protTMHMM
MyspiFRO13	748	237.17	23.07	10	i34-56o83-105i126-159o185-207i228-250o265-287i307-329o459-481i577-599o614-636i

View Redoxidase 19055
Entry information : MyspiFRO13(Myrspi0014g0379060.t1)
Entry ID 19055
Creation 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MyspiFRO13(Myrspi0014g0379060.t1)
Name MyspiFRO13(Myrspi0014g0379060.t1)
Class Ferric reduction oxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiFRO13
start..stop
S start..stop
AgluFRO04 890 0 13..748 12..746
LeFRO04 765 0 36..748 34..740
MyspiFRO32 753 0 36..748 35..743
AgluFRO03 720 0 13..691 9..715
Literature and cross-references MyspiFRO13(Myrspi0014g0379060.t1)
Protein sequence: MyspiFRO13(Myrspi0014g0379060.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   748
PWM (Da)   %s   83545.9 Transmb domain   %s   i34-56o83-105i126-159o185-207i228-250o265-287i307-329o459-481i577-599o614-636i
PI (pH)   %s   6.82
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19055','MyspiFRO13','pep','748','237.17','23.07','10','i34-56o83-105i126-159o185-207i228-250o265-287i307-329o459-481i577-599o614-636i')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19055','MyspiFRO13','pep','748','237.17','23.07','10','i34-56o83-105i126-159o185-207i228-250o265-287i307-329o459-481i577-599o614-636i')

Update Perox 19055 Properties = '748;6.82;83545.9'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALATSEDGD FLPLLTGEAG GGNRKQSTAR ILALWVLKIT IWVVFVGWVA MFFVVISPSG TDLYDDFVDA TESSFYGETG SALLIYSGPI LLIALLAVPY LLLLPNEDNV QLQEKKKKKP  RFGLQTFPVL VHGPFGVVSA AELIGIILFV LFVLWATYIY TVENFAIIDS LDISIAAVRR NYMIQATAFC FGLMASTCLA FLFLPVARGS ILLRIINIPF EHVVRYHIWL GNLTMFILTL  HGVFYMTNWI LRGILLESLV EWKSDTGANL AGVIAYLCGL AMWVTSLPPV RRRYFELFLY THQLYILFII FFALHVGDIT FAIATGGIFL FMLDRFLRFC QSKRKVSVIS VSNFSCGSVK  LVFSKPAGLQ YNALSFIFLR VRELSALQWH PFSVSSSPLD GNYHISVLIK AAGSWTSELK ERIQKIQEKE SLNELPFQVH PNITAFVEGP YSHESPSHLL YGNLILVAGG SGVSPFLAVV  SDILHRVRDR RPCLPRNIIL IWAVKNSNEL SLLHSIDMES ITQSSNRLCI DIRVYVTQES EPPLEEGNFD TLIRSSTFPI QEGQKSISPL VGTGSIIWSG VYVLSSTIGF IILFGLLDLT  YINPLGVSYW WYRGILLLIC MALSVVIFGG IVIYLWHIWE ERRDKESSEE SVGSADVVNG NRTVETGQRD SMLEKLGTSS SIVYGCRPDF KEIFESISKQ WGDVNVGVIV CGPLTLESSV 
