Entry information : LminPrx38(Lemmin8g0229660.t1)
Entry ID 18836
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx38(Lemmin8g0229660.t1)
Name LminPrx38(Lemmin8g0229660.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx108]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx38
start..stop
S start..stop
LminPrx37 642 0 1..319 1..319
LminPrx29 613 0 1..319 1..319
LminPrx101 609 0 1..319 1..319
LminPrx102 535 0 8..319 9..319
Literature and cross-references LminPrx38(Lemmin8g0229660.t1)
Protein sequence: LminPrx38(Lemmin8g0229660.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   319 (294)
PWM (Da):   %s   34129.03 (31581.7)  
PI (pH):   %s   9.44 (9.43) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-319
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSKMGIASPA SFFVVVLVCL SSVHGQLTPG FYSTSCPSLQ RIVQNAMRRA VRNDPRLPAS MIRLFFHDCF VNGCDASVLL ADTTTFTGEQ NAFPNRNSIR GMDVVEAIKS AVEASCNGTV  SCADILALAT RDGVFLSGGP SWTVPLGRRD ARTASQSAAN SNLPGPSSSL SALTTSFANQ GLNQRDLVAL SGAHTFGVAR CATFRNRIYN DTNIEPAFAA SRRANCPRSG GDANLSPLDV 
RTPRAFDNAY YANLVSRRGL LHSDQELFNN GSTDSIVRSY ALNRSVFFRD FVAAMVKMGN ISPLTGSNGE IRRVCSRVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCGTGGCAG ACCCCTAGAA TCAGAAGCTC TAATACCACT TATAAGCACA CAATTCTCAA GGAACGATCC CTCGATGAAA TCAAGAAGGA TGGAACTAAA ATTCAATCAA TCAAATGCAA  GAAAATCTCT TGAGAGTTCA CACACATCAC ACGCACACAC CGCACTTCAC TTAAGCATTT CGTCGAACAC AAGAATTACT ATTTATAGTT CGGGAGAGAG AGAGAAGAGG AAAGAAACGG  TTATAATCGT CACGGGCCCC ACTAATCCTC AATGTCTCAA TCTACGTCGT TATAACTCGA TCACGCAGAC TGTCCTGATA AACACCTGCA CTGAACATAA CACTGCCGTT AGATGAAGAT  CCAACGGCTA GGATCACCCC ATCACTATCG TCTCCAAACC ATGATGTCGA TTGGTTATTG ATCACACAAA TCGCTCGTAA TTGTAATTGC TGTTTACATG GCATTTCGTA TCATTCTAGG  GAGGCATAGG CGGCGGCCGA AAATGCAGTG GTTAGTGCGA GAGCAGGAGG GCTGTCATTT TCCCCCGTTG GGCTTGGCTG GTAGCAGGGT CTTGGTTGAC CCGGAGAACG TTCCCTGGTT  CTTGATGGTG ACGGATTGGA CAAGGTAGGA GCGGAATGGA CATCCCGGAA ATCTGACGTC GTGAAGCGAA TATTGCGGTT CCCATTTGTA AGACTCGGGA AATATGTGGG ACATAACGTG  TGGACCTTAT CCCGAGCTCA GAGGTTTTCG AATTTCGACG GCCCATCGCT