Entry information : LminPrx87(Lemmin38g0748930.t1)
Entry ID 18885
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx87(Lemmin38g0748930.t1)
Name LminPrx87(Lemmin38g0748930.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx030]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx87
start..stop
S start..stop
CescPrx82 447 6.27e-159 23..337 20..337
NnPrx06 411 1.11e-144 24..337 28..343
VvPrx19 405 1.15e-142 8..337 6..333
CclPrx118 402 1.83e-141 8..337 7..335
Literature and cross-references LminPrx87(Lemmin38g0748930.t1)
Protein sequence: LminPrx87(Lemmin38g0748930.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   337 (314)
PWM (Da):   %s   35403.6 (33068.4) Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   4.71 (4.69) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-337
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGSVRGSGLF LVLLLGMCME LGAVKKDCFL GGEFGWSLEF DVYRSTCPAA EEIIFAGVQR AVAGDSRMAA SLLRLHFHDC FVNGCDGSVL LDDSPSFTGE KSAAPNANSL RGFEVIDAIK  MELEAICPET VSCADILAVS ARDAVALSGG PAWDVELGRR DSLTASKAAA NKDIPSPTSG VKTLVDQFKG LGFSPRDMVA LSGGHTIGNA KCSSFSSRLK GLSSGIVSST NELGFLVSLQ 
QLCESGNSTA TTQLDLVTPA SFDNQYYVNL LNGVGLLASD QVLVNGGDSQ IFEIVKSYAE NPMIFFQDFK AAMVKMGRLG APSGSDGEVR RNCRVVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGCCTTTGCT TTTATTCCTT GTTTTTTTTC TAATCGTGAG TTGATTTTAT TCTGTTGTAT CTAATACTTC TTATATATAT ATACAACCAA TGAGATCGAG TAATAAATAA TATTTGTATT  ATCTTTCCCG TTACATTGCG AACACTTGTT ATGTTACTGA GGACTTGGAT CTATAACTTG TTAATGTCTA GGAATAGTAT CATATAGATT ATATCTTCAT TCACATTTCA TTTTTTTATC  TAAGTCTAGG GGCATAAGTA TTGCTCACTC AAAAACTAAA AAATATACGA TTTTGACAAA GTATCCATAT GTGCCAACTT GATTTCAATA GAAAATTAGT GTTAATATTC TTTAAAACCT  TTTTGATAGT GTTAATATTG AAACTATTTG CCCCATTAGG AAATGATAAG TCCAAATTAG TAGCCATTAA TGATACGTTA ACAATAGAGT ATCATGTACA TAATTTAAAT ATATACTTTT  GTTCTTCCCT ATTATTATTT TTAATGTGCA TAGTAAATCT TTTGTCCCAC AAGATCTTTC TTCTCGAGTT ATCAATGTGT TCTAAGAGTG GGTCATATCA ATGTATCAAC CAAATATATC  ATCTAATTTT GTGTAATTAT CAAAGAAGAG ATCCTAAGAA GAATCATTGG GTATCTCAAG CTCACAAAAA AGCATCAAAT ATACTGAAAA TTTCTCAATA GTGAAGAGGA AATGCGCTAA  TCACGTAACC