Entry information : LminAPx04(Lemmin5g0142180.t1)
Entry ID 18907
Creation 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminAPx04(Lemmin5g0142180.t1)
Name LminAPx04(Lemmin5g0142180.t1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2004]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminAPx04
start..stop
S start..stop
SpolAPx05 545 0 38..347 23..332
CescAPx02 520 0 1..347 1..348
PnodAPx14 513 0 1..347 1..344
PotacuAPx04 509 0 1..347 1..344
Literature and cross-references LminAPx04(Lemmin5g0142180.t1)
Protein sequence: LminAPx04(Lemmin5g0142180.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   347
PWM (Da):   %s   37768.76  
PI (pH):   %s   8.59
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVSYLSTLP SLRPLSLQLH PSLLPTSQTT NVSTVSSLRT ENRSSGIPSF GRREALKCVG AVLGLEILSS SGPFPQSATA ADLIQRRQRS EFLSFIKDVL AKAIKEHQEL FPSLLTLALN  DALTYDKGTK SGGPNGSIRL SSEISRPENS GLLAAVSLLE EVKKEIDAFS KGGPISYADL IQLAAQSAAK KTFMDSAIRK CGGKEEKGRI LYTAYGSTGQ WGLFDRQFGR IDSQEPDPEG 
RIPQWDKASV QDMKAKFVAV GLGPRQLAVM SAFLGPDQLA TESLLASDPE VRPWVEKYQR SRETVSQTDY EVDLITTLTK LSTLGQTINY EAYSYPVQRI ELGKLKL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGTGGGA GAGAGAAAAA GAGCAGCAGA GGGAGTAAGG GAGAGAGAGA AAGAGCGGTA GAGGGAGTGA GGGGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG  AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGCA AGAATTTCTA GAAAAAGAGA CTTGTGGGCT TTACGTACGC AATGGAGGGT TAATGAGGAT  TAAGGAAATT ATAAATCGGG AAAAGCGAGA TGTTGACACA CTGCGAAACA TGTGTTCACA TTTACATTGA ACTCGAATAA TCCATCACCA AAATTATAGG TTTTACTGAA CCATAACCAA  ACAATACCGA CACCGTCACT TAATCGAATT TAGGTATAGG TTTAGGTTTC TACAGCAAAC TAGTACTGAC ACTAGAACCA TAGAACCCTA AGAGAGAGAG AGACATGTTT GAATTGAATG  GAGCACTCAA GTTCAGAAGT CTAAACTTTA AAATAAAATA AAGCTTAAGA TGTGTTAGAA GATATATTGG CCCGCTAGTC ACTAAGGCTC ACTAAGGGTT CATTCTCTCT CACTCTAACT  CTCCATCTCC ACGTATGTAT TCATCCCCCC TAACTCTTCA CCTTCGTCTT CTGATATCAT TGTCTTGTTC CCCCACCCTT TATAAAGGGC AGAAGAATCA TGTAATCCTC ATCCACTATC  ATCTCATCTA TCTATCATCT TATTCTTGTC AACAATATGT TCATGCAAAA ATAGAGTTAA TTAGAGAACT ATTATATTCA TGCGAATGAA CAAAAACTAT CATAAAATAA ATCATGTTGT  GGCTCGTGCG TCTTTGAAAC CACAATACCA ATTTCATTGT GTTGAAATTT TATCATAAGC TACATTAGAG CATGGGCTGA AAATTTATTT GCAAACATTT ACAAAGATCA TGGAAGATCA  AATATATCAA GAGACGAGAG GTTTGAATTT TATCAATTGT TCATTAGTTG ACACTTAAAA ATAAAACAAA CTTTGATATG CTCATGCTAA CAGAGTATTT GTGCATCAAT TTCTCATACT  ATTTGTAAAA AATGACATTT GTAGAAGATA TGAAAATTGG GGGCACAGGA AAAAAATTGA TAAATTTAGA GGAGGAGAGG AGATAATCAG AGAATGAGTG AGAGAGAGAG ATGCAAATAG  AGATGAGAGA