Entry information : LminPrx98(Lemmin39g0759140.t1)
Entry ID 18896
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx98(Lemmin39g0759140.t1)
Name LminPrx98(Lemmin39g0759140.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx165]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx98
start..stop
S start..stop
LminPrx99 659 0 1..324 1..324
LminPrx64 596 0 1..323 1..323
LminPrx63 596 0 1..323 1..323
LminPrx62 586 0 1..323 1..323
Literature and cross-references LminPrx98(Lemmin39g0759140.t1)
Protein sequence: LminPrx98(Lemmin39g0759140.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   325 (301)
PWM (Da):   %s   34696.29 (32241.0)  
PI (pH):   %s   7.43 (7.47) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-325
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSPAMWGCCV LLLLTLQVAS PVAASHSLKV GFYEKSCPRA EHIVREVVGR AVAANAGIGA GLIRLHFHDC FVRGCDASVL LQGDDSERMH PANFNSLRGF EVVDEAKAAL ESRCPNTVSC  ADVLAFAARD AAEFTGGFSY KVPSGRRDGR VSIKSDADAL PGFSADAQTL ADNFKEQGLS LKDMVALSGA HSLGISHCPT FSGRLYSFNA THPQDPSMNA DLADYLKKRC PSPGTEPNSV 
PLDVATPNLL DVQYYRNLKK GKGILTSDQT LWDSSLTAGM VESFAKKPNV WAKSYAKAMV RMGAIDVLTG NEGEIRVKCS VVNDH 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGAAGAGAGA GGGAGCTCCG GAGAGCTCTA GAGAAAGAGA GAGAAAAAAA ACTTGTACTC TTGAATAGAT GATTGCTAAA GGATTTGAAT TACATGATGT TTGGGGGTTT TTATAAGGGA  GTTAGTTGGA AAGTTGCCGT GTGATCAAAT TACGGAAGGC GGTAAATTAG TCGAACACAT AGAGAATTAA TGCGGTTACA ACGTTTATTT GTTCCTCTTC ATGCTTGTCT TTGATTGGTC  CGATACCTTC TTTTAATCTG ATTAGTTGCC GCTGGTCCTT TTATTTCTTC ACTTGAATCA GGGTTTACTC CGTGTTGACT CTAGGCTTGA CTCGGAATCC GCAGGTGTTC AATCATTTGC  TTCAATACTC CTCCCCCAAG CACAACGTTG GTAGAACGTT GAGCTTCGAT TTAAGATGAA GGAATCGATG TTCGGGCAGA GCTTTAGTTA AAATGTCTGC AAGTTGATCC TTTGTCGATA  GGTAGGGATC GGAATCCGAC GTCCGGCGTC CGTCGTCCGG TCCGGTCCAG CAGCTGTCGG TCAACGAAAG CTGACGTCGG ACTCGGACGT CAGACTAGCC TACCGGACAA TCCGGTCCGG  TCGGGATTCT TAGCGCCTGC ATGTTTCAAT CAAGATAATA GAAAAGAAGA ACGACTTCGA CTTTTCTGTC TCAATCTCAG TCTGTCTCTT TATCTGTCTC TGCATATCTC TCTATCTCTC  GCTCTCTCTA TCTCTCGCTC TCTCTCTCTC TCTCTTACTA AATTTTCAGG GAAGATTCTT CTCGATGACT ATTTCTAATG ACCGGCTACA TTCCTGCTTC AACCCGGGAA ATTTTCATTC  GTCTGGACTA GAAAAGCTTA AGATGAAATA GGGACATCAC TCAAAAAGAA AATCATCGAA AAGAAGAGCA CCTTATACTA TTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTAT  CACTGTCAAT GAGTCTGTCT CAGTCTCTGT CTACGTCTCT CTCCGACTGG ACGGAACAAT AAAAATATGA ATTTTAAAGA CGAGTCATCC ATTCCTTGGC CCGTTTTATA TTTTTATAGG  TCCGACCACT GAGTATTTCC GACTCTGTCC TTAGAAAAAG TCATCGAGAA GAATTTTCCC GGAAGATCTA GTGAGAGAGA GAGACACACG CACATAGAAA CAGGGAGACA GTAAGAGAGA  GAGTAGACAG AGACCGAGAC AGACTCAGAG ACAGCGATAG AGATAGAGAA AACCTGAGAA AGAGAGAGAG ATTTAAAAGC CAATTTTGTG GGAGATAGAC TGCGGCAGGA GGGAAGGAGA  TATAGAGAGC ACGAGTCCGA AAATGTCTCC