Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
250 |
PWM (Da): |
27323.84 |
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PI (pH): |
5.91 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MGKCYPTVSEEYQKAVEKCKKKLRGLIAEKNCAPLMLRLAWHSAGTFDVKSKTGGPFGTMKQPAELGHAANNGLDIAVRLLEPIKEQFPTLSYADFYLAGVVAVEITGGPEIPFHPGRED KPEPPPEGRLPDATKGSDHLRQVFSVQMGLSDKDIVALSGGHTGRCHKERSGFEGAWTFNPLIFDNTYFKELLSGEKEGLLQLPSDKALLSDPAFRPLVEKYADEDAFFADYTDAHLKLS ELGFADA |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
complete from genomic |
Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
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Terminator +►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2 |
GAGTGACGAG CTGTTGGCGG CAAGACATAT TGTCATCTGC TTTTTATCAT GTTTATTAGA ACTAGTTAAG GCAATTACTT GCAATGAAGT TGGCTGGCTT TTGACTTCAA TTTCCCTAGT
TTTGTTTTCA GAAATTTCTG TGTAGCTCAT CATCCACATC CTTTGCACTT AATTTCCTCT TATTTTGGTG GTTGTTCCAG AGAAACGAAA CATCGAGTAG TATCTACTTC ATGGTTTTCT
TTAATATTTT GAATTACTAG TTGACCCTCT AAATGAATGG ATTTGTTACG AAAATGTTGG GTACGCATTA CACATATAGT CACGCGAAGG GGTTGATCAT GGTATGGTTT GGTTAAGTTT
AGGGAATATC TCAGTTTAAT GGATGATGCT AATGAATAGT TTGTTCATTA GCTTTGTGCT AACGAATAGT GTGTTCCGTT CCTCGACGAA TAAGGGCCTA TGTGGTGTTG ATGCTTTTTT
ACTTAGATGT CTTGTCTCGC ACTTGAGCGA CTCCCAAGTT CCAACAATGT TTGCAAAGAA TATTGGAGTT TTCTGGCATC ATAGATTTTT CGTGGCGATC TTGTTTGGGA CTTGTATGAA
TACCACAGAT GCATGGTTCA AACTCATCCT CCTTTTTTTA CAGCTCAAGT GGGTGATTCA TCGTGTGGTA ATTGAAGTAG ATATGCTTGA GATTGGTTTC GGTATCGGCC CTTGAATGTT
TTGTCATTTT AGTACGTGAC CGTAGAGAAA TGTTTGCTGA AAATATGGAA AAGAGATCGA AACTCGAAAG CCAAAATCTG CCCTTTAGCT GAAAAGGTGT TTTCCTTTTT TTCTAATTGC
TCTCTAAAGC CAGATGAAAT CAAAAGCTAC AGTCCTCCCA AATTTTGCAC ATCATAGCAT TCATGTGCAG ATGTTTCCAA ATACACTGAA GCAAGGTTCA AAATATCTAT ATGTGGCATT
TCGGGCGAAT TAATACTCCT TTTGGTGGTT TTTATTTTTA TTTTTATTTT TTGTCAACTG GTTCAGAGGA GCCGGTTTAG GTATTCGTCA CACCCTGAAC CAGTCAGGTG GGGTGTCGGA
ACAATATGTA TCGGCCGTAT GTGTGGATAA TTTGAACCTG CTGCTCATGT GCACATTACA GCATGCATTG GCATTTAGCA ATATTTTTCG CATTTGTAAT TGGGAGATGT TTACAATAAT
ACACCCAAGT GAATTCCCAA ATGGCACTTA GGCTGTGTTT GGTTGCAGTA TAAATTTATT TGCATTGATG CAAAACTAAG ACCTAAGGCA GAATAAAATC ATATGTAACC AACCAATCAT
GACTGGGGAC TGGCGTGTTC AGTATACATG GAATCCATGC TTTGTATACA AAACACTTAT TTATTCACTT GTAATTGCTT ATATAGTTTT TGTATACAAA ACACTTATTT ATTCACTTGT
