1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : PtaPrx64 (PTA00082981)
Entry ID 16905
Creation 2020-12-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2020-12-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PtaPrx64 (PTA00082981)
Name (synonym) PtaPrx64 (PTA00082981)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx006]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx64
start..stop		 S start..stop
PtaPrx65 618 0 1..318 1..318
PabPrx79 604 0 1..318 1..318
PabPrx125 588 0 1..318 1..318
PabPrx111 565 0 10..318 7..315
Literature and cross-references PtaPrx64 (PTA00082981)
Protein sequence: PtaPrx64 (PTA00082981)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   318 (294)
PWM (Da):   %s   33819.54 (31267.3)  
PI (pH):   %s   7.88 (7.70) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-318
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFSTAMRFL ACIVMVLCSA TAYAQLSSTY YDTSCPKALS TVKAAVKQAV AKEKRMGASL LRLHFHDCFV NGCDGSLLLD DSSNITGEKT AVPNNNSVRG FDVIDTIKSQ VETVCSGVVS  CADILAIAAR DSVVELGGPT WTVMLGRRDS RTASLSAANS NIPAPTSNLS ALISSFQAKG LSTKDMVALS GAHTIGQSRC TNFRTRIYNE SNINAAFATS LNTNCPSTGS DDNLSPLDLL 
TPTTFDNNYY SNLRSQKGLL HSDQQLYNGG STDSMVTTYS TKQNTFFTDF SAAMVNMGNI NPLTGTSGEI RTNCRKPN 

Retrieve as FASTA  
Remarks complete sequence from genomic (incorrect prediction, PTA00082981 contains 3 ORFs)
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTCT CTACAGCTAT GCGATTCCTC GCCTGTATTG TTATGGTTTT GTGTTCGGCC ACGGCGTACG CCCAGTTGAG CTCAACGTAT TATGATACGT CATGTCCCAA GGCCCTCTCG  ACGGTGAAGG CTGCTGTGAA GCAAGCGGTG GCCAAAGAGA AGCGCATGGG GGCATCACTC CTCCGCCTTC ACTTTCACGA CTGCTTCGTT AATGTAATCT AATGTTTCTG TTTGTCAGTT  CCTCGTTTGA AATTCCATTT GCTGTTTTTT TTCAGAATGG TAGTCCTAGA TTTCGGTATT TCCGTGATTG TGAAAAACAA GAGTTTTCTT GCAGGGTTGC GACGGGTCCT TGCTGCTGGA  CGACTCTTCG AATATAACTG GGGAAAAGAC CGCTGTTCCA AACAACAATT CGGTGAGGGG TTTCGATGTG ATAGACACTA TCAAGTCCCA AGTGGAAACA GTTTGCAGCG GAGTCGTTTC  ATGCGCTGAT ATTTTAGCGA TTGCTGCTCG AGATTCTGTT GTTGAAGTAA TTATCTATTG CTTATTTCCA TGGTATATTT TGGAAATTTT CAGAATTTGA CTTATAAGAC GGAAAGAATC  ATAGATAAGT TTGAATAACT AAGAGAAACC ATAAAGAGAT TAATTTTGAA ATTAAATTCA ATTTACTGTC TAGCTCGATT TAACTGATAT TTTTATGTCT AACTTGACTT AATCGATATT  TTTATCTTTA ACTTGATTTA ATCAGTATTT TTATGTGGAT TGCTGGTTAC CCAAATATTT GATAATGCAT AACCGCAACC ATGTCGAATC AACAATAAAC AGCCTGACCG CAACCATGTC  GAATCAACAA TAAACAGCCT GACCGCAACC ATGTCGACTC AGCAATAAAC ATAAGACTAG AGCAGATTCT CATTTCCAAA ATATTCTGAA AATAAACCAA TAAAAATGAA ATAAAAAAAA  TTAGTGTAGC TCTCAGCTTT GTCATATTCC