GTGTGTTACG AGGCAGCATC CTGCATCCAT TACCCTGAAT CTCTTGTACC TGCATTCTCT CTGGAAAATG CTCTGGTATG ATAAAGCAAG  AAAGAGGATC GCGGATGGTG CTGATGCTGT CGATGGGATA AAATGATTCG AAATATCCGC GATTTGTACC ATTCGACGAA AGCCGGGTGA GGTATTAGCT GCCTAATAGT ATATCGACGA  AGACAGCAAT CAACGAAGGC ATGTTCATAA GATGATTGGA TAGAACATCA TTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT GAATATTCCT AGAGTGCATT  ATCCATTCCA AATATTTCCG ACTGCTACGT TTTCTTAGGT CAAGAAACGA AGGCCAACGG AATAGGTCAG CTTCATGGCG CCTGCACGTT TCAATAATTC TGGTTGGTGG AGAACCCATC  GACCAAGTCC CATACGTCTA TCATTCCTGG ATCCCCTATA AATAAGGACC ATTCTAAAGG AGGCCTCCTC ATCTCGCAGC TTCGACCCCT CCTGAACCAA CCTTCTTCTC CGAGCTCATC 
CAGCCTCTGT CAACCCCTTT CCCCAGCCAT CATTCTTCCC GAGAGACGGC AGAAATAGGC CTGAGAAGGA ACGCGGACCA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCCCCCAGC GAAAGTCCAT CATGTCCTTT CATTCATGTT AAGTAAATCA CATGAAATGT ACGATCATCT GGAAAAATAA AATACTTCAG CAAAAAATAT ATGAAAATAC GTGAAATAGT  ATACAAATAT TATTTATTTA AATTATATAA TTCCAAAAAA TAATATTAGA ACATATATCC AATACTAACA AGAGAAAATG ACTAATTATG TTACGTGACC GGTCAGTGCC TCCGAGAGAT  AGAAGATTCC CCCAAGAACT GAAGAACCTG CCAAAATTGG AAATGAATGA TTCTCTCTCT AGAGTAAACG CCAATTCCTA GTCTCCTAGA GATCCGGATT CCATTACTGA TTACTATATT  AACTTATGAG ATTTTAAACC CTTAATGTGC TTCTATTTTA ATCAAGTTTT TGGGATAAAA ATACAGTGAA AGTGTCCTTC ATATATGTGC ATACAAACTC ATACTTCTCG GTTTATTATT  GAAGAGAGTT GGTGCAAAAG GACAGTATCA TAAATGTTCT ATATATATGT AGAGAGCCGA GAGTTTAAGA TATGTCCAAG CACCGTGTCC TGCGCCGACG TAAGAGATGC TCTTCTTGTC  GAGCATCGTG GGACATCAAA TTATCTGCAA GGAATAGCAT TATCTGATCT GACTCATGTG ATGAGTACGG TTGATCATGT GGCCATCGAT GTAGAGACAC CAAGGATAGA TAGTGGGTGC  ACTTTGGAGA AAGAGTTCAC TGAATGGATC TATATAAATC CCTGAATGGT ATTATACCTA ACTGTCAATC AAGTGGATTC AAGTCACAGT CGTGTAAGCG ATCCTTAAGG CCTATGACAT  CAAAGACATC CTGTGGAAGG ATGATCGTGT TTGACTACGA CTTATGAATC CCTAGACAGG GGATATCCAA AATGTCATAG ATTGGATACG AAATGAAGTC CTCGAAGGTG ATTGAGTGGT  CAAGATGCGA TCATCCGCCC TCGATATAAG AGGAGATTGA CTCGAGGAAT GAGATGTAGT TAAATCCTTG GTCAAGGTGA AAGAGTTCTC GTTGATTTCA TCCACTTATC AATACTAACC  AGAATGACCT ATTAGGGTAT GACGGTAAAC CATACCCCAA GTCATTTGGA AGTCTCGAAC GAATGAAGGA TTATACATAC ACGGTAACCG ATGACAAAAA GGTTCAATAA GAGAGTTCCT  ACACGTTGAC ATGACCCCAG CTGGTTGGTG CCGCGTATGA CGCAACGGCC AGCGCAACAA CCAGCTGGCT GGGCCGCCCA ATGCGACATG GCAACATAGG CGACACTGAC GTGGTGGCCT  AGCTATCACT AACGTGGTGG CATGGCCGTC ACTGACGTGG CGACCTGAGC CGACGCCAGC TGGGCGGGCC CGCGCTAACG TGGTGGCCAT TGGGCCATTC GGCCCAATTA GAATATAGTT  TAATTAACTA TATTCCAAAT TTAAATAGGC ATTTAAAAAT TCCAGAAAAA TTCAAAAAAA TTAGGAAAAA TATATTTTCT CATTATTGAG CCAAATATGT TTAATTTTAA ATTATTTGAT  ATCATTTAAA TGAGAAATTT ATTTCTTTTG GAATTATTGA ATGGAATAAT TTAAGATTTA AACTATTTTA AATTCAAATA AAATCCTTTA ATCATTATAA AGTGTTTAAA TGATTATTTC  TTGATTTTGA GCATGATGAT CATGTTTAAT TTTGCATTAA ATTGATGTGA TTGATTTTTG CAATGAATTA TAATTATTTA AATAATTGAT AAGTACAAAA TTAGGGTTTT AATATGTCGC  TGTTTAGGGC ATTTCAGACT TATACATTAA AATTTATAGT ATCACCTTAA ACGCAAAATA ACATGTATAG AGCGAGCAAT GGGTCGAACC ACAGGGAAAT TGGTTAATCA ATCCGACGTT 
