protTMHMM 
MyspiRboh18	839	96.66	0.02	4	o283-302i419-441o467-489i654-671o

View Redoxidase 19060
  1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : MyspiRboh18(Myrspi0022g0539460.t1)
Entry ID 19060
Creation 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiRboh18(Myrspi0022g0539460.t1)
Name MyspiRboh18(Myrspi0022g0539460.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiRboh18
start..stop		 S start..stop
MyspiRboh20 1758 0 1..839 1..839
MyspiRboh33 1712 0 1..839 1..839
EguRboh06 1234 0 12..839 3..857
EgrRboh06 1230 0 12..839 3..857
Literature and cross-references MyspiRboh18(Myrspi0022g0539460.t1)
Protein sequence: MyspiRboh18(Myrspi0022g0539460.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   839
PWM (Da)   %s   96117.34 Transmb domain   %s   o283-302i419-441o467-489i654-671o
PI (pH)   %s   9.25
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19060','MyspiRboh18','pep','839','96.66','0.02','4','o283-302i419-441o467-489i654-671o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19060','MyspiRboh18','pep','839','96.66','0.02','4','o283-302i419-441o467-489i654-671o')

Update Perox 19060 Properties = '839;9.25;96117.34'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNNNSSEEGR HDKSKWIMED VEIDEMVELP LNDDEPRTKV GDHVDKALRK NMSSLRWNGI GLPTTAAAES TAAKGITGLK FLNRSVTGKE TDEWNAIEKR FNQHADAGRL RREHFGPCIG  MGDSKEFAGE VFNALARRRK ISTDNGITLE QLQEFWEDIT NKDIDSTLQI FFDMCDKNGD GKLSEDEVKQ VIVLSASANK LTKLKEHAAS YAALIMEELD PDHLGYIEMW QLETLLRGMA  TPEEVLRCPK RAQSLTRTMI PKQYRTPVSK LLSKFSEYIH ENWRRVWVIS FWLMVNLILF SWKFHQYKHR GAFKIMGYCV CVAKGAAETL KFNMALILIP VCRRTLTKLR STFLSKVVPF  DDNINFHKLI ALAIATGTAT HALVHVTCDF PRVISCPKFK FMSILGPAFD YKQPTYPELV RSITGVTGIL MILIMAFSFT LATHYFRRNV IKLPCPFHHL AGFNAFWYAH HLLVVAYILF  VVHGYFLFLI KEWYKKTTWM YIVIPVLFYA SERTLTSVHD HNHRVSIVKA IIYTGNVLAL YMSKPHGFKY HSGMYLFVKC PDISSFEWHP FSITSAPGDD YLSVHIRTLG DWTTELKDRF  APACQPTATP RNGSLIRLET KHVSGYDHSR ASFPTIVIKG PYGAPAQNYK KYDILLLIGL GIGATPFISI IKDLLNHMRP IEKVTVMEKG KLQRLENTKD TFPERAYFYW VTREQGSFDW 
