Entry information : CescDiOx03(EVM0008712.1)
Entry ID 18778
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CescDiOx03(EVM0008712.1)
Name CescDiOx03(EVM0008712.1)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Colocasia esculenta    [TaxId: 4460 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CescDiOx03
start..stop
S start..stop
CescDiOx05 1091 0 1..629 1..593
LminDiOx01 981 0 2..628 3..634
LminDiOx02 979 0 2..628 3..634
LminDiOx03 973 0 2..628 3..634
Literature and cross-references CescDiOx03(EVM0008712.1)
Protein sequence: CescDiOx03(EVM0008712.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   629 (310)
PWM (Da):   %s   71204.63 (32628.4)  
PI (pH):   %s   7.08 (6.76) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-337
Sequence
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*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
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WINATSAFSV WDAPPNQFNL IPLYLRIPS 

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Remarks
Promoter
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTTTAAATA ACTAAAAAAA AACTTCACAA AAATAATTAC TGAGCAAGAA ATAAAAGCTT AATAAAGAAA TAGAGCATTT TTAGGAATAA ATGGATAACT AATAAATAAA GATTTATAAT  GTATTAAATT GAAGTTTCAA ACTGCATCGT TCTTCAATGA ATCTTCACTG TACTTCACCG TTGTTCGTGT TTCTTTCACA AAATTGTCAA AAGGTAAGTG ATCTTTGGGC ACAAATCTAA  TTAATCACTA CTAGACGACA CTTGTCATGT CTAGATCATT TCAACATATT CTCCCCAATT TATATCTTCT ATGTTATTTA AAAATTTATT TTTCATATGC ATTCATGATC ATGTAATATA  TCTACCCTGA ACATGTAATT CTCTTAACTT CATGTTGATT AGTATTTATT GTAGATTTAG ATGCATGCTT TAAAATATTT CAAAAAAAAA ATTTCCTCTC TTTGATGACC ATTCTATCAA  GTATTTTGCA TTTGAAGGAA GTTTAACTAA AATTAGGATT TTTTAGACTA CAAGTCGCCC TGGCCGACCT GGTGCATATA AGTTTGCGTC AAAAACGCTG GGCGCAATAG ACACTGTCAT  GTCAAACAAG ACAAGCGCCT CTATAGTCAT GCTCTGCAAT ATTGGCATGA CTAGAGTGTT TCTAGCAAAT TGTTATCATT CTTTTATGCA TGGTCCAAGG AAGGTTTAAC ATGATTTTAT  GAGGTTTTGG TTTAAGCCTC GAACATGGCG CACAATAAAC TGTAACAAGT TTTAATTCAC TCAACACGAC TAATTGATAC GAATTAGTAG TTTAATAAAA TTTTATCAAG TTTTAATTCT  GAATTAGTGT TTAATAGAAT TTAGTGATTT GACATCAATA AAAATAAAAA TTTTAACAAT TTTTCAATAC TATTTCTATA TATTTTTAAA CTATATATTT TTATTAATAT TTAGTCTGAT  TGACACAACT AATTGATACG TATATTATCT ATCTATTTAC GTTTTAATAT TTTGCGTCGG GAGGTAATTA GAGTGGTGCT ATTTCCGCCC TCCATATTTC TTCATATTCT ATCCTCAATC  TCCTATAATT CGCCGCAAGG ATAAGTCATG