protTMHMM
MyspiFRO03	699	219.59	33.64	9	o4-26i49-71o104-126i157-179o199-221i234-256o271-302i530-552o572-594i

View Redoxidase 19045
Entry information : MyspiFRO03(Myrspi0001g0025640.t1)
Entry ID 19045
Creation 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MyspiFRO03(Myrspi0001g0025640.t1)
Name MyspiFRO03(Myrspi0001g0025640.t1)
Class Ferric reduction oxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiFRO03
start..stop
S start..stop
MyspiFRO06 1386 0 1..699 25..723
MyspiFRO04 1374 0 1..699 23..723
AgluFRO01 913 0 2..699 23..711
LeFRO03 890 0 2..699 25..719
Literature and cross-references MyspiFRO03(Myrspi0001g0025640.t1)
Protein sequence: MyspiFRO03(Myrspi0001g0025640.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   699
PWM (Da)   %s   78526.52 Transmb domain   %s   o4-26i49-71o104-126i157-179o199-221i234-256o271-302i530-552o572-594i
PI (pH)   %s   9.87
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19045','MyspiFRO03','pep','699','219.59','33.64','9','o4-26i49-71o104-126i157-179o199-221i234-256o271-302i530-552o572-594i')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19045','MyspiFRO03','pep','699','219.59','33.64','9','o4-26i49-71o104-126i157-179o199-221i234-256o271-302i530-552o572-594i')

Update Perox 19045 Properties = '699;9.87;78526.52'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MIKLLVVVIF LGYCMIWIMV PTNTYRRDWL LKIRAKANST YFGSQGAQFL IYNFPVLFVA FLGCIYLHYL GKKQIHEAVT VQSGKTKKWS FVEWKKPVLV KGPLGIVSAI ELVLFVMFIA  LLVWSFSTYV HNSFATITPK SLKKSGRTMW EAKLDKVALR LGLVGNICLA FLFFPVVRGS SILPLFGLTS ESCIKYHIWL GHIVMLLFTS HGFCYVLLWA STHEISEMVK WEKVGVSNIA  GELALVAGLI MWATTIPRIR RKMFELFLYS HYLYILFMFF FILHVGISYA FIALPGFYLF LIDRYLRFLQ SRRGVRLVSA RILPCDTLEL NFSKNPGLKY NPTSTIFVNV PSISKLQWHP  FTISSSSSLE PEKLSVIIKS EGTWSQKLYQ MFSSPSSEEH VRVSLEGPYG PASSHFFRHD MLVMVSGGSG ITPFISIIRE LIYASSNSGN TPKVLLISSF KNSSSLTMLD LLLPISSSSL  VDLSKLDIQI EAYVTREKVS QEENQGVRAI WFKPNISDAP ISAILGPKSW LWLSVIISSS FVMYLISVGL LTRYYIYPIE HNTDKRYPTS SAALLNMLLI CGTIAITASG AFLWNKRKNG 
