Entry information : TsRboh05 (Thhalv10006725)
Entry ID 17744
Creation 2022-12-10 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-12-10 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: TsRboh05 (Thhalv10006725)
Name (synonym) TsRboh05 (Thhalv10006725)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Eutrema
Organism Thellungiella salsuginea (Eutrema salsugineum)    [TaxId: 72664 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value TsRboh05
start..stop
S start..stop
NoffRboh05-1B 1739 0 1..951 1..950
NoffRboh05-1A 1720 0 1..951 1..947
AtRboh05 1706 0 16..951 16..952
AlyRboh05 1628 0 16..951 16..925
Literature and cross-references TsRboh05 (Thhalv10006725)
Protein sequence: TsRboh05 (Thhalv10006725)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   951
PWM (Da):   %s   107417.7 Transmb domain:   %s   o389-411i470-492o525-547i573-595o
PI (pH):   %s   8.56
Sequence
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Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKLSPLSFSS RSSFSHADGI DDGVELRPSP VAGGAMLPVF LNDLSRNEDS GSGSSWDREL VEVTLELDGD DSIVVCEMSE AAAEAAASVD SRPRSVDVAG RLTRSLSTAS SRIRQKLGRL  LRSDSTRTTT SSIAGERDVE RQAAETPIMT ARDKRKENAK LQRSTSSAQR ALKGLQFINK TTKGNSCDCD WDCDCDQMWK KVEKRFESLS NEGLLAREDF GECVGMKDSK EFAVSVFDAL  ARRRRQKLEK VTKDELHDFW LQISDQSFDA RLQIFFDMAD SNEDGKITRE EIKELLMLSA SANKLAKLKE QAEEYASLIM EELDPENFGY IELWQLETLL LQRDAYMNYS RPLSTTSVGM  STPRRNLTKP RHVVRKCRQT LQCLVLDNWQ RSWVLLLWFI LMAILFVWKF LQYRDKAAFK VMGYCVTTAK GAAETLKLNM ALVLLPVCRN TLTWLRSTRA RAFVPFDDNI NFHKIIACAI  VIGILVHAGT HLACDFPRII NSSPEEFALI ASSFNGTKPT FKDLMTGAEG ITGISMVILT TIAFTLASTH FRRNRVKLPA PLDRLTGFNA FWYTHHLLVV VYIMLIVHGT FLFFADKWYQ  KTTWMYISVP LVLYVAERSL RACRSKYYSV KILKVSMLPG EVLSLIMSKP PGFKYKSGQY IFLQCPTISR FEWHPFSITS APGDDQLSVH IRTLGDWTEE LQRVLTMGKD LSTCVIGRSK  FSAYCNSDPS ERPKLLVDGP YGAPAQDYRS YDVLLLIGLG IGATPFISIL KDLLNNSREE HTDNEFSRSD FSWNSFTSSY TTTTPTSTQG GKKKAVKAHF YWVTREPGSV EWFRGVMEEI 
SDMDCRGQIE LHNYLTSVYD EGDARSTLIK MVQALNHAKN GVDILSGTRV RTHFARPNWK EVFSSIARKH PNSTVGVFYC GIPTVAKELK KQAQEMSQKT TTRFEFHKEN F 

