Entry information : NnRboh05 (Nelnuc025006g0595180)
Entry ID 18757
Creation 2023-05-22 (Sebastien Cabanac)
Last sequence changes 2023-05-22 (Sebastien Cabanac)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: NnRboh05 (Nelnuc025006g0595180)
Name (synonym) NnRboh05 (Nelnuc025006g0595180)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Nelumbonaceae Nelumbo
Organism Nelumbo nucifera (sacred lotus)    [TaxId: 4432 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NnRboh05
start..stop
S start..stop
CclRboh01 1625 0 1..945 1..946
CsRboh01 1621 0 1..945 1..946
CcaRboh05 1618 0 1..945 1..945
CcaRboh01 1618 0 1..945 1..945
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '18757' 'join(25018513..25019164,25019284..25019443,25019551..25019599,25020259..25020372,25021180..25021602,25027361..25027744,25027901..25027996,25028921..25029036,25029788..25029955,25030046..25030205,25030929..25031126,25031226..25031354,25032020..25032098,25032241..25032350)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 25018513..25019164 650 N° 2 25019284..25019443 158 N° 3 25019551..25019599 47 N° 4 25020259..25020372 112
N° 5 25021180..25021602 421 N° 6 25027361..25027744 382 N° 7 25027901..25027996 94 N° 8 25028921..25029036 114
N° 9 25029788..25029955 166 N° 10 25030046..25030205 158 N° 11 25030929..25031126 196 N° 12 25031226..25031354 127
N° 13 25032020..25032098 77 N° 14 25032241..25032350 108  
join(25018513..25019164,25019284..25019443,25019551..25019599,25020259..25020372 ,25021180..25021602,25027361..25027744,25027901..25027996,25028921..25029036,250 29788..25029955,25030046..25030205,25030929..25031126,25031226..25031354,2503202 0..25032098,25032241..25032350)


exon

Literature and cross-references NnRboh05 (Nelnuc025006g0595180)
Protein sequence: NnRboh05 (Nelnuc025006g0595180)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   945 (310)
PWM (Da):   %s   107149.17 (33559.0) Transmb domain:   %s   o384-403i522-544o564-586i743-760o
PI (pH):   %s   9.52 (4.16) Peptide Signal:   %s   cut: 33 range:33-342
Sequence
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Send to Peroxiscan
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Remarks
Promoter
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TTTAAAATTA TATACAATTA AATTCAAATA CCATATATCA TATATTATTA ATATTTAATT ACATACACGC ATAATGTTAA AATGTAAAAT TTTAAACGAG AATCCGGTAT GGGTTTTTCT  TTGAGAAATG AGTGATATGG TCACTTTCAT TTTGATAAAT CACGATGAAT GAACACGAGT GTACAAACTT TTAAAATGCA AAAGAAAAAA AAAATGTCCT TTTCCACTGG GGGATGCGCC  ACTTTTATAA AAATGGGATG TGTACGAATT TCATCATTTA ATCTTATATT GGACCCATTT ACTGCACCAG GATCCTATAC TTAGATCCGA CACATAACCC GTGCCCCAGC CCCACCTAGT  ATCCGTCATC CGGTGGGGTA CCGTACGATC TCCCATGATC CGAATCCGAC