KDENQINVTS ELTPAGTPNS SSCYKSEREL ESLPQQSLVQ ATNVYHGARP DLKSILFNRK ESSVGVLVCG PKKMRREVAT ICSSGLADNL HFESISFSW 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATAAAGC TACTGGTGGT GGTGATTTTT TTAGGGTATT GTATGATATG GATTATGGTG CCAACTAACA CATACAGGCG TGACTGGTTG CTCAAAATCC GAGCAAAGGC TAACTCTACT  TATTTTGGAT CCCAAGGTTA GTTTGCAAAC TTAGTGCATA TAGCTATCCT ATTTGTGTCG TCTTACCTAC GTTTTAATGC ATCGTAATGC TTATTAATTC CTTTAATGGG GAAAACGCAG  GTGCACAATT TCTTATTTAC AACTTCCCGG TTCTGTTTGT TGCTTTTCTT GGATGTATCT ATCTCCATTA TCTTGGCAAA AAACAGATTC ATGAAGCAGT AACAGTCCAA AGGTAAGCAT  AATTCTATAT ATTGTGATAG AGATTGATAG TGATAAAAAA AGTTGAGTGC AGATTTTTCC TTGTGTGATA AATCCGATGA TTGCAGTGGA AAGACGAAGA AGTGGTCTTT CGTGGAATGG  AAGAAGCCGG TTCTGGTGAA AGGGCCGCTA GGGATAGTAT CGGCAATAGA GCTAGTTTTG TTCGTAATGT TCATTGCTCT GTTGGTCTGG TCCTTCTCAA CTTACGTACA CAACAGCTTT  GCCACCATCA CTCCAAAATC CTTGAAGAAA TCTGGTCGAA CAATGTAAAA TTTTAAGCTA AAACTTCAAA CAGTAATTTA ATTTCACTCT TACTACTTGC ATGGTAAATT AATTTTATGT  TTTTGAGGGT TTACAGGTGG GAAGCAAAGT TGGACAAAGT TGCATTAAGG CTAGGGCTTG TAGGGAATAT CTGTTTAGCA TTTCTCTTCT TTCCGGTGGT TCGTGGGTCG TCAATTCTGC  CACTGTTTGG CCTGACGTCG GAATCTTGTA TCAAGTACCA CATATGGTTG GGGCATATCG TCATGCTGCT ATTCACTTCC CATGGTTTCT GCTACGTCTT ATTGTGGGCT TCTACTCATG  AAATTTCCGA GGTACGTAAT CAAATTCATC TATAGGATCT TTATATACGT AATATGTAAA CATATTTATG CAAATATTAT CTTAACAAGG CTCCATGCAT GCGTACGTCT TTTGTTCATA  AAGCACTTGC AACTGTGCAA GCAATCCTTC TGTTTTGAAA TTTCTGGTGA AAAAAAACAG ATATGGATGA CAGCCCCGCC GTCACCGGCC GTAGCGGTTC TTAAACAGAA AGCTCTTACG  AAGACGATGG GTGTTGCTTT TAGTTAGGAT AATGATATTA CTGCTTTTTT GCATTTGTTT TATAAATTAA TGATTAATAC TTTACAATAT ACAATATTTA ATATAAAAGT TGGTGGCCGC  TCTATATAAC AACGCCCTAA GGTCAAATAT AGTCCAACCG GAAGCCCGAG TGGAGGAGAA ACTCGATTCA GAGACCTCCC CCTTGTTCGT TACTATGGAG TAGGCCATCG GAATAAAATC  CCACTTCTTC GGAGATGGAA GTGGGGTTAG CTCAAACTCC ATAACTCGAC CTTGGTGCTC CACCAAACCA TATTGAGGTG CTGCACTGCA CCACCACCGT CAATACATGT TGACTTTGCA  AAAGTGATCC CTATAATTAA AAGTCAATTC CTAGGAACCA ATCTGTGTGT TGATTATATT ATGAAGTAGA CCATTTTTTA GTGGTAGTCA AAGTAATGAT CTTTCTCAGA TATCGATGCA  TGGATTATAT ATCATTCATA TATACTTTGA ATTTGTATTT TAATGAATGA ATGCAGATGG TGAAATGGGA GAAAGTTGGA GTGTCCAATA TCGCCGGAGA ACTTGCTCTA GTGGCAGGAT  TGATCATGTG GGCGACAACC ATCCCAAGAA