ALECRSLNVS RRNCNMPIFH FNSHSFRL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTGG CTACATCTGA AGATGGAGAT TTCCTTCCTC TTCTTACCGG AGAGGCCGGA GGTGGTAACC GGAAACAGAG TACGGCTCGG ATTCTGGCGC TGTGGGTCCT TAAAATCACA  ATCTGGGTCG TTTTCGTCGG TTGGGTTGCT ATGTTTTTCG TTGTTATTTC TCCATCTGGT ACTGATCTTT ATGATGATTT TGTTGATGCT ACTGAAAGTT CTTTCTATGG AGAGACGGGT  AATTTTTTGT TAATTAAAAT GCATGTTATT TTATTCTTTT CATTTGATTT TGCTGGAAAA TTTAATCTCG AGTTCTACTG AGTTTTAGAA TTAATCTTCA AATTAACTTT GCATTCTTGG  ATATCAAAAT GTTTTTTTTT CTCCGCACCA CTTGAAGACA TTCCAGTAAT TAGCCAGATT ATTTATTGTG ACAATGCATA TCTGACTCTT TCTAGCTGAT GTCCTTGGTA TAGCACATTC  ATTACTGGTA TTGATTGATG CCATAGTATC TCCACAAAAA TGTTGATTAT GTGTACCCTA AATGTGCTGA ACTCTTTGCA TTTAGCAGAC ACGTTGTATA TTTGATCATA ATCAAATATT  ACTTTAAACA ATTTAGTGGC TTCTGGATGA GGAAATTTAA ATTCTTTTTA TTTGGTTGGT TCATCAGTGC GTTGGAATTA AACTTCTATG ATCTTTGACC TCTATCGATA AAGCAAAACA  TTTCATCCGA GTTGAATGTA ACATGACCCT GCTCATTGTA TAATGTCTCA GTAGCCTTTT CAAAATTCAA TTAAAATTAC AGTATTTTTA TTATTGACGT ATGCGAATAA TCTCAGGCAG  CGCGTTGCTG ATTTACAGTG GCCCCATTCT CCTTATTGCA TTGCTTGCAG TTCCGTACCT TCTCTTGTTA CCAAATGAAG ATAATGTCCA ACTGCAAGAG TATGTTATAT TCATGTTCCA  TTTCTCCTTT TCTTTCTCTT TATTGTGGGA ATAATTAAGT TAGATCATTG GTATGTAAGG ACTAATTATG CTGACTATCG TGAAATTATA CAGGAAGAAG AAAAAGAAAC CGAGATTTGG  GCTCCAAACA TTTCCTGTAT TGGTACATGG ACCATTTGGA GTTGTTTCTG CTGCAGAATT GATTGGCATA ATCCTCTTTG TTCTGTTTGT CTTATGGGCA ACATACATAT ACACAGTAGA  AAACTTTGCG ATCATTGACT CCCTTGACAT ATCGATCGCT GCAGTAAGGA GGTAAAATAT TTTCTTCGAC CTCCATATCC AGTTGTCTCA TACAGGAACT GCTCGGTAGA TGTATGAGAG  CATCTTGTGT CATGATTATC CCGGTAAAAA TTAGTGTTAT AGTTGTGTGG TGTCCAATCA ATCTGTTAAT TGTCAATGGA TAAAATTAAT ATAACAACTT AATAATACCT GCTCTGCCTG  TTTAAATCGG TTTTAGGGTG TAACACCGAT TTCTTCGAAT GACAGAAAAT GAAATGCCAT TCTTTTCAGG AATTACATGA TACAGGCGAC GGCTTTTTGT TTCGGTCTAA TGGCGTCGAC  TTGTTTGGCT TTTTTGTTTC TTCCTGTTGC AAGAGGATCA ATACTTCTCC GCATTATCAA CATCCCTTTT GAGCATGTTG TCAGATATCA TATATGGCTG GGGAACCTGA CAATGTTCAT  CCTTACTCTC CATGGTGTTT TCTATATGAC TAATTGGATC CTTCGAGGCA TTTTGTTAGA GAGTGTAAGT TTCCATGTGG ACATATTACT ATACATTGTA TTAAGTCTTC CTCCAACTAT  GCAACTTTAT TAGCACGTAA AAATCTAACA CTATGGCTCA GAAAGGACAT TGCTAAAGAC TGTTCTGTAC TCTTCTTACT TTTGCAGCTA GTAGAGTGGA AGAGTGACAC TGGTGCAAAC  TTGGCTGGTG TTATTGCATA TCTTTGTGGT TTAGCAATGT GGGTCACTTC ACTTCCTCCT