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Remarks Incorrect prediction from Phytozome (splicing error)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTAT CGCCTCTGAG TTTCTCATCG CGATCGAGTT TCAGTCACGC CGATGGAATC GACGACGGCG TGGAGTTAAG ACCATCTCCA GTCGCCGGCG GCGCAATGCT GCCGGTTTTT  CTCAACGATT TGAGTCGTAA TGAAGACTCC GGAAGCGGAA GCAGCTGGGA TAGAGAGCTC GTGGAGGTGA CTCTGGAGCT CGACGGCGAC GACTCCATTG TCGTCTGCGA AATGTCAGAA  GCGGCGGCGG AGGCGGCGGC GTCTGTTGAT TCTCGGCCGA GATCGGTGGA CGTGGCGGGA AGATTAACGA GGAGTCTATC GACGGCGTCT TCGAGGATCC GGCAGAAACT GGGGAGGCTA  TTGAGGTCGG ATTCGACGAG AACGACGACT TCTTCAATCG CCGGCGAGAG AGATGTCGAG CGACAGGCGG CGGAGACGCC GATTATGACG GCGAGGGATA AACGGAAGGA GAACGCGAAA  TTGCAGCGAT CGACGTCGAG CGCACAGAGA GCGCTAAAGG GGTTACAGTT CATTAACAAG ACCACGAAGG GAAACAGCTG CGATTGCGAT TGGGATTGCG ATTGCGATCA GATGTGGAAG  AAAGTCGAGA AGAGATTCGA ATCGCTCTCT AATGAAGGAT TGCTCGCGCG AGAGGATTTT GGAGAGTGCG TTGGTAAGTA ATAGATAAAC CCAAGTTAAA TAAATATCTA TGTAACTTTT  GATTCTCATT AAAAAAAAAA AAAATGTGTG GAAAATTAGG GATGAAGGAT TCGAAGGAAT TCGCGGTGAG TGTATTCGAC GCGTTGGCAA GAAGAAGAAG GCAGAAACTG GAGAAGGTGA  CGAAAGATGA GCTTCACGAT TTCTGGTTAC AGATTTCTGA TCAAAGCTTC GACGCGCGTC TTCAAATTTT CTTCGATATG TACGTTTCCT CTCTTTCTCT TTTCTTCTTT GGTTTGTCTT  TACGTTTATA ACTGTTACGG GAATAACGCA TTTCAATTTG CAAAAGCATT AGAAAACAAA TGTGTTCATC CAAATTGCCA CGACTAAATT ATTAGTTGAC GACAATAATG ATTTTGTAGT  TTGCTTATCT ATCTTTTAGT ATTACGATTT CTGAATAATG CAGATGGAAC TCTGATCAAC TTGCGTTTTT TTCTATTGTC TGTTTGTGGT ACTTCATGAA GTTTAGGTGA TTATATCACA  TACTGAGTAA TTTTTGTTAA TTATAGAAAA CAAATTAGCT CACCAGTCAC TCGTTGATTG GAAATTGTTA TCTCCCTTTA CTGAGACTAC CGCAACTTGA GAGTTAACTT TTCTACAATT  TTGGGAATTA TTAAAATGTG TTAGTCATGT TGAAATGAAT TTATGAGGCA AATGCAACCG AATTGTTTTT ACTTTTGTTT AGATACATCA TCTAAATCAT GTGGTGTTCA TAGCCGTTGG  ATCTGGTAGT TCAAAAAAAC TACCTAGTGA GTTTGATTAT TGGGCCGCGG TTTACTTGGC CCAGTAAAAT AAAACTTGAC CAAATTTTCA AAAAAGTTTC CTCTTTTCTG CTTTCTTCCC  GCAATTAGTT TCTTGCAAGT CAGATAAAGA GGCCATGACT CTTAAATCCA CCAAATGATT TTGCGAAATT TTTTTTTTAA AAACCAAACA CTTATTATCT ATGTTCGCTT CATTCCATTA  TTCTGTCATT TTTACGACAA TAATAATTAA AATTTTGTTA GTTAATGATT CTATTATTGT GTTAATTTTG AAGGTTTTGA TTTTAAAAAA AGATTCTAAC TGATACATGT TTTGTTACAG  GGCTGATAGC AACGAAGACG GGAAGATTAC TAGAGAAGAA ATCAAAGAAG TATTTTTTTC TTCTTCTTGA CATTACGTAC AAATTACGTT TAAAACTATC AAACGATCCT AAGTAACGTT  TTACATCTAT TGAAACGCAG CTTTTAATGT TAAGCGCATC AGCAAACAAG TTAGCAAAAC TCAAGGAACA AGCAGAAGAG TACGCATCTC TGATCATGGA AGAACTTGAT CCAGAGAATT  TTGGATACAT TGAGGTTACA CAAGAAACAA AAAAGAAACA TATTAATATA TTCCTATTCT TCAAACACAT TGCCAACGAT TTTCTAATTT ATAAAAAAAA CTTTTGTGTT GTTTCAGTTA  TGGCAACTCG AGACACTCTT ACTTCAGAGA GACGCATACA