Entry information : LminAPx-R01(Lemmin7g0185790.t1)
Entry ID 18923
Creation 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LminAPx-R01(Lemmin7g0185790.t1)
Name LminAPx-R01(Lemmin7g0185790.t1)
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminAPx-R01
start..stop
S start..stop
LminAPx-R02 709 0 1..403 1..401
SpolAPx-R 400 9.61e-140 39..403 1..319
NnAPx-R01 357 1.28e-122 126..402 66..333
CescAPx-R01 357 5.47e-122 115..403 73..356
Literature and cross-references LminAPx-R01(Lemmin7g0185790.t1)
Protein sequence: LminAPx-R01(Lemmin7g0185790.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   408 (288)
PWM (Da):   %s   43060.02 (31167.8)  
PI (pH):   %s   8.58 (8.01) Peptide Signal:   %s   cut: 0 range:Ymax-287
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGRELGAGAS SSAGIFRLKS GPHTAVPVTF SCLLFRPAMT AAAATVVPGR FPLPPPKGAE LRQRGHARPR SQQVRCGPRR SPDFPDGKRV DNPCSSASST ECHSATAAAI TTCFLLAPNL  TADGSSSLAS CGRRIFFLAT APLVLPVQGS SEHSNANAAP EEEESLLVRS GVRKVLTKSK APGVLRLAFH DAGTFDMNDG RGGMNGSVIL ELDRPENAGL NKSVKVLRKA KSELDEVLDL  SWADLIAVAG AEAVSICGGP FIPVQLGRMD ASTVDPEGKL PEETLGAVDL KKRFSEKGFS TQELVVLAGA HTLGGKGFGS PIVFDNAYFK ILLDRPWAAP GSSGAAPSSM SSMIGLPSDH 
ALAEDDECLR WIAIYAADQV RFFEDFKRAY VKMVNTGATW RNAKPRVL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCGGCGGCCA ACAAGTTCAG AAAGTGACAG GTAATTGCAA GCGAAACGAG GAATGCTACG TGTGGCAAGG GGCAGCATGG GAGTGTAGTA GAGCGGACGC CCCGCTGGGG CACAATAGGG  AAAGCACCGT GCGGCAGGGC AACAAGACAG GGACAATGTT GGGACGCTAC AAAGCAGATG TCGCGGCAGC ACAGCTAGGT AGGCACTGTG CAATGGTATG GCAGGGCAAG ATTTGCATTG  GAACGTGGTG AGGCAAGCAT TGCAGCAGCA TGACGGTGTA GACCGCACTG GGGAGCGACA GAGGCAGGGC GCGGCACAAA AGCGTGTAAC ACAGTGGAGT TGCGAGGACG CACAATGAGA  GCAGACATGC TGGTTGTTGC AAGAACTAGG TGTGCAGATG ATGTGCCAAA AAGTAGAAAA GCAAGGGGAC GAGGTGACAC AACACTGTGG AGGAAGGACA TGCACAAAGA GGATCATGCG  ATGAGGATGA AGACAACAAC GTTAATGGTC GTTGATGGCA GCGGCTAGAT CAAACCCTAT GACTCTAATG CCAAGTTGAC AATAGAAGGA ACAAAACTCT AAGAATGGAA TAAGAAAAAT  GAGAGTCTTA CGAGAAGCAT GCATAGAGGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGATTGT GAGTGGACCC TTAATTAACC  AGATAGATGA GATATAAGTG AGAGATATGT GTGAACAAGA CATTATGGGC TAATATTTTT CTTTATATTA TTTTTCAAGA TTTTTCAGGT GTTTTGAAAG AATTTAAGAG AGGAGAAAAG  GATAAAAAGA ATAAATATAT ATATTTGAAC ACATATTTAG ACATCACAAA ATTTCAAAAA GGAGTGGATC TAGTGCCATG TAGGACCTGC GTGTTGAGGT GGCCACATGA TGCCTAGGTG  GCATGCATGT GTCACTTGTG