CTACGAGTTA GATGTCGAGC CAATCATAAT ACGCCACGTC ATCAAATCAT GACCCACGTG TATGGAGCGG  AGGTGGTGGT ATATCACGAA TTCACGATCA ACTCAGTATT TTACAAAGTA CAGAGTCTAC AGACGAAAAA CATTCGGCGT TGGAGAAGGC GTAACTTCGC CACAAAGCAT GCGTTAAACT  TGAGCGATGA GGTGTTTTGT CGCTAACCCT CTTGACTATT GAATATTCAT GCACGTTTTG AATATCAGAC TCGCATCTGC CTCACATTGG GTGCGAGTGA GTCTCCCGTG GTAGGAAACG  GCCTAATGCA TGGCGACGTG GCAAAACCGT TGTAATGAAA ATCATGTCCC TTCTTTGAAT AAGCTACCTG TGGAATTTGG GTAAATTGTA CACCACGTGG CAAACTGGAT GAATAGTAGA  TTCTTCTGGA AACAGGGAGA TCACAGATGT GAACAAATAT TCTCACGACC ACGTAAGATC ATGGGTGAGG TGAGGCCGTG AGGGTGACCC CACCCTCGGT TGACGCCATT TTATTCCCAA  CCTTCAGCTG GATGGAAATG ATATCTCAGC CGTATCAGAA ACCCAATCCA ATTCTTCGAA GCAAAACGTA GCCTTAATAA AGAAAGGTAA TTATCATAAT CATGATAATA AAATAATAAA  AAATTTCCCT TGAAATGTTC CTAGTCCCTA CAATATTCAT TCTTCTCTGG TCTTCTCTTT CCTTGCTGTC ATAGGCCATG GGTGGAAATG ACCATTTCAG GCATTGACCC GGGCGGTTCC  TGCTCTCCAC CCGGGAAACC AAAAGAAGAC AGCAAAACAG CATCCCCATT TCTTTCCAAC TTTATTAGAA AAAAATGCAT TTTGGGGTGA TCGTCTTGAC GTGAGGCCAA GTCCAATAAC  AAGTATAGCA CCAAATCATA AAATATATAT TAGATGAATG AATAAACTCA AATTTCTTCT TATATTCTCT CGTTTGGTCG TCGTCATTTC TTGATTTTCC CACTTGCCTA TCTTCTTTTC  CTCACTATAC GATTTTCTCA TCTACTTAAC CATACGACTT CTCTTTGTCT TTTGGATTTT AGCAAGGTGA GGACGGTAGC AGCTGAGAGA GAGAGAGAGA ACTCTTTATG CGGTCACGGA  GAATCAGAGG AGAATTTCGG TATAACTGGA CATATCGTTT CGGGAAGTTT CGGTGGATCA GAAACAACCA AAGAAAGAAA CCAAGACAGA GTATAAAGGG AAAATAAAGA CAATCTTCAA  TCCTAGCCTT GGCCTTGGTC CCTGGCTCCC TGCAGCGTTC GCACTAGCAG TGGCTCTCTG TTTCAAGCTT TGTCTTTTTC GTGGTCGTCC CCTCACTCTT TTTATTTCCA TTTTAGTCCC  ACTCAAAAGA CATCTCTGGT TCTCTCTCTC TCTCTCTCGT TTTAGCTGCG GCCACCGCGT AAATGTCTTT TCGGAGGGAT TCCGGACGCG TCCGATGGCT TCTCTCCTTT AAATAATTGG 
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Terminator +
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ATGTTTTTTT TAAATTGCTG AAACCTCCCG TTTGGTAATG GCAATCACTT CTCTTGAATT TTTTGATACA GTTGCAAGTA 

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DNA
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ACGCTTGATTTCCAGGGCGATGATACCATCGTTCTCCGGAGCGTCGAACCGGCTACTGTGCTTGACATCGATGCGGAAGTCTCCGCTGGGAGTGAGACTCCAGCGTCATCGAGATCGCCG
TCGATTAGGCGGAGTTCTTCGAATCGGTTACGTCAGTTCTCTCAGGAATTGAAAGCTGAAGCTGTGGCCAAAGCCAGGCAGTTCTCGCAGGAGCTTAAAGCCGAGCTTAGGAGGTTCTCG
TGGGGCCATGGCCATGCGTCTCGGGCACAATCTTCTTCGCCATCCTCGGCCGCCCAGAATGCTGCCGGCGCTAGCTCCGGATTAGACTCGGCTTTGGCCGCTCGGGCTCTCCGGAAGCAG
CGAGCTCAGCTCGATCGAACAAAATCTGGTGCTCAGAAAGCGCTCCGAGGGCTGAGGTTCATTAGCAACACCAGTAACCAAGGCGTCGATGCCTGGAACGAAGTTCAGAACAACTTCGAT
AAGCTTGCCAAGGACGGCTTTCTCCACCGTTCAGATTTCGCACAATGCATAG
AGGTTTTCTTCTTCTTTTTTTACTTTCCGGTTTTATCATCAATTCTTCGGAATTCTACTTAAGTTGCT
GCTATATTTATCATTTTTTGTTATATTGATTCCATCTTTTGCGTCGTTTGAAGGAATGAGGGATTCAAAGGAGTTTGCGTTGGAACTTTTCGATGCATTGAGTAGGAGGAGACGGTTGAA