FKGVMDDVAE HDSNRIIEMH NYLTSVYEEG DARSALIAMV QKLQHARNGV DVVSESKIRT HFARPNWRKV FSDLASRHQH QRIGVFYCGS AMLTKPLKKL CSEFSVDTTT RFQFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAACAATA ATAGCTCGGA AGAAGGACGA CACGATAAAT CTAAATGGAT AATGGAGGAT GTCGAAATTG ATGAGATGGT GGAACTTCCT CTCAACGATG ATGAACCACG AACAAAGGTT  GGTGATCATG TCGATAAAGC GTTGCGGAAA AACATGAGCA GTTTGAGGTG GAACGGGATT GGACTTCCAA CAACTGCGGC TGCAGAATCA ACAGCGGCCA AAGGGATTAC GGGCTTGAAG  TTTCTGAATA GGTCGGTTAC CGGGAAGGAA ACAGATGAGT GGAATGCCAT AGAGAAACGT TTCAATCAAC ATGCAGATGC TGGGAGGCTC AGAAGAGAAC ATTTTGGACC CTGTATTGGT  AAAATCTTCT TGACCCCTTT CAGGCTGTTA TAATTGAGGC CATTTTTCCT ATTATCTTGC TGTGGATTTA GTGCTTCAAT TTTGAAACTT GTTTTGATAA TAGGAATGGG AGATTCTAAG  GAGTTTGCGG GCGAGGTTTT TAATGCATTG GCTAGGCGTA GAAAGATTAG TACAGATAAC GGGATCACTC TGGAACAACT GCAGGAATTC TGGGAAGACA TAACTAATAA AGACATTGAT  TCGACGCTGC AAATTTTCTT CGACATGTAT GAAACCCTCC TCCTTCTTTC TATTTACAGA AGTTCAATAT GCAGAGATGC AAATTCTGGT TAGTTTAGCT GTATCCACTG TATACATAAT  TTAGATTGGA ATATGGAAAT TTCCCAGGTG TGACAAGAAT GGGGATGGGA AGCTATCAGA GGATGAGGTG AAGCAGGTGA GAAGAAAAAT CTTAGGCCTT TGTTGGTTCA TGCTTCTTCC  TCGTCCATGT AATAGATATT GAATGTCTCA AATTTGTGTG CAAAAGGTGA TAGTCCTGAG TGCCTCTGCA AACAAGTTGA CGAAACTAAA GGAACATGCA GCATCATATG CTGCTCTGAT  CATGGAAGAA CTTGATCCTG ATCATCTGGG CTACATAGAG GTTAGCAGAG AATGCCTTAA AAAATCAACA TCCTCCTCCT CCTGCCGCTG CTGCTTCTTT TAACCCATCT CCTAAATTCA  ATAATTCAAG CAGATGTGGC AGCTAGAAAC TCTACTCAGA GGGATGGCAA CCCCTGAAGA AGTCCTAAGG TGTCCCAAGA GAGCCCAATC CCTCACTAGA ACTATGATTC CAAAACAATA  CAGGACCCCG GTTAGCAAAC TTTTATCTAA ATTCTCAGAA TATATTCACG AGAACTGGAG GAGAGTATGG GTCATATCCT TCTGGCTAAT GGTAAACTTG ATCCTGTTCA GCTGGAAATT  CCATCAATAC AAACACAGAG GAGCATTTAA GATCATGGGT TACTGTGTCT GTGTGGCCAA GGGTGCAGCT GAAACACTGA AGTTTAACAT GGCGCTTATC CTCATCCCAG TCTGCAGAAG  AACCCTCACT AAATTGAGAT CGACGTTTCT CAGTAAGGTG GTTCCTTTCG ACGATAATAT CAACTTTCAC AAGTTGATTG CCCTGGCGAT CGCTACAGGA ACTGCAACTC ATGCCCTGGT  ACATGTTACA TGCGACTTCC CGAGGGTTAT TTCCTGCCCG AAATTCAAAT TCATGAGCAT CCTCGGCCCT GCATTTGATT ATAAGCAGCC AACTTATCCT GAACTTGTCA GAAGTATCAC  AGGTGTTACT GGGATTCTGA TGATCCTTAT AATGGCTTTT TCATTCACTT TGGCTACGCA CTATTTCAGA AGGAACGTGA TCAAGTTGCC ATGTCCTTTT CACCATTTGG CTGGTTTCAA  TGCCTTCTGG TATGCACACC ATTTGCTGGT CGTGGCCTAC ATCCTATTTG TTGTTCATGG CTACTTCTTA TTCCTAATCA AGGAGTGGTA CAAGAAAACG GTGCGTATAT CTTCAGAGCC  ATCTCTATTG TTTCATCAAT ATTCAATCCA AAGCACAAAT TCCATACCTC ATATGTATTG TTGAAGAAAG ATCACTCCTT TAGGTGTTTC TGGAAGTATG CATAAATGCT TTTCACTATC  AGTCTTAGAG CAATATCTGG CTTGGAATTA ATCTTTGAGG CCTGCTTGAT TTCCCTGCAG ACATGGATGT ACATCGTGAT CCCGGTGCTC TTTTATGCAA GCGAGAGAAC GTTGACATCA  GTTCATGATC ATAATCATCG CGTTAGCATC GTTAAGGTGT GAACTCCAAC