TAAATCCTTA TCTGAAATAA CTTTACTCTT TTTTTTTAAT TATAGTGAAT ATGTAACTCT TTCCACTCAT CTAAGGGAGG CTGGTGAGAG  GCTGGTGGTA TACATTTTAC TATCTTAATT CACATTCATA GAGATAATTT AAATTCAACT AGGAAATTGT GTCTTCAATT TATAAGTCAC TACAAATTTT AAAAATATCT CAAAAATTTA  AAAAAATCAA TTATCTAACC CCTCTTCTGA CCGTCAGAAT TCAAGATATT CCCATAATCT ACGGACAAGA TATTCCCATA ATCTAGCATG CGTGATCATT TATATGAATG GTCAAACTGG  TGATTGAATG AATATCCTCT ACATAGTTTA CCTTGGTACC TGGAAAAGTT TCCTTCATTC AGAAATATGT AACGAGATAT CTAATTGTGG TTAATGGTTT ACTTTGTCGA AATTTTCTGC  ACATTCTACA CGTATTGTCT ACACTCTACA CTCATAGAAA AAATTGACAA TCGTTCTGTT CGTGTGCGTA GAGAAATATT CTTAAGGGAA ATGTTAATTA GATTTGATCT TCAATTTTGT  TGATCGCAGT TGGGAGGCCC GACATGGACA GTGATGCTTG GAAGGAGAGA CTCCAGGACT GCCAGCCTAA GTGCTGCAAA CTCCAACATT CCGGCTCCCA CTTCCAACCT TAGCGCTCTC  ATCTCATCTT TTCAAGCTAA GGGTCTTTCA ACTAAGGATA TGGTTGCTCT GTCAGGTATA TATAATATTT CACAACACAC CTCCAATGTT TATATCATGG AGATTGAGCA AGATATGGTC  ACCATATGAT CTGAAATTTT ATTTCGCAAT ATGTTATTGA ACTAGGTGCG CATACCATTG GTCAATCGCG GTGCACAAAC TTTAGGACTC GCATCTACAA TGAATCCAAC ATCAACGCAG  CATTCGCCAC TTCCCTCAAC ACAAACTGCC CGAGTACTGG AAGCGACGAT AATCTCTCGC CTTTGGACCT CCTTACTCCA ACCACTTTTG ATAACAACTA CTACAGTAAT CTCAGAAGCC  AAAAGGGACT TCTCCACTCG GACCAGCAGC TGTATAACGG AGGTTCTACA GACTCCATGG TTACTACATA CAGCACCAAA CAGAACACTT TTTTCACGGA CTTTTCCGCT GCTATGGTGA 
ATATGGGAAA CATCAATCCT CTAACAGGCA CAAGCGGAGA GATCCGAACA AACTGTAGGA AACCTAACTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTCT CTACAGCTAT GCGATTCCTC GCCTGTATTG TTATGGTTTT GTGTTCGGCC ACGGCGTACG CCCAGTTGAG CTCAACGTAT TATGATACGT CATGTCCCAA GGCCCTCTCG  ACGGTGAAGG CTGCTGTGAA GCAAGCGGTG GCCAAAGAGA AGCGCATGGG GGCATCACTC CTCCGCCTTC ACTTTCACGA CTGCTTCGTT AATGGTTGCG ACGGGTCCTT GCTGCTGGAC  GACTCTTCGA ATATAACTGG GGAAAAGACC GCTGTTCCAA ACAACAATTC GGTGAGGGGT TTCGATGTGA TAGACACTAT CAAGTCCCAA GTGGAAACAG TTTGCAGCGG AGTCGTTTCA  TGCGCTGATA TTTTAGCGAT TGCTGCTCGA GATTCTGTTG TTGAATTGGG AGGCCCGACA TGGACAGTGA TGCTTGGAAG GAGAGACTCC AGGACTGCCA GCCTAAGTGC TGCAAACTCC  AACATTCCGG CTCCCACTTC CAACCTTAGC GCTCTCATCT CATCTTTTCA AGCTAAGGGT CTTTCAACTA AGGATATGGT TGCTCTGTCA GGTGCGCATA CCATTGGTCA ATCGCGGTGC  ACAAACTTTA GGACTCGCAT CTACAATGAA TCCAACATCA ACGCAGCATT CGCCACTTCC CTCAACACAA ACTGCCCGAG TACTGGAAGC GACGATAATC TCTCGCCTTT GGACCTCCTT  ACTCCAACCA CTTTTGATAA CAACTACTAC AGTAATCTCA GAAGCCAAAA GGGACTTCTC CACTCGGACC AGCAGCTGTA TAACGGAGGT TCTACAGACT CCATGGTTAC TACATACAGC 
ACCAAACAGA ACACTTTTTT CACGGACTTT TCCGCTGCTA TGGTGAATAT GGGAAACATC AATCCTCTAA CAGGCACAAG CGGAGAGATC CGAACAAACT GTAGGAAACC TAACTGA 

Retrieve as FASTA