Entry information : LminRboh06(Lemmin24g0547760.t1)
Entry ID 18918
Creation 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminRboh06(Lemmin24g0547760.t1)
Name LminRboh06(Lemmin24g0547760.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminRboh06
start..stop
S start..stop
LminRboh07 2103 0 1..1035 1..1040
LminRboh04 1659 0 157..1035 16..892
CescRboh02 1289 0 181..1035 42..953
PnodRboh03 1225 0 190..1035 57..912
Literature and cross-references LminRboh06(Lemmin24g0547760.t1)
Protein sequence: LminRboh06(Lemmin24g0547760.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1035
PWM (Da):   %s   116260.33 Transmb domain:   %s   o449-466i479-501o562-581i609-631o657-679i715-734o
PI (pH):   %s   8.02
Sequence
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*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MILAKLRQAG LRKTWLCAPE YGCCPFSIVI KVTFVDKDGE EKEIKVPVGM SMLEAAHAND IELEGACEGS LACSTCHVIV MDVDYYNKME DPTDEENDML DLAFGLTQTS RLGCQIVAKP  ELDGMRLALP AATRNFAVDG FSAAAETAAP PVCSFPPAET VGIYDRLQGR MRTPSWRSSS RPAFSDDGGE MLEVMLELDM ESALVKGVSA AGENSFSQSS STESRIRRKF PWLWSPSSPR  RSSSDPAAMA ARDERRKQAR LERTKSGAQQ ALKGLRFIRN HSEALWEVVE SRFHALAMDN LLRREDFGEC IGMVDSEEFA MGIFDALARR RRQNLDRITI EELREFWLQI TDQSFDARLQ  IFFDMVDTNV DGRITREEVQ ELIVLSASAN KLSKLQEQAE EYAALIMEEL DPEDLGYIEI WQLEALLLQR DCYMNYSRPM SSASMGRSQN LAGGAAALVL LRLLLRRLRL SAQEHWQRAW  VLFLWFAAMG FLFIWKFAQY LHRPEFLVMG YCLPTAKGAA ETLKLNMALV LLPVCRNTLT WLRSTRARLF FPFDDNINFH KIIAAAIMAG ILLHAGNHLA CDFPRVINSS SEQYRSLVKD  FGRKKPTYGS FVGGVEGVTG ILMLALMAVS FTLATTWFRK SVVRLPPPLN RLTGFNAFWF SHHLLAIVYL LLIVHGFCMQ LVRRWYQKTT WMYVAAPLLL YLGERSLRTL RSEAFTVRIL  KVAVLPGSVL ILVMSKPLGF KYKSGQYIFL KCPAISPFEW HPFSITSAPD DGHLSVHIRT LGDWTQELRR VFTEANRGAI IGRATFSDAG SVPQNTVPRL LVDGPYGAPA QNYKSYDVLL  LVGLGIGATP FISVLRDLLN SIRAAEEQLE SSSCTDTSRS DDSGSSVNSL WGKKRAQKTS SAHFYWVTRE PGSFEWFKGI MNEVAEMDHK GVIEMHNYLT SVYEEGDARS TLLTMVQALN 
HAKHGVDIVS GTRVRTHFAR PNWSDVFARI ASRHPSATVG VFYCGAPALA KELKSLSQEL TRRTTTRFHF HKEYF 

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Remarks
Promoter
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CGCTCCACAG CCACACTCAC CGTCGACGAG CAGCAGCGGG GGTTTCCCTG GATGCCCTCC TCTCTGCTCG CACCGATCCG CCTAGACCGG TCCTGACCAA ACCGAACTGG CCGGTCCAGG  CTGAACTGGC CCAACACTAA ACGGTCAAGC AACTACCAAG CGAGTTGAGC ATGCCGCCAG GAATGCCATT TGCCCGCCCA GGCACTTATG CGGGTCGCCC GACGGCCCAG CCCTCCCAAC  GGACCTATGC GCCGTCTCGG CTCGGTCCAA CTCCTTTAGA GCGAGCCCAT GCTGGTCCAG GCAGGCCCAC TAGTCTTTAA AATATATCCA GCCGGTTTTT GCCGGCCCAA TAGGGCAATT  TGATCGGCCT GGCTGCTCCC CGGCGCTAGT GACCCCTTCG GCGCTGTCTC GACCCATCCC GCATCATTTG CTCCTCCCGA TGGCTTTCCC TTCGACCGCT TGTCCAACAC CACTCACAAA  GTCAACGGAG TCGAGTTCTC CCGACCTCGG