ATTAGGGTTT AAGCACAATG CAAGCTAATT TCAGGAATCA ACCGCTAGGA TTAAAATATT TAGTGTATAT TCTCATAATT TTGTTACCAT AGGTAATTTT TGCCTTTTCT  CATTAACTAT ACCATTTTAA TTTGAGAAAA TGATGTAATA ATAATAATTA TTATTATGAA AATAATAATT AAAAGGGTAG GGAATTAGAT GCATGGAAGC AAGTATTCCT AGCCTATTTA  TAATATGTCT TGACGACATT CTACCAAAAA GTCGTATTTT GGCCTCGTCT ACTTTCTTGA GATAATTTTG GGTATATTCA TGTTTACCCT ATCAAGCAAG GTGTAGGATA CCGTAGGTAT  TATCTTAGAT GATACAATGC TTAGAGATGA TCTTACACTA CAATGAATGA GATATTTGCG AGACTTGGAG AGATTTTGAA CGAATATCTG CTTTGGAGGA ATAATCTCTC TCTCTCTCTC  TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTTTGTCTC TCTCAAATGG TCCAAAGCTT CAGATGAGGT ACATCATTCT TTAGAGAGAG AAATCTAGTG TTGTCCTTAA ATATCACCAT  AAGTATCTCT CTCTTAAACT GGTCCAATAC TTAGCTTCAA ATGGGGTACA CCACTTTTTA GAGAGCGAGC TAGTATCGTC CTTAAATATC ACCGAAGTAC CTATCTCTCT TTAACTGGTC  CAATACTTAG CTTCAAATGG GGTACATCAC TCGTTAGAGA GAGAAAACTA GTGTTGTCCA CAAATATCAC CATAATTATC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAT AATGGTCCAA TACTCGGCTT  CTAATGAGGT ACATCATTCG TTAGAGAGAG AAAGCTAGTG TTGTTCTTAA ATATCACCAT AAGTTATTAT CATAAAACAA TAAGTGAGAT AAAATAATTA AAGATAAAAA ACACGGTAAA  AATGGGGATT TGGTCGTCAT ATTTACTTCA TACGATAATA AAATGGCATC AATTTGAAGG GCTCGGTCAC TACGGTTCTG CCGTCAAGGA CAGTCAGTTT CACCGGCTAC GCGCATTCCC  TCCGCCCGAT CCGTCCGTGG TCAACGGCCT CATCAGCTAC TCTCCAGCGC CATGTGGAAG CTGACCTAAT CCTCTACTGG CTACGCGAGC TCTCTTGTTC TCTCTCTCTA TAAATACCCC 
TTCATGCGCG CTTCATTAAA TCACTCCAAG CTGAAGCTCA AGTGAGGTAG AGATAGAGAG AGAAAGAGGG AGAGAGAGAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGAAGTTGTT CTTGGAAGGG CTCTTATTCT TCTTCTAGGG TTTCTTCTTC TTCTTTGGCA TAGGTTTCTT GTTCTTGTTT TCCTCATTCC ATGTGTATTA TGGTTATCTT TGAATAAATG  ACCCTTCTAT TGTGTGTGAA TATATGTCTT AATTTACTGA TTGGAGAGCT TATTTATCTT ATTTTGGGGT TCCTACTATT GGATGCAAAC TCCAGCGAGT TTACTAACTA ATAATTCTGG  ATATAAACTA ATAGGAATAT AAAGTAGTAT TGAGAAATAA ATTATCACAA TGATGGAGTG TGCTATATAA AAAAGTGTCA AATTAATACC TCAGAATTTA TCTTCAACAT GTCAGTTGTG  TTGACTTCAA GAATGATCTC GCCTCTTCGC GTATTAAACA CAAATCTATA ACCCCAGTCA TAGAATAGAA TCTAAGCTTG AGATGTATAG ATTACCTTGG TCAAATACCT TCAAATAGTC  TTGAGATGAA AATTTTCTAA TCCTCCTATT TTCATAGCAT