TCATTGGGAA GAGAGAGTCG TAGGAGCGGA CAGGTTCTGT AGAAGGGCAA GCAAATGGAA GCGCAATAGT  CTGCAGAACA ATGCTAAGGG AAACCACGCA AGTATGAGAA GCTATGATCG GATGTGTAGA GGAAGTGATC GGAAGTCGGC CGGCTGTCAT CAGTTGATAA AGCGTGGAGG ACTGGTGGTC  GTGGATACGC ATGTAGGCAC TTGATCTTTT CAACAAAAAA TAGAAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGATACACGT ATTAAAGAAA TGAACTCTGC TGTTAATCGA TTTGACGATC  GGCCAAACCT TTGACCAAGA ACAGATCGAT AGGAGATGGA CGCAGCCCAG TTGGTATGGT CTAGACGGCT ATAGTAAGCA GATTTTGTTC ACTTTGTGTG TCGCAAAGCG GTCAAGAGCA  AGGTGCCGGA ACTAGGAAAC GGCGGGATTA GCTGACGTTC AAAGGAATCA ACTCCGTCCG AGTTTAACCC TCCCCACCGC GCGAAGCAGG GAACTCGAGG ATGCTGACTT TCAACGCGGC  GGGCCCGCTG AAATCCTCTC GCTGGCTCCC ACAAGCAGCA AGGGAGAGGC CAAGAAGATT CCAGCCATTT AGCGCGAGCA TTTTTCCGAG TATTTTTTAG TATGCGATGA AAGGAGAGTG  TGTTATGCCG ACACTCGAGA CCTAGGAAAA GCAGGTCTAC TCTAAGCAAG CAATGACTCT CTCCTCCTCC TCCTCCTCCT CCTCTTCTTC TTCTTCCTAA ACCAGAAGAG AGAGGACGTC  TTCTCTACGA CCATCGTGAA CGTGAGCATG TTCTCTACAG ACGTACTGCT CTCTCTCTCT CTACCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTTT CCCTCCCCGT GATAGATAGG ATCAGGATTG  TCTTCCGTTC CGACGCATTG ACCTAGAAAA TTCCACTTTC TCCTACCCCC TCCAGCCTGG CCCCCGCCCA CATCCAAGAC TCGTTCCAAG GTCAACCCCT CTCCACTGCG CCGAACGCGG  AATGAAGTCG ACTAGTTGTT CTACAGCCGA GCACGACATC TAGCTCTATC ATCTATAAAA GCGGCAAAAG CGCTGCAATC TTCCATCGCA CAGCACCCCG CAGCGCAGTT TCAGAGAGAA 
GAGACCAAGA GAGGGAAAAA GAGAGACGAC GAAAGCTCCT TCTTTCTCGT CTGATAGAAA AGCTTCCTTC CTCCCCAGCA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGGGTTCCGC TTATCATCAC CGAATACCTA TCGTTAGCCT TGTTCATTTA GTAAAAAAAC GAAATACTTA TTGTCCAATT AAGCCATCAG CTGAGAATAT TTACTGGTCG ACTCTTTGTT  CAGATGGTTT GTCCCATATA CGACTCTTTA TGTCCTCCCC TTTTTCTAGT CATCAAGTAG GGTGGCAAAG TAGGAACTAT GGGGTATGGT TGGAATGCCG ACTATCTGAT AAGAAGTTTC  TATAAACTTT AATTCTACAT TTCCCCTACT AATGTGGTCG TGAATGAAGT GTGATGTCGA ATCTAGATGT GCTTTATATG CGAATGCACA ATAAGATTCT TCATGAGATT AATCTTGTTT  TGTCACAGTG GATTGGGATT TTTTTCAAGG TTTATCCCAT AATTCTTAAG TTGATTCTTG ATCCACAGAT CTTTGTAACA CATGTTTCAC TTGCCACATA GTTGGCTTTG GCCTTAGAGA  GGACAATAAA ATTTTGATTT TTGGACTTCC AAGAAACAAA