TCGAGGTGGA CACAATAGCT TGCACCATGA GGCTGGGTGA ACAGCCAAAT ACTTAGTAGG GGAGCCCTCG CGTAGGAGGA GAAGGGAAGT ATTTTAAGGG  CATAAAGCTT GTATCTTACA TACCTCTTTT CAGCAACTCA CAAAGTCAAT GTGGGACTCA TAGACGAGGA TAAAATTTTA AAGTTGACTC GTTTCTCTTT AATCTTGTAG AAACCTTTCA  AGGATTACCT TTTAAGGATT TAGGCAAACT TTTCCAAGTG TGTGAATTCA GTGAGTTCAC AAATATATCC ATTGAAACAT TGAAGATGAG ATTATTTATA TTCATCTTTA AATACGTGGC  CATTGATTCG TTTGGTAATT TGGCGCAACA ATTTAATGCA TTCGGTGAAT CAAAAGAAGT ATTTACCAAA AAAACTACTT AGGTAAATCG ATTCCGTTAG AAAGGCAATC AAAGATTTCA  CATAAAAAAC GAACGAAATA TTTCATCAAG CTTGAGAGAG ATTAAAGGAC TTTACTGGAC AACATCCCCG TTATGGTGTG ACACACTATG ATTTAGTTCA GTTCCTTATG ATTAATTAGG  GGCAACTGAC AGGTACCGTT TAGATGCCAC TGGTGGAAGC ACTTTACGGG CAAATACGAG GATGAAGCAC CGTCAACTTG ATGAGAAAGG GGTCATGAAT AGTCATCGTC ACATTGCCAA  ATCATTTAAT GGTTGAGTTG TACGACCCAG AAGAAGAGGT TGTGGAATTT GGGATAAAAT TGGACACGAG GATTTCCTAT CATCCCCCCC TCTGGGGTTA ATTAGAAATT GGAGAGAGAG  CATTGGGTCA ACAATAAGAT GAATTTTGTT TTTTAAACCG TTTTTTTAAT TGCCTCAGTA CAACATATGA TAGGGGTATG CAGAAGAGTA GCGTACTGGG CCGTGCCCAT CCCGTACACC 
CCTACAACAT CGAAAGGCTC CGAACCCTAC ATCCGCTCGT CACTCTAGGT AGTTGACACG AACCCTAACA GTCCGGCCCA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATAAGCGCAG TCATCAAGTT TTGATACGAG AGCGCGGTAT AAAATCATTT TAGACAGTCT GATATCAGAG ATTTGATTTG GTTGATGGCC TTGATGCTTG CACAACATCA AGAAGTTGCC  TCCTTTCTCG CTATCATTCA CTCTTAGAAC AAAAGCACAC AAAACATAGC GTCAAAGGGT ACGAGCACCC CTTGCACCGC CTAATGTGCT GGGAGCATCA CTCTATATCG CAAACTTTGT  TGCGAGCGCC CTTACGCCAC CTACTACACT ACAAACGTGG TTCTATGTCG CAAACTTTGC CACAAGCACC TTTACGTTGT CTACTATGTT GCAAGTGTCA CTCTATGCCG AAAACTTTGC  TGCAACGCCT CTTGCTTCAC GTACTGTGCT GCAAGCGTCA CTCTCCGCCG AAAACTTTGT TGCGATGTCC CCTATGCCCC CTACTCCACC TACTATTCTG CGAACGTCAC AAAACCTCAA  TAACTTTTTT GTGAGCGTCC TTACGTGCCT ACTATGCTGC AAGTGTCACT CTATGCCACA AACTTCAATG TGACGCCCCC TACTCCACCT ACTGTGTTAC GAGCGTCACT CTACATTATC  TACTACTACA TTGCATGTTG TGCATGGTGT TCCTATGTGC TCCAGCTTGA AAGGGAGTAT TAGAATAGGC CCGTTAGCTC CTTGGGCCCA ATAAGCTCAC CTCGGCCTTA TAGGCCCGTG  TTTGACTTAT TCATCAGACA CCCCTATTCT ATCTGCACTA CCTCTCATTT TCTCTCCACC TCTCTTTGCT AGTACTCTTC CTTGTACCCT ATATAAGGGA TATAGGTGTT CATCTATAAG  CATGCTCTCT TTGGTTCACA ATTACCTTAT ACAAAACATA AAAATTACCA TCATTTCATC CTCCAATGTA TAAGTTTGAC TTTATCAATG TAAATTCATT GAGTTGACTT TCTCATTGAT  TTCTTCACTG CCTTTAAACT ACTTTTTAAA CAAATTTGAT TAATTAAGTT TCGATCATTA TTCTCTAATT GTATGTATAT TTTTTCATAG