AAGTGTGTCT CTAAAAACTA AGGATTCCAA CATATTGCAG TCATCTTATA CTTGTAATCA TTGTAGGCTA  TAATATATAC TGGAAATGTC CTAGCTCTAT ATATGAGCAA ACCTCATGGA TTCAAGTACC ACAGCGGAAT GTACCTTTTT GTCAAGTGTC CAGATATCTC AAGCTTTGAA TGGTAACACT  CTCCTATAGA CTGAAAAATC ATACGCGTAG AAATCTTTCT ACGCCACATT GTTTCTGATC ATAGTATAGG CATCCCTTCT CTATCACTTC TGCACCAGGA GATGATTACC TGAGCGTCCA  TATAAGAACC TTAGGAGACT GGACTACAGA GCTCAAAGAC AGATTTGCAC CTGTGAGTTA TATCTTCTTC ACCATGATTC CTAAGTTGCA AGTTTCAGAA GCATTTCTTC CAGAACCGTG  TGTCTAAAAA AAATTATATG CAGGCGTGTC AGCCAACAGC CACACCGAGA AATGGAAGTC TAATTCGACT GGAAACGAAG CATGTCTCGG GTTATGACCA TTCACGAGCT AGGTGAGCAG  AAGCACGGCA GGATTTGTAC AGAGGAACAG ACAATAGGTC ATTCAGTTTT TTCTTTCCAT TTTAGACATC TTACACCTTT TAGTTTACAG CTTCCCAACA ATCGTTATTA AAGGACCTTA  TGGAGCTCCA GCTCAGAACT ACAAGAAGTA TGACATACTG CTACTCATTG GCCTGGGAAT AGGAGCAACT CCATTCATCA GCATAATTAA GGATCTGCTG AACCACATGA GACCGATCGA  AAAGGTTACA GTGAGTCAGA AAGGCAAGAG AGCTTGAAAT TGATTCAGCA ATATTCCAAA TGTAGGTTCT AATATCTGAA TCTCGGAATC AAACTAATGC AGGTAATGGA GAAGGGCAAG  TTGCAGAGGC TAGAGAACAC AAAGGATACA TTTCCTGAAA GAGCATATTT CTACTGGGTG ACAAGGGAAC AAGGCTCATT TGATTGGTTC AAAGGTGTGA TGGATGATGT TGCGGAGCAT  GACAGCAATG TATGTTGCAC CAAACAACAG ATATCAAACA CTCAAAACAC ATTTGCATTA GCACAAGTAG AATCTTCATC TAATGGCAAT CCTTTCATGA ATCTTGTAGA GAATCATAGA  AATGCACAAC TACTTGACCA GTGTGTACGA AGAAGGCGAT GCACGATCAG CACTCATCGC AATGGTGCAG AAGCTGCAAC ATGCAAGGAA CGGGGTCGAT GTTGTCTCGG AGAGCAAGGT  ACAAAACTCA ACTTCATGGA GCAAATCTCA TTTCTTTTGG TTCCACTTAT TTTGCTAAAA GATGGCAAAA ACAGATAAGG ACACATTTCG CAAGGCCTAA TTGGAGAAAA GTGTTCTCAG  ATTTAGCAAG CAGACATCAA CATCAACGAA TAGGTAATAT GCCTACTACA ACGTCCATTA AACATTTGTT AACTATAAGT TGAAAGAATG TGGACTTTTG CTGCAGGTGT GTTTTACTGT 
GGAAGTGCAA TGCTTACAAA ACCACTAAAG AAACTTTGCT CCGAGTTCAG CGTCGATACA ACCACTCGTT TTCAGTTCCA TAAGGAGAAT TTCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAACAATA ATAGCTCGGA AGAAGGACGA CACGATAAAT CTAAATGGAT AATGGAGGAT GTCGAAATTG ATGAGATGGT GGAACTTCCT CTCAACGATG ATGAACCACG AACAAAGGTT  GGTGATCATG TCGATAAAGC GTTGCGGAAA AACATGAGCA GTTTGAGGTG GAACGGGATT GGACTTCCAA CAACTGCGGC TGCAGAATCA ACAGCGGCCA AAGGGATTAC GGGCTTGAAG  TTTCTGAATA GGTCGGTTAC CGGGAAGGAA ACAGATGAGT GGAATGCCAT AGAGAAACGT TTCAATCAAC ATGCAGATGC TGGGAGGCTC AGAAGAGAAC ATTTTGGACC CTGTATTGGA  ATGGGAGATT CTAAGGAGTT TGCGGGCGAG GTTTTTAATG CATTGGCTAG GCGTAGAAAG ATTAGTACAG ATAACGGGAT