GAAAAGACAC TCCACTGGTG TTTTTCCTTT TCAGGTCCGG AAAAGTATTA CAAAAGCCAA GAAGCTCAAG TTCTTGACAT  TTAGAGTACC AGAGTCCGAA ATTTATTTAT TCCTATGAGA TACCAAAATA ATACGCTTGA CTGTCAAGTG TGACTCTTTA GGATTGCTTT AGAAGCGAGC ACAAAGAAAT ACACTAAACA  GTATGTCAAG TCAACTTCTT GTTAGCTACA AGAGAGAAGC TATAATTCCC TTATTCTTCT TATGAAAAAC CCTCTTCGCT TTCTTGTCTG CGTCAATTTT TAAACCATTC GCCATTAGTG  TCCACTTTGA TTTCAAATCC TTCACCCTAA ATTTTGCGAG CAGTTTCCTT GCATATTTCT CTTGTGATAC AAAGAGACCA TTAGGTGTTT GCTTGATTTT CAAGGCCTAA GAAGTAGGTG  TGTTCTCCCA TCAAACTCAT TATTCATTAA GTCTACAAAA TTATTGCAAA GTGTCTGGCT ACTTGATCTG AATATAATGT CATCGACATA TATTTGAACC ATTATCATCT TGTTATTCAT  AATCTTGACG AACATCATTG TATGTACATG TCCTTGCAAG TATTCATGGT CTATGAGAAA ACTACCTAGC TTCTCATAAC AAGTTGTAGG AGCTTGTTTG AACTCATATA AGTACTTGTG  TAGTCGATAG ACCCAACCTA TTAGAGGGAT ATTCGAGAAA GACATCGAAA TATCCGGAGA GAACAACACT ATCTGATCTG ACTCATATGA TGAGTATGAC TAATCCTATG GCCATAAGTG  TGGAGACAGT AAGGATCAAT AGAGGGTGCT CTTTAGAGAA ATAGTTCATT AAATTGATCT ATATGAATCC TTGAATGATA TTATACATAA CTTTCAATCA GGTCGATTAA TGTCACGGTC  GTGTAAGTGA TCATTAAATT TGAGACACCA AAGACAGCTT GTGGATGGAT GATCATGTTT TGACTATGAC TTATGAATCC CTAGCCACGG GATCTCCAAA ACGTCATTGA TTGGATATAA  CATAAAGTCC TCAAAGGCGA TTGAGTGGTC AAGATGGAAT CGTCCGCCCT TAGTATAAGA GGAGATTGAC TCAAGGAATG AGATGTGGTT AAATCCTTAG ACAATGTAGT AGAAATATCG  AAGAGTTCTC GATGATTTCC TCCTCACATC AGTACTAACT GCAATGACTG ATTAAAGTTT GACAGTTGAC CATACCCTAA GTCATTTAAG AGTCCCGAGC GGATGAAGGC TTATACATAC  ATGGTAATCA ATGACGTTAA GGTTCCATAA AGAGTTTTTA TACAATCTAT ATCTTCTAGA GCACGTGGTC TAGCTTGGCA CCCAACGGGA TAGCAACCCA ACCTCTCGAT TGGGTTAAAT 
TAACCTTGAT CAATCAAACT ATATATTGAT ATAGTTAATT GTTAAGGTTG GCCAATATAT GTTATTGGGC CTATAGAGTT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGAAGA TGGGCATTGC ATCTCCGGCC TCCTTTTTCG TGGTCGTGCT CGTATGCCTT TCCTCGGTTC ACGGGCAGCT GACTCCCGGC TTCTACTCGA CTTCCTGCCC AAGCCTGCAG  AGAATCGTCC AAAACGCCAT GCGAAGGGCC GTGAGGAACG ATCCTCGATT GCCGGCCTCC ATGATCCGCC TCTTCTTCCA CGACTGTTTC GTCAACGTAC GAACATACGC GAGCGACTTC  TTTCTTCTGG GGGCCTCTTT ACTCCTTCTA ATGTTTCAGC GCAAATGTGC TTCCTGCAGG GCTGCGACGC GTCTGTTCTA