GAGATAATAA ACATACCTCA TTATCATCAA AATCTTCCAC TGGCATTCTG CATCTCTGGC ATATCTAGAC AATGGGAGTG GCAGTTGCAT TGGTGGTGGC ATGCCGCAGC  GGTGGCGGTG TTGGAGTGGT GGATGGTCAA AGAAGGGGAG TCAATGAGAA AGGAGAGAGA AATAGGAAAT GTGATTAGGT AGTTAGGTGA ATATGAAAAG AGAGAATTTG GAGACGAAAA  AGGCTCTGAT CAACATTGAG AAGGCTCAGA ACAAAATGAA TCCTTATGAG AGACGACTAT GATCGATCGG TAGCCGTCCG GAAGGAGATT TGGCTTGATC GTGCGATCTG ACAATCACGA  CCGACGACCT CTTAACCCTA CCGTGCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCCTTC TCCCATTAGA GGGAACAAAC TCTCTTTATG AAATTTTCAC GGCATTAAAT TGAGAGCTCT AGCTAGCTAA  AATATCCATA AATTTTCATT TCCATCAAAT ATAAGGTTCC CAAAAATAAT TTTTATAATG TTTTTTGTAT ATAATTAATA TTAAATAAAT ACTGGATTCG AAAATCTTTT TGGGCCTATT  TTTTATGGGC ATAAAAATCT TTTCCCGCGT GGATATCCTG CAGATAACGT CCATATCTCT CGAACCCCAC TCGTCCGCCA CGTCGCGAAT GGACCTCCTC CTCCTCCAGT CCTCTCTCTC 
TGTCTCTCTG TCTCTCTCTT CGTGTATTCT TCCACCTCGC TGACAGGCAG AAGAGAGAGA AAGATAGTGG AGAGCTTGCC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATGATGAT GTGTGGGTTT CCGAAAGGTG GCGATTTTTT GTGGGCGGGA AGGTTGAATG GATTCCATGT TCTCATCACC ACCTTTCCCT GCCGGCAACC AGAGTTTCTC TCTCTGATTC  CCCCCCTTTC AAGTGACATT TTAGTCAATG AATTATATAT AAACCCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTTCATT ACTCCCTCTC TCATCAATAA TTGGCAGCAA ATCGGATTAA  ATTTTTAAGG AGAAGATGAA AGGCAAAAAT TTAAATAGTC AATGAGAAAA AAAGAACGAT TAATAATCCC CCAAGAGTGA GAGAGAGAGA GAGATCTCAC CGAGACTTTG GAGAAATAAC  TGAAAGCCCG CCCATGAAAG GCCTCAGAGG CTCAGGAATC AGAACAGAGC CATCTTTTTG CTGGAAGCTT TCAAGCAGAC ATAAAATCAT GCGAGGAACT GCACAAGCAG TGGCATTCAG  CGTGTGGACG AACTGGGTTG GCGCTGTGCT GGTCCCCTTG CCCTTCTTTG CACTCGCCGA GTCCTGATCC ACTGACAAAC TTGGCCGGTA GCGGATACCC AATCGACGGC TCTGATAATC  CGTGCAGTTT GAGGCACTCG ATATCTGCCA CACGTATAAT TACATTGTTA TTTCCTCTAT GCTTACGCTG CCAAGGCTTG CTTTCTTCGT TGGATTCATA GATCAAATTG CTGACAAATT  AGGGTTTCCA TTATTGCAAT ATAGCAACTT ATATGAGACA TTACTATACG ATATTAGATG GGTTCCAATT TTATCGGATG TTCCAATTTT ATCGCATATT AGATGGGTTC CAATTTCTAG  ATTATTTCAA ATCTCAGAAC CACATTAAAT ATCCAATAAA TAACCTTTTT GTTAACATAC CTCGCCATAA CGCCCCAGAC CTGGCATCCA TGCTTCGACA TCGAATTTGC GGTATGCGGG  CGCCCCTAAG TCCTCCGATG CCATTTCTAA GGTCCTGATT TGGATGAAAT TTCCAAGGAT GTGAGAGATA ATGTCAAGGA AAGAAGAGGG GATGCGTATA TAATTACTTG AAGTGCAGTC  CGAGGGATGC GAATAGCTCC TCCTCGATTC CAATAAGCTC TTCATGGAAA CGGTCGCTGT CCTCAGGACG ACAGAGGATG AACATCTCCA CCTTGCTGAA CTGATGCACT CGATAGAGCC  CTCTGCCCAT GGATGTCAAA AAAATTGAAT AATTAATTAA GAGTTAGAGT GAAGCGACAT GAATTTCATG TTTGTGTTTG ACCCCCATTT GGGCACATTA AAGGAGGCAC CAGAGACCTA  GGGGATAGAC AAAAACCCAA GTTTAGCAGG GGCTTAATTT