AATTGCTTAT ATAGCCTTTT ATATAGCAGC AGATATGGGT TCCCAAAACC AATCCATGGT TTAAAGGCTA AGGCTGTGTT TGATTGCAAT GCAAATAAAT TTGCATTGAT GCAAAATTAT
GACATCACAC CCAATGGCAC AGTTGCCATT AGTCGAACAG AAAGCATCAA AGTTGATTTT GATGCAATCA GTTTTGGGCT TAAACCACTT AACAAGATTT AGACTTTAAC TGTTAGTGTT
ACCCACGCAA AAAGAAACTT CTTTAATTTC ATTCCAGTAA GCAAAAGCTC TACTAATGAT ATTCTCTGCA TTACTGAAAC CTTCATTAAA ACATTTATTT TTCTATTCCT CCAAATGAAC
CAAGAAACAC AAGCAAATTT TTCTCTCAAG AAATTATCCC TGGAATAACC ATTTTGCTTG TTAAGTAAAG ACCACCACTG CCTGACCAAC GGGAAAGAGT TCCCGAGAAT TGGAAAGTCC
TCATCTAATC CACTCCAGAT TTGTTTAGAG TTTTCACATC TAATAAATAG GTGATGGAAG TCCTCTACCT CCCCACAAAA
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Retrieve as FASTA
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DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGAAAGTGCTACCCAACCGTGAGTGAGGAATACCAGAAGGCAGTCGAGAAATGCAAGAAGAAACTCAGGGGATTAATCGCTGAGAAGAACTGCGCCCCTTTGATGCTCCGATTGGCG CGTAAGCCATTCTCATTTTTTATTTATATTTTTTACGCCTTTTCGTCTTCCATTATCTGATCATGGACTGATTGTGTTGCTATTCTGTTACAGATGGCACTCAGCCGGAACCTTCGATGT CAAATCTAAGACAGGAGGTCCATTCGGAACCATGAAGCAACCAGCGGAGCTTGGTCACGCGGCCAACAACGGCCTTGATATCGCCGTTAGGCTCTTGGAGCCCATCAAGGAACAGTTCCC AACCTTGTCGTATGCTGACTTCTATCAGAGGTGTGTTCTTTTATTCTTTCATTTCTTTATGCGTTATTCAAAACGTAGGTTCTATTTTTTTTCGTTTTATACTTTATTTATGTATTTTTG AATCAGTTGATATTTCGTGTTTTTTAATTGCAGTTGGCCGGTGTTGTTGCTGTTGAAATTACCGGAGGACCTGAAATTCCGTTCCACCCTGGAAGAGAGAGGTGAGTGAAGCTCCGTCTC GCGCTCTCAAGTCACTGGCATTTTTGTGTTGCAGTGGCTTATGGCTGATTTCTGTCTGCTAAATATTTCATGGTTATTTATTGTGTACTTTTGGGGACAAGTTCAGCCCAGCCTGCCTTG AGTTGAAATATGCGTGTTTCAGAAATCATCAGTGTAGGAAATAGCAACACCATTTTTTTAATTTTGTCTCTATCCAAAAAAATAGAGTGAATAAATTTGCACCTACTCCTCAAAATGGGG ACCACATCAATTTGCTCTCTCCCCAAACAAATAACCCTCTCCCTGCGGCATTTTTTATTCATATTAATTGGGAACTACATCATTTACTCCTTAGTGGGTGTTCTTTTTTTGGATTTTGAG AGATTTGTGGGGGGGTTGGTCAATGTGATTTTGGTTCCCATCAAAACCTATGTTCTTTTTTGAGATTTTTGTGAGGATCAGGGAAAGTTTATTTTCTTGGCTGTCGCTTGGGTAGGTGAT ACCCATCTCCCCACATAGGAAAAGTCACATGGGACAAAAGTGCCCCTTTTAATAATGGATTTTTATGGCTAAAAAGGTCATTGCCTTTAAAAGAATTACCCAGTTATATACCCATCTCCT AGTGGGTAAATAACTTTCCTACATGGGAAAAGTCACATGGGACAATAGTGCCCCTTTTAATAATGGATTTATATGGCTAAAAAGGTCATTGCCTTTAAAAGAATTACCCAGTTAATGCAT TTTTTATATGTATTTTCATTATACATATTTGTATTTTAGGCTCAGTTTGAAAAGAGTAGAAATACAAAAATGTACAATGCAAATACATACAAAAATAATATAAAATACAAGGTTTTGTAC