CACTCTGGAA CAACTGCAGG AATTCTGGGA AGACATAACT  AATAAAGACA TTGATTCGAC GCTGCAAATT TTCTTCGACA TGTGTGACAA GAATGGGGAT GGGAAGCTAT CAGAGGATGA GGTGAAGCAG GTGATAGTCC TGAGTGCCTC TGCAAACAAG  TTGACGAAAC TAAAGGAACA TGCAGCATCA TATGCTGCTC TGATCATGGA AGAACTTGAT CCTGATCATC TGGGCTACAT AGAGATGTGG CAGCTAGAAA CTCTACTCAG AGGGATGGCA  ACCCCTGAAG AAGTCCTAAG GTGTCCCAAG AGAGCCCAAT CCCTCACTAG AACTATGATT CCAAAACAAT ACAGGACCCC GGTTAGCAAA CTTTTATCTA AATTCTCAGA ATATATTCAC  GAGAACTGGA GGAGAGTATG GGTCATATCC TTCTGGCTAA TGGTAAACTT GATCCTGTTC AGCTGGAAAT TCCATCAATA CAAACACAGA GGAGCATTTA AGATCATGGG TTACTGTGTC  TGTGTGGCCA AGGGTGCAGC TGAAACACTG AAGTTTAACA TGGCGCTTAT CCTCATCCCA GTCTGCAGAA GAACCCTCAC TAAATTGAGA TCGACGTTTC TCAGTAAGGT GGTTCCTTTC  GACGATAATA TCAACTTTCA CAAGTTGATT GCCCTGGCGA TCGCTACAGG AACTGCAACT CATGCCCTGG TACATGTTAC ATGCGACTTC CCGAGGGTTA TTTCCTGCCC GAAATTCAAA  TTCATGAGCA TCCTCGGCCC TGCATTTGAT TATAAGCAGC CAACTTATCC TGAACTTGTC AGAAGTATCA CAGGTGTTAC TGGGATTCTG ATGATCCTTA TAATGGCTTT TTCATTCACT  TTGGCTACGC ACTATTTCAG AAGGAACGTG ATCAAGTTGC CATGTCCTTT TCACCATTTG GCTGGTTTCA ATGCCTTCTG GTATGCACAC CATTTGCTGG TCGTGGCCTA CATCCTATTT  GTTGTTCATG GCTACTTCTT ATTCCTAATC AAGGAGTGGT ACAAGAAAAC GACATGGATG TACATCGTGA TCCCGGTGCT CTTTTATGCA AGCGAGAGAA CGTTGACATC AGTTCATGAT  CATAATCATC GCGTTAGCAT CGTTAAGGCT ATAATATATA CTGGAAATGT CCTAGCTCTA TATATGAGCA AACCTCATGG ATTCAAGTAC CACAGCGGAA TGTACCTTTT TGTCAAGTGT  CCAGATATCT CAAGCTTTGA ATGGCATCCC TTCTCTATCA CTTCTGCACC AGGAGATGAT TACCTGAGCG TCCATATAAG AACCTTAGGA GACTGGACTA CAGAGCTCAA AGACAGATTT  GCACCTGCGT GTCAGCCAAC AGCCACACCG AGAAATGGAA GTCTAATTCG ACTGGAAACG AAGCATGTCT CGGGTTATGA CCATTCACGA GCTAGCTTCC CAACAATCGT TATTAAAGGA  CCTTATGGAG CTCCAGCTCA GAACTACAAG AAGTATGACA TACTGCTACT CATTGGCCTG GGAATAGGAG CAACTCCATT CATCAGCATA ATTAAGGATC TGCTGAACCA CATGAGACCG  ATCGAAAAGG TTACAGTAAT GGAGAAGGGC AAGTTGCAGA GGCTAGAGAA CACAAAGGAT ACATTTCCTG AAAGAGCATA TTTCTACTGG GTGACAAGGG AACAAGGCTC ATTTGATTGG  TTCAAAGGTG TGATGGATGA TGTTGCGGAG CATGACAGCA ATAGAATCAT AGAAATGCAC AACTACTTGA CCAGTGTGTA CGAAGAAGGC GATGCACGAT CAGCACTCAT CGCAATGGTG  CAGAAGCTGC AACATGCAAG GAACGGGGTC GATGTTGTCT CGGAGAGCAA GATAAGGACA CATTTCGCAA GGCCTAATTG GAGAAAAGTG TTCTCAGATT TAGCAAGCAG ACATCAACAT  CAACGAATAG GTGTGTTTTA CTGTGGAAGT GCAATGCTTA CAAAACCACT AAAGAAACTT TGCTCCGAGT TCAGCGTCGA TACAACCACT CGTTTTCAGT TCCATAAGGA GAATTTCTAG 

Retrieve as FASTA