TCCGAAGAAA AATGTTTGAA CTATTTTTGT ACTCTCATTA TCTCTATATC CTCTTCATGT TCTTCTTCAT TCTCCATGTT GGCATTTCTT  ATGCTTTCAT AGCCCTTCCT GGTTTCTACC TCTTCTTAAT CGATCGTTAC CTGAGATTTC TACAATCTCG GAGAGGTGTA CGGTTGGTCT CAGCTCGCAT CCTCCCCTGC GACACCCTTG  AACTCAATTT CTCCAAGAAT CCAGGTTTTC AGCCTCCTAT ATATATATAT ATGATCTTTT TTTCATTTCG GTCATCGCCT GGATATGAAC TTTGAAACAG GAGTTCTTAC TACTTTAATG  TTATTGAAGC AGGTTTAAAG TACAATCCGA CAAGCACAAT TTTTGTGAAT GTTCCCAGCA TTTCCAAGTT ACAGTGGCAT CCTTTCACTA TAAGTTCAAG TAGTAGTCTG GAACCAGAGA  AGCTGAGTGT CATTATAAAG AGTGAAGGTA CTTGGTCCCA GAAGCTCTAC CAGATGTTTT CATCTCCTTC TTCAGAGGAA CATGTCAGAG TTTCCCTTGA AGGACCTTAT GGACCTGCTT  CAAGCCATTT CTTCAGGTTT ATTTGGTCAA CTTTCTTAAT TGATTACATT TTTCCACAAG TGCTTCAAAA GTCAAATTCT GTGAATACTA AGAAAAAAAA GACTGCTTCT TGAATTGCAG  GCATGACATG CTGGTAATGG TGAGTGGGGG CAGTGGGATC ACCCCTTTTA TCTCAATCAT TAGAGAGCTC ATTTATGCTA GCTCAAACTC TGGCAATACT CCAAAGGTTC TCTTAATTTC  CTCATTCAAG AACTCATCAA GTCTAACCAT GTTAGATCTT TTGCTCCCTA TTTCTTCCTC TTCCCTCGTT GATCTTTCCA AGCTGGACAT ACAAATTGAG GCCTATGTGA CAAGAGAAAA  AGTGTCCCAA GAAGAAAACC AGGGAGTTCG GGCCATTTGG TTCAAACCAA ACATCTCTGA TGCACCCATA TCAGCAATTC TAGGTCCAAA GAGCTGGCTA TGGCTATCTG TTATAATCTC  GTCTTCATTT GTGATGTACC TAATCTCAGT GGGACTTCTC ACCCGGTACT ACATTTACCC CATTGAACAC AACACCGACA AAAGATATCC AACCTCTTCT GCAGCCTTAC TGAATATGCT  ACTTATATGT GGCACAATAG CTATAACAGC TAGTGGAGCC TTTCTCTGGA ACAAGAGGAA AAATGGGAAA GACGAGAACC AAATCAACGT CACCAGTGAA TTAACTCCAG CTGGAACACC  AAACTCATCA TCGTGCTACA AATCCGAGAG GGAATTGGAA AGCCTGCCTC AGCAATCTCT TGTTCAAGCT ACTAATGTAT ATCATGGTGC AAGACCCGAC CTGAAAAGTG AGTTAAGATC  CTTTATATGT ACTAAAACGA TATCTGGAGA TCATCAAATT TAACAATTGT TCTTCTTCCC TTTATTTGCT ACAGGCATAT TGTTTAATCG CAAGGAGTCA AGTGTTGGGG TGCTTGTTTG 
TGGACCTAAG AAGATGAGGC GTGAGGTTGC TACCATCTGT TCATCTGGTT TGGCAGACAA CCTGCATTTC GAATCCATCA GTTTTAGCTG GTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATAAAGC TACTGGTGGT GGTGATTTTT TTAGGGTATT GTATGATATG GATTATGGTG CCAACTAACA CATACAGGCG TGACTGGTTG CTCAAAATCC GAGCAAAGGC TAACTCTACT  TATTTTGGAT CCCAAGGTGC ACAATTTCTT ATTTACAACT TCCCGGTTCT GTTTGTTGCT TTTCTTGGAT GTATCTATCT CCATTATCTT GGCAAAAAAC AGATTCATGA