GAGAATGATG GCGGATCATC CACCACGGTA CGACACGAGG AATTTTTGGA GGACAATGGT GTAATTATCT TTGCTTTTAT GTGTGAGTCG  GTCAGGTGGG CCAATGTGAG TCTGTATGGG CCAGCCTTCT CCTCAGGAAC TGTGTTGGGC CTCGACGAGA AAGGGATGGC CTAATTTCCA TTTCTTTATC TTTATTTTTG TGTTTTTTTT  CCTCCCTCTC TTTTTTGGAC CAAATTTTTT ATGCTCAATT AAGAGAGGGA AATTTAACTT GGAAAATGGG CCCATTAAGG ATCCCTCCTC TCCTAGGCCC ACTCGGGGGT CCTATAAAGA  ATCTAGGGTG GGACCCCCTA GATGTTTTTG GTATTTTTGA AGATTGGTTA TCGTTGACTC TCTCTCTCCC TCGCTCAGTG ACTTTTCCCC TTATGGGGCC CTCCTCCGGC GGACGCCGGC  TGCCATCACC AGTTTCCACT GAGGGAGATA GCCCACATTG TCGTTTGAAC GTGAAGAGGA GACCATCAGA GACGCCTACG ACGACTTCCC TCCACCCGAC GTCCTGCATC AAATTGATAT  TAGATCATCA TTTCATTGAT ATAGGAACGA GTCTTAGGGT ATCATCTTGC ATAAATAATC TTTATCATTG AGACTCTTAA GTTTCCCGAA CGAACCAAGC TAATTAAGAT TGACTACTAC  TACATTCGTG ACAAAGTGAT GTCTGACTTT ATCTCCACTC CCTATGTCAT TTCATCGCAC CAGCTCGTGA ACGTGTTCAC CAAGAGTCTC TTGTGGATCT CTTAGGCATG TTTGATCTAC  ATCTCCAACT TGCGGGGGAG TGTCCAAAGG TGTTATCAGA CTCTAGGCCC ATTAGGCCCA TTACTCTCTC TCTCTCTCTT CTAATATAAA ATTTTGTACC CATTTCTTGA TTCATTCCAT  TCAGGGGTTT CTCCCCTCTT GTGTCAACAA TAATAAAATA ATTGAGTGTT TTATATAAAG ATGTATTCCT CTGGGGTTGC AAACACTACA TAAGAAAAAA TTCTTCGAGG TTTACTTCCC  ATTCAAGTGG GAGCTTATGT TCTTAGGGCC AAGTGCACAG TGTTTCGCTT CTCATGGTCA CTCCATGAAT ACCCATACGG TCCAACATGT ACGTCTTATA TAGAATGGTT GAACATTTAA  TTATTACGTC ATTTATGGAT TTTTTTCTTC AAAAAGGGAG AGCTGGGCTG GCCCAACTTT AATGGGCCTA TTATGGGTTC TCCAGACTGG AATCTAGCCC ATTAACAACT TTCTCATCCC  CACCTCCCTC GAACGTCGCT GAGGCGGTGG TGTTCGGCGG AGATTTGAAA AGCCACTAAG CCCTAGAGCT CTGCTTGCCC GGCCAGTGGC CATCGCCGCC AGAGTTGCCA TCTGGTCCCC 
CTCTGCTCCG CTCTATCCTT CGAAGCTCGC TGGGTTTCCG TGTTTTTCGT CGCTCCTCGT CGTCTGAATT CGTCGCTATT 

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Terminator +
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCGACCCCG GACGCCATAG CATCCCAATT TTGACTCAAA TCGCCGGCGG CGGATGTAAA TAGAGGGAGA ACAACCTAAT ATGTCAGGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAT  GTGCCCATTT CCAGGAGGGG AATAATGACA AAACTAGCTT GTAGTATGGT TCTTCAGTCT TGTGGAGACG AACTACGGAA GCTGATTTTG AGAGAAACCA GCTCGCCGTC TCCCACTGGA  GGTGTGGGCA GATTCACGCC AAGGCCCGCA TTTAGAGCGG GCCTCTGTTT GGGCTGGAAC AGTAATGACT CTCATTGGGC CCACACTCTT AGAATGGAAA TGTACGTAAA AGTCTCCTTA  AGATTACGCG ACGGTAAGGT ACAATGAAAA TAATAATCCT TTTCTGTGTC AAATCATGCT CAGTTATTAT TTTCATTCAA TTAATAATTA TATTCTATAA TTTATACCAA AAGTTGTCTT  CCATTTTTTT TGGTGTGGGT CTAAAGTCTA GTTCTCTGTG GGTGCTGCTG CCGCCCCCAC TGCCTCCCGT TGCCACAAAC ACAGAAACAC TGCTCTCTAG ACTCGATGCC ATATGGGCTT  AATGGGATGT GCCGACCTGC AGTCCCAGCC AGCGTCCAGG TCATTTGGAG GGGTCCGGTC CAACGTCCCA ATTTGAATTG GACTATCCCA ACCTGACACA CTAACCTTAC TCTCCCTATA  TAAGGATTCT AGTACATTGT TCCTCCACAC GAGATCAATG AATGACGCGA GTTAACATAA AGATAAGGAA