CCTTCAATAG AGGATGATAT CGAGTGGATA GAGAAGAGCA CTCACTAACG TAGTGGCTTT GATCTTAACT CCTCACTCAC  CTTTCTCCAC CTTGATCTCA CCTTTCTTGT CCTCGATTTG CCATTTTCAG AGGTCAAGGA AAGATCAAGA ATGCGGTCAG GGAAAGAAAT ATACAAGAAG TTCTACAAAT ATACAGATTC  CAACAAATGT ACTGTAAAAA TTTGACTTTG ACAATTTCAT CATAATCCCT AGTATAAAAC TATAGTTTTC ACTAAAAGAA AAATACAGAT GATTTCGTGA AAATACCTAG TTAATGGTTA  TAACCTTCAA GAAAATAAAA TACAACCTAA AAAACAAACT ACTTAAATGT CACAAGGACA AACTATGCTT TATGACAATC CCCCTCAAGC AAAGAATGGA TATCCTTCAA ACTAGGCTTT  TTAATTATTT ATAAAACTTA AACTCTTGCT GATCCTTTGG AAAAAGATAT CCACGCAATT TTAAGATGAT TTGATATAAG GGGTGCATAT AAGGCCTTCT TCCAACCTGT CTTTAGTAAA  ATGCCAATCT TTACCAAAAT GCTTAGTTCT CTTGTGTTGA ACTAGATCGT GAACCATACT TGTTGAAGAT TTGTTGTCCA TCATCAGCCA GATTGGTACA TGAAAATTAA TTTGAAGTTC  ATCAAACATA ACTTTGATCC ATTTAACTTC ACTTACTCCA GTGCCAAGAG CTCTCAATTA TGCTTCACCA CTATATCTTG AATTTGACAT CCCCTTCTTT CTCTTCTAAG TAAAAATTGT  GGAATGACGA GAGAATGAAT CACATAAATG ACTGCCCTAT CCTATATATA GGGTTGGGGA ATATGTACAT ATGGTGGTAG AGGAGATAAA CGTAGAGAGA AAAGAGAAAA GAAAAGTGCT  AAGTCAAAGG TGGGCATATT AGCCCTGGTG GTCCTATTGG GCCTAACACA CCCGCTCACA CTCTCCCTCA AGCTAGAGAT TAGATATGAA TCATTCTTAT CTTGGTGCAT ATACTATCAT  AGGAAGGTCC GGTCATGCTC TTATTGAGGA CATTTGTCAG TTGGTTTGAA AGGTGACAAG TGGTGTAGTG ATAAGCCCTT GTACTACCTT GTCGCGAATT GAGTGACAAC CTATGTCAAT  ATGATTGGTA TGTTTGTGGA AGGTTGGGTT GCTTGCGATG ATGATGGACT CATGGTTGTC GCAATGCATC CACGTGGGTC TACGCAGTTG AGATTCAAGC TCTAGTAGAG AATGAATCCA  CATCATTTCT AATGCAATGT CAGCCATAGC TCGATATTCA GCTTCAATGC TAAATCAAGA AACCACATTA TGCTTTTTGC TTCTCCAAGT GATCAAGTTT CTGCCAAGGT AAGAATGATC 
TCCCCATTTA TTGTATTCAA TGCAAAAATT TAATATCTAT TCATAGAATA TAATATAAGC TCGAGATGTA TATATTACCT 

Retrieve as FASTA  
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTCAG TGCGAGGTAG TGGTCTCTTT CTAGTTCTTC TTCTGGGTAT GTGTATGGAG TTGGGTGCAG TGAAAAAAGA CTGTTTTTTG GGTGGGGAGT TTGGGTGGTC GTTGGAGTTC  GACGTTTACC GGAGCACCTG CCCGGCGGCG GAGGAGATAA TCTTCGCCGG AGTGCAGCGG GCAGTCGCCG GCGATTCTCG CATGGCAGCT TCCCTCCTCC GTCTCCACTT CCATGACTGC  TTCGTCAACG TAGAGCCTCT TAATCTTCCA TTATCTTTCT ATCTTTTTAT GGCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCCCCCC CGAGACTGCT TCGCCAACGT TGAGCACGCT AATCTCCCAT  TCTCCTTTTT TTCTATGTAT TTTTATGATC TCTCTCTCTC TTCACGACTG CTTCGTCAAC TTTTTGCACT GTCTTCCGTT ATCTTTCTAT TTTTCTTGGG TTCGTCTGCT CTCTCTCTCT  CTCTCTCTCT CTCTCTCTCC CCCCGTCAAT GCCGAGCATC TTAATCTTCC ATTATCTTTC TATGGTTTTT TCTGATCTCT CTCTCTTCCC CGACTGTTCC GTCGAAGTTC AGCATCTCAA  TCTTCCATCC TCTTCCTCTC TTTTCTTAAA TTTTTCCAAT CTTTCTCTCT CCTCACGACA GCTCCAACGT TAAACCCAAA CCTTCCATTA TCTCTCCATC TTTCCACCAT TCTTCTTCAT  CTCTGCCTCC TCCACTCGTC CTCCGTCGAC TTGAACCATC TCAATCTTCC GCCATCTCTC TATCACTCTA CCTGTCTAGG GTTTTCTCTG ATCTCTATCT TCTCTCTAGG GCTGCGACGG  CTCCGTTCTT CTGGACGACT CTCCATCCTT CACCGGAGAG AAATCCGCCG CTCCAAACGC CAACTCCCTG AGAGGCTTCG AAGTCATCGA CGCCATTAAA ATGGAGCTCG AAGCTATCTG  CCCGGAGACC GTTTCGTGCG CTGACATTCT CGCTGTCTCT GCAAGAGACG CCGTTGCACT GGTGAAAAGT CAACCCTTGA CTCGACTTGA CTTTCTTTAT TCACTAGCGT TGACTTTGGT  GTGGGTACGT GGCAAAGTCT GGTGGACCCG CGTGGGACGT GGAGCTAGGG AGAAGGGACA GTTTGACCGC CAGCAAAGCA GCTGCTAACA AGGACATTCC GTCGCCCACC TCTGGTGTGA  AGACCCTCGT TGACCAGTTC AAGGGTTTGG GCTTCTCTCC AAGGGACATG GTTGCCCTCT CAGGTCAAAC TCATTGGTCA AACTCATTTT CATTTTTTTC ATTTTTTTTA AAACCCAAGA  AGAAAAATAT CATCATCTAT CTACTAAAAC ATTTCATTAG TCTACCATAT CATGTTCTTT AGAAATTCAT AGAATTTGTT CCTAAGTTTA GACCTAAAAA AGCCCAATTT ACTAGACAAA  TAGTGCTAAT TGCAAGTATG ATTTTTCTTC CAAATGATTT AGGATACCAT CATGGTCATC ATCTTGTTCT TCAGAAATTG ATAGAGAATC TTCTCATATT TTGATCCAAG AAGGCAATAA  GTCTATGGGA GATAGGCCAT GCTCATTGCA TATTTTGTTT GCTTCAAATG GTTTAGGTTA TCATCATGGT CAACATCTTG TTCTTCAGGA ATTGATAAAG GATCTTCTTA CATTTTGAAT  CCAACAAGGC TATATTTATA TAGATGATAG GCCATGCTGA TTGCAAGTGT AGTTTTCTCC AATGGTTTAG GATGTGATCA TGTTCATCAT CTTGTTCTTC AGAAATTTAT AGAGAATCTT  CTTACATAAT TTTATAAATG ATAGGTCATC CCGATAGCGA GTATAATTTT ATCCTTCAAT GGTTAGAATG TGATCATGTT CATCACCTTG TTCTTTGGAG TTTAATAGAA AATATTCTTA  AATTTTGATC CGACAAGGTT ATATTTCCAT AGATGATAGG CCATGCTGAT TGCAAGTATA ATTGTCTCCT TCAATGATCA GGATGTCATC ATGTTCATTG TCTCGGTCTT CAAAAATTGA  TAGAGAATAT TCTTACATTT TGATCCAACA AAGTTATATT TCCATATATG ACAGGCCATG ATGCTTGCAA GTATAATTGT ATCCTTCAAT GGTCAGGATG TCATCATGTT CATCATGATA  TGCCATTTGC ATCTTAGTAT TTATAAATTC