GGTCGACAAGATCAGTAGAGAAGAGCTTCACGGATTCTGGTGTCAAATTACCGATCAGAGTTTCGATTCACGTCTCCAAATCTTCTTCGACAT
ATGTATGCACTATAATTAACACGAAAT
CATTTCTCCTTTAATTTCTGTTTATCATAATCTTTCTTTCTAAATAATATATTTAACTTAACTCGTACATCATATGCTGCAGGGTTAACAAGAACGAAGACGGACGAATCACAGAAGAAG
AAGTGAAAGAG
AGGTATAGGATCAGTAGGACCTCGTCCTCATCTCTCCAATTCTCCATCCATTTTTTCCCTTTTTTATTACCACTAATTACTACTTTAACCAGCAAACAACTCGATCAAT
CAACCTCGGTGAAGTGTAATTAATTATTCATTATTGATTTCTTCTACAAATTATGCTCGTCGTAGCAAGAAGCATAATTAATAAACTATTAGTAAAATCACTCTGTCAGATTCCTGCGAG
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CAAAAAATGAATATCCAAATGGAACCAAATTCTGGAAAACGAGTGAGGTCATTTTCAGGAGGGTAGGTTAAGGGTATAATGGGAATTTAAATGGTGTCTTTTGCTTTTTCTTTCTTTCTT
TCTTTAATAATTTGTTATTATCTACTACTATTACTAATAATAATAACTTGTCATGATTTTTTTTTTCTGTAGATTATCATGTTAAGTGCTTCTGCAAATAAATTGTCGAGGCTGAAGGAA
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TAAAAAAAGAGAGGAGAAAGGGAAAGGAGATGAGCAAAGAAATTATCAATGGAAGTAGGGTATAAGTGTAACGTTTTGGGTGAGGGTATTTTGGTAATTGTGGGAAGTCCACTGTTTTTT
TATCTGACGTGGCGGGTCAGTGGACAATGGGGGAGAGCTGGTTCCCATGATTCCATGTGGAATGCGTAATACGCACTCTTGCACTAACACAGGGCGTGCTCGAGTGGGCAGCCAAATGAG
TAGGGACTGTAGCAGAGCTGCTTATGATTGTGATCATCATGGGTCAGGTCAAATTTGTGATTTCAGATAATATATAATTTTGAATTTTTGATGGGTTGGTTTGCTACTTTGCTTTGTTGC
ATTGCGTGATGGATGGTGGGTGGTGGGTGATGCAGCTTTGGCAGCTGGAGACGTTGCTGCTGCAGAAGGACACGTACCTGAATTACAGCCAGGCCTTGAGCTACACGAGCCAGGCGCTGA
GCCAGAACCTGCAGGGGCTGAGGAAACGGAGCCGGATTCAGAGGGTGAGCACCAAGGTGATGTACTACCTGGAGGATAACTGGAAGAGGCTGTTGGTGTTGGCGTTGTGGGTGTGCATCA
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TCATCCTGTTACCCGTTTGTAGGAACACCATCACCTGGCTCAGGTCCACCAAGCTCGCCCTGCTCGTTCCCTTCGACGATAACATCAATTTTCACAAG
AGGTACCCTCCACTCTTCTCTT
TCCTCTTTTTCTTTTCCATGACGCCATGTTAGATGGGTTCCAAGAGTAATTGCACTCACTATCTTTTAACCAAAAAGATAAATAGGGGACTGAATAGGATAACATATCATGTAGAAGAAG
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TTTTTTTTTTGCATGATTCCTTTTGAATTCCAATCAGATGATAAAGAATAAATTGTCACGTAAGCGCGTGATTTTTTTCTTAAAGTACTGCTTTATGAACTTGTAAGTTCTAATACATAT
ATGGAGGTTGTTGACTTTGGATTTGGTACTAGGCAGCAAAGGTTGACCTGAAAATTATTACTTTCTTTTATTGTTTGTGAGTTGTAATATAGGGGTGAGGGTTTTTTCTTTTAGTTATTA
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AAGTCTTGGTTTGGTGATGTTGAATATCAACAGTATTGTTTGGCAATGTTTTGAAAACTGGTCCGAGGTTGAACTGTTTTTACCTCTAGGTCGTGGGTCACTGGTTTAACTGTCCGGGAT
ATATACACGTTTTCATTGGTATCCTGTCTAGTGTCTTCTAGTAAAGGCGTTTTCACTGTTATCCTCTCTAGTGTCTTATGATGCTTAATGATGCTTATTTGTATTAAACAATAAAAAACA
ATTGTAACATTATATTATGGGGTAAGTTGCTAAAACCTTTCCTAAAGTTTTTGGTTGTTGCTGAAACTTCCTTTGAAGTTTGGTAATTGTAATCACCTCTCTTGAACTTGCTGATATAAT
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AGTTTGTATTGTTTTATTTTTCATATATAGAAACCAGCCTCAATAATAACTACATGGGTATTTTGGAAATTCCCATGACTTTTTTAGAAGATTCTACCTAAGGTTGTCAATGGACTGGTT
TTGGATTGGACTCCGTCCAGTCCAAAATCAATTTGGACGGATTGGATGGACCAATCAAGTCCAAAATATTTATTAGATTGGATTGGACTTGGTTCGTCCATAACAAATTTATATTGGATT