TGTACAGCTC TTTCTTGACC TGAACTAAAC GATAAACCTT TCCAAGATTG TTACGCGCGG TAGTACTCCA AATTAGACCG TTCATGAACC  TGCAACTGGC CCAAAATTGG GAGCATTCGA GGAAGAAACG GGAAGAATTA AGGGGGCTGC GATTCCGGGT CGGATGTCCC GTCCGTCCTA GTGGAATCTC GCGCGTCCAT CAGCTAGCTA  GCTTTCCGAC GTTGTTCTCC GCGACCGCCC TTCGAACTTA TCAACTTGGT CACATTACAT GCATGGGCAA GACCAAAGAC CTTCTCACTT TTCAATTCCT CGCACGTGCG GAAATTAATG  TTCTCAACAT CTTTACTTAA AATCCAGGGC TCACAGCTGA TAAATTTTGA TAATTTTATT AACTCAAAGA TAATTTGATA ACTTATCCTG TGAATAATTT ATCTGTACAT TAACTTAATT  ATTTAGTTAT CGAAAGAGTC ATACGTAAAC ATTCATAATT ATAACAGATC ACTTGGACAA TACTTTTCAT ATCCGCTGAG ATGGACGGAC AATCACATGT GGAGGGAATT TATTGGGTTC  ACACCAACAG GGACGTGCCT AATTAAACCA GATAATACCA ATCTGGTCCA CGGAGTGCAA AAAAATCTCT CTATTGTAAA AACTTTCTTC AGCATGAGCA GACAGCGCGA CTTCTTACGC  GTACACACAC CTCATACACA CGAACAAGAA CGTGGCGTCT ACCTATAATT GTAAAATAAT GACATATATA TACGCACACG TTTAAAATTT ATCGTATTTG ACTCTATTAA GATATTTAAT 
TAAATTATTA TCGAGCCGAA GTGGTCATCC ATTTTTTTAT CACATGGCGC GGGTGTAGTC GCCATGCCAC AGGCATGCAG 

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Terminator +
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCGCTTCATC ACCCCCTGTA CATTTATACG TACAGGAGAT TGGAAGGTGA TCGTTTCTTT ACGAGCTATT TCAACGAGAA GACGTACACC AAAAGGGGAC TCGAGTGGGT GAACACAACC  GAGAGTCTGA AGGATGTCAT CGGCCGCCAC TACCCGGCAA TCGCTAAGAA ATGGATCAAT GCAACAAGTG CATTCTCAGT GTGGGATGCC CCTCCAAATC AGTTCAACTT GATCCCACTT  TACCTGAGAA TTCCCAGTTG AGGGGGAAGA TGATGATCAT GCTAGCTAGC TCATATCCAG CTCAATTCTC ATATATAATC TGTAATTCCT TGATCTTCCT CCTAGAACAA TAAGACACAT  CTTCAGGATT GATCCTTCAA TTCTACGTAC GCCCATATAG CTGGGATATT TGTTTCTGGT ACTGAATGTT AAGTTGTTTT ATATTCATAT TGAGCATATT TATTGTTTAA TTTGTATCCC  ACAATCACCA CGCAGGAGAG AATCTCGATC AGTATAACGT AAAAATTGAC ATTTTATAAT TAAATTCACC CTATGCAAAA AACTTTACAT TTAACACAAG GATCAAAATG TAAAATATTA  CTTTTTTACC TTGTACTGAC ATGATCCCCT CCTGCACGAT ACTGAGGGGA TCCCTTCTAC TCAAAGGCTC TCGTAGTCCT TAATTTGTCG AGGAGTGAAA AGATCAAGTC TATGACTAGC  TCTAGTGGAG GGTACAGGAC TATTAAAAAT TTGTCTTGAA TGGCCAATAA AAACTAATAC AGAAATAAAA TTTTAGTGCA GACATGAGAG AGAAGAAGGA AGCAAGTACA TAAAGAGACA  CCGATTTTAT CATGGTTCGG TAAGACCTCC TTTGGTCTAC CTACGTCAAG TCCTCACAAA TACGGTGGGA TTTACCCTCT CAAAAAATTG AACTACAACC GCTGATTTAT GTGGTGCCCA  ACTCAGCAAC AAACAGCTAG TTAATACGGT GCCTAACTCA CTAACATTGC AAGAAAAATT GAAATTAGCG ACAGAACTTT GCGACAGAAA TATTCCGTCG CAAATTCGTC GTAAATCTGC  GACGAATTCG