ATTGAAAATA TTATTTGTAG AAATGATTTA ATTACTTTAT GATAACCCTT TTAATTGAAC CTATAATTAT TGACTTTCAA CTTTTGTGTA  TAGAATCATA TTTATTGAAG TTAGAGCTAA CAAGTCTCTA TTGACTAGAT GATAATACAT AGTAATTGAA TTTATAATTA TTGCCTTTAA TTTTTTTAGG TATCAAAATG TTCAACATTT  TGTTCTTCAA AAACTCAGAA AAAAAATGCT TTTATTCACT ATATAATGAA GCATTATAAA TTTATATATA ACATAAATTT TGGCCTTTAA ATGGTTTAAG ATGTTACCAA AGTCATCCTC  TTTATGTTTT TAATATTCCC CTATTAGAGA ATCCACTAAG AAAAAAATCT TTTACCCTTA AAACCTAATT GCAGGAGGGC ACACGATAGG TAATGCCAAG TGCAGCTCAT TCAGTTCAAG  GCTGAAGGGA CTCTCTTCAG GCATCGTCTC TAGCACCAAT GAATTAGGGT TTTTGGTCTC TTTGCAGCAG CTTTGTGAAT CAGGAAACTC AACAGCAACG ACACAATTGG ATCTTGTTAC  TCCAGCAAGT TTTGATAACC AGTACTACGT AAATCTTCTC AATGGAGTTG GGTTACTTGC TTCGGACCAG GTGCTTGTTA ATGGAGGAGA TAGCCAGATC TTTGAGATAG TGAAAAGCTA  TGCAGAGAAT CCTATGATCT TCTTCCAGGA CTTCAAGGCA GCCATGGTTA AGATGGGCAG GCTTGGGGCT CCGAGTGGGA GTGATGGGGA AGTTAGAAGG AACTGCAGGG TCGTGAATTG 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTCAG TGCGAGGTAG TGGTCTCTTT CTAGTTCTTC TTCTGGGTAT GTGTATGGAG TTGGGTGCAG TGAAAAAAGA CTGTTTTTTG GGTGGGGAGT TTGGGTGGTC GTTGGAGTTC  GACGTTTACC GGAGCACCTG CCCGGCGGCG GAGGAGATAA TCTTCGCCGG AGTGCAGCGG GCAGTCGCCG GCGATTCTCG CATGGCAGCT TCCCTCCTCC GTCTCCACTT CCATGACTGC  TTCGTCAACG GCTGCGACGG CTCCGTTCTT CTGGACGACT CTCCATCCTT CACCGGAGAG AAATCCGCCG CTCCAAACGC CAACTCCCTG AGAGGCTTCG AAGTCATCGA CGCCATTAAA  ATGGAGCTCG AAGCTATCTG CCCGGAGACC GTTTCGTGCG CTGACATTCT CGCTGTCTCT GCAAGAGACG CCGTTGCACT GTCTGGTGGA CCCGCGTGGG ACGTGGAGCT AGGGAGAAGG  GACAGTTTGA CCGCCAGCAA AGCAGCTGCT AACAAGGACA TTCCGTCGCC CACCTCTGGT GTGAAGACCC TCGTTGACCA GTTCAAGGGT TTGGGCTTCT CTCCAAGGGA CATGGTTGCC  CTCTCAGGAG GGCACACGAT AGGTAATGCC AAGTGCAGCT CATTCAGTTC AAGGCTGAAG GGACTCTCTT CAGGCATCGT CTCTAGCACC AATGAATTAG GGTTTTTGGT CTCTTTGCAG  CAGCTTTGTG AATCAGGAAA CTCAACAGCA ACGACACAAT TGGATCTTGT TACTCCAGCA AGTTTTGATA ACCAGTACTA CGTAAATCTT CTCAATGGAG TTGGGTTACT TGCTTCGGAC  CAGGTGCTTG TTAATGGAGG AGATAGCCAG ATCTTTGAGA TAGTGAAAAG CTATGCAGAG AATCCTATGA TCTTCTTCCA GGACTTCAAG GCAGCCATGG TTAAGATGGG CAGGCTTGGG 
GCTCCGAGTG GGAGTGATGG GGAAGTTAGA AGGAACTGCA GGGTCGTGAA TTGA 

Retrieve as FASTA