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GACATTGAATTGGATCGGTCTAAATTGGTCCAAAAATATTCATTGGATTGGATTAGACTTGGTCCATTTATAATGGACTCACATTGGACTGGATCGGATTGGACCAAATCCAGCCCAATT
GACCCCTAATTCTATCAAAGGGGGTCTAATTGCAACTGTATTAGAAAGTTCAGGAAAGATGATTGCAAATACTAAACTTAATGGGAGATTTCAGCAATGGTTAGAAAATTTAGGAGAGGT
TTCAGCAATTTGCCCTTATATTATGTGGCCAAACCTTTTTTTTCTTACAATACCAAACACCACCAAAATTGGTGGACCTTACCTGTTCCCACCCATTAATATCTTGTGATGTGATGTAAT
ACCTATAAAAGACAATTGTTTATACATGAAAAAACACTAGGCACCAATTGAGGGTTGATTGTTGATGTATTAGCTGGTTTGTTTCGAGTGTTAATGTTAAATCGAATCCTGCACCCAGCA
CTTTAGAGAAAAAAAGGGTCAAGAGGAAAATTATTAATGGTGCATGGTACCAAATACAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAACGCATTAGGTCATATTATTGTTTGCAGACATGGTA
TATTACTAGTAAGCCTCAAGTTGAACAATTAAAGATGAATGTGCATTTTGTGATACCAGTATTGTGAAACATGTCTTTGTTTATAGAATAGCTCATTTTTTATGGATACACACGTATGTT
TGATTTGTTATTCTATAATTTTTAAATAAAACATATTTATGCATATTAGATAAAATTTTCTTTGGAGTCGAAACGGACATCCCCATACCATGCCGATTTCTTGTTTACTAAAAAGATGTT
CGGGTTTCTTGAAGAAAATTTTAAATTTGCAAGTAATATCAGGTTTTCCCAAATAATGTCATTTTCTTCTGGCTAAAAAAAAAATAGTCGTAAGAAAAACATTTGCCTTTTCTTATTTTA
TTTTATTTGTTGTGCACAGCATTTGCCTTCATTTGAAGTAAAAATCTTTAGCATGTTAGATTGGAACGAAATTGCCTTTTCTATTTTCTGTGTAGATGTGAAGAAAAAAGAAAAAAATCA
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CACCGAAAAGTACAAAAATTTAGAAAACAAGGAAATATGGTCATATCATCTCTACCCTCTTTCGGCCTTTCCTCTTTTATAGGAGTAAAAGTTTTTTCATTTCTATGGATCACTGACATG
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CATATATATGTTATTACCTATCCCAATATGTCAACATAACCATGTCAACACGAGAAAGTTTTGGCTTTGGCTGTCCATGTTATGTGTTATTGCAGAGAGAGCCTTGTGTGGATAGAAGAG
GCTGTACAGCATAGCTGGTTTTTTTTTTCAAACATTTAAAGTTTATCCTTAGTATGGAGTCTCACATGTTGACTGACATGTGTAATATGATATAAAATTACTACCCATTCTTTTCTTTCT
ATTTCTTTTTATAAGGAGATTTACTTGGTGAACTTCTTTCAACTTTTTGGAGTCATTTATAAGTATATTTGAATAAGTAGGGTTCTAAACCTATTTGCTCTAATCTTTCTGGTTACTCAT
CTAAAAATTCAAAATTTCACACATTTTTTTTTGGACATATTGTTCCTTGGCCCCAACTTTGCTCCATACAACATTATTAGCTTTACAATTATTTATTATTTTTTTTACTTTTAACTTGAG
TTTTATTTTCCTATCATCCTTCTATGATTCTAGGAACAATATCCTCTTGAATCACTTGTTTTTTTTCGTTTTGTTAAAGAACCAAGGTGATAGAGTAGTTACATTGACTAAAGCACCCTT
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GACAATACCCCCAAAGTTCAGTTAATAAAGTAGAATTTTCACATATGAATATTACTATCAAATTATATCAAAATCAATGTTTACATTAAGTATCTAAATCCACCATATTTTACGTTTAGA
ATTAGCCACAGCCCATTCTATTACACACCACATCACAGACAGCCATAATGAATTTTTGACACCCCTAGAACACTGCTTCTTCCTTCAAGCAATATTTAGTATGGATGGAGCAAAGGGACT
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CDS
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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GGGACTAGA
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CAAGAATTGAGGAAGCTCTGCCAGGTATACAACCAAAAAGGTTCTACCAAGTTCGAATTCCACAAGGAACATTTCTGA

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