TGAATTACAG TAGACCGCTT AGCACAACAA GCGTTGGAAT GAGCACACCA AGACGGAATC TAACTAAACC TCGTCATGTG  GTTCGAAAAT GTAGACAAAC ACTTCAGTGT CTGGTTTTAG ATAACTGGCA AAGAAGCTGG GTTCTGTTAC TGTGGTTCAT TCTTATGGCT ATTCTCTTCG TGTGGAAGTT CTTACAGTAC  AGAGACAAAG CTGCTTTCAA GGTCATGGGT TATTGTGTAA CCACTGCCAA AGGAGCTGCA GAGACTCTCA AGCTCAATAT GGCTCTGGTT CTGTTACCTG TGTGTAGAAA CACATTGACC  TGGCTGAGAT CTACACGTGC TCGAGCTTTT GTTCCTTTTG ATGATAACAT CAATTTCCAT AAGGTAAAAC ACAATAAAAC CTTCCATCAC TCTTTCTATT TTTCATTCTT CATAGGTCAA  AAACTTGAGA TCAAGAATCT TTGCCTCTCT GTTGTCCCCG GTGTGTTTGC AGATTATTGC TTGTGCCATA GTGATTGGGA TACTTGTTCA TGCTGGCACT CATTTGGCGT GTGATTTTCC  CCGAATCATA AACTCGAGTC CAGAAGAATT CGCCTTGATC GCTTCTTCCT TTAATGGTAC TAAGCCTACT TTCAAAGACT TGATGACTGG TGCGGAAGGG ATCACCGGAA TCTCGATGGT  GATCTTGACA ACCATCGCGT TCACATTAGC ATCAACACAT TTCAGGAGAA ACCGTGTGAA GCTACCGGCA CCACTTGATC GGTTGACTGG CTTTAACGCA TTCTGGTACA CTCATCACCT  TCTAGTGGTT GTCTACATTA TGCTCATTGT GCACGGGACC TTCCTCTTCT TCGCTGACAA GTGGTATCAG AAAACTGTAA GCCGAACCTA ATCTTACTTT GGTTTTAAAC CGTAACTTCA  AAATGTCTTC AAACCTAAAT TGTATTGCTT CTTGAACCTC TCAGACTTGG ATGTACATCT CGGTTCCTCT GGTGCTCTAT GTGGCAGAAC GAAGTCTACG AGCTTGTAGG TCCAAGTATT  ACTCTGTCAA AATCCTCAAG GCAACCACCG TTCACTGAGC AAATTACTTC CTGCTAAAAA GTGTTTGAAT AACATATAAT TCCAACCTCG ATCTCTGCAG GTTTCCATGC TACCTGGGGA  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CAAGAAATGA GTCAAAAAAC AACCACACGG TTCGAGTTCC ATAAAGAGAA TTTCTAA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTAT CGCCTCTGAG TTTCTCATCG CGATCGAGTT TCAGTCACGC CGATGGAATC GACGACGGCG TGGAGTTAAG ACCATCTCCA GTCGCCGGCG GCGCAATGCT GCCGGTTTTT  CTCAACGATT TGAGTCGTAA TGAAGACTCC GGAAGCGGAA GCAGCTGGGA TAGAGAGCTC GTGGAGGTGA CTCTGGAGCT CGACGGCGAC GACTCCATTG TCGTCTGCGA AATGTCAGAA  GCGGCGGCGG AGGCGGCGGC GTCTGTTGAT TCTCGGCCGA GATCGGTGGA CGTGGCGGGA AGATTAACGA GGAGTCTATC GACGGCGTCT TCGAGGATCC GGCAGAAACT GGGGAGGCTA  TTGAGGTCGG ATTCGACGAG AACGACGACT TCTTCAATCG CCGGCGAGAG AGATGTCGAG CGACAGGCGG CGGAGACGCC GATTATGACG GCGAGGGATA AACGGAAGGA GAACGCGAAA  TTGCAGCGAT CGACGTCGAG CGCACAGAGA GCGCTAAAGG GGTTACAGTT CATTAACAAG ACCACGAAGG GAAACAGCTG CGATTGCGAT TGGGATTGCG ATTGCGATCA GATGTGGAAG  AAAGTCGAGA AGAGATTCGA ATCGCTCTCT AATGAAGGAT TGCTCGCGCG AGAGGATTTT GGAGAGTGCG TTGGGATGAA GGATTCGAAG GAATTCGCGG TGAGTGTATT CGACGCGTTG  GCAAGAAGAA GAAGGCAGAA ACTGGAGAAG GTGACGAAAG ATGAGCTTCA CGATTTCTGG TTACAGATTT CTGATCAAAG