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Entry information : NoffPrx[P]29-1A (Nasoff72g0078530.t1)
Entry ID 18396
Creation 2023-03-22 (Bruno Savelli)
Last sequence changes 2023-03-27 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-11-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffPrx[P]29-1A (Nasoff72g0078530.t1)
Name (synonym) NoffPrx[P]29-1A (Nasoff72g0078530.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx037]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffPrx[P]29-1A
start..stop		 S start..stop
NoffPrx29-1B 620 0 1..333 1..339
AlyPrx29 587 0 1..331 1..337
AhalPrx23 585 0 1..332 1..338
BstrPrx17 584 0 1..332 1..338
Literature and cross-references NoffPrx[P]29-1A (Nasoff72g0078530.t1)
Protein sequence: NoffPrx[P]29-1A (Nasoff72g0078530.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   332 (310)
PWM (Da):   %s   36046.83 (33767.7) Transmb domain:   %s   o256-278i
PI (pH):   %s   4.63 (4.51) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-332
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKPNSKAAVA SCFLLMSLLC NGDQMETNYE SLSYSYYEKT CPRVEEIVRS SLSSIFVLDH TFPAALLRLM FHDCQVQDCD ASILLDPSGD QQFTELDSVK NFGIRKRDLI GAIKSSLEME  CPQQVSCADV IILAAREAVA LSGGPLIAVP LGRKDSLSTP SKHVADSELP PSTADVEATL SLFAGKGMTV EESVAIMGAH T*GVTHCNNV LSRLDNANAT NENMDPRFET FLRVVCPEFS 
PSSLTAKVTF VPNDQTPVVF DTAYYDDSMV GRGTLRIDSE IGADPRTRPF VEAFAADNNR FFNAFSSAFV KLSSYKVLTG NEGVIRIVCD KVA 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene. Prediction exons 1 and 2 from Braker. OVAZ01000072.1 146328..148303
Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTGAGATGA AGTTTGCAAA CACTAGATGA GGCAATATAT ATTTTGGGCT TCCAGAGAAG CCATCGTGGT ATCTCAGCAT TTCACCTTGT AATAAACAAT TTTTTTTTTG TGTAATTGGA  TTAGTAATGG AAATTTTAAG ATTACAACAA AAACAAAAGA TAAAAAAAAT AGTAGTCTTT TGCGACATAT GTAACAAATT ATGAGTCCAT TATATGACTT AGTCAGTTGA TGTAATCATA  TAAACTACGC AAAAAAGGGG GCTTGGCATT GTAGTTGATA AGATGAATTT AAAAAAAAAA AAACTTTATT TGGTCTACGA ATCTCCCCAG CAGTAATAAA GTAATTTGCA GATGAATGAA  TATTAGGAAA CTTCATGGCA AAATTTATGG AAAAAAACTT GTCATAAAAA TATACATTTT TCATTTGTTA GCATATTTAT AATGTATTGG TTAATCGCTA ATGCGTTAAA TATGTTCGAT  TAATCAATTA AAATGTAATT TATAAAAAAA AAGACAATGA CATATTAGTT TTAAAAAAAT AAACATACAA AATGTGTATG GTTGACATCC TATGAAACTA GTATTTGTCG TTTTCAAAGT  ATCAATGCTA TTAAATGTTC CAAATATTTA TTTAATAAAT ACTCCTACGA CAAGAGTGGG GGCTGTATAA TTCATTTATA GAAAATTAAG TAATTAAAGA TAAATCTAGT CCATAACAAA  TCCAGAAACC TGAAACTTGA TGAGGAATGG GAACAGAGAG GAAGAAAGCC TACAACTTTG ATGCTACTTG TGAAAATTTA CTGTTACGCT TTACTCTTAG TTGACAATAA ATTAAATTAA  CGTAAACAAA ATAAATTTGG TAGAATTAAC GTAATTTCTT TGCCCAGATG AACAGTTAGG GCCATTAATT TCACAAAAGT TGTATTAATT AGTCCTGCCA ATACTACTCG TCCTTTTCTA  CTAACCCTAC ATTGGGCTAT TTTCATGATT TTATTCTAAT TCATTTATAT CTTGTAGATA AAGCTTATCT TACTTTTATA CCGAAATAAA TTCCATGTAC GATCGAAAAT ATTTTATCAC  GTTTTAGGTC ATTGATATTT TGATGATAAA AATATAACTA GCTAGTTCAC TAATTTATTT ATTTATTTTC TGCTTCTTTT AATCTAACCA AGACAGTATT TGTCTGTTGC TGGAACATCT  AATCAAAACA TTATTAGCTT ATGATCATCA AAATGCTAAA AAAAACTTGA ATGCTATCTT AAAAAGTATT GTAAATATGT TTAAAAGATA AGCTAAGGAT TTCTCTACGC AGTATATACA  TATATATGAT AAACGAATAC GTGAAATCAA CCTAATTGCT CACATTAGTC ATGTTGCTTT GCCCATTCTT TGTCTTGTCT TCTACCTATA ACCATTTATT GGACCATCCC GGTCCACCGG  TTCGCTACTT TCCTGTAAAG CAAATGCGCA ATTTCAATCC CCAGCTCATG CAGCTATTAC TCAAAAACAA ACAAAATGAA TAGAAAGAAG AGTTGGCTAT CACTCGAAAA AATATTATTT  TTCCAGCTGC ACCATGTTAA TAATGTAAGC TTCGGTCGTT AAACTGTTAA CCAGACTCAA CCGGAAGTAT AATTGCCTTT ATACTAATAT TTATTTTCCG TACGTCGGTA TATATCGAGA  CAAATATCAA CGGTATAATT TGAGTCATAA AAACTAAAAA CCCAACATCT CCATCTTCAA TCCGGTTTTG TACAATGAAA TCGATATGAT AACCAAACTC AACCAAAAAA TCGATAAAAC  GATTGGTTAA AACCAGTTTC TTTTTTTTTT TAATTATTTT CAGTTGGGAT TAATAATTGT CACGGGCCAT ATCTTTAGAT TCCTATTTAT ACATACACTC CCAGGTGCAA ATATACAAGT 
CATATCGTTT CTTTGATTAC CGTTTACCGA TACTAATTAC CTCATATTTT AAACAGAAAA TAAAAATAAA ATATAGAGTG 

Retrieve as FASTA