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Entry information : PtaPrx93(PTA00029214)
Entry ID 16921
Creation 2021-01-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2021-01-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx93(PTA00029214)
Name PtaPrx93(PTA00029214)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx009]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer Cold stress
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx93
start..stop		 S start..stop
PabPrx228 614 0 1..333 1..333
PabPrx109 596 0 1..333 1..333
PtaPrx142 567 0 1..333 1..333
PgPrx06 554 0 1..333 1..333
Literature and cross-references PtaPrx93(PTA00029214)
EST ref. GenBank:   CX651501.1 [5' end]
Protein sequence: PtaPrx93(PTA00029214)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (302)
PWM (Da):   %s   36408.24 (32891.3) Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   7.92 (5.76) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVPKKYTRKP LVLAGFIIWV LFGLCVSKGS AQLSENFYAE TCPNVESIVR NAVSQKFEQT FVTVPATLRL FFHDCFVQGC DASVIIQSTP NNIAEKDYSD NLSLAGDGFD TVIKAKQAVE  NVCPNTVSCA DILAMAARDV VALAGGPKFN VELGRRDGLV SLASNVPGNL PEPTFNLNQL NALFTRKGLN QTEMIALSGA HTVGFSHCDR FANRIYNFSS GSSVDPTLNP AYAMQLQQMC 
PRNVDPSIVV NMDPITPNTF DNVYYQNLRS AKGLFTSDEA LFTDRRSRST VNTYAQSAAA FNKAFVNAMT KLGRVDVKTG TEGQIRLDCT RFN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST.
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTCCCAA AGAAATATAC CAGGAAGCCA TTGGTATTGG CTGGATTTAT AATTTGGGTA TTGTTTGGAT TGTGTGTAAG TAAAGGATCA GCTCAGCTTA GTGAGAATTT TTATGCAGAA  ACCTGTCCCA ATGTTGAATC CATTGTAAGG AATGCTGTTT CACAAAAGTT TGAGCAGACG TTTGTCACAG TCCCTGCAAC ACTGAGGCTC TTCTTCCATG ACTGCTTCGT GCAGGTAAGG  GAGACATCTG TATAGATATG TTCAGGTTTT TGCTTTGAAT TTGAAATTGA AATTGAAATT CTTTGTTCTT TCATCTTTTA CCCATTGTTG ATCCCACTAA ATTAGTATTA TTAATATATG  GGCTCATATA TATTGTTGAA CACTGTCAAT TATGATGATG GATGTTTGCA TTGAGGTCAA ATGGTCTGAT TTTGCATTTG GGTTTGCACA GGGATGTGAT GCCTCTGTGA TTATTCAGTC  TACACCAAAC AACATAGCTG AGAAAGATTA TTCAGACAAC TTGTCACTAG CTGGTGATGG ATTTGATACT GTAATAAAGG CCAAGCAAGC TGTAGAAAAT GTGTGCCCCA ACACGGTGTC  TTGCGCTGAT ATCCTAGCCA TGGCTGCCAG AGATGTTGTA GCATTGGTAA GTGATTTGCA TTACAGGGCT AAGTTGCCCA CATTATTTTT GGAGAATTAA TTGCTTTTTA GCATTGGTAA  GTGATTTGCA TCACAGGGTT AAGTGGCCCA ACTCCTCCTT AATGCGAACA TGGGGAATTA ATGGGTTTGC ACTCCATAGT AAGTAGGATG ACTATGGTCA AAATCATAAG CAGATAATCC  ATACAGATGA ACTGGATTTC GATGGAAAGG CACTCATTTT GACATAAAAC TAAAAATTTA AAGGGGATTG ATGAAATGAC TGAAACATAT GTAATAAAGT TAAAAATTAC TATTTTTGTT  TGAAATTTTG ACTTCAGACG AATATAATTA GACCTTTAGA TGAGATATAA ACATCAAAAT TGAAAATCTC GCATTAGATC TAAAGATGAG TGAACCTACC AAAATTCATC AAATATTTCC  TTGCATCTAA ATTTGGAAGG AAAATAATTT TTGGTGTACT GTCACGATGG AAAGTGATAA ATTTCATAAA GCTGTGAGAC CTTCCCAACC AACAAAAAAA AGTGAGGTTA CCCAGATTCT  TTGAGGCATT GACCTGGGGA TTTTACTTCT TGCAAATTTT CCATTATTGC AAATCTGAAT TGTAATCATA GGATTGGGAT TTAGATGACC ATGTTACATT AATTCATCAA CTAATGTTAC  TTGTTATTCT CTTATTTTGC AGGCTGGAGG CCCAAAATTT AATGTGGAGT TAGGGCGACG AGATGGATTG GTATCACTAG CCTCAAATGT CCCAGGAAAT CTGCCGGAGC