TAATTTCAAT AAAAGAGGGA CGAGAGAAGA CCGAAGTGAG AGTGAATTAA GATGAGAAGA TTAGAGTGAA GAAAGAAAGA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGCCGG CTATGTGGGG ATGCTGCGTT TTGCTTCTGC TGACCCTCCA GGTCGCTTCT CCTGTGGCTG CCTCTCATTC TCTCAAGGTG GGCTTCTACG AGAAGAGCTG CCCCCGGGCC  GAGCACATCG TCAGAGAAGT CGTGGGCAGA GCCGTTGCGG CCAACGCAGG GATAGGCGCA GGACTCATCA GGCTGCACTT CCACGACTGC TTCGTCAGGG TAACCTACTC GTCCCTGAGC  TTCTCTCCTA GCTCACTAGC TCGCCCCTTT GTCCTCCACC ATTTGAGCAT ATTCCCATTA AAATGATACC CTTTCCTTGA TCAGATATCT GAATCTTAAT AAATGCTGTT GTGCTGAAAC  AGGGCTGCGA CGCTTCGGTT CTCCTCCAGG GCGACGACTC TGAGAGAATG CACCCTGCCA ACTTCAACAG CCTTCGGGGT TTCGAGGTGG TCGACGAGGC TAAGGCTGCG CTGGAGTCTC  GATGCCCGAA CACCGTGTCC TGCGCCGACG TCCTGGCCTT TGCCGCTCGC GATGCCGCCG AGTTCACCGG CGGCTTCAGT TACAAGGTGC CCTCGGGGAG ACGCGACGGG AGGGTATCGA  TCAAATCCGA CGCCGACGCC CTTCCGGGGT TCTCCGCCGA CGCCCAGACC CTCGCCGACA ACTTCAAGGA GCAAGGGCTG TCTCTGAAAG ACATGGTGGC CCTCTCCGGC GCTCACTCTC  TCGGCATCTC CCACTGCCCG ACCTTCTCCG GCAGGCTCTA TAGCTTCAAC GCCACCCACC CGCAGGATCC CTCCATGAAC GCCGACCTCG CAGACTACCT GAAGAAGCGC TGCCCGTCTC  CCGGGACCGA ACCTAATTCC GTTCCGCTTG ACGTCGCCAC TCCTAATCTC CTCGACGTCC AATACTACAG AAACCTGAAG AAAGGGAAGG GGATCCTCAC CTCTGACCAG ACTCTCTGGG  ACAGCTCTCT CACCGCGGGC ATGGTGGAAT CCTTCGCCAA GAAGCCCAAT GTTTGGGCCA AGAGCTACGC CAAAGCCATG GTGCGGATGG GCGCAATCGA CGTCTTGACT GGAAACGAGG 
GCGAGATAAG GGTCAAATGC TCTGTCGTGA ATGACCACTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGCCGG CTATGTGGGG ATGCTGCGTT TTGCTTCTGC TGACCCTCCA GGTCGCTTCT CCTGTGGCTG CCTCTCATTC TCTCAAGGTG GGCTTCTACG AGAAGAGCTG CCCCCGGGCC  GAGCACATCG TCAGAGAAGT CGTGGGCAGA GCCGTTGCGG CCAACGCAGG GATAGGCGCA GGACTCATCA GGCTGCACTT CCACGACTGC TTCGTCAGGG GCTGCGACGC TTCGGTTCTC  CTCCAGGGCG ACGACTCTGA GAGAATGCAC CCTGCCAACT TCAACAGCCT TCGGGGTTTC GAGGTGGTCG ACGAGGCTAA GGCTGCGCTG GAGTCTCGAT GCCCGAACAC CGTGTCCTGC  GCCGACGTCC TGGCCTTTGC CGCTCGCGAT GCCGCCGAGT TCACCGGCGG CTTCAGTTAC AAGGTGCCCT CGGGGAGACG CGACGGGAGG GTATCGATCA AATCCGACGC CGACGCCCTT  CCGGGGTTCT CCGCCGACGC CCAGACCCTC GCCGACAACT TCAAGGAGCA AGGGCTGTCT CTGAAAGACA TGGTGGCCCT CTCCGGCGCT CACTCTCTCG GCATCTCCCA CTGCCCGACC  TTCTCCGGCA GGCTCTATAG CTTCAACGCC ACCCACCCGC AGGATCCCTC CATGAACGCC GACCTCGCAG ACTACCTGAA GAAGCGCTGC CCGTCTCCCG GGACCGAACC TAATTCCGTT  CCGCTTGACG TCGCCACTCC TAATCTCCTC GACGTCCAAT ACTACAGAAA CCTGAAGAAA GGGAAGGGGA TCCTCACCTC TGACCAGACT CTCTGGGACA GCTCTCTCAC CGCGGGCATG  GTGGAATCCT TCGCCAAGAA GCCCAATGTT TGGGCCAAGA GCTACGCCAA AGCCATGGTG CGGATGGGCG CAATCGACGT CTTGACTGGA AACGAGGGCG AGATAAGGGT CAAATGCTCT 
GTCGTGAATG ACCACTGA 

Retrieve as FASTA