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Entry information : AdurRboh08(aradu.Aradu.TQ7E6.1)
Entry ID 16308
Creation 2020-03-12 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes 2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AdurRboh08(aradu.Aradu.TQ7E6.1)
Name AdurRboh08(aradu.Aradu.TQ7E6.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh004]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Arachis duranensis    [TaxId: 130453 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AdurRboh08
start..stop		 S start..stop
AipaRboh01 1587 0 1..830 1..838
AeveRboh09 1191 0 93..830 87..832
NschRboh09 1181 0 71..830 44..813
CausRboh09 1164 0 60..830 39..812
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '16308' 'join(400..850,1895..2051,2306..2354,2569..2682,3443..3865,3990..3993,4294..4637,4718..4813,5359..5474,5555..5657,6375..6554,6677..6811,7022..7153,7305..7383,9188..9297)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 400..850 449 N° 2 1895..2051 155 N° 3 2306..2354 47 N° 4 2569..2682 112
N° 5 3443..3865 421 N° 6 3990..3993 2 N° 7 4294..4637 342 N° 8 4718..4813 94
N° 9 5359..5474 114 N° 10 5555..5657 101 N° 11 6375..6554 178 N° 12 6677..6811 133
N° 13 7022..7153 130 N° 14 7305..7383 77 N° 15 9188..9297 108  
join(400..850,1895..2051,2306..2354,2569..2682,3443..3865,3990..3993,4294..4637, 4718..4813,5359..5474,5555..5657,6375..6554,6677..6811,7022..7153,7305..7383,918 8..9297)


exon

Literature and cross-references AdurRboh08(aradu.Aradu.TQ7E6.1)
Cluster/Prediction ref. Genebank:   107470897
Protein sequence: AdurRboh08(aradu.Aradu.TQ7E6.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   830
PWM (Da):   %s   94612.84 Transmb domain:   %s   i315-337o436-458i484-506o
PI (pH):   %s   9.39
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MDDVHHVQVESKAPPHHHHNHDSHHRSSLIALMRASPSSSLTPSSSTSSSSSSSSSSSSWTLKKYLLYDHPGPTGSNNVPPHDDEDHQEHQLRPPHVAEIQELQKRVFIDGIVGHSGMQW
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Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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TTGCTTTTCAATAAGATCTTTTAAAAAAAGATAACTCGAAAAAAATCTTTTTTTAGAAATTCACCCAAACAAGTCCTATAAATATTTTTTATAATTAAGATCAACGGTTAAAAATCACTA
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Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATGATGTTCATCATGTTCAAGTAGAATCAAAAGCTCCTCCTCATCATCATCATAATCATGATAGTCATCATCGTTCTTCTCTCATTGCTCTCATGAGAGCATCACCATCTTCTTCA
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AACCATGTGAACAGCCGGTTCGACCAAGTTTCCTCGACCAGAACCAGCCCTGAACCGGTTGTAGAATGGTCCAACTTTGCCTTCTGCATTGGGATGCAGTCTTCACCAGAATTTGCCAAT
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ACAGAGAAGCAAAATAATGTGGAGAGCAACAAGAATGGGTTCCTTGAGGAGCAAGAAGCAATGTCGAGGGCGGAAGTGTTGTTCCGAACGAACTGGCGGCGAGCTTGGATGGTTCTGGTT
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CTCAACATGGCTCTCATTCTCCTCCCTGTTTGTAGAAACACAATCACTTGGCTCCGCAAGGATCCTAGGATCAACTATCTCATTCCTTTTAATGACAACATTAACTTCCACAAGGCTAGT
ACACACCTTGCCTGTGATTTCCCAAGAATCAGCGGCTCAAGCACGGCGGTTTTCCAGCAGACTATAGCGGCGAGATTCGGGTTCCGGCAGCCAACGTACTTGCAAATTTTGGCCACAACA
GAGGTGGCAAGTGGGATAGCCATGGTGTTTCTAATGGCCATTGCATTCACACTTGCAACAAAGTGGCCGAGACGTCGCTCGCCGGCGCTGCCGGTGTCCCTAAGAAGAGTCACCGGCTAC
AACACATTTTGGTACTCACACCATTTGTTTGTTATTGTCTATGCATTGCTCATTGTCCACTCCATGTTCTTGTTCCTAACTAACAAATGGACCGAGAAAACGACTTGGATGTACATTGCT
TTTCCAGTTTTGTTATACACTGGAGAGAGGATCTTTAGAGCTGTAAGGTCAGGATCTTATGAAGTTGATATCTTCAAGGTAAGTCTGTGTCCCGGAAAAGTTTTGTACCTGAAAATGCAA
AAACCTGAAGGCTTCAAGTACCAAAGTGGCATGTATATATTTCTTCAGTGCCCACAAATTTCATCCCTTGAATGGCATCCATTTTCCTTAACTTCAGGACCACAAGATGATTACCTTAGT
GTGCATATTAGAACTCTTGGAGATTGGAGCTACCAAATATACGACCTATTCCAAGAGGCAGTGTTAACAAGATCGGAAGTGTGTCCAAAAGTGTACATAGATGGGCCATATGGTTCTGCT
TCTCAAGATCATGTTAAGTATGATATTGTGGTGCTGATTGGCCTTGGTATTGGAGCCACACCTTTCATTAGCATCCTCAAAGATGTAGCAGCTACAACACACAATGATCATGTTCATAGT
GGTGTGAGAGAATACGGCAACTTAACAAAGTGTCCGCAAAAGGCATATCTCTATTGGGTCACAAGAGAGCAAAATTCCCTTGATTGGTTTAGAGATGTTATGAATCAAATTGCAACTTCA
AACAGAAATCAGTCGGTGGTGGAAATGCACAATTTCCTTACTAGTACCGTATATCCTGCCGGAGATATCCGTGCGGCGCTGCTAAGTGTCATTCAGGGGTTGCATCACGCCAAGAATGGC
ACTGACTTAGTTTCCAGGAGCCCAATATACACTCATTTTGCTCGTCCGAATTGGTTCAACATATTTGCTAGATTAGCTCAAAGGCACAGGGGAGCTAAGATTGGGGTTTTCTATTGTGGC
TCATCTAATTTGGCAAGGGAGTTGAAGAAGTTGTGCACCAAATTTTCCACCAAAACCACAACAAGATTTGTTTTCCACAAGGAAAATTATTAA

Retrieve as FASTA