGACTCACTT TGCTAAACCC AATTGGCGTA CTGTCTACAA GCGTATTGCG CTTTCTCATC CTCATGCCAG AGTTGGGGTG 
TTCTACTGTG GTCCGCCGAC TGTGATAAAA GATCTACGCC AATTGGCTTC GGATTTTTCT CACAACACAA GCACGAAATT CGATTTCCAT AAAGAGAACT TTTGA 

Retrieve as FASTA