AGTTTTCACC TAATGGAAAG AGAGGGTGGC  GCATGCCCAA CATTGCATGA AGCCGTTAAA TCAGGCGGAA AACTTACAAA ATAGGGTTTG GAGATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA  TATATAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGGCC CAATAAGCCG ATATTCTCAC ACTCCTCCTC AAGCTAGAGT ATAGAGGTCA AATAAGGCCA ACTTGCATGA  GAACGAATCA TAGGATGTAA CACTCGGGCC CTTGGTGAAG ACATTTACAA GTTGATCCGA GGATACAACA TATGGAGTAC AAATGAGGCC AATAATAATG TGATGACGAA TAGTATGACA  ATCAACCTCT ATATGCTTGG TGTGAGCATG ATAGGTGAGA TTGTTGGCAA TAAAGGTGGA TGCCTGGTTG TCACAAGTAC ATAGGCATGG TCCCTTGTAC TTGAATACCA AGCTCCTGAA  GAATAGAACG TACCCATAGC ATCTCGGATG AAGTATCCAC CATCGTCCGA TATTCTCCTT ATGCACTAGA AAGAGATACC GCCCGATGCT TGCGACTCCG CCAGATAACC AAGTTTCCAT  CGACATAGAC AGAATAGCCA GATGTGGATT TCTGGTCTCC ACGATCTCTA GCATAACTCG AATCAGACTA GGCTTCAACT CGAAGATGTC CGTGTCATTT GAAGATGAGT CCTCATCTTG  GAGAATTATT CAGATAAGCT AGAAGATGAA GAGTGGCCGA CCAATATACG TCCCGAGGTG CATGCATGAT TTGACTCAAA AGAGTGACAG TGTTGGCAAT GTCCCAACAT TATAGATGAG 
CTTCCCAACG AATAATCGTC AAGTAGATGA GCTTCCCAAC AAGACGCCGA TAACGATGAG GATCCGTGAG TAGGGGGGAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCCGTG AGCTCGGGGC CGGAGCGTCA TCTAGCGCGG GTATTTTCCG GCTAAAATCT GGCCCTCACA CCGCCGTCCC CGTAACTTTT TCCTGCCTCT TGTTCCGGCC GGCGATGACA  GCTGCAGCGG CTACCGTCGT ACCGGGCCGC TTCCCTCTCC CGCCTCCTAA AGGGGCTGAG CTGCGGCAAC GGGGGCACGC GCGGCCTCGC TCCCAACAAG TCAGATGCGG CCCTAGAAGA  TCTCCCGATT TCCCGGATGG GAAGCGAGTG GACAACCCCT GCTCGTCCGC GTCCTCTACG GAATGTCACA GTGCTACAGG TAATGGCGAT TTCCGCTCGC CGGCTCCTTT ACCCTGCATT  GATAGTCGTA ATCGCCGTTT TCCGACTTTT GCGCAGCAGC TGCGATCACT ACTTGCTTTT TACTCGCCCC TAATTTGACG GCAGATGGGA GCAGTTCCTT GGCCTCCTGC GGAAGAAGAA  TTTTCTTCCT TGCGACGGCT CCGTTGGTAC TCCCCGTACA GGGTTCGTCA GAACACTCTA ATGCCAACGC CGCGCCAGAG TATGCTTCAT AATTTCCGTT CCGCTTCCCG ATCCTTGCTT  GTAGTTGTGC TCGTCAATCC ACTGGCTAAA AATCTGAAAC CCAAATTTCG AGACGACTTG TCATCGTCTT CATTCTTCTC TTCTCTCAGA GAAGAGGAAT CTCTCTTGGT TCGAAGCGGG  GTTAGAAAAG TCCTGACCAA GTCCAAGGCC CCCGGGGTAC TCCGCCTGGC CTTCCACGAC GCCGGGACGT TTGACATGAA CGACGGAAGA GGTGATTATC GTGCCACACA GCGTTTCCTG  TTTCTTCCGG GTGATGTATG GCATGTTCTC CTCGCAGGCG GAATGAATGG GTCCGTCATC TTGGAGCTAG ATAGACCCGA GAACGCCGGC TTGAACAAAT CTGTAAAGGT GGGGCACTCT  TCTGCTCAAT CAATCATCTT CTCCGTTCAT AGTCACCCTA TCCAGGTTTG TTCGCATTTC CTGCTCAGGT TCTGCGGAAA GCGAAAAGCG AGCTCGACGA AGTTCTCGAC CGTACGATTT  TATACGTCTA CTGTGATTGT CTAGTAGCTG AATTGTAATC GTCTGAGATG