GTGAGGAGGA GATACTTTGA ATTATTTTTA TACACCCATC AGCTGTACAT TCTTTTCATT  ATATTCTTTG CATTGCACGT TGGTGATATT ACCTTCGCCA TAGCTACTGG AGGAATATTT CTCTTCATGC TTGACCGCTT TCTAAGATTT TGTCAATCAA AAAGAAAAGT CAGTGTTATT  TCCGTCTCCA ACTTCTCATG TGGATCTGTT AAGTTGGTCT TCTCAAAACC CGCAGGTAAG ACTAAATTAA GGGACACAAT TTTGCATTAA CTTTCTTTTA CAAATCTAAA AGATGTTTCC  ATATTTCATT TAGGTCTGCA ATACAATGCT CTCAGCTTTA TCTTCCTGCG AGTTAGGGAA TTATCTGCAT TGCAGTGGCA TCCTTTTAGT GTGTCATCTA GTCCGTTGGA TGGAAACTAC  CATATTTCTG TTCTTATAAA GGCAGCAGGT AGCTGGACCT CGGAGCTAAA AGAGAGAATA CAGAAGATTC AAGAAAAGGA ATCCTTAAAT GAACTACCTT TCCAAGTCCA CCCTAATATT  ACAGCTTTTG TAGAAGGTCC CTATAGCCAT GAATCACCAT CCCACCTATT GTATGTTTTA CTGTGGTTAC ATGAATACAT TTTTTGCCTA TGATTATTAG CTTCCGTATT TGTTACTTAA  TTTCACTCTG TCAGGTATGG AAATCTTATA TTGGTAGCTG GAGGCAGTGG AGTTTCTCCA TTTTTAGCTG TCGTGAGCGA TATTCTGCAT CGTGTCAGGG ATAGGAGACC TTGTCTTCCA  AGAAATATCA TCCTTATATG GGCGGTGAAG AATTCAAATG AACTTTCTCT CCTACATTCG ATTGACATGG AATCAATCAC CCAATCCTCC AATAGGCTTT GTATTGATAT CCGAGTTTAT  GTCACACAGG AATCAGAACC CCCACTGGTA TGTAAAAGCT AGTTTTTGTT TCTTGTGAAA GAGTTTTCTT CTGGAACCTA GCTTCATATT TGTTCACTTG TTTGTGATTC AACCGCAGGA  AGAGGGTAAT TTTGATACGT TGATACGCTC TTCTACATTC CCTATCCAGG AAGGACAGAA GAGCATATCT CCTTTGGTTG GTACAGGAAG CATAATATGG AGTGGAGTAT ACGTCCTTTC  ATCAACAATT GGCTTTATCA TCCTCTTTGG CTTATTAGAT CTTACATACA TCAATCCTTT GGGGGTAAGT TATTGGTGGT ACAGAGGGAT CTTATTGCTA ATCTGCATGG CGTTGAGTGT  TGTGATATTT GGGGGCATAG TAATATACTT GTGGCACATT TGGGAAGAAA GGCGAGATAA AGAAAGCAGT GAGGAAAGCG TAGGGAGCGC AGATGTGGTG AACGGGAACA GGACGGTGGA  GACGGGACAG AGAGATTCAA TGCTGGAGAA GCTTGGCACT TCAAGTAGCA TAGTGTATGG CTGCCGACCT GACTTCAAAG GTAATGCTGA AAAAACAAAT ACGACACTAT TTCAGAAACA  CAATATCTTT TTTGATGGTT CTTTCCCATT GATTGCAGAA ATTTTTGAAT CAATCTCGAA GCAATGGGGC GATGTTAATG TCGGTGTCAT CGTATGCGGA CCGTTGACTC TTGAATCAAG 
TGTGGCATTG GAGTGCAGAT CTTTGAATGT ATCAAGAAGA AACTGCAATA TGCCAATCTT CCATTTCAAC AGCCATAGCT TCCGGTTATA G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTGG CTACATCTGA AGATGGAGAT TTCCTTCCTC TTCTTACCGG AGAGGCCGGA GGTGGTAACC GGAAACAGAG TACGGCTCGG ATTCTGGCGC TGTGGGTCCT TAAAATCACA  ATCTGGGTCG TTTTCGTCGG TTGGGTTGCT ATGTTTTTCG TTGTTATTTC TCCATCTGGT ACTGATCTTT ATGATGATTT TGTTGATGCT ACTGAAAGTT CTTTCTATGG AGAGACGGGC  AGCGCGTTGC TGATTTACAG