TCCTTCCAAACTAAGCCTTAATTCCTTCCAAGGCTCTGATTGAGGAGTGTGCAAATACAAATATTCACGGTTTATCAATTTTTTACCAACACAAAATCCAAGACTGGAATTTCAATGTAA TCTCAACTCTCAATTTTAAAACGAATAAATCACTATGCTGGTATTGTTACTGTATCCACTATCTACGATTGATTTTTTTTTCCATGGGTACTATGTAGTATAGCCTTAAAATTTTGGTTT GATTATGATGAAAAATATTTTGTTTATCACAGGACAAACCTGAGCCACCACCAGAAGGACGTCTGCCTGATGCTACTAAGGGGGTTAGTTTGTTTTACTACTTGCATTTAGAGGGTGCAG TTAAAAGGGTGGGGTGGGTATGGGGTTTAAAGGTGGGCTCTCGGATGGAATTTAAGGTATTTTGTGTTTTACCTTCAGGTTCGGACCATCTGAGGCAAGTTTTTAGTGTACAAATGGGAC TCAGTGACAAGGATATTGTTGCTCTCTCTGGCGGCCACACCCTGTGGTTTGTTTACAAATCTGACATTTTCTTCCATTTGTATTAGTCTATTTAGCACAGCTTTAACGCTGAGAGTTGAT GTTTATAATTATACGTCTTGGATGGACAATTGTTCAACAGGGAAGGTGCCACAAGGAGCGTTCTGGGTTTGAAGGAGCTTGGACTTTTAACCCTCTTATCTTTGATAACACCTACTTCAA AAGTAAGCTGCTACTAGCTAAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGAGAGGTATGTGATTTAGCATCGAACGGGTTGTCGGTATTCTTAGTGTGTAAGCATTTTATTAACAGGGAGCT CCTCAGTGGTGAGAAGGAAGGACTTCTCCAGCTGCCATCCGACAAGGCCCTTCTGAGTGATCCTGCCTTCCGTCCTTTAGTAGAGAAATATGCTGCGCGGTTTGTATTCAATCACCATTT GTATTTTATCCCTTGATGTCAATTATGATGATCTTCTGTTCCTAATGGGGTTGGTTGACTCTGTTTCAGGATGAGGATGCTTTCTTCGCTGATTATACAGATGCTCATCTGAAACTCTCT GAGCTTGGGGGTGAGTGGTGGATATGTGGATTTTGTTTCGTTTTTTTTTCTCTATCTTTTATTTAAAAGGAATTTGGTTCGTATTTTCTATTTTTTTTTTTTTAACTTAATATCTCACCA TTTGAGTTGATGTTGCTTGTCTATATTATTGGTGACATAACCTTGCTTTTGTTTTCAGGTTTGCTGATGCGTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGAAAGTGCTACCCAACCGTGAGTGAGGAATACCAGAAGGCAGTCGAGAAATGCAAGAAGAAACTCAGGGGATTAATCGCTGAGAAGAACTGCGCCCCTTTGATGCTCCGATTGGCA TGGCACTCAGCCGGAACCTTCGATGTCAAATCTAAGACAGGAGGTCCATTCGGAACCATGAAGCAACCAGCGGAGCTTGGTCACGCGGCCAACAACGGCCTTGATATCGCCGTTAGGCTC TTGGAGCCCATCAAGGAACAGTTCCCAACCTTGTCGTATGCTGACTTCTATCAGTTGGCCGGTGTTGTTGCTGTTGAAATTACCGGAGGACCTGAAATTCCGTTCCACCCTGGAAGAGAG GACAAACCTGAGCCACCACCAGAAGGACGTCTGCCTGATGCTACTAAGGGTTCGGACCATCTGAGGCAAGTTTTTAGTGTACAAATGGGACTCAGTGACAAGGATATTGTTGCTCTCTCT GGCGGCCACACCCTGGGAAGGTGCCACAAGGAGCGTTCTGGGTTTGAAGGAGCTTGGACTTTTAACCCTCTTATCTTTGATAACACCTACTTCAAGGAGCTCCTCAGTGGTGAGAAGGAA GGACTTCTCCAGCTGCCATCCGACAAGGCCCTTCTGAGTGATCCTGCCTTCCGTCCTTTAGTAGAGAAATATGCTGCGGATGAGGATGCTTTCTTCGCTGATTATACAGATGCTCATCTG AAACTCTCTGAGCTTGGGTTTGCTGATGCGTAA |
Retrieve as FASTA
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