TTGTGGGGTT GATGGTGTTC AGTGTCGTGG GCCGATTTGA TCGCCGTCGC CGGCGCCGAA GCCGTCTCGA  TTTGCGGCGG GCCTTTCATT CCCGTCCAGC TGGGGAGGAT GGACGCGAGG TTGGTTTTCT GTTCTTCAAT CCGGACGCCT TCTCTCTCCT TCTAATCCTT CTTTTTCTCG GGGGTGGTGT  TCGTTCAATC GTCCAGCACA GTAGACCCCG AAGGAAAACT TCCAGAGGAG ACTCTGGGTG CGGTCGACCT GAAGAAGCGC TTCTCGGAGA AGGGCTTCTC GTGAGTACGG CGACGGACAT  TTCCATTTTC CTCGACTTCG TCTGATCATT CGCTCCGAGG GTCCAACTGC AGAACGCAGG AGCTGGTGGT GCTGGCGGGA GCGCACACGC TGGGAGGCAA AGGGTTCGGG AGCCCGATAG  TCTTCGACAA CGCCTACTTC AAGATTCTCC TGGACAGACC CTGGGCCGCT CCGGGGTCCT CGGGTCAGTG AAATACTAAA CACCGACGGG GCGATATCTC TCGCCAACTC TCTCCAATGT  CGAGCATGTC CTGCGTGTTT CAGGGGCGGC CCCTTCTTCC ATGTCGAGCA TGATCGGGCT TCCGTCGGAC CACGCGCTCG CGGAGGACGA CGAGTGTCTG AGGTGCTTTC TGCGGCCGCC  ATTTGGGTCT CTCGCTCTAG TTGTTTGATG TCGCCCTGGA TGTCGCAGGT GGATCGCCAT CTACGCAGCT GACCAGGTGA GGTTCTTCGA GGATTTCAAG AGGGCGTACG TCAAGATGGT 
CAACACCGGC GCCACGTGGA GAAACGCCAA GCCGCGAGTT CTTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCCGTG AGCTCGGGGC CGGAGCGTCA TCTAGCGCGG GTATTTTCCG GCTAAAATCT GGCCCTCACA CCGCCGTCCC CGTAACTTTT TCCTGCCTCT TGTTCCGGCC GGCGATGACA  GCTGCAGCGG CTACCGTCGT ACCGGGCCGC TTCCCTCTCC CGCCTCCTAA AGGGGCTGAG CTGCGGCAAC GGGGGCACGC GCGGCCTCGC TCCCAACAAG TCAGATGCGG CCCTAGAAGA  TCTCCCGATT TCCCGGATGG GAAGCGAGTG GACAACCCCT GCTCGTCCGC GTCCTCTACG GAATGTCACA GTGCTACAGC AGCTGCGATC ACTACTTGCT TTTTACTCGC CCCTAATTTG  ACGGCAGATG GGAGCAGTTC CTTGGCCTCC TGCGGAAGAA GAATTTTCTT CCTTGCGACG GCTCCGTTGG TACTCCCCGT ACAGGGTTCG TCAGAACACT CTAATGCCAA CGCCGCGCCA  GAAGAAGAGG AATCTCTCTT GGTTCGAAGC GGGGTTAGAA AAGTCCTGAC CAAGTCCAAG GCCCCCGGGG TACTCCGCCT GGCCTTCCAC GACGCCGGGA CGTTTGACAT GAACGACGGA  AGAGGCGGAA TGAATGGGTC CGTCATCTTG GAGCTAGATA GACCCGAGAA CGCCGGCTTG AACAAATCTG TAAAGGTTCT GCGGAAAGCG AAAAGCGAGC TCGACGAAGT TCTCGACCTG  TCGTGGGCCG ATTTGATCGC CGTCGCCGGC GCCGAAGCCG TCTCGATTTG CGGCGGGCCT TTCATTCCCG TCCAGCTGGG GAGGATGGAC GCGAGCACAG TAGACCCCGA AGGAAAACTT  CCAGAGGAGA CTCTGGGTGC GGTCGACCTG AAGAAGCGCT TCTCGGAGAA GGGCTTCTCA ACGCAGGAGC TGGTGGTGCT GGCGGGAGCG CACACGCTGG GAGGCAAAGG GTTCGGGAGC  CCGATAGTCT TCGACAACGC CTACTTCAAG ATTCTCCTGG ACAGACCCTG GGCCGCTCCG GGGTCCTCGG GGGCGGCCCC TTCTTCCATG TCGAGCATGA TCGGGCTTCC GTCGGACCAC  GCGCTCGCGG AGGACGACGA GTGTCTGAGG TGGATCGCCA TCTACGCAGC TGACCAGGTG AGGTTCTTCG AGGATTTCAA GAGGGCGTAC GTCAAGATGG TCAACACCGG CGCCACGTGG 
AGAAACGCCA AGCCGCGAGT TCTTTAG 

Retrieve as FASTA