AGCAGTAACA  GTCCAAAGTG GAAAGACGAA GAAGTGGTCT TTCGTGGAAT GGAAGAAGCC GGTTCTGGTG AAAGGGCCGC TAGGGATAGT ATCGGCAATA GAGCTAGTTT TGTTCGTAAT GTTCATTGCT  CTGTTGGTCT GGTCCTTCTC AACTTACGTA CACAACAGCT TTGCCACCAT CACTCCAAAA TCCTTGAAGA AATCTGGTCG AACAATGTGG GAAGCAAAGT TGGACAAAGT TGCATTAAGG  CTAGGGCTTG TAGGGAATAT CTGTTTAGCA TTTCTCTTCT TTCCGGTGGT TCGTGGGTCG TCAATTCTGC CACTGTTTGG CCTGACGTCG GAATCTTGTA TCAAGTACCA CATATGGTTG  GGGCATATCG TCATGCTGCT ATTCACTTCC CATGGTTTCT GCTACGTCTT ATTGTGGGCT TCTACTCATG AAATTTCCGA GATGGTGAAA TGGGAGAAAG TTGGAGTGTC CAATATCGCC  GGAGAACTTG CTCTAGTGGC AGGATTGATC ATGTGGGCGA CAACCATCCC AAGAATCCGA AGAAAAATGT TTGAACTATT TTTGTACTCT CATTATCTCT ATATCCTCTT CATGTTCTTC  TTCATTCTCC ATGTTGGCAT TTCTTATGCT TTCATAGCCC TTCCTGGTTT CTACCTCTTC TTAATCGATC GTTACCTGAG ATTTCTACAA TCTCGGAGAG GTGTACGGTT GGTCTCAGCT  CGCATCCTCC CCTGCGACAC CCTTGAACTC AATTTCTCCA AGAATCCAGG TTTAAAGTAC AATCCGACAA GCACAATTTT TGTGAATGTT CCCAGCATTT CCAAGTTACA GTGGCATCCT  TTCACTATAA GTTCAAGTAG TAGTCTGGAA CCAGAGAAGC TGAGTGTCAT TATAAAGAGT GAAGGTACTT GGTCCCAGAA GCTCTACCAG ATGTTTTCAT CTCCTTCTTC AGAGGAACAT  GTCAGAGTTT CCCTTGAAGG ACCTTATGGA CCTGCTTCAA GCCATTTCTT CAGGCATGAC ATGCTGGTAA TGGTGAGTGG GGGCAGTGGG ATCACCCCTT TTATCTCAAT CATTAGAGAG  CTCATTTATG CTAGCTCAAA CTCTGGCAAT ACTCCAAAGG TTCTCTTAAT TTCCTCATTC AAGAACTCAT CAAGTCTAAC CATGTTAGAT CTTTTGCTCC CTATTTCTTC CTCTTCCCTC  GTTGATCTTT CCAAGCTGGA CATACAAATT GAGGCCTATG TGACAAGAGA AAAAGTGTCC CAAGAAGAAA ACCAGGGAGT TCGGGCCATT TGGTTCAAAC CAAACATCTC TGATGCACCC  ATATCAGCAA TTCTAGGTCC AAAGAGCTGG CTATGGCTAT CTGTTATAAT CTCGTCTTCA TTTGTGATGT ACCTAATCTC AGTGGGACTT CTCACCCGGT ACTACATTTA CCCCATTGAA  CACAACACCG ACAAAAGATA TCCAACCTCT TCTGCAGCCT TACTGAATAT GCTACTTATA TGTGGCACAA TAGCTATAAC AGCTAGTGGA GCCTTTCTCT GGAACAAGAG GAAAAATGGG  AAAGACGAGA ACCAAATCAA CGTCACCAGT GAATTAACTC CAGCTGGAAC ACCAAACTCA TCATCGTGCT ACAAATCCGA GAGGGAATTG GAAAGCCTGC CTCAGCAATC TCTTGTTCAA  GCTACTAATG TATATCATGG TGCAAGACCC GACCTGAAAA GCATATTGTT TAATCGCAAG GAGTCAAGTG TTGGGGTGCT TGTTTGTGGA CCTAAGAAGA TGAGGCGTGA GGTTGCTACC 
ATCTGTTCAT CTGGTTTGGC AGACAACCTG CATTTCGAAT CCATCAGTTT TAGCTGGTGA 

Retrieve as FASTA