CTTCGACGCG CGTCTTCAAA TTTTCTTCGA TATGGCTGAT  AGCAACGAAG ACGGGAAGAT TACTAGAGAA GAAATCAAAG AACTTTTAAT GTTAAGCGCA TCAGCAAACA AGTTAGCAAA ACTCAAGGAA CAAGCAGAAG AGTACGCATC TCTGATCATG  GAAGAACTTG ATCCAGAGAA TTTTGGATAC ATTGAGTTAT GGCAACTCGA GACACTCTTA CTTCAGAGAG ACGCATACAT GAATTACAGT AGACCGCTTA GCACAACAAG CGTTGGAATG  AGCACACCAA GACGGAATCT AACTAAACCT CGTCATGTGG TTCGAAAATG TAGACAAACA CTTCAGTGTC TGGTTTTAGA TAACTGGCAA AGAAGCTGGG TTCTGTTACT GTGGTTCATT  CTTATGGCTA TTCTCTTCGT GTGGAAGTTC TTACAGTACA GAGACAAAGC TGCTTTCAAG GTCATGGGTT ATTGTGTAAC CACTGCCAAA GGAGCTGCAG AGACTCTCAA GCTCAATATG  GCTCTGGTTC TGTTACCTGT GTGTAGAAAC ACATTGACCT GGCTGAGATC TACACGTGCT CGAGCTTTTG TTCCTTTTGA TGATAACATC AATTTCCATA AGATTATTGC TTGTGCCATA  GTGATTGGGA TACTTGTTCA TGCTGGCACT CATTTGGCGT GTGATTTTCC CCGAATCATA AACTCGAGTC CAGAAGAATT CGCCTTGATC GCTTCTTCCT TTAATGGTAC TAAGCCTACT  TTCAAAGACT TGATGACTGG TGCGGAAGGG ATCACCGGAA TCTCGATGGT GATCTTGACA ACCATCGCGT TCACATTAGC ATCAACACAT TTCAGGAGAA ACCGTGTGAA GCTACCGGCA  CCACTTGATC GGTTGACTGG CTTTAACGCA TTCTGGTACA CTCATCACCT TCTAGTGGTT GTCTACATTA TGCTCATTGT GCACGGGACC TTCCTCTTCT TCGCTGACAA GTGGTATCAG  AAAACTACTT GGATGTACAT CTCGGTTCCT CTGGTGCTCT ATGTGGCAGA ACGAAGTCTA CGAGCTTGTA GGTCCAAGTA TTACTCTGTC AAAATCCTCA AGGTTTCCAT GCTACCTGGG  GAAGTACTCA GCTTAATCAT GTCAAAGCCT CCAGGATTTA AGTACAAAAG CGGTCAATAC ATATTCTTGC AGTGTCCAAC AATCTCTCGA TTTGAATGGC ACCCATTTTC TATTACCTCT  GCGCCAGGAG ATGACCAACT TAGCGTTCAC ATCCGAACAC TCGGAGACTG GACAGAGGAG CTACAACGAG TTCTAACAAT GGGCAAAGAT CTTTCAACAT GCGTGATTGG GCGATCAAAA  TTCTCTGCCT ATTGCAATAG TGATCCATCA GAACGACCGA AATTACTAGT AGACGGTCCA TATGGAGCTC CAGCACAGGA CTACAGAAGT TATGATGTCT TACTCCTCAT TGGATTGGGA  ATAGGAGCTA CTCCTTTCAT AAGCATCCTG AAGGATCTCC TGAACAATTC AAGAGAAGAA CATACAGACA ATGAGTTCAG CAGATCAGAT TTCAGCTGGA ATAGCTTCAC ATCTTCATAT  ACCACAACAA CTCCAACTTC AACACAAGGA GGGAAAAAGA AAGCAGTGAA GGCTCACTTC TACTGGGTCA CAAGGGAGCC AGGATCCGTC GAATGGTTTA GAGGAGTAAT GGAGGAAATA  TCAGACATGG ACTGCAGAGG CCAGATTGAG TTGCACAACT ACCTTACGAG CGTATATGAC GAAGGCGATG CAAGATCAAC CCTGATAAAA ATGGTCCAGG CTTTGAACCA TGCCAAAAAT  GGAGTTGATA TTCTATCCGG AACACGGGTG AGAACACATT TTGCAAGGCC CAACTGGAAG GAAGTATTCA GTAGCATAGC AAGAAAGCAT CCAAATTCAA CAGTCGGAGT GTTTTACTGC 
GGCATACCAA CCGTGGCAAA GGAGTTGAAG AAGCAAGCAC AAGAAATGAG TCAAAAAACA ACCACACGGT TCGAGTTCCA TAAAGAGAAT TTCTAA 

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