CGACAGAAAT TAATACGCCG CTGATCTACC TCTAATGCAG GAACCAATTA ATGGCAAGAA TTTCTCGTAA CAAATTTCCG TAGCTAATCA GCTAGGAATT TGCGACGAAA  CTTTCTGTCG CTGATCAACG AGGGAAATTT TGCGACTAAA CATTTCGTCG CTGATTAGCG ATGGATTTTT TCTTCGCTGA TCAGCGACGA ATCGGTGACA GAATTTTTTT GTGATTAGCA  GCGAATAATT GCCGCCTCTA ATTCGTCACC GATCAGCGAT GGAAAATCAC TTCCTTCATT TAACTTTTTC TTAGTTGTTT TATGTTTACG TATACTTACC CATCGTTGTT GCTAACTAGT  TACATTATTT ATAAGTAGTT TAGTTGTATT ACAGATATAA TTATCTATAT TTATTATATA CATAATTTAT ATAATATTCT TAGAAAATAG AAAAAATATA TTAAAAATTA TAAGTTACAT  TTTCAATCTA CGGAATATAT ATATTACTTA ACTAATAAAT TAACAATTAT TGCTAAGTAT TTGTTGCATT ATTTATATTA TAGTAGTTTA CTTATATTAT AGATATAGTT ATTTATATTA  TTTCATATAT ATGTAATATA GTATGCATGT TTTTTTCTAA TTATTATGAA AATGACATAA AACAATATAT ATATATATAT ATATATTTAT AAGCTATAAT TTTCAATTTA GTCAATATAT  ATGTATATAA TATTTGTTAT GTACATATAC ACAGGATATT TGGATACTTA TAAAATGTAT TGTATTTGCT TAGTGAATAT ACTTGTGATA AATTTTTTAA ATATTAACTA TTTATAATTA 
TTAATAGTAA TATTTATATT TCATATTATG ATATATATTT TAATATTATG TAGCTCATCA AGAGTAATTC CAGAAGTCGT 

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DNA
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AAAGGGGACT TCGAAAGAGA AGAGAGAGGA GTAATAGATA GGGCGAAAGG ATCAGGTGAA AAAAGAAGGG TGGCTTTGAA GGGAAGCGAG GGAGAGCAAT CTAGAGAGCA GGGAGGAGTG  TCACCATGTG TTTCCGGTCC TTCATCCACC CAGACCTCCG GGAGGCCTAC GACAGGATGT CCTTCGGACA TAAGCTCATC TTCCTGGTGA GACTTTAGTT CGATCTTTTG AAGTTTCTTC  TTCTACCATT TTGCAGTTGG GGGGGTGTTG CTCTTCCCTT GGGACGAGCG TATATGCATA TGGACGCGAC AATCTGCGGA CTCACTTAAA AATTTGCTTC CGTACGTCGA CCCTTCTCTC  TCGACGTATT ACGCAGGTGG TGCATGGAGT CGACAAGATG AAGTTGTGGC ACCGGCTGCC GGTGATTCTG GGCCTCCTCT ACCTGGCTGG CCGGCGGACT CTCCAGGACA GCTACAACCT  GCTCAACGTG GGGAAGATTG ACACGACGTC GTTCGACCCC GACAAGTACC CTTACCGGAC GGCGGACGGC AAGTATAACG ATCCCAAGAA TGCCAGTGCA GGCAGCCAGA TGACCTTCTT  CGGCCGGAAC GTCCACCCCG TTGATCAGAA GGATCAGGTG CCCATGCTCT CTCTCTCTCT CTCTTCTTGT TTCTCCTGAC ATCGATGCAA AACAAAACAC AAAACCGCGT TCAATCAGAA  CTAAATAGTA AAGCTATGAA GATTAAGAAT CAATTGTACC AAATTACATG AAGCCAAAAT GGGAAAAGAA TCTTGCAAAT ATATAGTTCA GATAGCACTA TCATAGGTTT CAACTTGATG  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CDS
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TGGATCAATG CAACAAGTGC ATTCTCAGTG TGGGATGCCC CTCCAAATCA GTTCAACTTG ATCCCACTTT ACCTGAGAAT TCCCAGTTGA 

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