GCAAAATGTT CCTAGACTTA GGTATCGATG AGATCATTAT CAAGTGAGAC GAGGTTGGGC AGAATCACTC TGACCTGCTT  GGACTACTGT TCTGTTTCTT GAATTTCTGT AACTGCTTTT CTTGAAGAGC TACACTTCTT GATTGCTGAT GATAGAAGTC TATCATTTTT CAAGCTAGCT ACCAAAATAA AACCTTATTT  TTGTCTGTAT TTAGAGTTTG ATACGTCAGT GAATTTTTTC AAGGCAAAAG TCCTGATTTC TCCAATTCTT GACATCCAGA AATAAAAAAA CGGTTTGTAC TCGCAAAAGT TTAAACAGTC  AACGTACCTC GTCGCAGTCC CGGCAGCGCC GGCCTCTGTC CTGAAGCAGT GCGAATAGGC TACATACTTC AAGGGCAAAG AAGAGTCGGG GATAATTGAA TCCATATGGA TACCGCCGAC  AGGAATCTCT GCTGTTCCAA TGAGGCACTG ATCACTTCCT TCGATGGAGT AAACCTGTTC ACAAAAAAAT TAAATGTGTA GATTGAATGA TTTTGTTTTT AAGGATTTCA CAGACTCACA 
TCCTAAGCAG GTGTAAACTA GTAAAAGTAG ACCAAAGAGA AATACTCGAC CAGTCTTTTA AGTGAGTTTC TGTGGAGATC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGTGT CTTATCTCTC CACTTTGCCT TCCCTCCGTC CGCTCTCGCT CCAGCTTCAT CCCTCCCTTC TACCGACGAG CCAGACCACA AATGTAAGAC GCGGATGCCT TTTCCTCGAC  ATCCGCTTCT CTCGATCCTC ATTCCTGCTT CGCTAACTTG CAGAGCTCTT TCAGGTGTCG ACAGTTTCTT CTCTCCGAAC CGAGAATCGT TCTTCCGGAA TCCCTTCCTT CGGCAGGCGA  GAAGCTCTAA AATGCGTCGG CGCTGTTCTA GGCCTGGTAC GATTCTTCTT CTCCGATCTC GCATCAACCT AAATGTCCTC GATTCTTCTT CTCCGATTCT TCTTGAAGCT TCATAGATCT  TCATTTTAGA TCTGAACAGA TTTTTCTTCG CGTGCAGGAG ATTTTGTCAA GCTCGGGACC GTTCCCTCAG TCGGCGACCG CAGCGGATCT GATTCAGAGA AGACAACGCT CGGAATTTCT  ATGTAATTTG GAGGATAATC CCGATCTTTT TAAGTCCGAA AATTATCGCC TAAAATTGAC TATATGAATT CGGTCTCCAT TTACAGCCTT CATCAAAGAT GTTCTTGCAA AAGCCATCAA  GGTATGTAGA TGATAGACCA TCAACATCAC CATCAAGGCA TGTTCTAACG ATCTTGCCGC CTCTTTCCAC TCCAAGGAGC ATCAAGAACT TTTCCCATCA CTGCTCACTC TCGCACTAAA  TGATGCCCTA ACATACGATA AGGTCAGATC ATTCCACAAT TCTTCAATTT AGTAGCTATA TTTTGATGTT TTGGCCATCA AATTTCTCCT AGAAATTCTC CTGTTTTACT GCTGATAGAT  TAAGGTGATA ATCTAGGGCA CAAAATCTGG AGGACCCAAC GGATCGATCA GACTCAGGTA CTTGTTCTTC AAAAAGATGT GCTATTATCC TTAGCTCAAA ATTTTCAAAC CTGGGCATAT  TCTCATGAAG CTCGGAGATC AGTAGACCTG AGAACAGCGG GCTTCTTGCT GCTGTAAGCC TTCTAGAGGA GGTGAAGAAG GAGATAGACG CCTTCTCCAA GGGAGGGCCT ATCTCTTATG  CAGATCTCAT TCAATTAGCG GGTAAAGTAC ATATCATGCC TCTTTCATGA TAATGTGATC ATTCTCTTTC ATGTTTTCTG ATTTTCTTTC ATTCATTGAA TCATGCCATG ACATCCTGAA  AGCATGCAAA AACCAAATAA TCCCCCAATT GATGGCCTAA TAAGGCCATC CCTTCTGATT GTTAGCCTAG TTTGAGACAT TCTCTGTACT TAGAACCTCC TTCATCCCGA ACTCCGGCTG  CATAACATAT TATATGAACA TACCACACAT CATATGTGCA TAACGTATGA ACATACCGCA CGCCATAGAA TGCCGCTTAG ACATTGCGTG AGGCACAAGG CATGGTGGAA GAGTCTCCAT  TAACGTCGAC GGCTTTGCAA TTTCCTGTTC AAATATGGCA ATCATGACAA CAGCTAGTTG AATTTTATGT CTTCAAAATA TTTTTTGTTT TCCCTAGAGT TGGCATTGAT AGAATTTTTT  