CTACATTCAA  TCTCAACCAA CTGAACGCTT TATTTACGAG GAAAGGATTG AATCAGACAG AAATGATAGC TCTTTCCGGT AATTTACAGC AATTTTCATT TTTCTATTTG TCTGTAAATT TTAGGGTCAG  ACTGTTAGGG TGGATCTGGT AAATTTGATT TGGTAAATTA TTTATAGTTT TCCTTTCTAG ATTTATGAGA ATTTATTGTT TTTTCCATGG TATTCCTTTC TAATCAAGCT TTATTTAAAG  GTTGAAAAAA TCAAAAGTAA ATTGCCTCGT GGCCACTGAG AACACAGTAA GACACCACCA TCTCTCTCCA TGCTCTGTGA TCCTTACACA GATTCCCAAT AATTTTATGT AGTAATTAAC  TGCAATGACC CAGATTTTTC TTTTAAATTT ACAACCAAAT TAAATATCAA ATTGGTGTAT AAGATTCTTT ATTTTTATAT AAAGAAAATT TAATGTAAAA CAACAATCTA ACTCCACCTT  GCCATTTCAT TATTAAAATT TATAAATTAA AATATACATA CCTATATTAT AGCTATGAAC CTATCATTTT TTAAGAAGGA ATACCATTTC TTAACCATTA AATCCATAAG AATCCTTCTG  CAAATTCCTG CGGCCCTTGT CTGGCCTCGT AATCCCAATT CCCAATTCTC CAGTAAATTA CAGTAAGAAG ATTAATAAAC AAATTCTTCA GTAACTTCAA GTAATAAATT AGGAACATTA  ATAAGTAAAT GGGAAATAAT TTGCAGTTTG AAAAGGTTAG AAAAATACTG AAATGAAATG AATTTCAAAA TTATTTTATT GTTTTTTCAA AACTTCCTTG CTCTTTCATA ATGTTATCAA  AATCTACTCA TATCTCCCTC TTCCATAATG TTATCAAAAT CCACTCGTCT CCCTGAGCTT AAGTCTAAGA CGGTTGGGCT CCATAATCAG TCTAAGTCGG ATGGGCTCCA TAATCTTATC  AAAATCCACT CATATCTTCT TGCGCTTAAA TTGGATTCCC AGAATATTCC GGGATCCAAT AGACATGGGC TAGGCTAATT ATTCTGAGAT CAGGAATTCT AAGAACATGG TCGATGTCAA  TTATTTCAAT ATTGGAAAGA TATGAACAAA AACAAATAAT TGATTTCACT TATGTCCATT GAAGCCCCAA ATATTCTAGG AATCACGTGG AATCCACATG AGGATGCCCC TTATATCTAT  CCTGACACTA ACTTTTGTTT TTGGTCTTTT TACAGGAGCG CATACCGTGG GATTTTCTCA CTGCGACAGA TTCGCAAATA GAATCTACAA TTTCAGTAGT GGGAGTTCCG TGGACCCAAC  TTTGAACCCT GCCTACGCCA TGCAACTCCA ACAAATGTGC CCCAGAAACG TGGATCCGAG CATTGTCGTC AACATGGATC CCATAACTCC CAATACATTC GATAATGTAT ATTACCAGAA  TTTGCGATCC GCGAAGGGGC TCTTCACCTC TGACGAAGCT CTATTCACTG ACAGACGCTC ACGGAGCACA GTGAATACAT ATGCACAAAG TGCAGCTGCG TTTAATAAGG CTTTCGTGAA 
CGCCATGACT AAATTGGGTC GTGTAGATGT TAAGACGGGA ACAGAGGGCC AGATCAGACT AGATTGCACC CGCTTTAATT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTCCCAA AGAAATATAC CAGGAAGCCA TTGGTATTGG CTGGATTTAT AATTTGGGTA TTGTTTGGAT TGTGTGTAAG TAAAGGATCA GCTCAGCTTA GTGAGAATTT TTATGCAGAA  ACCTGTCCCA ATGTTGAATC CATTGTAAGG AATGCTGTTT CACAAAAGTT TGAGCAGACG TTTGTCACAG TCCCTGCAAC ACTGAGGCTC TTCTTCCATG ACTGCTTCGT GCAGGGATGT  GATGCCTCTG TGATTATTCA GTCTACACCA AACAACATAG CTGAGAAAGA TTATTCAGAC AACTTGTCAC TAGCTGGTGA TGGATTTGAT ACTGTAATAA AGGCCAAGCA AGCTGTAGAA  AATGTGTGCC CCAACACGGT GTCTTGCGCT GATATCCTAG CCATGGCTGC CAGAGATGTT GTAGCATTGG CTGGAGGCCC AAAATTTAAT GTGGAGTTAG GGCGACGAGA TGGATTGGTA  TCACTAGCCT CAAATGTCCC AGGAAATCTG CCGGAGCCTA CATTCAATCT CAACCAACTG AACGCTTTAT TTACGAGGAA AGGATTGAAT CAGACAGAAA TGATAGCTCT TTCCGGAGCG  CATACCGTGG GATTTTCTCA CTGCGACAGA TTCGCAAATA GAATCTACAA TTTCAGTAGT GGGAGTTCCG TGGACCCAAC TTTGAACCCT GCCTACGCCA TGCAACTCCA ACAAATGTGC  CCCAGAAACG TGGATCCGAG CATTGTCGTC AACATGGATC CCATAACTCC CAATACATTC GATAATGTAT ATTACCAGAA TTTGCGATCC GCGAAGGGGC TCTTCACCTC TGACGAAGCT  CTATTCACTG ACAGACGCTC ACGGAGCACA GTGAATACAT ATGCACAAAG TGCAGCTGCG TTTAATAAGG CTTTCGTGAA CGCCATGACT AAATTGGGTC GTGTAGATGT TAAGACGGGA 
ACAGAGGGCC AGATCAGACT AGATTGCACC CGCTTTAATT GA 

Retrieve as FASTA