CTGGCGGATA CTACGACGTT CACTGGGGAA CAGAACGCCT  TCCCGAATAG AAACTCCATC CGCGGAATGG ACGTCGTCGA GGCTATCAAG TCCGCCGTCG AGGCGTCGTG CAATGGCACC GTGTCCTGCG CCGACATCCT GGCCCTTGCC ACTCGGGACG  GCGTCTTCCT GGTGAGATAC TTTTCATGCA TTCTCCGCCA CCCTATTTTG CAGCGCTATC TCTGTCCGTT ACAAGTCTAA CCGGAGAGGA CGACGCTTTC CTTCGCTATG CAGAGCGGAG  GGCCTTCGTG GACGGTGCCG CTGGGGCGGC GGGACGCGAG GACGGCAAGC CAGAGCGCCG CCAACAGCAA CCTCCCAGGC CCGTCGTCCA GCCTCTCCGC CCTCACCACC AGCTTCGCCA  ACCAGGGCCT CAACCAGCGG GACCTCGTTG CCCTCTCTGG AGCGCACACC TTCGGCGTCG CTCGGTGCGC CACCTTCCGG AACCGCATCT ACAACGACAC CAACATCGAG CCCGCGTTTG  CCGCGTCTAG GCGGGCCAAC TGCCCGCGAT CGGGCGGCGA CGCCAACCTC TCGCCCCTCG ACGTCCGCAC GCCCAGAGCC TTCGACAACG CCTACTACGC GAACCTCGTC TCCCGCCGGG  GACTTCTCCA CTCCGACCAG GAGCTATTCA ACAATGGGTC CACCGACTCC ATTGTCCGCA GCTATGCTCT GAACAGATCC GTCTTCTTCA GAGACTTCGT GGCCGCCATG GTCAAGATGG 
GCAACATCAG CCCCCTCACC GGCTCCAACG GGGAGATCAG GCGGGTCTGC AGCAGGGTGA ACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGAAGA TGGGCATTGC ATCTCCGGCC TCCTTTTTCG TGGTCGTGCT CGTATGCCTT TCCTCGGTTC ACGGGCAGCT GACTCCCGGC TTCTACTCGA CTTCCTGCCC AAGCCTGCAG  AGAATCGTCC AAAACGCCAT GCGAAGGGCC GTGAGGAACG ATCCTCGATT GCCGGCCTCC ATGATCCGCC TCTTCTTCCA CGACTGTTTC GTCAACGGCT GCGACGCGTC TGTTCTACTG  GCGGATACTA CGACGTTCAC TGGGGAACAG AACGCCTTCC CGAATAGAAA CTCCATCCGC GGAATGGACG TCGTCGAGGC TATCAAGTCC GCCGTCGAGG CGTCGTGCAA TGGCACCGTG  TCCTGCGCCG ACATCCTGGC CCTTGCCACT CGGGACGGCG TCTTCCTGAG CGGAGGGCCT TCGTGGACGG TGCCGCTGGG GCGGCGGGAC GCGAGGACGG CAAGCCAGAG CGCCGCCAAC  AGCAACCTCC CAGGCCCGTC GTCCAGCCTC TCCGCCCTCA CCACCAGCTT CGCCAACCAG GGCCTCAACC AGCGGGACCT CGTTGCCCTC TCTGGAGCGC ACACCTTCGG CGTCGCTCGG  TGCGCCACCT TCCGGAACCG CATCTACAAC GACACCAACA TCGAGCCCGC GTTTGCCGCG TCTAGGCGGG CCAACTGCCC GCGATCGGGC GGCGACGCCA ACCTCTCGCC CCTCGACGTC  CGCACGCCCA GAGCCTTCGA CAACGCCTAC TACGCGAACC TCGTCTCCCG CCGGGGACTT CTCCACTCCG ACCAGGAGCT ATTCAACAAT GGGTCCACCG ACTCCATTGT CCGCAGCTAT  GCTCTGAACA GATCCGTCTT CTTCAGAGAC TTCGTGGCCG CCATGGTCAA GATGGGCAAC ATCAGCCCCC TCACCGGCTC CAACGGGGAG ATCAGGCGGG TCTGCAGCAG GGTGAACTGA 

Retrieve as FASTA