TTAATAACTT AATTCTCCCT GAATATTGAC AAATGCTTGA TTGGGTCATA  GTGGGTGATG CAGGACGACA GGGGTTCAGC CTTCGTCCCG ATCAATGGGG GTAAATGCTC TGATACCAAC GATAATGGGT GCAAGATATG GGCTGGCTCA AATAATGCAA CCTAGTCCCT  AAGTTTGACC TCCTGAGACT CTAAATGATG AACAATCTAT GTCCAGGCAG GCGCGTCGAA GTGCAGGGCT GGCGTCCAAG GCGACCGGGG CAAATGCCAA GATAATGGCG CGGGAGTCTC  CTTCGCTTCC ACGTCCGGGT AAGTGGCGGA ACAAGTTGTC GTGATGTAGC ACAAGGGCTG CAGCTCACGA TCTCGTGACA AACCTGACGC ACGCGTCAGA GGAGCACGAC CTATATCCGT  TCTAACCTAT CTAGGTCTTC CGAAGGCGGT GGTAGCGAGA GTAAAGAAAC ACTTCGAGAA ATAATTAACT TTCAATAATA GGAGGGGACG AAGCTAACCT GCGGGGCAGG ACGTGCCCGG  TCGGTCGTGG CGTAAGCGGA GGGTTTGGCA CGGGCAGGGA CGGCGATGTC AAACGACTCG GAACTCCGGA AACGGGTAGA CGCGGTGCGC GGTGCTCGGA GAAGACGAAT CGGTGAAGAC  GGGGCTCTCG GCGTTGTTGG CACGGAAATC GAGGCGTGAC GTGCCGGCCG GGAGCGTCGT CGGGCTTCGT AGAAGGTCCA CTGACGTCTT GACGCGGGGC GGGAGTATCC GGGCAGCGGC  GGCAGCTTTC GGGCCCCTTG GGGGGCCAAT GGCACGCGGG CTGGCGTGCT GGCGCGGCGG CGCGCGCGGG CGTGCAGCCA GCTGGCGCGC AGGCGCGCGC GCGCGGCGCG TAGGGCGCCG  GCGGGTGGGC GCCCGGGTCG CGCGCGATCC GAAATTCCGG CCGCGGCGGG GCGGACGACG GCGGCGGCGG CTGGCCGGGC TGGGCGCCCG GCCGGCGGGC GGTGGCGCTG GCTTGCGCCC  AGCAGCGCCC CGGGCTTGGC GCGCGCGCTG CGGCGGGCGG CGGCAGGCCG GTGGCTGCGC GACCCGGGAG GCACCGTTTG GTGCCGGAAG GCCTCAAAGG GCCGATGGGG CCCGGTAAGG 
GCCTGGAGGG GCTGGCGGCG GCGCGGGCGG GCGGACGACG GCGGCGGCGG CGGTGATCTT CAAGGGCCGC CGTATGAAGG 

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DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATCCTCG CCAAGCTCCG GCAAGCTGGA TTGAGGAAAA CTTGGCTCTG CGCTCCAGGT ACTTCGTTGT GCGCTCATTT CCAATCTAGA GAAATCAGTC TGTAACGCTT CGATTCTCGC  TTGAAACATG CGGAAGAATT AAGCCTACTG ATCACCTTTT GGAATCAAAG TCAATATATC GACATTTGCT TGGAATGTGC TCCTTCCTCC CATGCCATAG TCTTTGAGCA AATTATTCGA  TTCTTTTCCC TTGCGCTTGA GTGCTCCGTG GGGTCTAAGA AGACGTCTCA TCTCACTATA GAGTATTACT GTGTTCTAGA ATATGGTTGT TGCCCTTTCT CCATCGTGTA CGTCTTTTCC  GTTGCTTTTT TTTGGATTAA ATGGGCAATC TATTGTATAC TAGTTCTTAT TGCTGCATTT TTCCCCCCCT GATCCTGTGT TCTTCAGGTT CATTGGATCA AACCAGACCT GCGTATCTTC  AAAGATCATT CAGTCATTAT TTATGGCCTT CGGTTGGTCA ATTTCCCTGT TCAATTCCCG AAGAATTTCT CATCTCATGG TTTTCCTAAC TAAAATTTCT TCAAGTTTCA GAAGAGGCAG  TGTTCTACTT CTGCGGTGGA AACCAGTGGA GAATCTGAAG AGAGAGAAAA GTGAGTTTCT CTCTCTTAAA AATTAAATTT TTTTATTATA TCAGGTAGTT ATCTTCAAAA AAATTGGAGG  TTGTGTGATT TGATTTTTGA ATTTTGTTTT TCAGAATAAA AGTGACGTTT GTGGACAAGG ATGGAGAGGA GAAGGAGATC AAGGTTCCGG TGGGGATGTC CATGCTGGAA GCTGCCCATG  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CDS
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GTCTTCTACT GCGGCGCTCC CGCGCTGGCC AAGGAGCTCA AGAGCCTGTC CCAAGAGCTC ACCCGCCGGA CCACCACACG CTTCCACTTC CACAAGGAGT ACTTCTGA 

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