TGGCCCCATT CTCCTTATTG CATTGCTTGC AGTTCCGTAC CTTCTCTTGT TACCAAATGA AGATAATGTC CAACTGCAAG AGAAGAAGAA AAAGAAACCG  AGATTTGGGC TCCAAACATT TCCTGTATTG GTACATGGAC CATTTGGAGT TGTTTCTGCT GCAGAATTGA TTGGCATAAT CCTCTTTGTT CTGTTTGTCT TATGGGCAAC ATACATATAC  ACAGTAGAAA ACTTTGCGAT CATTGACTCC CTTGACATAT CGATCGCTGC AGTAAGGAGG AATTACATGA TACAGGCGAC GGCTTTTTGT TTCGGTCTAA TGGCGTCGAC TTGTTTGGCT  TTTTTGTTTC TTCCTGTTGC AAGAGGATCA ATACTTCTCC GCATTATCAA CATCCCTTTT GAGCATGTTG TCAGATATCA TATATGGCTG GGGAACCTGA CAATGTTCAT CCTTACTCTC  CATGGTGTTT TCTATATGAC TAATTGGATC CTTCGAGGCA TTTTGTTAGA GAGTCTAGTA GAGTGGAAGA GTGACACTGG TGCAAACTTG GCTGGTGTTA TTGCATATCT TTGTGGTTTA  GCAATGTGGG TCACTTCACT TCCTCCTGTG AGGAGGAGAT ACTTTGAATT ATTTTTATAC ACCCATCAGC TGTACATTCT TTTCATTATA TTCTTTGCAT TGCACGTTGG TGATATTACC  TTCGCCATAG CTACTGGAGG AATATTTCTC TTCATGCTTG ACCGCTTTCT AAGATTTTGT CAATCAAAAA GAAAAGTCAG TGTTATTTCC GTCTCCAACT TCTCATGTGG ATCTGTTAAG  TTGGTCTTCT CAAAACCCGC AGGTCTGCAA TACAATGCTC TCAGCTTTAT CTTCCTGCGA GTTAGGGAAT TATCTGCATT GCAGTGGCAT CCTTTTAGTG TGTCATCTAG TCCGTTGGAT  GGAAACTACC ATATTTCTGT TCTTATAAAG GCAGCAGGTA GCTGGACCTC GGAGCTAAAA GAGAGAATAC AGAAGATTCA AGAAAAGGAA TCCTTAAATG AACTACCTTT CCAAGTCCAC  CCTAATATTA CAGCTTTTGT AGAAGGTCCC TATAGCCATG AATCACCATC CCACCTATTG TATGGAAATC TTATATTGGT AGCTGGAGGC AGTGGAGTTT CTCCATTTTT AGCTGTCGTG  AGCGATATTC TGCATCGTGT CAGGGATAGG AGACCTTGTC TTCCAAGAAA TATCATCCTT ATATGGGCGG TGAAGAATTC AAATGAACTT TCTCTCCTAC ATTCGATTGA CATGGAATCA  ATCACCCAAT CCTCCAATAG GCTTTGTATT GATATCCGAG TTTATGTCAC ACAGGAATCA GAACCCCCAC TGGAAGAGGG TAATTTTGAT ACGTTGATAC GCTCTTCTAC ATTCCCTATC  CAGGAAGGAC AGAAGAGCAT ATCTCCTTTG GTTGGTACAG GAAGCATAAT ATGGAGTGGA GTATACGTCC TTTCATCAAC AATTGGCTTT ATCATCCTCT TTGGCTTATT AGATCTTACA  TACATCAATC CTTTGGGGGT AAGTTATTGG TGGTACAGAG GGATCTTATT GCTAATCTGC ATGGCGTTGA GTGTTGTGAT ATTTGGGGGC ATAGTAATAT ACTTGTGGCA CATTTGGGAA  GAAAGGCGAG ATAAAGAAAG CAGTGAGGAA AGCGTAGGGA GCGCAGATGT GGTGAACGGG AACAGGACGG TGGAGACGGG ACAGAGAGAT TCAATGCTGG AGAAGCTTGG CACTTCAAGT  AGCATAGTGT ATGGCTGCCG ACCTGACTTC AAAGAAATTT TTGAATCAAT CTCGAAGCAA TGGGGCGATG TTAATGTCGG TGTCATCGTA TGCGGACCGT TGACTCTTGA ATCAAGTGTG 
GCATTGGAGT GCAGATCTTT GAATGTATCA AGAAGAAACT GCAATATGCC AATCTTCCAT TTCAACAGCC ATAGCTTCCG GTTATAG 

Retrieve as FASTA