TTTCTAACTT AAGATTTTTA ACGCTTGAAA TGCAATATAG CACAATCTGC GGCGAAGAAA ACATTCATGG ACTCTGCCAT TCGAAAATGT GGGGGAAAGG AAGAGAAAGG AAGGATACTA  TACACAGCTT ATGGTTCTAC TGGTCAGGTA TGTTTCTAGA ACCAACCCAT GGTTTTGGAC TAAGTTTTTT TTTTCATCAA GTGACATGGG TAAAACAGTA AAAGGATCAA CTCGCACTAT  TACTAGTTAG ATCTGGTGTT CTTCGCTCTT GTTAGATCTT GGTAGTAGAT CATTCTTTTT CCTCGCCACT ATTTTTAATA TCTAATTATC AGAAACATGG TGATTTTAAT TATTTACTTA  TTTTTTCTAT AGATTAAAAG GGCATAATCT TACTTGCTGC CCTATGTTAA CAGTGGGGCT TGTTCGACAG ACAATTTGGG CGGATTGATT CTCAAGAGCC CGATCCAGAA GGACGCATCC  CTCAGTGGGA TAAAGCATCC GTCCAAGATA TGAAAGCAAA GTTCGTCGCC GTCGGCTTGG GCCCTCGCCA GGTAATTTAA TACCTATATC AACCCTCTTC CATATATTTA TCTATTTATT  CTTCCAGTTA TAGATAAATA ACTGGTCTCG GTCTTTCTAG TTTGAAGTCA ACCTCGTTAG ATCTCCAATG AAAGGATTTT GCAATCCTTG ATCTCCAAGA GTTGTTCCTT TCAAATACAC  TAAAAATAGG GTCCTTTTTC TTGCTAAAAC CAAACCACTT TGATGGAATG TGATCTAGTC CCTGTCCAAG AAAATTGATA TCTCATCACT CTGAGCTGTT TTCTATAAAC AGTTAGCAGT  GATGTCAGCA TTCCTCGGCC CCGATCAACT GGCTACAGAG AGCTTGCTAG CATCAGACCC CGAAGTTCGT CCCTGGGTCG AAAAATATCA ACGAAGTCGA GAGACCGTGT CTCAGACTGA  TTACGAGGTG GGGAGATGTT TTTTGCCCTA ATTCGAGCCT CTTAGATCAT GCAAATAACG TGTTTGTTGT GTGGCAGGTG GATTTGATAA CAACTCTCAC CAAACTGAGT ACCCTTGGGC 
AGACGATCAA CTACGAAGCG TATTCCTATC CAGTGCAGAG GATCGAGCTG GGTAAGCTGA AACTCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGTGT CTTATCTCTC CACTTTGCCT TCCCTCCGTC CGCTCTCGCT CCAGCTTCAT CCCTCCCTTC TACCGACGAG CCAGACCACA AATGTGTCGA CAGTTTCTTC TCTCCGAACC  GAGAATCGTT CTTCCGGAAT CCCTTCCTTC GGCAGGCGAG AAGCTCTAAA ATGCGTCGGC GCTGTTCTAG GCCTGGAGAT TTTGTCAAGC TCGGGACCGT TCCCTCAGTC GGCGACCGCA  GCGGATCTGA TTCAGAGAAG ACAACGCTCG GAATTTCTAT CCTTCATCAA AGATGTTCTT GCAAAAGCCA TCAAGGAGCA TCAAGAACTT TTCCCATCAC TGCTCACTCT CGCACTAAAT  GATGCCCTAA CATACGATAA GGGCACAAAA TCTGGAGGAC CCAACGGATC GATCAGACTC AGCTCGGAGA TCAGTAGACC TGAGAACAGC GGGCTTCTTG CTGCTGTAAG CCTTCTAGAG  GAGGTGAAGA AGGAGATAGA CGCCTTCTCC AAGGGAGGGC CTATCTCTTA TGCAGATCTC ATTCAATTAG CGGCACAATC TGCGGCGAAG AAAACATTCA TGGACTCTGC CATTCGAAAA  TGTGGGGGAA AGGAAGAGAA AGGAAGGATA CTATACACAG CTTATGGTTC TACTGGTCAG TGGGGCTTGT TCGACAGACA ATTTGGGCGG ATTGATTCTC AAGAGCCCGA TCCAGAAGGA  CGCATCCCTC AGTGGGATAA AGCATCCGTC CAAGATATGA AAGCAAAGTT CGTCGCCGTC GGCTTGGGCC CTCGCCAGTT AGCAGTGATG TCAGCATTCC TCGGCCCCGA TCAACTGGCT  ACAGAGAGCT TGCTAGCATC AGACCCCGAA GTTCGTCCCT GGGTCGAAAA ATATCAACGA AGTCGAGAGA CCGTGTCTCA GACTGATTAC GAGGTGGATT TGATAACAAC TCTCACCAAA 
CTGAGTACCC TTGGGCAGAC GATCAACTAC GAAGCGTATT CCTATCCAGT GCAGAGGATC GAGCTGGGTA AGCTGAAACT CTAA 

Retrieve as FASTA